MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 2943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	AATCG	2	10	144	153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014532	AGGCG	2	10	608	617	20 %	0 %	60 %	20 %	307543590
3	NC_014532	TTGCC	2	10	3573	3582	0 %	40 %	20 %	40 %	307543592
4	NC_014532	GAGCA	2	10	3644	3653	40 %	0 %	40 %	20 %	307543592
5	NC_014532	GGGGA	2	10	7392	7401	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014532	GATGG	2	10	8052	8061	20 %	20 %	60 %	0 %	307543595
7	NC_014532	GGGCT	2	10	8238	8247	0 %	20 %	60 %	20 %	307543595
8	NC_014532	TGCAG	2	10	8635	8644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014532	ATTGG	2	10	10982	10991	20 %	40 %	40 %	0 %	307543597
10	NC_014532	AGGGG	2	10	11164	11173	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014532	GGGCA	2	10	12917	12926	20 %	0 %	60 %	20 %	307543598
12	NC_014532	GACGG	2	10	14112	14121	20 %	0 %	60 %	20 %	307543599
13	NC_014532	AGTCA	2	10	17027	17036	40 %	20 %	20 %	20 %	307543602
14	NC_014532	AGGCG	2	10	18934	18943	20 %	0 %	60 %	20 %	307543604
15	NC_014532	CTCGT	2	10	18948	18957	0 %	40 %	20 %	40 %	307543604
16	NC_014532	CAGCC	2	10	19590	19599	20 %	0 %	20 %	60 %	307543604
17	NC_014532	GCGCC	2	10	21611	21620	0 %	0 %	40 %	60 %	307543606
18	NC_014532	CGATG	2	10	22762	22771	20 %	20 %	40 %	20 %	307543606
19	NC_014532	GGCGC	2	10	24035	24044	0 %	0 %	60 %	40 %	307543607
20	NC_014532	CGGCT	2	10	24404	24413	0 %	20 %	40 %	40 %	307543608
21	NC_014532	AGGCG	2	10	25192	25201	20 %	0 %	60 %	20 %	307543608
22	NC_014532	CGGCG	2	10	25261	25270	0 %	0 %	60 %	40 %	307543608
23	NC_014532	GCCGC	2	10	25962	25971	0 %	0 %	40 %	60 %	307543609
24	NC_014532	CGCCC	3	15	30363	30377	0 %	0 %	20 %	80 %	307543614
25	NC_014532	GGCGG	2	10	31037	31046	0 %	0 %	80 %	20 %	307543614
26	NC_014532	ATGTA	2	10	31722	31731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014532	CTGGC	2	10	32178	32187	0 %	20 %	40 %	40 %	307543615
28	NC_014532	GTCGG	2	10	32578	32587	0 %	20 %	60 %	20 %	307543615
29	NC_014532	GGAGC	2	10	33783	33792	20 %	0 %	60 %	20 %	307543616
30	NC_014532	AGCGG	2	10	35476	35485	20 %	0 %	60 %	20 %	307543617
31	NC_014532	GGCGC	2	10	39690	39699	0 %	0 %	60 %	40 %	307543622
32	NC_014532	CTGGC	2	10	42550	42559	0 %	20 %	40 %	40 %	307543625
33	NC_014532	TCCTC	2	10	42659	42668	0 %	40 %	0 %	60 %	307543625
34	NC_014532	TGAAC	2	10	43715	43724	40 %	20 %	20 %	20 %	307543626
35	NC_014532	CGCTC	2	10	44602	44611	0 %	20 %	20 %	60 %	307543627
36	NC_014532	CACGA	2	10	47997	48006	40 %	0 %	20 %	40 %	307543630
37	NC_014532	GATTG	2	10	48643	48652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014532	CCTCA	2	10	49251	49260	20 %	20 %	0 %	60 %	307543631
39	NC_014532	CCTGA	2	10	49284	49293	20 %	20 %	20 %	40 %	307543631
40	NC_014532	GGCTC	2	10	50184	50193	0 %	20 %	40 %	40 %	307543632
