MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 467

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	AAATA	2	10	2600	2609	80 %	20 %	0 %	0 %	307591952
2	NC_014533	TTCGC	2	10	7822	7831	0 %	40 %	20 %	40 %	307591953
3	NC_014533	TTTGC	2	10	9601	9610	0 %	60 %	20 %	20 %	307591954
4	NC_014533	CGGGT	2	10	11395	11404	0 %	20 %	60 %	20 %	307591954
5	NC_014533	TCAAA	2	10	15508	15517	60 %	20 %	0 %	20 %	307591956
6	NC_014533	TGATT	2	10	18879	18888	20 %	60 %	20 %	0 %	307591957
7	NC_014533	GTTTA	2	10	26261	26270	20 %	60 %	20 %	0 %	307591958
8	NC_014533	TACAT	2	10	26925	26934	40 %	40 %	0 %	20 %	307591959
9	NC_014533	ACATG	2	10	28882	28891	40 %	20 %	20 %	20 %	307591962
10	NC_014533	TAAAA	2	10	29140	29149	80 %	20 %	0 %	0 %	307591963
11	NC_014533	AAATT	2	10	31185	31194	60 %	40 %	0 %	0 %	307591964
12	NC_014533	CGATG	2	10	31845	31854	20 %	20 %	40 %	20 %	307591965
13	NC_014533	TAAAT	2	10	34309	34318	60 %	40 %	0 %	0 %	307591965
14	NC_014533	TAAAT	2	10	34672	34681	60 %	40 %	0 %	0 %	307591965
15	NC_014533	AGTTA	2	10	36060	36069	40 %	40 %	20 %	0 %	307591965
16	NC_014533	AGTTA	2	10	36756	36765	40 %	40 %	20 %	0 %	307591965
17	NC_014533	GCAAA	2	10	46908	46917	60 %	0 %	20 %	20 %	307591968
18	NC_014533	CTTTC	2	10	49360	49369	0 %	60 %	0 %	40 %	307591971
19	NC_014533	TGACT	2	10	50429	50438	20 %	40 %	20 %	20 %	307591973
20	NC_014533	AAAAG	2	10	51998	52007	80 %	0 %	20 %	0 %	307591974
21	NC_014533	AAAAG	2	10	52146	52155	80 %	0 %	20 %	0 %	307591974
22	NC_014533	AAAGC	2	10	54340	54349	60 %	0 %	20 %	20 %	307591975
23	NC_014533	ATTTA	2	10	54419	54428	40 %	60 %	0 %	0 %	307591975
24	NC_014533	TAAAA	2	10	55187	55196	80 %	20 %	0 %	0 %	307591975
25	NC_014533	CCAAC	2	10	62426	62435	40 %	0 %	0 %	60 %	307591980
26	NC_014533	AGTCC	2	10	63080	63089	20 %	20 %	20 %	40 %	307591980
27	NC_014533	AATTG	2	10	71096	71105	40 %	40 %	20 %	0 %	307591986
28	NC_014533	TTTTC	2	10	71968	71977	0 %	80 %	0 %	20 %	307591987
29	NC_014533	CAGCG	2	10	72034	72043	20 %	0 %	40 %	40 %	307591987
30	NC_014533	TAATT	2	10	72923	72932	40 %	60 %	0 %	0 %	307591988
31	NC_014533	AAATA	2	10	74225	74234	80 %	20 %	0 %	0 %	307591988
32	NC_014533	TCTTT	2	10	74503	74512	0 %	80 %	0 %	20 %	307591988
33	NC_014533	TGCAC	2	10	76978	76987	20 %	20 %	20 %	40 %	307591991
34	NC_014533	GATAG	2	10	79108	79117	40 %	20 %	40 %	0 %	307591992
35	NC_014533	ATTTG	2	10	82149	82158	20 %	60 %	20 %	0 %	307591995
36	NC_014533	TCCAG	2	10	87968	87977	20 %	20 %	20 %	40 %	307592000
37	NC_014533	ATTTT	2	10	88383	88392	20 %	80 %	0 %	0 %	307592000
38	NC_014533	ACAAA	2	10	90448	90457	80 %	0 %	0 %	20 %	307592003
39	NC_014533	CCCAT	2	10	91503	91512	20 %	20 %	0 %	60 %	307592003
40	NC_014533	GTTTT	2	10	94101	94110	0 %	80 %	20 %	0 %	307592007
41	NC_014533	GGCAA	2	10	95115	95124	40 %	0 %	40 %	20 %	307592007
42	NC_014533	TAGTT	2	10	98364	98373	20 %	60 %	20 %	0 %	307592008
43	NC_014533	TCCAA	2	10	101753	101762	40 %	20 %	0 %	40 %	307592009
44	NC_014533	TTAAT	2	10	102819	102828	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
45	NC_014533	TTTAG	2	10	103187	103196	20 %	60 %	20 %	0 %	307592009
46	NC_014533	TAATA	2	10	104518	104527	60 %	40 %	0 %	0 %	307592009
