MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	GGCTT	2	10	346	355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014533	AGCGA	2	10	1896	1905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014533	AAATA	2	10	2600	2609	80 %	20 %	0 %	0 %	307591952
4	NC_014533	TTCGC	2	10	7822	7831	0 %	40 %	20 %	40 %	307591953
5	NC_014533	TTTGC	2	10	9601	9610	0 %	60 %	20 %	20 %	307591954
6	NC_014533	CGGGT	2	10	11395	11404	0 %	20 %	60 %	20 %	307591954
7	NC_014533	TCAAA	2	10	15508	15517	60 %	20 %	0 %	20 %	307591956
8	NC_014533	TGATT	2	10	18879	18888	20 %	60 %	20 %	0 %	307591957
9	NC_014533	TGCCG	2	10	22895	22904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014533	CAAAT	2	10	23995	24004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014533	GTTTA	2	10	26261	26270	20 %	60 %	20 %	0 %	307591958
12	NC_014533	TACAT	2	10	26925	26934	40 %	40 %	0 %	20 %	307591959
13	NC_014533	ACTTT	2	10	28247	28256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014533	ACATG	2	10	28882	28891	40 %	20 %	20 %	20 %	307591962
15	NC_014533	TAAAA	2	10	29140	29149	80 %	20 %	0 %	0 %	307591963
16	NC_014533	AAATT	2	10	31185	31194	60 %	40 %	0 %	0 %	307591964
17	NC_014533	AATTA	2	10	31617	31626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014533	CGATG	2	10	31845	31854	20 %	20 %	40 %	20 %	307591965
19	NC_014533	TAAAT	2	10	34309	34318	60 %	40 %	0 %	0 %	307591965
20	NC_014533	TAAAT	2	10	34672	34681	60 %	40 %	0 %	0 %	307591965
21	NC_014533	AGTTA	2	10	36060	36069	40 %	40 %	20 %	0 %	307591965
22	NC_014533	AGTTA	2	10	36756	36765	40 %	40 %	20 %	0 %	307591965
23	NC_014533	GTTTC	2	10	45696	45705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014533	GCAAA	2	10	46908	46917	60 %	0 %	20 %	20 %	307591968
25	NC_014533	CTTTC	2	10	49360	49369	0 %	60 %	0 %	40 %	307591971
26	NC_014533	TGACT	2	10	50429	50438	20 %	40 %	20 %	20 %	307591973
27	NC_014533	AAAAG	2	10	51998	52007	80 %	0 %	20 %	0 %	307591974
28	NC_014533	AAAAG	2	10	52146	52155	80 %	0 %	20 %	0 %	307591974
29	NC_014533	AAAGC	2	10	54340	54349	60 %	0 %	20 %	20 %	307591975
30	NC_014533	ATTTA	2	10	54419	54428	40 %	60 %	0 %	0 %	307591975
31	NC_014533	TAAAA	2	10	55187	55196	80 %	20 %	0 %	0 %	307591975
32	NC_014533	TTAAG	2	10	60729	60738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014533	AACTC	2	10	60933	60942	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014533	TAATT	2	10	61150	61159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014533	ATTTA	2	10	61174	61183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014533	CCAAC	2	10	62426	62435	40 %	0 %	0 %	60 %	307591980
37	NC_014533	AGTCC	2	10	63080	63089	20 %	20 %	20 %	40 %	307591980
38	NC_014533	GGCTA	2	10	68951	68960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014533	ATTTA	2	10	69109	69118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014533	TTGAA	2	10	70901	70910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014533	AATTG	2	10	71096	71105	40 %	40 %	20 %	0 %	307591986
42	NC_014533	TTTTC	2	10	71968	71977	0 %	80 %	0 %	20 %	307591987
43	NC_014533	CAGCG	2	10	72034	72043	20 %	0 %	40 %	40 %	307591987
44	NC_014533	TAATT	2	10	72923	72932	40 %	60 %	0 %	0 %	307591988
45	NC_014533	AAATA	2	10	74225	74234	80 %	20 %	0 %	0 %	307591988
46	NC_014533	TCTTT	2	10	74503	74512	0 %	80 %	0 %	20 %	307591988
47	NC_014533	AAAAG	2	10	74712	74721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014533	ATTTT	2	10	74762	74771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014533	TGCAC	2	10	76978	76987	20 %	20 %	20 %	40 %	307591991
50	NC_014533	TAATC	2	10	77677	77686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014533	GATAG	2	10	79108	79117	40 %	20 %	40 %	0 %	307591992
52	NC_014533	ATTTG	2	10	82149	82158	20 %	60 %	20 %	0 %	307591995
53	NC_014533	TTAAA	2	10	84350	84359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014533	TGAAA	2	10	84507	84516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014533	TAAAA	2	10	84530	84539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014533	CGTTA	2	10	85094	85103	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014533	ATATT	2	10	85436	85445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014533	GTTAA	2	10	86715	86724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014533	TCCAG	2	10	87968	87977	20 %	20 %	20 %	40 %	307592000
