MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	GTTCAA	2	12	2554	2565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591952
2	NC_014533	ATCGTC	2	12	5970	5981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307591953
3	NC_014533	AAAGAC	2	12	7029	7040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307591953
4	NC_014533	AATGCC	2	12	10667	10678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307591954
5	NC_014533	GTTATA	2	12	18992	19003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307591957
6	NC_014533	TCTGAA	2	12	27338	27349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591960
7	NC_014533	TTCCGC	2	12	32393	32404	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307591965
8	NC_014533	GTTATT	2	12	33279	33290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591965
9	NC_014533	ATCATT	2	12	35997	36008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591965
10	NC_014533	TTTCTC	2	12	37458	37469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591965
11	NC_014533	ACTGAT	2	12	37786	37797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591965
12	NC_014533	TAACCC	2	12	38121	38132	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307591965
13	NC_014533	AAGATA	2	12	39078	39089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307591965
14	NC_014533	TCCCAT	2	12	48661	48672	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307591971
15	NC_014533	AGGAAT	2	12	49688	49699	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307591972
16	NC_014533	GGTTTG	2	12	50322	50333	0 %	50 %	50 %	0 %	307591973
17	NC_014533	TGTTTC	2	12	53573	53584	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307591974
18	NC_014533	TCGCCT	2	12	56979	56990	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307591976
19	NC_014533	ATTCTC	2	12	60377	60388	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591978
20	NC_014533	CTAATT	2	12	61657	61668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307591980
21	NC_014533	TCTGCT	2	12	62940	62951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307591980
22	NC_014533	ATTGAC	2	12	63840	63851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307591980
23	NC_014533	ACCGCC	2	12	66543	66554	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307591983
24	NC_014533	ACTGCT	2	12	69809	69820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307591985
25	NC_014533	CCTACA	2	12	72285	72296	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307591987
26	NC_014533	TTTGGG	2	12	73990	74001	0 %	50 %	50 %	0 %	307591988
27	NC_014533	TTCTTT	2	12	83557	83568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307591996
28	NC_014533	TTGAAT	2	12	86140	86151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307591999
29	NC_014533	TAATCC	2	12	88159	88170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592000
30	NC_014533	CTCCAC	2	12	89215	89226	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	307592002
31	NC_014533	AAAAAG	2	12	90527	90538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307592003
32	NC_014533	ATATTA	2	12	101535	101546	50 %	50 %	0 %	0 %	307592009
33	NC_014533	TTAATT	2	12	102690	102701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592009
34	NC_014533	ATTTTA	2	12	104496	104507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592009
35	NC_014533	TGATTT	2	12	106633	106644	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307592009
36	NC_014533	TTTGAT	2	12	106784	106795	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307592009
37	NC_014533	AGGAGA	2	12	108337	108348	50 %	0 %	50 %	0 %	307592009
38	NC_014533	AATTGA	2	12	108619	108630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307592009
39	NC_014533	ATGCTG	2	12	112540	112551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307592010
40	NC_014533	CGTTAT	2	12	117572	117583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592015
41	NC_014533	AGGTAA	2	12	119088	119099	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592017
42	NC_014533	CAAACT	2	12	119497	119508	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307592017
43	NC_014533	GATAAC	2	12	127782	127793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307592024
44	NC_014533	TCTAAA	2	12	129149	129160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307592024
45	NC_014533	TTTAAA	2	12	131103	131114	50 %	50 %	0 %	0 %	307592026
46	NC_014533	CGGCTC	2	12	139184	139195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307592035
47	NC_014533	CTGCAC	2	12	139640	139651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307592035
48	NC_014533	GCACCA	2	12	140374	140385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307592035
49	NC_014533	TAGCAT	2	12	143210	143221	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592035
50	NC_014533	TAATTT	2	12	143417	143428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592035
51	NC_014533	TAGGCT	2	12	143994	144005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307592035
52	NC_014533	ACTTCT	2	12	152554	152565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307592043
53	NC_014533	TTTTAG	2	12	153521	153532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307592043
54	NC_014533	ATTTTT	2	12	153723	153734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307592043
55	NC_014533	AAACTA	2	12	155257	155268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307592045
