MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	TCACG	2	10	595	604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014534	CTTTT	2	10	823	832	0 %	80 %	0 %	20 %	307591290
3	NC_014534	ACCGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014534	ATCCG	2	10	2286	2295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014534	ATTTA	2	10	8680	8689	40 %	60 %	0 %	0 %	307591294
6	NC_014534	AATCA	2	10	9105	9114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014534	CTTCC	2	10	9911	9920	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014534	CTCTT	2	10	14479	14488	0 %	60 %	0 %	40 %	307591300
9	NC_014534	CTCGA	2	10	15308	15317	20 %	20 %	20 %	40 %	307591300
10	NC_014534	GAATT	2	10	16605	16614	40 %	40 %	20 %	0 %	307591301
11	NC_014534	AAGCC	2	10	19727	19736	40 %	0 %	20 %	40 %	307591303
12	NC_014534	CATCC	2	10	21711	21720	20 %	20 %	0 %	60 %	307591304
13	NC_014534	GTGTC	2	10	23645	23654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014534	GAGTG	2	10	28323	28332	20 %	20 %	60 %	0 %	307591306
15	NC_014534	AGTTT	2	10	29571	29580	20 %	60 %	20 %	0 %	307591307
16	NC_014534	GGTTC	2	10	29819	29828	0 %	40 %	40 %	20 %	307591307
17	NC_014534	TAAAT	2	10	30672	30681	60 %	40 %	0 %	0 %	307591308
18	NC_014534	AATTG	2	10	31611	31620	40 %	40 %	20 %	0 %	307591308
19	NC_014534	TCTTT	2	10	32740	32749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014534	TAGAA	2	10	33014	33023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014534	AATTA	2	10	33134	33143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014534	ATTTA	2	10	33587	33596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014534	GGAAT	2	10	35464	35473	40 %	20 %	40 %	0 %	307591312
24	NC_014534	TCTTT	2	10	36135	36144	0 %	80 %	0 %	20 %	307591313
25	NC_014534	ATATT	2	10	40202	40211	40 %	60 %	0 %	0 %	307591317
26	NC_014534	CAGCA	2	10	40941	40950	40 %	0 %	20 %	40 %	307591317
27	NC_014534	TCTTT	2	10	44047	44056	0 %	80 %	0 %	20 %	307591317
28	NC_014534	ACTTA	2	10	44807	44816	40 %	40 %	0 %	20 %	307591317
29	NC_014534	ATTTA	2	10	44873	44882	40 %	60 %	0 %	0 %	307591317
30	NC_014534	GACTG	2	10	45217	45226	20 %	20 %	40 %	20 %	307591317
31	NC_014534	GGCGA	2	10	45466	45475	20 %	0 %	60 %	20 %	307591317
32	NC_014534	CAAAG	2	10	47383	47392	60 %	0 %	20 %	20 %	307591317
33	NC_014534	TTTAA	2	10	51277	51286	40 %	60 %	0 %	0 %	307591317
34	NC_014534	TAATT	2	10	51942	51951	40 %	60 %	0 %	0 %	307591317
35	NC_014534	GTTTG	2	10	53667	53676	0 %	60 %	40 %	0 %	307591317
36	NC_014534	GAGAT	2	10	54011	54020	40 %	20 %	40 %	0 %	307591317
37	NC_014534	ATCAA	2	10	60809	60818	60 %	20 %	0 %	20 %	307591317
38	NC_014534	AGATT	2	10	63123	63132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014534	TCTCG	2	10	64190	64199	0 %	40 %	20 %	40 %	307591319
40	NC_014534	TTAGT	2	10	66237	66246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014534	TCAAT	2	10	66569	66578	40 %	40 %	0 %	20 %	307591320
42	NC_014534	AAACC	2	10	67305	67314	60 %	0 %	0 %	40 %	307591320
43	NC_014534	CTCTA	2	10	67488	67497	20 %	40 %	0 %	40 %	307591320
44	NC_014534	GTTGA	2	10	68110	68119	20 %	40 %	40 %	0 %	307591321
45	NC_014534	TTAAT	2	10	68858	68867	40 %	60 %	0 %	0 %	307591321
46	NC_014534	TTGAA	2	10	70224	70233	40 %	40 %	20 %	0 %	307591321
47	NC_014534	GTAAA	2	10	70970	70979	60 %	20 %	20 %	0 %	307591322
48	NC_014534	TAATA	2	10	71216	71225	60 %	40 %	0 %	0 %	307591323
49	NC_014534	AATTT	2	10	73554	73563	40 %	60 %	0 %	0 %	307591324
50	NC_014534	TCGCT	2	10	74129	74138	0 %	40 %	20 %	40 %	307591325
51	NC_014534	AAAAT	2	10	74753	74762	80 %	20 %	0 %	0 %	307591325