60	NC_014533	ATTTT	2	10	88383	88392	20 %	80 %	0 %	0 %	307592000
61	NC_014533	ACAAA	2	10	90448	90457	80 %	0 %	0 %	20 %	307592003
62	NC_014533	CCCAT	2	10	91503	91512	20 %	20 %	0 %	60 %	307592003
63	NC_014533	GTTTT	2	10	94101	94110	0 %	80 %	20 %	0 %	307592007
64	NC_014533	GGCAA	2	10	95115	95124	40 %	0 %	40 %	20 %	307592007
65	NC_014533	CTTCG	2	10	95794	95803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014533	AGTTT	2	10	96472	96481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014533	GGCAA	2	10	97511	97520	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014533	AGAAA	2	10	97669	97678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014533	GGTAA	2	10	97779	97788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014533	TAGTT	2	10	98364	98373	20 %	60 %	20 %	0 %	307592008
71	NC_014533	TTTGA	2	10	100528	100537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014533	ATTAA	2	10	100546	100555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014533	TCCAA	2	10	101753	101762	40 %	20 %	0 %	40 %	307592009
74	NC_014533	TTAAT	2	10	102819	102828	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
75	NC_014533	TTTAG	2	10	103187	103196	20 %	60 %	20 %	0 %	307592009
76	NC_014533	TAATA	2	10	104518	104527	60 %	40 %	0 %	0 %	307592009
77	NC_014533	GGAAA	2	10	104607	104616	60 %	0 %	40 %	0 %	307592009
78	NC_014533	AATAA	2	10	104708	104717	80 %	20 %	0 %	0 %	307592009
79	NC_014533	AATTT	2	10	105008	105017	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
80	NC_014533	AAATT	2	10	106371	106380	60 %	40 %	0 %	0 %	307592009
81	NC_014533	ACTTT	2	10	106617	106626	20 %	60 %	0 %	20 %	307592009
82	NC_014533	TAATT	2	10	107137	107146	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
83	NC_014533	ACGAT	2	10	110224	110233	40 %	20 %	20 %	20 %	307592010
84	NC_014533	ATATT	2	10	110254	110263	40 %	60 %	0 %	0 %	307592010
85	NC_014533	ATGAT	2	10	111037	111046	40 %	40 %	20 %	0 %	307592010
86	NC_014533	CCTTG	2	10	113561	113570	0 %	40 %	20 %	40 %	307592011
87	NC_014533	TGTGG	2	10	115685	115694	0 %	40 %	60 %	0 %	307592014
88	NC_014533	GTAAA	2	10	116909	116918	60 %	20 %	20 %	0 %	307592015
89	NC_014533	ATTTA	2	10	118894	118903	40 %	60 %	0 %	0 %	307592016
90	NC_014533	TTTAG	2	10	119803	119812	20 %	60 %	20 %	0 %	307592017
91	NC_014533	ACCAG	2	10	119910	119919	40 %	0 %	20 %	40 %	307592017
92	NC_014533	AATTT	2	10	120593	120602	40 %	60 %	0 %	0 %	307592017
93	NC_014533	CTTCC	2	10	125149	125158	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014533	ATGAT	2	10	125612	125621	40 %	40 %	20 %	0 %	307592022
95	NC_014533	GAATT	2	10	131389	131398	40 %	40 %	20 %	0 %	307592026
96	NC_014533	TACCC	2	10	132196	132205	20 %	20 %	0 %	60 %	307592028
97	NC_014533	TATAA	2	10	135711	135720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014533	GGTCA	2	10	136892	136901	20 %	20 %	40 %	20 %	307592033
99	NC_014533	TTTGA	2	10	139226	139235	20 %	60 %	20 %	0 %	307592035
100	NC_014533	ATTTA	2	10	142773	142782	40 %	60 %	0 %	0 %	307592035
101	NC_014533	TTTGA	2	10	143496	143505	20 %	60 %	20 %	0 %	307592035
102	NC_014533	AAATT	2	10	143510	143519	60 %	40 %	0 %	0 %	307592035
103	NC_014533	TTATT	2	10	143951	143960	20 %	80 %	0 %	0 %	307592035
104	NC_014533	TAATT	2	10	144537	144546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014533	CCGTC	2	10	145269	145278	0 %	20 %	20 %	60 %	307592036
106	NC_014533	GAAAA	2	10	147229	147238	80 %	0 %	20 %	0 %	307592038
107	NC_014533	AGTTA	2	10	147398	147407	40 %	40 %	20 %	0 %	307592038
108	NC_014533	AAGCA	2	10	148213	148222	60 %	0 %	20 %	20 %	307592039
109	NC_014533	TGTTA	2	10	151161	151170	20 %	60 %	20 %	0 %	307592040
110	NC_014533	CAATC	2	10	151217	151226	40 %	20 %	0 %	40 %	307592040
111	NC_014533	ATTTT	2	10	151280	151289	20 %	80 %	0 %	0 %	307592040
112	NC_014533	AAAAC	2	10	151546	151555	80 %	0 %	0 %	20 %	307592040
