MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 424

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	AC	3	6	4521	4526	50 %	0 %	0 %	50 %	307591291
2	NC_014534	TC	3	6	5044	5049	0 %	50 %	0 %	50 %	307591292
3	NC_014534	AG	4	8	5546	5553	50 %	0 %	50 %	0 %	307591293
4	NC_014534	AC	3	6	7446	7451	50 %	0 %	0 %	50 %	307591293
5	NC_014534	GA	3	6	8917	8922	50 %	0 %	50 %	0 %	307591294
6	NC_014534	AC	3	6	11182	11187	50 %	0 %	0 %	50 %	307591295
7	NC_014534	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	307591296
8	NC_014534	GT	3	6	12122	12127	0 %	50 %	50 %	0 %	307591296
9	NC_014534	GA	3	6	13019	13024	50 %	0 %	50 %	0 %	307591298
10	NC_014534	TA	3	6	13227	13232	50 %	50 %	0 %	0 %	307591299
11	NC_014534	CT	3	6	13651	13656	0 %	50 %	0 %	50 %	307591299
12	NC_014534	TC	4	8	13974	13981	0 %	50 %	0 %	50 %	307591300
13	NC_014534	CG	3	6	14256	14261	0 %	0 %	50 %	50 %	307591300
14	NC_014534	TA	3	6	14437	14442	50 %	50 %	0 %	0 %	307591300
15	NC_014534	TA	3	6	14473	14478	50 %	50 %	0 %	0 %	307591300
16	NC_014534	TC	5	10	14517	14526	0 %	50 %	0 %	50 %	307591300
17	NC_014534	TA	3	6	14875	14880	50 %	50 %	0 %	0 %	307591300
18	NC_014534	AT	3	6	16349	16354	50 %	50 %	0 %	0 %	307591301
19	NC_014534	TC	3	6	16861	16866	0 %	50 %	0 %	50 %	307591301
20	NC_014534	TC	4	8	16956	16963	0 %	50 %	0 %	50 %	307591301
21	NC_014534	CT	3	6	18407	18412	0 %	50 %	0 %	50 %	307591303
22	NC_014534	AT	3	6	18588	18593	50 %	50 %	0 %	0 %	307591303
23	NC_014534	AT	3	6	19250	19255	50 %	50 %	0 %	0 %	307591303
24	NC_014534	CT	3	6	19369	19374	0 %	50 %	0 %	50 %	307591303
25	NC_014534	TA	3	6	21330	21335	50 %	50 %	0 %	0 %	307591304
26	NC_014534	AC	3	6	21945	21950	50 %	0 %	0 %	50 %	307591304
27	NC_014534	TA	3	6	22744	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	307591304
28	NC_014534	AT	3	6	25078	25083	50 %	50 %	0 %	0 %	307591306
29	NC_014534	AC	3	6	29011	29016	50 %	0 %	0 %	50 %	307591306
30	NC_014534	AT	3	6	30029	30034	50 %	50 %	0 %	0 %	307591307
31	NC_014534	TC	4	8	30411	30418	0 %	50 %	0 %	50 %	307591308
32	NC_014534	AG	3	6	30544	30549	50 %	0 %	50 %	0 %	307591308
33	NC_014534	TA	3	6	30665	30670	50 %	50 %	0 %	0 %	307591308
34	NC_014534	CT	3	6	30960	30965	0 %	50 %	0 %	50 %	307591308
35	NC_014534	GA	3	6	32558	32563	50 %	0 %	50 %	0 %	307591309
36	NC_014534	GA	3	6	36046	36051	50 %	0 %	50 %	0 %	307591313
37	NC_014534	AT	3	6	36381	36386	50 %	50 %	0 %	0 %	307591314
38	NC_014534	TA	3	6	37246	37251	50 %	50 %	0 %	0 %	307591315
39	NC_014534	CT	3	6	37969	37974	0 %	50 %	0 %	50 %	307591316
40	NC_014534	AT	5	10	38104	38113	50 %	50 %	0 %	0 %	307591316
41	NC_014534	CA	3	6	39768	39773	50 %	0 %	0 %	50 %	307591317
42	NC_014534	AT	3	6	41329	41334	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
43	NC_014534	AT	3	6	43758	43763	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
44	NC_014534	CT	3	6	44060	44065	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
45	NC_014534	GA	3	6	44473	44478	50 %	0 %	50 %	0 %	307591317
46	NC_014534	TA	3	6	45766	45771	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
47	NC_014534	AT	3	6	48481	48486	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
48	NC_014534	TA	3	6	49484	49489	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
49	NC_014534	TC	3	6	49498	49503	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
50	NC_014534	CT	3	6	52535	52540	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
51	NC_014534	CT	3	6	53038	53043	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
52	NC_014534	CT	4	8	54998	55005	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
53	NC_014534	TA	3	6	56956	56961	50 %	50 %	0 %	0 %	307591317
54	NC_014534	CT	3	6	57956	57961	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