41	NC_014532	GTGCC	2	10	51682	51691	0 %	20 %	40 %	40 %	307543634
42	NC_014532	TGCCC	2	10	52379	52388	0 %	20 %	20 %	60 %	307543634
43	NC_014532	CGGCC	2	10	54884	54893	0 %	0 %	40 %	60 %	307543636
44	NC_014532	CAGGC	2	10	56963	56972	20 %	0 %	40 %	40 %	307543638
45	NC_014532	TGACC	2	10	57498	57507	20 %	20 %	20 %	40 %	307543638
46	NC_014532	GCTGG	2	10	60796	60805	0 %	20 %	60 %	20 %	307543641
47	NC_014532	CTGGC	2	10	61935	61944	0 %	20 %	40 %	40 %	307543642
48	NC_014532	ACGTC	2	10	62339	62348	20 %	20 %	20 %	40 %	307543642
49	NC_014532	CGCTG	2	10	63069	63078	0 %	20 %	40 %	40 %	307543643
50	NC_014532	CGACT	2	10	64092	64101	20 %	20 %	20 %	40 %	307543644
51	NC_014532	ACCCG	2	10	67975	67984	20 %	0 %	20 %	60 %	307543647
52	NC_014532	TGGCC	2	10	68297	68306	0 %	20 %	40 %	40 %	307543647
53	NC_014532	CCGCA	2	10	68950	68959	20 %	0 %	20 %	60 %	307543648
54	NC_014532	GGGGC	2	10	72207	72216	0 %	0 %	80 %	20 %	307543652
55	NC_014532	CGCGG	2	10	72410	72419	0 %	0 %	60 %	40 %	307543652
56	NC_014532	GCCGA	2	10	72787	72796	20 %	0 %	40 %	40 %	307543652
57	NC_014532	GGGCG	2	10	72842	72851	0 %	0 %	80 %	20 %	307543652
58	NC_014532	CTGGC	2	10	73295	73304	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014532	GGGCC	2	10	73470	73479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014532	CGGCA	2	10	73770	73779	20 %	0 %	40 %	40 %	307543653
61	NC_014532	CGACG	2	10	74314	74323	20 %	0 %	40 %	40 %	307543653
62	NC_014532	CGGGC	2	10	74452	74461	0 %	0 %	60 %	40 %	307543654
63	NC_014532	CGCGG	2	10	75269	75278	0 %	0 %	60 %	40 %	307543654
64	NC_014532	GGCCA	2	10	78182	78191	20 %	0 %	40 %	40 %	307543657
65	NC_014532	CGGGA	2	10	78545	78554	20 %	0 %	60 %	20 %	307543657
66	NC_014532	GGCGC	2	10	78691	78700	0 %	0 %	60 %	40 %	307543657
67	NC_014532	CTGGC	2	10	79106	79115	0 %	20 %	40 %	40 %	307543658
68	NC_014532	GGCTC	2	10	82099	82108	0 %	20 %	40 %	40 %	307543661
69	NC_014532	CCGGT	2	10	82505	82514	0 %	20 %	40 %	40 %	307543661
70	NC_014532	GCATC	2	10	83401	83410	20 %	20 %	20 %	40 %	307543661
71	NC_014532	TTTGA	2	10	84050	84059	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014532	CTTCG	2	10	85227	85236	0 %	40 %	20 %	40 %	307543662
73	NC_014532	GGCCA	2	10	86438	86447	20 %	0 %	40 %	40 %	307543663
74	NC_014532	TGGCG	2	10	89069	89078	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014532	ATGTC	2	10	89209	89218	20 %	40 %	20 %	20 %	307543665
76	NC_014532	CCATG	2	10	89552	89561	20 %	20 %	20 %	40 %	307543665
77	NC_014532	GGCCT	2	10	90116	90125	0 %	20 %	40 %	40 %	307543666
78	NC_014532	ACGAC	2	10	91689	91698	40 %	0 %	20 %	40 %	307543668
79	NC_014532	GCGGT	2	10	91778	91787	0 %	20 %	60 %	20 %	307543668
80	NC_014532	GAGGC	2	10	92104	92113	20 %	0 %	60 %	20 %	307543668
81	NC_014532	TCGGC	2	10	94103	94112	0 %	20 %	40 %	40 %	307543669
82	NC_014532	GCGAC	2	10	94314	94323	20 %	0 %	40 %	40 %	307543669
