MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 1321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	TAAT	2	8	261	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014534	TAAC	2	8	278	285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014534	CTCA	2	8	503	510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014534	TAAA	2	8	571	578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014534	GGCT	2	8	1054	1061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014534	AACC	2	8	1103	1110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014534	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014534	AATT	2	8	1217	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014534	CATT	2	8	1249	1256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014534	GATA	2	8	1587	1594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	AGGG	2	8	1964	1971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014534	GGAG	2	8	2550	2557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	TCAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014534	TTTG	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014534	CAAA	2	8	4330	4337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014534	AATA	2	8	4383	4390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014534	GATT	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014534	ATTG	2	8	5141	5148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014534	CCTT	2	8	5221	5228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014534	ATCA	2	8	5280	5287	50 %	25 %	0 %	25 %	307591293
21	NC_014534	TTCG	2	8	5660	5667	0 %	50 %	25 %	25 %	307591293
22	NC_014534	CTAC	2	8	6022	6029	25 %	25 %	0 %	50 %	307591293
23	NC_014534	CAAA	2	8	6737	6744	75 %	0 %	0 %	25 %	307591293
24	NC_014534	ACCC	2	8	7207	7214	25 %	0 %	0 %	75 %	307591293
25	NC_014534	CTGG	2	8	7617	7624	0 %	25 %	50 %	25 %	307591293
26	NC_014534	AGGA	2	8	7662	7669	50 %	0 %	50 %	0 %	307591293
27	NC_014534	TTTC	2	8	8706	8713	0 %	75 %	0 %	25 %	307591294
28	NC_014534	GCCA	2	8	8835	8842	25 %	0 %	25 %	50 %	307591294
29	NC_014534	AGGT	2	8	9649	9656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014534	TTAT	2	8	9853	9860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014534	TCTT	2	8	10362	10369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014534	TGGT	2	8	10389	10396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014534	CGTT	2	8	10772	10779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014534	CTGG	2	8	11353	11360	0 %	25 %	50 %	25 %	307591295
35	NC_014534	TTCC	2	8	11457	11464	0 %	50 %	0 %	50 %	307591295
36	NC_014534	TTAT	2	8	11576	11583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014534	GAAA	2	8	11599	11606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014534	GCTC	2	8	14098	14105	0 %	25 %	25 %	50 %	307591300
39	NC_014534	GATT	2	8	14217	14224	25 %	50 %	25 %	0 %	307591300
40	NC_014534	AAAT	2	8	15006	15013	75 %	25 %	0 %	0 %	307591300
41	NC_014534	TTTC	2	8	15523	15530	0 %	75 %	0 %	25 %	307591300
42	NC_014534	CTTT	2	8	15591	15598	0 %	75 %	0 %	25 %	307591300
43	NC_014534	ATTT	2	8	15721	15728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014534	CATT	2	8	15788	15795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014534	AAAG	2	8	16683	16690	75 %	0 %	25 %	0 %	307591301
46	NC_014534	GGCT	2	8	16934	16941	0 %	25 %	50 %	25 %	307591301
47	NC_014534	ATTC	2	8	17135	17142	25 %	50 %	0 %	25 %	307591301
48	NC_014534	ATTG	2	8	18627	18634	25 %	50 %	25 %	0 %	307591303
49	NC_014534	CTTT	2	8	19342	19349	0 %	75 %	0 %	25 %	307591303
50	NC_014534	TAAT	2	8	19424	19431	50 %	50 %	0 %	0 %	307591303
51	NC_014534	TTTA	2	8	19758	19765	25 %	75 %	0 %	0 %	307591303
52	NC_014534	ATTT	2	8	19869	19876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014534	TTAT	2	8	19971	19978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014534	GTGA	2	8	20529	20536	25 %	25 %	50 %	0 %	307591304
55	NC_014534	CATC	2	8	20880	20887	25 %	25 %	0 %	50 %	307591304
56	NC_014534	GGTT	2	8	20901	20908	0 %	50 %	50 %	0 %	307591304
57	NC_014534	TTTG	2	8	22236	22243	0 %	75 %	25 %	0 %	307591304
58	NC_014534	ACTA	2	8	22510	22517	50 %	25 %	0 %	25 %	307591304
59	NC_014534	CAGG	2	8	22641	22648	25 %	0 %	50 %	25 %	307591304
60	NC_014534	CCGT	2	8	22693	22700	0 %	25 %	25 %	50 %	307591304
61	NC_014534	CCAG	2	8	22728	22735	25 %	0 %	25 %	50 %	307591304
62	NC_014534	TCGT	2	8	22891	22898	0 %	50 %	25 %	25 %	307591304
63	NC_014534	TTAA	2	8	23590	23597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014534	ATTT	2	8	23610	23617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014534	TTAA	2	8	24164	24171	50 %	50 %	0 %	0 %	307591305
66	NC_014534	GAGC	2	8	24391	24398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014534	TTAT	2	8	24426	24433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014534	TATT	2	8	25832	25839	25 %	75 %	0 %	0 %	307591306
69	NC_014534	TTTG	2	8	26879	26886	0 %	75 %	25 %	0 %	307591306
70	NC_014534	TTAC	2	8	27580	27587	25 %	50 %	0 %	25 %	307591306
71	NC_014534	ATTT	2	8	27622	27629	25 %	75 %	0 %	0 %	307591306
72	NC_014534	GTTG	2	8	27768	27775	0 %	50 %	50 %	0 %	307591306
73	NC_014534	ATAA	2	8	27897	27904	75 %	25 %	0 %	0 %	307591306
74	NC_014534	AAAT	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	307591306
