MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	TTTTAT	2	12	1080	1091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014533	AATGAA	2	12	20699	20710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014533	AAATAG	2	12	22265	22276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014533	GGAGAT	2	12	24737	24748	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014533	GAAAAT	2	12	24857	24868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014533	ATTTAT	2	12	42498	42509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014533	CCCCTT	2	12	43763	43774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014533	TACTTG	2	12	61272	61283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014533	ATAAGT	2	12	61303	61314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014533	TACAGG	2	12	78229	78240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014533	AAGCTT	2	12	100223	100234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014533	ACAGCA	2	12	127164	127175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014533	ATAACT	2	12	129749	129760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014533	AGTATT	2	12	134831	134842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014533	TGAGTT	2	12	166870	166881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014533	AATTTT	2	12	182618	182629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014533	CTTTCC	2	12	206314	206325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014533	CAGCTA	2	12	228001	228012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014533	TTTTAA	2	12	261876	261887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014533	CCCCTT	2	12	262021	262032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014533	TAATTA	2	12	262191	262202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014533	AAATCC	2	12	272118	272129	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014533	AATCAG	2	12	273849	273860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014533	CTCAAG	2	12	297450	297461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014533	TGTTTT	2	12	319910	319921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014533	TCAATT	2	12	363152	363163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014533	TTTCCC	2	12	450141	450152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014533	TGATAA	2	12	491432	491443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014533	ATTTTA	2	12	503007	503018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014533	AAGAAT	2	12	510171	510182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014533	TAATTG	2	12	524105	524116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014533	TTTAAA	2	12	524172	524183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014533	CGGTTT	2	12	526116	526127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014533	GCTTAT	2	12	527865	527876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014533	TCTGTT	2	12	531467	531478	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014533	TGGCTC	2	12	533326	533337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014533	CTATTT	2	12	534222	534233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014533	TTACAC	2	12	600481	600492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014533	CTGATG	2	12	618011	618022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014533	TGTAAC	2	12	636146	636157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014533	GAGTAA	2	12	636746	636757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014533	GAATAA	2	12	636758	636769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014533	AAAAAC	2	12	646919	646930	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014533	AAATCC	2	12	696657	696668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014533	GTAAAA	2	12	732867	732878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014533	ATTAAG	2	12	736182	736193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014533	ATCTTT	2	12	748072	748083	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014533	ATATTT	2	12	755361	755372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014533	CGAGAC	2	12	757692	757703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014533	AATGTA	2	12	761058	761069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014533	GTCCAA	2	12	761760	761771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014533	ATTTTT	2	12	768345	768356	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014533	GTTGCT	2	12	768555	768566	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014533	TGGATT	2	12	788144	788155	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014533	ATAACT	2	12	788425	788436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014533	CGGTTT	2	12	799121	799132	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014533	GCTTAT	2	12	800870	800881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014533	GAGGAA	2	12	821690	821701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014533	CCATAA	2	12	832259	832270	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014533	TAGATA	2	12	832857	832868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014533	TTCTCA	2	12	861548	861559	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014533	ACTAAT	2	12	879168	879179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.