83	NC_014532	GCCCG	2	10	95882	95891	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014532	CGTCT	2	10	97431	97440	0 %	40 %	20 %	40 %	307543673
85	NC_014532	GGCCT	2	10	98424	98433	0 %	20 %	40 %	40 %	307543673
86	NC_014532	CTGCG	2	10	98607	98616	0 %	20 %	40 %	40 %	307543673
87	NC_014532	CGGCC	2	10	98693	98702	0 %	0 %	40 %	60 %	307543673
88	NC_014532	GCCGG	2	10	98791	98800	0 %	0 %	60 %	40 %	307543673
89	NC_014532	TCGCG	2	10	100592	100601	0 %	20 %	40 %	40 %	307543675
90	NC_014532	ACGCC	2	10	101001	101010	20 %	0 %	20 %	60 %	307543675
91	NC_014532	TCCTC	2	10	101616	101625	0 %	40 %	0 %	60 %	307543675
92	NC_014532	GGGGC	2	10	103749	103758	0 %	0 %	80 %	20 %	307543678
93	NC_014532	CTGGA	2	10	103925	103934	20 %	20 %	40 %	20 %	307543678
94	NC_014532	TGGGT	2	10	109444	109453	0 %	40 %	60 %	0 %	307543684
95	NC_014532	GGCGT	2	10	111102	111111	0 %	20 %	60 %	20 %	307543686
96	NC_014532	CGTGG	2	10	112629	112638	0 %	20 %	60 %	20 %	307543686
97	NC_014532	TCGAC	2	10	113109	113118	20 %	20 %	20 %	40 %	307543686
98	NC_014532	GAATA	2	10	113733	113742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014532	CCAGC	2	10	114376	114385	20 %	0 %	20 %	60 %	307543688
100	NC_014532	GATCG	2	10	118346	118355	20 %	20 %	40 %	20 %	307543692
101	NC_014532	CACTG	2	10	118471	118480	20 %	20 %	20 %	40 %	307543692
102	NC_014532	CAACC	2	10	119962	119971	40 %	0 %	0 %	60 %	307543693
103	NC_014532	GCCAG	2	10	120837	120846	20 %	0 %	40 %	40 %	307543693
104	NC_014532	CCTGG	2	10	121042	121051	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
105	NC_014532	TGCCG	2	10	121851	121860	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
106	NC_014532	AGGGA	2	10	123985	123994	40 %	0 %	60 %	0 %	307543694
107	NC_014532	ATCAG	2	10	124370	124379	40 %	20 %	20 %	20 %	307543695
108	NC_014532	CCAAG	2	10	125324	125333	40 %	0 %	20 %	40 %	307543696
109	NC_014532	GGGCG	2	10	125688	125697	0 %	0 %	80 %	20 %	307543696
110	NC_014532	GGCTG	2	10	127395	127404	0 %	20 %	60 %	20 %	307543697
111	NC_014532	TAACC	2	10	128121	128130	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014532	GCATG	2	10	129027	129036	20 %	20 %	40 %	20 %	307543699
113	NC_014532	GCCCC	2	10	129205	129214	0 %	0 %	20 %	80 %	307543699
114	NC_014532	CAGCG	2	10	129714	129723	20 %	0 %	40 %	40 %	307543700
115	NC_014532	CGAGC	2	10	132858	132867	20 %	0 %	40 %	40 %	307543702
116	NC_014532	CACGG	2	10	136554	136563	20 %	0 %	40 %	40 %	307543706
117	NC_014532	GGCGG	2	10	136601	136610	0 %	0 %	80 %	20 %	307543706
118	NC_014532	GGCGG	2	10	136701	136710	0 %	0 %	80 %	20 %	307543706
119	NC_014532	CCTAG	2	10	138936	138945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014532	AAGGA	2	10	139052	139061	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014532	GCCCC	2	10	139158	139167	0 %	0 %	20 %	80 %	307543709
122	NC_014532	GTCAT	2	10	140764	140773	20 %	40 %	20 %	20 %	307543710