47	NC_014533	GGAAA	2	10	104607	104616	60 %	0 %	40 %	0 %	307592009
48	NC_014533	AATAA	2	10	104708	104717	80 %	20 %	0 %	0 %	307592009
49	NC_014533	AATTT	2	10	105008	105017	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
50	NC_014533	AAATT	2	10	106371	106380	60 %	40 %	0 %	0 %	307592009
51	NC_014533	ACTTT	2	10	106617	106626	20 %	60 %	0 %	20 %	307592009
52	NC_014533	TAATT	2	10	107137	107146	40 %	60 %	0 %	0 %	307592009
53	NC_014533	ACGAT	2	10	110224	110233	40 %	20 %	20 %	20 %	307592010
54	NC_014533	ATATT	2	10	110254	110263	40 %	60 %	0 %	0 %	307592010
55	NC_014533	ATGAT	2	10	111037	111046	40 %	40 %	20 %	0 %	307592010
56	NC_014533	CCTTG	2	10	113561	113570	0 %	40 %	20 %	40 %	307592011
57	NC_014533	TGTGG	2	10	115685	115694	0 %	40 %	60 %	0 %	307592014
58	NC_014533	GTAAA	2	10	116909	116918	60 %	20 %	20 %	0 %	307592015
59	NC_014533	ATTTA	2	10	118894	118903	40 %	60 %	0 %	0 %	307592016
60	NC_014533	TTTAG	2	10	119803	119812	20 %	60 %	20 %	0 %	307592017
61	NC_014533	ACCAG	2	10	119910	119919	40 %	0 %	20 %	40 %	307592017
62	NC_014533	AATTT	2	10	120593	120602	40 %	60 %	0 %	0 %	307592017
63	NC_014533	ATGAT	2	10	125612	125621	40 %	40 %	20 %	0 %	307592022
64	NC_014533	GAATT	2	10	131389	131398	40 %	40 %	20 %	0 %	307592026
65	NC_014533	TACCC	2	10	132196	132205	20 %	20 %	0 %	60 %	307592028
66	NC_014533	GGTCA	2	10	136892	136901	20 %	20 %	40 %	20 %	307592033
67	NC_014533	TTTGA	2	10	139226	139235	20 %	60 %	20 %	0 %	307592035
68	NC_014533	ATTTA	2	10	142773	142782	40 %	60 %	0 %	0 %	307592035
69	NC_014533	TTTGA	2	10	143496	143505	20 %	60 %	20 %	0 %	307592035
70	NC_014533	AAATT	2	10	143510	143519	60 %	40 %	0 %	0 %	307592035
71	NC_014533	TTATT	2	10	143951	143960	20 %	80 %	0 %	0 %	307592035
72	NC_014533	CCGTC	2	10	145269	145278	0 %	20 %	20 %	60 %	307592036
73	NC_014533	GAAAA	2	10	147229	147238	80 %	0 %	20 %	0 %	307592038
74	NC_014533	AGTTA	2	10	147398	147407	40 %	40 %	20 %	0 %	307592038
75	NC_014533	AAGCA	2	10	148213	148222	60 %	0 %	20 %	20 %	307592039
76	NC_014533	TGTTA	2	10	151161	151170	20 %	60 %	20 %	0 %	307592040
77	NC_014533	CAATC	2	10	151217	151226	40 %	20 %	0 %	40 %	307592040
78	NC_014533	ATTTT	2	10	151280	151289	20 %	80 %	0 %	0 %	307592040
79	NC_014533	AAAAC	2	10	151546	151555	80 %	0 %	0 %	20 %	307592040
80	NC_014533	ATTGT	2	10	152917	152926	20 %	60 %	20 %	0 %	307592043
81	NC_014533	TGTGG	2	10	153220	153229	0 %	40 %	60 %	0 %	307592043
82	NC_014533	TTTTA	2	10	154151	154160	20 %	80 %	0 %	0 %	307592044
83	NC_014533	ATTTA	2	10	155644	155653	40 %	60 %	0 %	0 %	307592045
84	NC_014533	TAAAA	2	10	155694	155703	80 %	20 %	0 %	0 %	307592046
85	NC_014533	AGTTA	2	10	156371	156380	40 %	40 %	20 %	0 %	307592046
86	NC_014533	GGATC	2	10	159418	159427	20 %	20 %	40 %	20 %	307592049
87	NC_014533	ATATT	2	10	160913	160922	40 %	60 %	0 %	0 %	307592050
88	NC_014533	AAATA	2	10	161089	161098	80 %	20 %	0 %	0 %	307592050
89	NC_014533	GAAAA	2	10	164010	164019	80 %	0 %	20 %	0 %	307592051
90	NC_014533	AGTTA	2	10	164179	164188	40 %	40 %	20 %	0 %	307592051
91	NC_014533	TAGTT	2	10	168592	168601	20 %	60 %	20 %	0 %	307592054
92	NC_014533	AATTT	2	10	169848	169857	40 %	60 %	0 %	0 %	307592054