52	NC_014534	AATTT	2	10	76093	76102	40 %	60 %	0 %	0 %	307591326
53	NC_014534	CAGGC	2	10	84522	84531	20 %	0 %	40 %	40 %	307591335
54	NC_014534	GAATT	2	10	84630	84639	40 %	40 %	20 %	0 %	307591335
55	NC_014534	CGGTA	2	10	84716	84725	20 %	20 %	40 %	20 %	307591335
56	NC_014534	CTTAG	2	10	87696	87705	20 %	40 %	20 %	20 %	307591336
57	NC_014534	AACAT	2	10	88172	88181	60 %	20 %	0 %	20 %	307591337
58	NC_014534	AAGAA	2	10	89031	89040	80 %	0 %	20 %	0 %	307591339
59	NC_014534	TTGAA	2	10	90006	90015	40 %	40 %	20 %	0 %	307591340
60	NC_014534	TTGTT	2	10	91303	91312	0 %	80 %	20 %	0 %	307591341
61	NC_014534	GTTGA	2	10	93734	93743	20 %	40 %	40 %	0 %	307591342
62	NC_014534	TTTGT	2	10	93965	93974	0 %	80 %	20 %	0 %	307591342
63	NC_014534	TAAAT	2	10	94305	94314	60 %	40 %	0 %	0 %	307591342
64	NC_014534	ATTTG	2	10	99246	99255	20 %	60 %	20 %	0 %	307591347
65	NC_014534	CCGAA	2	10	99464	99473	40 %	0 %	20 %	40 %	307591347
66	NC_014534	GGGGA	2	10	99514	99523	20 %	0 %	80 %	0 %	307591347
67	NC_014534	CTTCT	2	10	99995	100004	0 %	60 %	0 %	40 %	307591347
68	NC_014534	AAATT	2	10	101326	101335	60 %	40 %	0 %	0 %	307591349
69	NC_014534	TGCCC	2	10	103372	103381	0 %	20 %	20 %	60 %	307591351
70	NC_014534	AAATC	2	10	103576	103585	60 %	20 %	0 %	20 %	307591351
71	NC_014534	TCCAT	2	10	105230	105239	20 %	40 %	0 %	40 %	307591351
72	NC_014534	AATAA	2	10	105930	105939	80 %	20 %	0 %	0 %	307591351
73	NC_014534	TCCCA	2	10	107846	107855	20 %	20 %	0 %	60 %	307591353
74	NC_014534	TAATT	2	10	108134	108143	40 %	60 %	0 %	0 %	307591353
75	NC_014534	GAAAA	2	10	111905	111914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014534	TAATT	2	10	112625	112634	40 %	60 %	0 %	0 %	307591357
77	NC_014534	TTTAA	2	10	112707	112716	40 %	60 %	0 %	0 %	307591357
78	NC_014534	CAAGA	2	10	113151	113160	60 %	0 %	20 %	20 %	307591358
79	NC_014534	ACCAC	2	10	114504	114513	40 %	0 %	0 %	60 %	307591359
80	NC_014534	TATTT	2	10	115997	116006	20 %	80 %	0 %	0 %	307591362
81	NC_014534	AATTT	2	10	118483	118492	40 %	60 %	0 %	0 %	307591364
82	NC_014534	GTATC	2	10	121202	121211	20 %	40 %	20 %	20 %	307591365
83	NC_014534	CGAGC	2	10	121808	121817	20 %	0 %	40 %	40 %	307591365
84	NC_014534	TTGAA	2	10	122068	122077	40 %	40 %	20 %	0 %	307591365
85	NC_014534	GAACG	2	10	122728	122737	40 %	0 %	40 %	20 %	307591365
86	NC_014534	TTAAA	2	10	122978	122987	60 %	40 %	0 %	0 %	307591365
87	NC_014534	TGGGA	2	10	123066	123075	20 %	20 %	60 %	0 %	307591365
88	NC_014534	GTGTC	2	10	124130	124139	0 %	40 %	40 %	20 %	307591365
89	NC_014534	TAATT	2	10	125000	125009	40 %	60 %	0 %	0 %	307591365
90	NC_014534	CGGGG	2	10	125423	125432	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014534	AAAGG	2	10	125450	125459	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014534	CTTTT	2	10	126743	126752	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014534	TGATT	2	10	129692	129701	20 %	60 %	20 %	0 %	307591369
94	NC_014534	AAGAC	2	10	129886	129895	60 %	0 %	20 %	20 %	307591370
95	NC_014534	GCCAA	2	10	133639	133648	40 %	0 %	20 %	40 %	307591374
96	NC_014534	ACCAA	2	10	135214	135223	60 %	0 %	0 %	40 %	307591375
97	NC_014534	TAATT	2	10	137375	137384	40 %	60 %	0 %	0 %	307591377
98	NC_014534	GATTC	2	10	138064	138073	20 %	40 %	20 %	20 %	307591377
99	NC_014534	ATTTA	2	10	138185	138194	40 %	60 %	0 %	0 %	307591377
100	NC_014534	AATTA	2	10	139878	139887	60 %	40 %	0 %	0 %	307591381
101	NC_014534	TGTCC	2	10	141297	141306	0 %	40 %	20 %	40 %	307591383
102	NC_014534	AAGGG	2	10	142817	142826	40 %	0 %	60 %	0 %	307591385
103	NC_014534	CTTGT	2	10	144269	144278	0 %	60 %	20 %	20 %	307591386