55	NC_014534	CA	3	6	58218	58223	50 %	0 %	0 %	50 %	307591317
56	NC_014534	TG	3	6	59910	59915	0 %	50 %	50 %	0 %	307591317
57	NC_014534	CT	3	6	60261	60266	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
58	NC_014534	TC	3	6	60714	60719	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
59	NC_014534	TC	3	6	60853	60858	0 %	50 %	0 %	50 %	307591317
60	NC_014534	TA	3	6	66548	66553	50 %	50 %	0 %	0 %	307591320
61	NC_014534	AT	3	6	66600	66605	50 %	50 %	0 %	0 %	307591320
62	NC_014534	AT	3	6	66687	66692	50 %	50 %	0 %	0 %	307591320
63	NC_014534	TC	3	6	67771	67776	0 %	50 %	0 %	50 %	307591320
64	NC_014534	TC	4	8	70413	70420	0 %	50 %	0 %	50 %	307591322
65	NC_014534	AT	3	6	70764	70769	50 %	50 %	0 %	0 %	307591322
66	NC_014534	AG	3	6	71493	71498	50 %	0 %	50 %	0 %	307591323
67	NC_014534	TC	3	6	73202	73207	0 %	50 %	0 %	50 %	307591323
68	NC_014534	TC	3	6	75037	75042	0 %	50 %	0 %	50 %	307591325
69	NC_014534	TA	3	6	75046	75051	50 %	50 %	0 %	0 %	307591325
70	NC_014534	AG	3	6	76626	76631	50 %	0 %	50 %	0 %	307591327
71	NC_014534	AT	4	8	76975	76982	50 %	50 %	0 %	0 %	307591327
72	NC_014534	GA	3	6	80519	80524	50 %	0 %	50 %	0 %	307591331
73	NC_014534	CT	3	6	80627	80632	0 %	50 %	0 %	50 %	307591331
74	NC_014534	AG	3	6	80796	80801	50 %	0 %	50 %	0 %	307591331
75	NC_014534	GA	3	6	84471	84476	50 %	0 %	50 %	0 %	307591335
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77	NC_014534	TA	3	6	85908	85913	50 %	50 %	0 %	0 %	307591335
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80	NC_014534	GA	3	6	90742	90747	50 %	0 %	50 %	0 %	307591340
81	NC_014534	GA	3	6	90792	90797	50 %	0 %	50 %	0 %	307591340
82	NC_014534	CT	3	6	91836	91841	0 %	50 %	0 %	50 %	307591341
83	NC_014534	GA	3	6	92297	92302	50 %	0 %	50 %	0 %	307591341
84	NC_014534	AT	3	6	92677	92682	50 %	50 %	0 %	0 %	307591342
85	NC_014534	GA	3	6	92887	92892	50 %	0 %	50 %	0 %	307591342
86	NC_014534	TC	3	6	94459	94464	0 %	50 %	0 %	50 %	307591342
87	NC_014534	TC	3	6	94950	94955	0 %	50 %	0 %	50 %	307591343
88	NC_014534	GA	3	6	95456	95461	50 %	0 %	50 %	0 %	307591344
89	NC_014534	TC	3	6	95798	95803	0 %	50 %	0 %	50 %	307591344
90	NC_014534	TC	3	6	96178	96183	0 %	50 %	0 %	50 %	307591345
91	NC_014534	TA	3	6	97495	97500	50 %	50 %	0 %	0 %	307591345
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101	NC_014534	CA	3	6	105924	105929	50 %	0 %	0 %	50 %	307591351
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103	NC_014534	GA	3	6	107459	107464	50 %	0 %	50 %	0 %	307591353
104	NC_014534	GA	3	6	107974	107979	50 %	0 %	50 %	0 %	307591353
105	NC_014534	AG	3	6	108337	108342	50 %	0 %	50 %	0 %	307591353
106	NC_014534	AG	3	6	111130	111135	50 %	0 %	50 %	0 %	307591355
107	NC_014534	GA	3	6	111185	111190	50 %	0 %	50 %	0 %	307591355
108	NC_014534	AT	3	6	112682	112687	50 %	50 %	0 %	0 %	307591357
109	NC_014534	AG	3	6	113190	113195	50 %	0 %	50 %	0 %	307591358
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111	NC_014534	GA	3	6	114018	114023	50 %	0 %	50 %	0 %	307591359
112	NC_014534	AT	3	6	114583	114588	50 %	50 %	0 %	0 %	307591359
113	NC_014534	AG	3	6	115418	115423	50 %	0 %	50 %	0 %	307591361
114	NC_014534	GA	3	6	115895	115900	50 %	0 %	50 %	0 %	307591362
115	NC_014534	GA	3	6	117270	117275	50 %	0 %	50 %	0 %	307591363
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119	NC_014534	GA	3	6	120333	120338	50 %	0 %	50 %	0 %	307591365
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122	NC_014534	AT	3	6	124411	124416	50 %	50 %	0 %	0 %	307591365
123	NC_014534	AG	3	6	124896	124901	50 %	0 %	50 %	0 %	307591365
124	NC_014534	AG	3	6	125319	125324	50 %	0 %	50 %	0 %	307591366
125	NC_014534	GA	3	6	128075	128080	50 %	0 %	50 %	0 %	307591367
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.