MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	TAAT	2	8	261	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014534	TAAC	2	8	278	285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014534	CTCA	2	8	503	510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014534	TAAA	2	8	571	578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014534	GGCT	2	8	1054	1061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014534	AACC	2	8	1103	1110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014534	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014534	AATT	2	8	1217	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014534	CATT	2	8	1249	1256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014534	GATA	2	8	1587	1594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	AGGG	2	8	1964	1971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014534	GGAG	2	8	2550	2557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	TCAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014534	TTTG	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014534	CAAA	2	8	4330	4337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014534	AATA	2	8	4383	4390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014534	GATT	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014534	ATTG	2	8	5141	5148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014534	CCTT	2	8	5221	5228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014534	AGGT	2	8	9649	9656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014534	TTAT	2	8	9853	9860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014534	TCTT	2	8	10362	10369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014534	TGGT	2	8	10389	10396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014534	CGTT	2	8	10772	10779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014534	TTAT	2	8	11576	11583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014534	GAAA	2	8	11599	11606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014534	ATTT	2	8	15721	15728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014534	CATT	2	8	15788	15795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014534	ATTT	2	8	19869	19876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014534	TTAT	2	8	19971	19978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014534	TTAA	2	8	23590	23597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014534	ATTT	2	8	23610	23617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014534	GAGC	2	8	24391	24398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014534	TTAT	2	8	24426	24433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014534	TAAT	2	8	30151	30158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014534	TGAA	2	8	32064	32071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014534	AAAT	2	8	32901	32908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014534	TAGA	2	8	33190	33197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014534	TAAA	2	8	33277	33284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014534	ATTA	2	8	33317	33324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014534	TTTA	2	8	33341	33348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014534	ATTT	2	8	33441	33448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014534	TATT	2	8	33599	33606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014534	ATTT	2	8	33802	33809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014534	TCTT	2	8	33936	33943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014534	AATT	2	8	34182	34189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014534	TATT	2	8	34814	34821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014534	GCAA	2	8	35254	35261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014534	TAAA	2	8	36283	36290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014534	TTTA	2	8	36814	36821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014534	GAAT	2	8	38940	38947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014534	AGTG	2	8	63552	63559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014534	TTTC	2	8	66103	66110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014534	GAAG	2	8	73372	73379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014534	ATCA	2	8	76143	76150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014534	CATA	2	8	76258	76265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014534	AATA	2	8	76380	76387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014534	TAGA	2	8	77245	77252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014534	AGCA	2	8	79339	79346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014534	GAAC	2	8	82603	82610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014534	GAAA	2	8	83451	83458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014534	TCCA	2	8	83744	83751	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014534	CTAA	2	8	86074	86081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014534	TAAT	2	8	86127	86134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014534	TAAA	2	8	86782	86789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014534	ATTG	2	8	86926	86933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014534	TTAA	2	8	87237	87244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014534	TTAA	2	8	87257	87264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014534	AATC	2	8	87960	87967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014534	ATCT	2	8	88234	88241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014534	AAAT	2	8	95101	95108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014534	TAAA	2	8	108677	108684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014534	ATTA	2	8	108700	108707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014534	GCTT	2	8	109864	109871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014534	TAAA	2	8	118988	118995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014534	CTCG	2	8	125482	125489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014534	TAAT	2	8	125739	125746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014534	CATT	2	8	126723	126730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014534	GCTT	2	8	127429	127436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014534	CGTT	2	8	127450	127457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014534	ATTT	2	8	129733	129740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014534	CTAA	2	8	131329	131336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014534	CTAA	2	8	131387	131394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014534	AATA	2	8	133135	133142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014534	AATT	2	8	133212	133219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014534	AAAT	2	8	137015	137022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014534	AACT	2	8	144673	144680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014534	TTTC	2	8	146972	146979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014534	CTTA	2	8	148705	148712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014534	GCAA	2	8	150987	150994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014534	TATC	2	8	151422	151429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014534	ATGG	2	8	151978	151985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014534	AACA	2	8	153148	153155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014534	ATTG	2	8	153465	153472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014534	CTAT	2	8	153492	153499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014534	TTGG	2	8	155410	155417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014534	GTAG	2	8	155903	155910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014534	ATTT	2	8	156164	156171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014534	ATTA	2	8	160227	160234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014534	TAAA	2	8	162572	162579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014534	AAAC	2	8	162704	162711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014534	ATTA	2	8	164423	164430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014534	TAAA	2	8	166327	166334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014534	ACTC	2	8	166541	166548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014534	CAAG	2	8	166823	166830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014534	AGAA	2	8	167152	167159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014534	GAAA	2	8	167350	167357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014534	ATTA	2	8	169461	169468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014534	AGAT	2	8	180770	180777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014534	ATTG	2	8	180778	180785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014534	ATTT	2	8	180789	180796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014534	AAGA	2	8	182636	182643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014534	TAAA	2	8	186817	186824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014534	ATTA	2	8	197575	197582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014534	AAAG	2	8	212272	212279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014534	TAGT	2	8	213753	213760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014534	TTGA	2	8	215983	215990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014534	ACAA	2	8	216473	216480	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014534	AGGA	2	8	217056	217063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014534	CTAT	2	8	217669	217676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014534	TACT	2	8	217846	217853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014534	CCTT	2	8	218093	218100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014534	CTTT	2	8	218514	218521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014534	ATTT	2	8	218547	218554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014534	ACCA	2	8	219732	219739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014534	TAGA	2	8	220052	220059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014534	AATT	2	8	224779	224786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014534	ATTA	3	12	226288	226299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014534	TAAT	2	8	226719	226726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014534	GAAA	2	8	227918	227925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014534	ACTA	2	8	228081	228088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014534	CAAA	2	8	233316	233323	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014534	TAAA	2	8	233329	233336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014534	TTAT	2	8	236545	236552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014534	TTAG	2	8	239985	239992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014534	GAAT	2	8	240944	240951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014534	ATTT	2	8	241612	241619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014534	GTAG	2	8	241838	241845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014534	CAAG	2	8	242059	242066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014534	TAAA	3	12	242375	242386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014534	ATAA	2	8	243509	243516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014534	ATTT	2	8	253854	253861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014534	AAAT	2	8	253912	253919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014534	CTCA	2	8	267306	267313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014534	TACC	2	8	267335	267342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014534	CTAT	2	8	268417	268424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014534	GGAA	2	8	269979	269986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014534	TCGT	2	8	270159	270166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014534	CGAT	2	8	272966	272973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014534	TCTG	2	8	274919	274926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014534	TTTC	2	8	275218	275225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014534	AGCA	2	8	276475	276482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014534	TTGG	2	8	278364	278371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014534	CTAA	2	8	278506	278513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.