56	NC_014533	AGGTTT	2	12	155337	155348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307592045
57	NC_014533	TTAAGT	2	12	156892	156903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307592047
58	NC_014533	CCTCTA	2	12	158061	158072	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307592048
59	NC_014533	TAAAAT	2	12	159268	159279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592049
60	NC_014533	GTAGCC	2	12	162308	162319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307592050
61	NC_014533	GCAGAA	2	12	169160	169171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307592054
62	NC_014533	ACAAGA	2	12	175431	175442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307592059
63	NC_014533	ATTTAG	2	12	175493	175504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307592059
64	NC_014533	TAGGAT	2	12	178381	178392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592062
65	NC_014533	TGAAGA	2	12	181231	181242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592064
66	NC_014533	TGGAAA	2	12	190079	190090	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592072
67	NC_014533	CAACAT	2	12	195370	195381	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307592077
68	NC_014533	TTCCTT	2	12	195829	195840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592077
69	NC_014533	ATCTAT	2	12	195986	195997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307592077
70	NC_014533	TCTCCA	2	12	195999	196010	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307592077
71	NC_014533	GCTTTT	2	12	197684	197695	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307592077
72	NC_014533	AAATAT	2	12	198112	198123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592077
73	NC_014533	TTTGAG	2	12	204191	204202	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307592081
74	NC_014533	ATAGCT	2	12	208306	208317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592084
75	NC_014533	ATGGAG	2	12	208360	208371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307592084
76	NC_014533	TATCAA	2	12	208449	208460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307592084
77	NC_014533	CTACAC	2	12	209051	209062	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307592084
78	NC_014533	TTTTTG	2	12	213323	213334	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	307592086
79	NC_014533	GTGAAC	2	12	215368	215379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307592090
80	NC_014533	ATGCTT	2	12	225990	226001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592099
81	NC_014533	TCCTTT	2	12	226483	226494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592100
82	NC_014533	TAGCTT	2	12	232083	232094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592105
83	NC_014533	GTGCTT	2	12	232935	232946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307592105
84	NC_014533	TGTTGC	2	12	234576	234587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307592107
85	NC_014533	AATACC	2	12	234596	234607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307592107
86	NC_014533	TTGAGG	2	12	234679	234690	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307592107
87	NC_014533	GAATAA	2	12	234745	234756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307592107
88	NC_014533	AATACT	2	12	241661	241672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307592112
89	NC_014533	ATGCTA	2	12	243266	243277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592113
90	NC_014533	GTTCTA	2	12	243784	243795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592113
91	NC_014533	ATAGAG	2	12	249053	249064	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592115
92	NC_014533	CATAAG	2	12	249438	249449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307592115
93	NC_014533	AAAGTT	2	12	249729	249740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307592116
94	NC_014533	TTTGAC	2	12	253977	253988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592118
95	NC_014533	CTAGAA	2	12	255884	255895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307592119
96	NC_014533	CATCGT	2	12	256172	256183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307592119
97	NC_014533	GAAATT	2	12	257501	257512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307592120
98	NC_014533	TCAAGG	2	12	260824	260835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307592123
99	NC_014533	ACAAAT	2	12	261842	261853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307592124
100	NC_014533	TGAACA	2	12	263088	263099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307592125
101	NC_014533	CCACTA	2	12	268601	268612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307592129
102	NC_014533	GGCAAT	2	12	270123	270134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307592130
103	NC_014533	TTAATA	2	12	275300	275311	50 %	50 %	0 %	0 %	307592131
104	NC_014533	TACCCA	2	12	278358	278369	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307592134
105	NC_014533	AGAATT	2	12	287107	287118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307592139
106	NC_014533	AGAACA	2	12	292594	292605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307592143
107	NC_014533	CGTCTC	2	12	299525	299536	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307592147
108	NC_014533	GAAGCA	2	12	299837	299848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307592147
