MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	TGAAAA	2	12	4486	4497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591291
2	NC_014534	ATACTC	2	12	4746	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591292
3	NC_014534	ATCCCT	2	12	14189	14200	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307591300
4	NC_014534	ATCTTT	2	12	17401	17412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307591301
5	NC_014534	ATCTTT	2	12	18417	18428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307591303
6	NC_014534	GGCTTG	2	12	19671	19682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307591303
7	NC_014534	TGTTTC	2	12	24926	24937	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307591306
8	NC_014534	GCAGGT	2	12	24960	24971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307591306
9	NC_014534	ATTTTG	2	12	25279	25290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591306
10	NC_014534	TTTTGA	2	12	27065	27076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591306
11	NC_014534	GAAAAT	2	12	27213	27224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591306
12	NC_014534	CTAATG	2	12	29691	29702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591307
13	NC_014534	ATAAAA	2	12	40772	40783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307591317
14	NC_014534	AAAGAC	2	12	45556	45567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591317
15	NC_014534	TTCAAG	2	12	45584	45595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591317
16	NC_014534	GATGAA	2	12	46777	46788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307591317
17	NC_014534	TGATTT	2	12	47367	47378	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591317
18	NC_014534	AATGGG	2	12	50866	50877	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307591317
19	NC_014534	TTAACT	2	12	50887	50898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591317
20	NC_014534	TTTCTT	2	12	51632	51643	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307591317
21	NC_014534	GTTAAC	2	12	52224	52235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591317
22	NC_014534	TAATTT	2	12	53526	53537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591317
23	NC_014534	GTTGAG	2	12	53736	53747	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307591317
24	NC_014534	GGCATT	2	12	56518	56529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307591317
25	NC_014534	TGTTGG	2	12	58086	58097	0 %	50 %	50 %	0 %	307591317
26	NC_014534	TCCTGA	2	12	59532	59543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307591317
27	NC_014534	TCTGTT	2	12	63938	63949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307591319
28	NC_014534	ATTTTT	2	12	67540	67551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307591320
29	NC_014534	AGGTTT	2	12	67740	67751	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307591320
30	NC_014534	TATTAA	2	12	68876	68887	50 %	50 %	0 %	0 %	307591321
31	NC_014534	AAAAAG	2	12	75158	75169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307591325
32	NC_014534	CCGAAG	2	12	83911	83922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307591335
33	NC_014534	ATCAGT	2	12	90063	90074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591340
34	NC_014534	GATAGA	2	12	90966	90977	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307591340
35	NC_014534	CCTGCC	2	12	91670	91681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	307591341
36	NC_014534	GTAGCT	2	12	92984	92995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307591342
37	NC_014534	TTCTTT	2	12	94290	94301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307591342
38	NC_014534	ACCGTA	2	12	100226	100237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591348
39	NC_014534	TTGAAT	2	12	100744	100755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307591348
40	NC_014534	TTGAGA	2	12	107474	107485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591353
41	NC_014534	GGGGTC	2	12	109379	109390	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307591354
42	NC_014534	TCTCTA	2	12	109511	109522	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591354
43	NC_014534	TTTTAA	2	12	111416	111427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591355
44	NC_014534	TTTTAA	2	12	112432	112443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591357
45	NC_014534	ATAAAT	2	12	113799	113810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591359
46	NC_014534	TTGGAG	2	12	115283	115294	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307591360
47	NC_014534	TAAAAT	2	12	117922	117933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591364
48	NC_014534	AGCTTT	2	12	128512	128523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307591367
49	NC_014534	GAACGA	2	12	130067	130078	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307591370
50	NC_014534	AATTAA	2	12	138113	138124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591377
51	NC_014534	CAAGAG	2	12	139957	139968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307591381
52	NC_014534	GTTGAT	2	12	140186	140197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307591381
53	NC_014534	AAGTAA	2	12	148072	148083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591389
54	NC_014534	TCTAGA	2	12	149231	149242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591391
55	NC_014534	AAGTCA	2	12	150172	150183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307591393
56	NC_014534	ATCAAA	2	12	157726	157737	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307591398
57	NC_014534	CAAGCT	2	12	160085	160096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591402
58	NC_014534	AGACAA	2	12	161114	161125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591404
59	NC_014534	TAAATT	2	12	165341	165352	50 %	50 %	0 %	0 %	307591407
60	NC_014534	CTTTCA	2	12	167930	167941	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591409
61	NC_014534	CAGTAA	2	12	173032	173043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307591413
62	NC_014534	AGTAAT	2	12	173342	173353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307591413
63	NC_014534	TACTAA	2	12	173365	173376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307591413
64	NC_014534	TGACGG	2	12	173605	173616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307591413
65	NC_014534	GCAAAA	2	12	187002	187013	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591422
66	NC_014534	GCTCAA	2	12	189615	189626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591423
67	NC_014534	GATGCT	2	12	197241	197252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307591429
68	NC_014534	ATCTCA	2	12	200070	200081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591432
69	NC_014534	AAATTC	2	12	206303	206314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307591438
70	NC_014534	TTTTAA	2	12	206437	206448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591438
71	NC_014534	TAATTC	2	12	210089	210100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591441
72	NC_014534	AGAGTC	2	12	221617	221628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591450