93	NC_014533	CTTTT	2	10	172610	172619	0 %	80 %	0 %	20 %	307592056
94	NC_014533	TAATT	2	10	174984	174993	40 %	60 %	0 %	0 %	307592059
95	NC_014533	TTGGA	2	10	176138	176147	20 %	40 %	40 %	0 %	307592060
96	NC_014533	AGTCA	2	10	177666	177675	40 %	20 %	20 %	20 %	307592062
97	NC_014533	CGCAG	2	10	178680	178689	20 %	0 %	40 %	40 %	307592062
98	NC_014533	TAATT	2	10	181174	181183	40 %	60 %	0 %	0 %	307592064
99	NC_014533	AAAAT	2	10	181645	181654	80 %	20 %	0 %	0 %	307592065
100	NC_014533	TTTGG	2	10	182257	182266	0 %	60 %	40 %	0 %	307592065
101	NC_014533	ATTAA	2	10	184444	184453	60 %	40 %	0 %	0 %	307592067
102	NC_014533	AGAAA	2	10	186053	186062	80 %	0 %	20 %	0 %	307592068
103	NC_014533	GTCTT	2	10	189902	189911	0 %	60 %	20 %	20 %	307592072
104	NC_014533	TGGAT	2	10	191344	191353	20 %	40 %	40 %	0 %	307592073
105	NC_014533	TTATG	2	10	191875	191884	20 %	60 %	20 %	0 %	307592073
106	NC_014533	CGAAA	2	10	192536	192545	60 %	0 %	20 %	20 %	307592074
107	NC_014533	ATTTT	2	10	193597	193606	20 %	80 %	0 %	0 %	307592075
108	NC_014533	TATTG	2	10	195230	195239	20 %	60 %	20 %	0 %	307592077
109	NC_014533	TTGGC	2	10	196278	196287	0 %	40 %	40 %	20 %	307592077
110	NC_014533	AGGTA	2	10	197132	197141	40 %	20 %	40 %	0 %	307592077
111	NC_014533	ACCAA	2	10	201821	201830	60 %	0 %	0 %	40 %	307592080
112	NC_014533	AAAAT	2	10	202076	202085	80 %	20 %	0 %	0 %	307592080
113	NC_014533	GATGG	2	10	205691	205700	20 %	20 %	60 %	0 %	307592081
114	NC_014533	TAATT	2	10	209477	209486	40 %	60 %	0 %	0 %	307592084
115	NC_014533	GTAAA	2	10	211307	211316	60 %	20 %	20 %	0 %	307592085
116	NC_014533	ATACT	2	10	212405	212414	40 %	40 %	0 %	20 %	307592085
117	NC_014533	GACAG	2	10	212774	212783	40 %	0 %	40 %	20 %	307592086
118	NC_014533	ACCGA	2	10	213690	213699	40 %	0 %	20 %	40 %	307592086
119	NC_014533	AATAA	2	10	214221	214230	80 %	20 %	0 %	0 %	307592087
120	NC_014533	CTCGA	2	10	216715	216724	20 %	20 %	20 %	40 %	307592091
121	NC_014533	TAAAG	2	10	217083	217092	60 %	20 %	20 %	0 %	307592092
122	NC_014533	GTTTT	2	10	217262	217271	0 %	80 %	20 %	0 %	307592092
123	NC_014533	TTGCC	2	10	220141	220150	0 %	40 %	20 %	40 %	307592095
124	NC_014533	AACTT	2	10	224171	224180	40 %	40 %	0 %	20 %	307592097
125	NC_014533	ATATG	2	10	227381	227390	40 %	40 %	20 %	0 %	307592101
126	NC_014533	TCCAG	2	10	228805	228814	20 %	20 %	20 %	40 %	307592102
127	NC_014533	ATTAT	2	10	228855	228864	40 %	60 %	0 %	0 %	307592102
128	NC_014533	TAAAA	2	10	231571	231580	80 %	20 %	0 %	0 %	307592105
129	NC_014533	TCAAA	2	10	234985	234994	60 %	20 %	0 %	20 %	307592107
130	NC_014533	CATTT	2	10	235370	235379	20 %	60 %	0 %	20 %	307592107
131	NC_014533	AAATA	2	10	236754	236763	80 %	20 %	0 %	0 %	307592108
132	NC_014533	TAGAC	2	10	240248	240257	40 %	20 %	20 %	20 %	307592111
133	NC_014533	ATTCC	2	10	244216	244225	20 %	40 %	0 %	40 %	307592113
134	NC_014533	TAAAG	2	10	244413	244422	60 %	20 %	20 %	0 %	307592113
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136	NC_014533	ATTCC	2	10	250126	250135	20 %	40 %	0 %	40 %	307592116
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262	NC_014533	TATTT	2	10	503133	503142	20 %	80 %	0 %	0 %	307592273
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