MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	ATAA	2	8	104	111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014533	ATTA	2	8	137	144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014533	TAAA	2	8	317	324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014533	ATTT	2	8	459	466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014533	CATT	2	8	526	533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014533	TTAA	2	8	744	751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014533	TAAA	2	8	1806	1813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014533	TTGG	2	8	2111	2118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014533	AAAT	2	8	2265	2272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014533	TAAT	2	8	3601	3608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014533	TACA	2	8	13445	13452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014533	ATAA	2	8	13599	13606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014533	ATAA	2	8	17813	17820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014533	ATAA	2	8	20578	20585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014533	TACT	2	8	20683	20690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014533	GTCG	2	8	20908	20915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014533	CCTA	2	8	21044	21051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014533	CCTA	2	8	21116	21123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014533	CCTA	2	8	21196	21203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014533	CCTA	2	8	21270	21277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014533	CCTA	2	8	21344	21351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014533	CCTA	2	8	21418	21425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014533	CCTA	2	8	21492	21499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014533	CCTA	2	8	21570	21577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014533	CCTA	2	8	21646	21653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014533	CCTA	2	8	21724	21731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014533	CCTA	2	8	21797	21804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014533	CCTA	2	8	21947	21954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014533	CCTA	2	8	22026	22033	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014533	CCTA	2	8	22100	22107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014533	ATTC	2	8	22149	22156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014533	CCTA	2	8	22174	22181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014533	CCTA	2	8	22250	22257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014533	CCTA	2	8	22322	22329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014533	GAAC	2	8	22369	22376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014533	CCTA	2	8	22395	22402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014533	CCTA	2	8	22472	22479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014533	CCTA	2	8	22546	22553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014533	CCTA	2	8	22619	22626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014533	CCTA	2	8	22692	22699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014533	CCTA	2	8	22768	22775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014533	CCTA	2	8	22843	22850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014533	CCTA	2	8	22920	22927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014533	CCTA	2	8	22994	23001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014533	CCTA	2	8	23065	23072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014533	CCTA	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014533	GCGA	2	8	23178	23185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014533	CCTA	2	8	23215	23222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014533	ATTT	2	8	23358	23365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014533	TCTT	2	8	23418	23425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014533	ATAA	2	8	23500	23507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014533	CTAT	2	8	23678	23685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014533	AAAT	2	8	23766	23773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014533	TTAT	2	8	23796	23803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014533	ATCA	2	8	24227	24234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014533	AATT	2	8	24262	24269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014533	CTTA	2	8	24318	24325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014533	AAAT	2	8	24397	24404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014533	TTTA	2	8	25638	25645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014533	CTAA	2	8	27683	27690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014533	TCTA	2	8	28128	28135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014533	CTTA	2	8	28223	28230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014533	ATCA	2	8	28319	28326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014533	TAAA	2	8	31221	31228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014533	AATG	2	8	31246	31253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014533	TTTA	2	8	31482	31489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014533	TAAA	2	8	31524	31531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014533	AGTT	2	8	42214	42221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014533	TATT	2	8	42324	42331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014533	AATA	2	8	42332	42339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014533	AATA	2	8	42513	42520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014533	TCAC	2	8	43257	43264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014533	CTTA	2	8	43409	43416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014533	TTTA	2	8	43561	43568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014533	ATTT	2	8	43653	43660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014533	AAAT	2	8	43661	43668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014533	GGCG	2	8	43809	43816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014533	CTTT	2	8	43849	43856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014533	ATAA	2	8	44665	44672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014533	TTTA	2	8	44692	44699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014533	AAAG	2	8	44748	44755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014533	AGAA	2	8	44865	44872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014533	GTTT	2	8	45257	45264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014533	AGGA	2	8	45376	45383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014533	AGAT	2	8	45880	45887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014533	ATTT	2	8	54245	54252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014533	TGAC	2	8	56502	56509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014533	GCCT	2	8	56540	56547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014533	CAGC	2	8	56675	56682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014533	CAAA	2	8	56752	56759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014533	GGGT	2	8	58147	58154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014533	ATTT	2	8	60492	60499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014533	ATCT	2	8	60658	60665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014533	ATAA	2	8	60697	60704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014533	ATTA	2	8	60716	60723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014533	CCTT	2	8	68936	68943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014533	GATT	2	8	70943	70950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014533	ATTG	2	8	77528	77535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014533	TTAA	2	8	78024	78031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014533	TAAA	2	8	78041	78048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014533	AATA	2	8	78114	78121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014533	TTTA	2	8	78287	78294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014533	TCAG	2	8	83656	83663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014533	TTTA	2	8	83958	83965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014533	ACCC	2	8	84123	84130	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014533	ATTA	2	8	84264	84271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014533	TTCT	2	8	85231	85238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014533	ATTT	2	8	86597	86604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014533	CAGT	2	8	91653	91660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014533	ATTT	2	8	92281	92288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014533	ATAA	2	8	93116	93123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014533	AATT	2	8	93278	93285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014533	AATT	2	8	95710	95717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014533	TCTT	2	8	96207	96214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014533	AATA	2	8	96881	96888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014533	ATTA	2	8	96974	96981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014533	TAAG	2	8	97503	97510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014533	AGAT	2	8	97578	97585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014533	AGTT	2	8	97609	97616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014533	AGTA	2	8	97621	97628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014533	TTTA	2	8	99705	99712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014533	ATAA	2	8	99734	99741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014533	ATAA	2	8	99845	99852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014533	TTTA	2	8	100029	100036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014533	ATCT	2	8	100095	100102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014533	TCAC	2	8	100695	100702	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014533	TCAG	2	8	100776	100783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014533	TTGA	2	8	100843	100850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014533	ATAA	2	8	114186	114193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014533	TTTA	2	8	114305	114312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014533	TAGA	2	8	115074	115081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014533	ATAA	2	8	115119	115126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014533	TTTA	2	8	115163	115170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014533	GGCT	2	8	115283	115290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014533	TATT	2	8	122415	122422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014533	ATTA	2	8	122428	122435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014533	ACCC	2	8	122590	122597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_014533	ATCT	2	8	123850	123857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014533	AAAC	2	8	125223	125230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014533	ATGA	2	8	127026	127033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014533	TTTA	2	8	127217	127224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014533	ATCT	2	8	127253	127260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014533	AAAG	2	8	127261	127268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014533	AAGA	2	8	127371	127378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014533	TTCT	2	8	132844	132851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014533	TTAG	2	8	132852	132859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014533	TTGA	2	8	132898	132905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014533	TTTG	2	8	133579	133586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014533	ATAA	2	8	134695	134702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014533	AGTA	2	8	137668	137675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014533	TTTA	2	8	137779	137786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014533	AATA	2	8	138722	138729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014533	TTGG	2	8	144123	144130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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