104	NC_014534	TTCGC	2	10	144518	144527	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014534	TAGCC	2	10	144712	144721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014534	GAGAA	2	10	145694	145703	60 %	0 %	40 %	0 %	307591388
107	NC_014534	TGCCT	2	10	145726	145735	0 %	40 %	20 %	40 %	307591388
108	NC_014534	CAATT	2	10	146925	146934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014534	ACAAG	2	10	147323	147332	60 %	0 %	20 %	20 %	307591389
110	NC_014534	GAAAA	2	10	148003	148012	80 %	0 %	20 %	0 %	307591389
111	NC_014534	TCTTT	2	10	148512	148521	0 %	80 %	0 %	20 %	307591390
112	NC_014534	TGACA	2	10	150893	150902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014534	AAGTC	2	10	152478	152487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014534	CAAGC	2	10	155133	155142	40 %	0 %	20 %	40 %	307591395
115	NC_014534	GTTTA	2	10	155177	155186	20 %	60 %	20 %	0 %	307591395
116	NC_014534	GACTT	2	10	155644	155653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014534	TCGGT	2	10	156106	156115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014534	TCCAT	2	10	156874	156883	20 %	40 %	0 %	40 %	307591397
119	NC_014534	AATTA	2	10	159538	159547	60 %	40 %	0 %	0 %	307591401
120	NC_014534	ATTTT	2	10	159905	159914	20 %	80 %	0 %	0 %	307591401
121	NC_014534	ACTTT	2	10	160408	160417	20 %	60 %	0 %	20 %	307591403
122	NC_014534	CCAAA	2	10	161096	161105	60 %	0 %	0 %	40 %	307591404
123	NC_014534	AGCCA	2	10	162381	162390	40 %	0 %	20 %	40 %	307591404
124	NC_014534	CAGTA	2	10	163846	163855	40 %	20 %	20 %	20 %	307591405
125	NC_014534	TGGCT	2	10	164262	164271	0 %	40 %	40 %	20 %	307591405
126	NC_014534	TTGAT	2	10	164393	164402	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014534	GTTAA	2	10	166192	166201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014534	TGCCC	2	10	168803	168812	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_014534	GTTTG	2	10	169892	169901	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014534	CTTGT	2	10	170455	170464	0 %	60 %	20 %	20 %	307591411
131	NC_014534	AAAAG	2	10	171020	171029	80 %	0 %	20 %	0 %	307591412
132	NC_014534	AACAA	2	10	171295	171304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014534	GGTTC	2	10	173937	173946	0 %	40 %	40 %	20 %	307591413
134	NC_014534	TAATC	2	10	177248	177257	40 %	40 %	0 %	20 %	307591415
135	NC_014534	TTTTA	2	10	179327	179336	20 %	80 %	0 %	0 %	307591415
136	NC_014534	CTTTT	2	10	179555	179564	0 %	80 %	0 %	20 %	307591415
137	NC_014534	GATAG	2	10	179956	179965	40 %	20 %	40 %	0 %	307591415
138	NC_014534	TTAAG	2	10	180133	180142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014534	GATTA	2	10	182946	182955	40 %	40 %	20 %	0 %	307591420
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149	NC_014534	AATTT	2	10	190261	190270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_014534	AGGGT	2	10	310855	310864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014534	GTAAT	2	10	313987	313996	40 %	40 %	20 %	0 %	307591527
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261	NC_014534	ATTGA	2	10	325048	325057	40 %	40 %	20 %	0 %	307591536
262	NC_014534	AATAC	2	10	328589	328598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014534	CTGGC	2	10	331719	331728	0 %	20 %	40 %	40 %	307591542
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265	NC_014534	CAGTC	2	10	334750	334759	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_014534	TACAT	2	10	335495	335504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014534	GTAAA	2	10	336365	336374	60 %	20 %	20 %	0 %	307591546
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.