109	NC_014533	ACAAGA	2	12	300977	300988	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307592148
110	NC_014533	ATGCTA	2	12	302286	302297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592149
111	NC_014533	ACAAGA	2	12	303393	303404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307592150
112	NC_014533	TGAAGA	2	12	308984	308995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592156
113	NC_014533	TTCTGT	2	12	309510	309521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307592157
114	NC_014533	AGCATC	2	12	311115	311126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307592159
115	NC_014533	CTAAAT	2	12	311396	311407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307592159
116	NC_014533	CGCTTT	2	12	311409	311420	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307592159
117	NC_014533	GCTTGA	2	12	311956	311967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307592159
118	NC_014533	GGGCAG	2	12	312080	312091	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	307592159
119	NC_014533	CCCCAT	2	12	317670	317681	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	307592164
120	NC_014533	ATGACC	2	12	319160	319171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307592165
121	NC_014533	TTTGAC	2	12	321455	321466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592166
122	NC_014533	TTGATA	2	12	322016	322027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307592167
123	NC_014533	ATGACC	2	12	323018	323029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307592167
124	NC_014533	TCCTTG	2	12	326470	326481	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307592169
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126	NC_014533	GGATTT	2	12	328511	328522	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307592169
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138	NC_014533	TTTAAA	2	12	351854	351865	50 %	50 %	0 %	0 %	307592185
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220	NC_014533	AACCCC	2	12	556720	556731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592303
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222	NC_014533	ATAATG	2	12	558224	558235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307592304
223	NC_014533	AACAAT	2	12	564610	564621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307592309
224	NC_014533	CTAACC	2	12	567917	567928	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307592311
225	NC_014533	TTAGCG	2	12	568204	568215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307592311
226	NC_014533	CGCTTG	2	12	569271	569282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592311
227	NC_014533	CTGTTT	3	18	569777	569794	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307592311
228	NC_014533	CTGTTG	2	12	569846	569857	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307592311
229	NC_014533	AATACC	2	12	570096	570107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307592311
230	NC_014533	AAAGGC	2	12	573713	573724	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307592313
231	NC_014533	AAACTA	2	12	573841	573852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307592314
232	NC_014533	ACCCCA	2	12	577183	577194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592319
233	NC_014533	CTCCAT	2	12	579918	579929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307592321
234	NC_014533	ACTGTA	2	12	580635	580646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307592321
235	NC_014533	GAAAAT	2	12	581541	581552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307592321
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330	NC_014533	TTTAAA	2	12	789372	789383	50 %	50 %	0 %	0 %	307592425
331	NC_014533	GAAATG	2	12	790895	790906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307592426
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343	NC_014533	ATAAAG	2	12	833221	833232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307592461
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345	NC_014533	ATTTGG	2	12	834275	834286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307592461
346	NC_014533	ATTTTC	2	12	835758	835769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307592463
347	NC_014533	ATTCCC	2	12	838071	838082	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307592465
348	NC_014533	AAGATA	2	12	840320	840331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307592465
349	NC_014533	AAGCTA	2	12	849707	849718	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307592472
350	NC_014533	CTGTAC	2	12	851131	851142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307592473
351	NC_014533	CTGACT	2	12	853186	853197	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307592474
352	NC_014533	TGGTTA	2	12	854922	854933	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307592475
353	NC_014533	CCCGAA	2	12	855478	855489	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307592475
354	NC_014533	AGCGTG	2	12	857906	857917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307592476
355	NC_014533	GGCATC	2	12	861210	861221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307592482
356	NC_014533	TGATTC	2	12	863064	863075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307592483

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.