73	NC_014534	GATGCC	2	12	225301	225312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307591454
74	NC_014534	GGACTG	2	12	229088	229099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307591459
75	NC_014534	GTACAG	2	12	234660	234671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591460
76	NC_014534	TTAGCT	2	12	236083	236094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307591461
77	NC_014534	ACTCAA	2	12	243277	243288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307591468
78	NC_014534	TTATCT	2	12	243804	243815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307591469
79	NC_014534	TGAAAA	2	12	248366	248377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591471
80	NC_014534	CCAAAT	2	12	249854	249865	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307591473
81	NC_014534	CTTTAT	2	12	250908	250919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307591473
82	NC_014534	TTGAGT	2	12	254380	254391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307591478
83	NC_014534	GCGAGA	2	12	256237	256248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307591480
84	NC_014534	AGTCGT	2	12	256648	256659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307591480
85	NC_014534	CTTTCT	2	12	257454	257465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591480
86	NC_014534	AGGAGT	2	12	258881	258892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307591482
87	NC_014534	AAAAAG	2	12	259401	259412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307591483
88	NC_014534	GGGGGA	2	12	260330	260341	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	307591483
89	NC_014534	AGTAGG	2	12	260347	260358	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307591483
90	NC_014534	CAATAA	2	12	263548	263559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307591486
91	NC_014534	GCCTTC	2	12	264394	264405	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307591487
92	NC_014534	TGAGCG	2	12	267054	267065	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307591488
93	NC_014534	CCCTCT	2	12	268162	268173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591489
94	NC_014534	GTGATC	2	12	268806	268817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307591490
95	NC_014534	AATTAG	2	12	269804	269815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307591490
96	NC_014534	TATTGT	2	12	273308	273319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591494
97	NC_014534	TGAAGA	2	12	282626	282637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307591502
98	NC_014534	GATCGA	2	12	284166	284177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591505
99	NC_014534	GAATTA	2	12	285467	285478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307591505
100	NC_014534	CATAGC	2	12	291235	291246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591511
101	NC_014534	CTTTCA	2	12	291772	291783	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591512
102	NC_014534	CTTTTT	2	12	300038	300049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307591516
103	NC_014534	GCTTTA	2	12	306135	306146	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307591522
104	NC_014534	TATCAC	2	12	308329	308340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591524
105	NC_014534	GGATGA	2	12	316110	316121	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307591530
106	NC_014534	ATCGAG	2	12	319516	319527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591533
107	NC_014534	AAAGAA	2	12	323573	323584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307591535
108	NC_014534	AGATAA	2	12	324967	324978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591536
109	NC_014534	TTACAG	2	12	328130	328141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591539
110	NC_014534	CCACAT	2	12	329623	329634	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307591540
111	NC_014534	GAAAAG	2	12	335908	335919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591546
112	NC_014534	GTTCTC	2	12	350074	350085	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307591558
113	NC_014534	AAAGCT	2	12	362642	362653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307591565
114	NC_014534	TTGAGA	2	12	363402	363413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591566
115	NC_014534	CAAATT	2	12	364515	364526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307591567
116	NC_014534	TGCGAC	2	12	368572	368583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307591569
117	NC_014534	ATAGGA	2	12	369511	369522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307591570
118	NC_014534	ACCCTA	2	12	369884	369895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307591570
119	NC_014534	TTTTCC	2	12	370590	370601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591570
120	NC_014534	AAAACG	2	12	372553	372564	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591571
121	NC_014534	AGCAAC	2	12	375773	375784	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307591573
122	NC_014534	AGTGCC	2	12	380171	380182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307591576
123	NC_014534	CGGCTA	2	12	391639	391650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307591581
124	NC_014534	TCTGTT	2	12	393513	393524	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307591581
125	NC_014534	ATCGGA	2	12	396036	396047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591582
126	NC_014534	AACAAT	2	12	407275	407286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307591586
127	NC_014534	TTAGAC	2	12	408913	408924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591588
128	NC_014534	ATCATT	2	12	413524	413535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591592
129	NC_014534	AAATTT	2	12	416616	416627	50 %	50 %	0 %	0 %	307591594
130	NC_014534	TGCCCT	2	12	417177	417188	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307591594
131	NC_014534	GCCACC	2	12	420893	420904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307591599
132	NC_014534	GTAGGA	2	12	421589	421600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307591600
133	NC_014534	CGAACA	2	12	424749	424760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307591603
134	NC_014534	AACTCG	2	12	427888	427899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591606
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136	NC_014534	ACTTTA	2	12	433629	433640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591610
137	NC_014534	AACTCC	2	12	435173	435184	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307591613
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140	NC_014534	AAACCC	2	12	443316	443327	50 %	0 %	0 %	50 %	307591622
141	NC_014534	GTGGGA	2	12	449575	449586	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	307591627
142	NC_014534	ATTTAA	2	12	460819	460830	50 %	50 %	0 %	0 %	307591641
143	NC_014534	TTAAAA	2	12	461902	461913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591643
144	NC_014534	GATAGC	2	12	464368	464379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591646
145	NC_014534	TGGACA	2	12	470389	470400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307591651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.