113	NC_014533	ATTGT	2	10	152917	152926	20 %	60 %	20 %	0 %	307592043
114	NC_014533	TGTGG	2	10	153220	153229	0 %	40 %	60 %	0 %	307592043
115	NC_014533	TTTTA	2	10	154151	154160	20 %	80 %	0 %	0 %	307592044
116	NC_014533	ATTTA	2	10	155644	155653	40 %	60 %	0 %	0 %	307592045
117	NC_014533	TAAAA	2	10	155694	155703	80 %	20 %	0 %	0 %	307592046
118	NC_014533	AGTTA	2	10	156371	156380	40 %	40 %	20 %	0 %	307592046
119	NC_014533	TTTAT	2	10	158986	158995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014533	GGATC	2	10	159418	159427	20 %	20 %	40 %	20 %	307592049
121	NC_014533	ATATT	2	10	160913	160922	40 %	60 %	0 %	0 %	307592050
122	NC_014533	AAATA	2	10	161089	161098	80 %	20 %	0 %	0 %	307592050
123	NC_014533	TAACT	2	10	163343	163352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014533	GAAAA	2	10	164010	164019	80 %	0 %	20 %	0 %	307592051
125	NC_014533	AGTTA	2	10	164179	164188	40 %	40 %	20 %	0 %	307592051
126	NC_014533	CTCAA	2	10	165876	165885	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014533	TCCTC	2	10	166280	166289	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014533	ATAAA	2	10	168461	168470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014533	TAGTT	2	10	168592	168601	20 %	60 %	20 %	0 %	307592054
130	NC_014533	AATTT	2	10	169848	169857	40 %	60 %	0 %	0 %	307592054
131	NC_014533	CTTTT	2	10	172610	172619	0 %	80 %	0 %	20 %	307592056
132	NC_014533	TAATT	2	10	174984	174993	40 %	60 %	0 %	0 %	307592059
133	NC_014533	TTGGA	2	10	176138	176147	20 %	40 %	40 %	0 %	307592060
134	NC_014533	AGTCA	2	10	177666	177675	40 %	20 %	20 %	20 %	307592062
135	NC_014533	CGCAG	2	10	178680	178689	20 %	0 %	40 %	40 %	307592062
136	NC_014533	TAATT	2	10	181174	181183	40 %	60 %	0 %	0 %	307592064
137	NC_014533	AAAAT	2	10	181645	181654	80 %	20 %	0 %	0 %	307592065
138	NC_014533	TTTGG	2	10	182257	182266	0 %	60 %	40 %	0 %	307592065
139	NC_014533	ATTAA	2	10	184444	184453	60 %	40 %	0 %	0 %	307592067
140	NC_014533	AGAAA	2	10	186053	186062	80 %	0 %	20 %	0 %	307592068
141	NC_014533	GTCTT	2	10	189902	189911	0 %	60 %	20 %	20 %	307592072
142	NC_014533	ATTAA	2	10	190985	190994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014533	TGGAT	2	10	191344	191353	20 %	40 %	40 %	0 %	307592073
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151	NC_014533	ATAAA	2	10	199180	199189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014533	TGGTT	2	10	201300	201309	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014533	TAAAA	2	10	231571	231580	80 %	20 %	0 %	0 %	307592105
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183	NC_014533	ATATA	2	10	247445	247454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_014533	AGTTT	2	10	334564	334573	20 %	60 %	20 %	0 %	307592173
252	NC_014533	TTTAA	2	10	335828	335837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014533	TTATA	2	10	337110	337119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_014533	GAAGC	2	10	337303	337312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
255	NC_014533	TGGTT	2	10	339436	339445	0 %	60 %	40 %	0 %	307592178
256	NC_014533	TAGCG	2	10	340250	340259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_014533	TAGCG	2	10	340281	340290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
258	NC_014533	TAGCG	2	10	340312	340321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_014533	AATCT	2	10	341843	341852	40 %	40 %	0 %	20 %	307592179
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262	NC_014533	TTCTC	2	10	344687	344696	0 %	60 %	0 %	40 %	307592181
263	NC_014533	TAAAT	2	10	344709	344718	60 %	40 %	0 %	0 %	307592181
264	NC_014533	TTTTG	2	10	346245	346254	0 %	80 %	20 %	0 %	307592182
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267	NC_014533	ATTAA	2	10	347140	347149	60 %	40 %	0 %	0 %	307592183
268	NC_014533	TTTCC	2	10	348994	349003	0 %	60 %	0 %	40 %	307592184
269	NC_014533	TAAGG	2	10	349266	349275	40 %	20 %	40 %	0 %	307592184
270	NC_014533	TTCAG	2	10	350756	350765	20 %	40 %	20 %	20 %	307592185
271	NC_014533	AATTA	2	10	352375	352384	60 %	40 %	0 %	0 %	307592185
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