75	NC_014534	CTTC	2	8	28380	28387	0 %	50 %	0 %	50 %	307591306
76	NC_014534	CTTT	2	8	28810	28817	0 %	75 %	0 %	25 %	307591306
77	NC_014534	AGCA	2	8	29266	29273	50 %	0 %	25 %	25 %	307591306
78	NC_014534	TAAT	2	8	30151	30158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014534	TGAA	2	8	32064	32071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014534	AAAT	2	8	32901	32908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014534	TAGA	2	8	33190	33197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014534	TAAA	2	8	33277	33284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014534	ATTA	2	8	33317	33324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014534	TTTA	2	8	33341	33348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014534	ATTT	2	8	33441	33448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014534	TATT	2	8	33599	33606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014534	ATTT	2	8	33802	33809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014534	TCTT	2	8	33936	33943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014534	AATT	2	8	34182	34189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014534	AAAT	2	8	34627	34634	75 %	25 %	0 %	0 %	307591310
91	NC_014534	TATT	2	8	34814	34821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014534	GTCG	2	8	34920	34927	0 %	25 %	50 %	25 %	307591311
93	NC_014534	GCAA	2	8	35254	35261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014534	GTGA	2	8	35556	35563	25 %	25 %	50 %	0 %	307591312
95	NC_014534	GATT	2	8	35620	35627	25 %	50 %	25 %	0 %	307591312
96	NC_014534	AAGC	2	8	36031	36038	50 %	0 %	25 %	25 %	307591313
97	NC_014534	TAAA	2	8	36283	36290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014534	TTTA	2	8	36814	36821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014534	ATTA	2	8	36938	36945	50 %	50 %	0 %	0 %	307591315
100	NC_014534	AAAG	2	8	37125	37132	75 %	0 %	25 %	0 %	307591315
101	NC_014534	ATTA	2	8	37267	37274	50 %	50 %	0 %	0 %	307591315
102	NC_014534	ATTA	2	8	37795	37802	50 %	50 %	0 %	0 %	307591315
103	NC_014534	GAAT	2	8	38940	38947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014534	AGAA	2	8	39600	39607	75 %	0 %	25 %	0 %	307591317
105	NC_014534	CAGC	2	8	40127	40134	25 %	0 %	25 %	50 %	307591317
106	NC_014534	TTTA	2	8	40158	40165	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
107	NC_014534	ATCA	2	8	40221	40228	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
108	NC_014534	AAAC	2	8	40390	40397	75 %	0 %	0 %	25 %	307591317
109	NC_014534	CTAG	2	8	41041	41048	25 %	25 %	25 %	25 %	307591317
110	NC_014534	CACC	2	8	41300	41307	25 %	0 %	0 %	75 %	307591317
111	NC_014534	TCAA	2	8	41428	41435	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
112	NC_014534	AATT	2	8	41553	41560	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
113	NC_014534	TAAC	2	8	42029	42036	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
114	NC_014534	CTCA	2	8	42445	42452	25 %	25 %	0 %	50 %	307591317
115	NC_014534	CTTC	2	8	42553	42560	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
116	NC_014534	AATC	2	8	42765	42772	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
117	NC_014534	ATTT	2	8	42811	42818	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
118	NC_014534	AATC	3	12	42867	42878	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
119	NC_014534	ACCG	2	8	43156	43163	25 %	0 %	25 %	50 %	307591317
120	NC_014534	GATA	2	8	43602	43609	50 %	25 %	25 %	0 %	307591317
121	NC_014534	TATT	2	8	43611	43618	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
122	NC_014534	CAAA	2	8	43677	43684	75 %	0 %	0 %	25 %	307591317
123	NC_014534	TTAC	2	8	44273	44280	25 %	50 %	0 %	25 %	307591317
124	NC_014534	TATT	2	8	44557	44564	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
125	NC_014534	ATTT	2	8	44638	44645	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
126	NC_014534	GAAA	2	8	44647	44654	75 %	0 %	25 %	0 %	307591317
127	NC_014534	GGAA	2	8	45093	45100	50 %	0 %	50 %	0 %	307591317
128	NC_014534	AAAC	2	8	45370	45377	75 %	0 %	0 %	25 %	307591317
129	NC_014534	GAAC	2	8	45645	45652	50 %	0 %	25 %	25 %	307591317
130	NC_014534	GTGA	2	8	45853	45860	25 %	25 %	50 %	0 %	307591317
131	NC_014534	AGAA	2	8	46101	46108	75 %	0 %	25 %	0 %	307591317
132	NC_014534	CTTC	2	8	46963	46970	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
133	NC_014534	CCCA	2	8	47002	47009	25 %	0 %	0 %	75 %	307591317
134	NC_014534	TTCC	2	8	47292	47299	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
135	NC_014534	GATA	2	8	47637	47644	50 %	25 %	25 %	0 %	307591317
136	NC_014534	TATT	2	8	48059	48066	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
137	NC_014534	GAAA	2	8	48701	48708	75 %	0 %	25 %	0 %	307591317
138	NC_014534	TCAA	2	8	48861	48868	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
139	NC_014534	ATGT	2	8	48985	48992	25 %	50 %	25 %	0 %	307591317
140	NC_014534	CAAT	2	8	49452	49459	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
141	NC_014534	CCTT	2	8	50838	50845	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
142	NC_014534	TCAA	2	8	51083	51090	50 %	25 %	0 %	25 %	307591317
143	NC_014534	CTCC	2	8	52286	52293	0 %	25 %	0 %	75 %	307591317
144	NC_014534	TTTA	2	8	54084	54091	25 %	75 %	0 %	0 %	307591317
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