123	NC_014532	TGAGC	2	10	144087	144096	20 %	20 %	40 %	20 %	307543713
124	NC_014532	CTTCT	2	10	144829	144838	0 %	60 %	0 %	40 %	307543714
125	NC_014532	TGGGC	2	10	149350	149359	0 %	20 %	60 %	20 %	307543717
126	NC_014532	GCGCC	2	10	149813	149822	0 %	0 %	40 %	60 %	307543718
127	NC_014532	CTGGC	2	10	150516	150525	0 %	20 %	40 %	40 %	307543718
128	NC_014532	GGGGT	2	10	150919	150928	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014532	GCCAG	2	10	153336	153345	20 %	0 %	40 %	40 %	307543720
130	NC_014532	GGCGT	2	10	153956	153965	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
131	NC_014532	TGGCG	2	10	154158	154167	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
132	NC_014532	GCTGG	2	10	154213	154222	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
133	NC_014532	TCGGC	2	10	155151	155160	0 %	20 %	40 %	40 %	307543721
134	NC_014532	CACGC	2	10	155986	155995	20 %	0 %	20 %	60 %	307543721
135	NC_014532	CGAGC	2	10	156292	156301	20 %	0 %	40 %	40 %	307543721
136	NC_014532	GCGCG	2	10	157495	157504	0 %	0 %	60 %	40 %	307543722
137	NC_014532	AGGGC	2	10	158273	158282	20 %	0 %	60 %	20 %	307543723
138	NC_014532	GCCGC	2	10	158527	158536	0 %	0 %	40 %	60 %	307543723
139	NC_014532	CGCAG	2	10	160175	160184	20 %	0 %	40 %	40 %	307543724
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151	NC_014532	CAGCG	2	10	175287	175296	20 %	0 %	40 %	40 %	307543740
152	NC_014532	CCTGG	2	10	177011	177020	0 %	20 %	40 %	40 %	307543741
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195	NC_014532	CCGCT	2	10	230072	230081	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
196	NC_014532	GCCGA	2	10	231171	231180	20 %	0 %	40 %	40 %	307543786
197	NC_014532	GTGCA	2	10	231477	231486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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213	NC_014532	AGTCG	2	10	262718	262727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
214	NC_014532	GCTTG	2	10	265011	265020	0 %	40 %	40 %	20 %	307543810
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234	NC_014532	CGACT	2	10	310064	310073	20 %	20 %	20 %	40 %	307543861
235	NC_014532	GCGTG	2	10	311405	311414	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
236	NC_014532	TAGCG	2	10	313114	313123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
237	NC_014532	GTGCC	2	10	313412	313421	0 %	20 %	40 %	40 %	307543865
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240	NC_014532	TCGCG	2	10	316849	316858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
241	NC_014532	GGCCA	2	10	318381	318390	20 %	0 %	40 %	40 %	307543869
242	NC_014532	GTCGC	2	10	319298	319307	0 %	20 %	40 %	40 %	307543870
243	NC_014532	GGTGC	2	10	320446	320455	0 %	20 %	60 %	20 %	307543872
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248	NC_014532	TGCCC	2	10	323747	323756	0 %	20 %	20 %	60 %	307543875
249	NC_014532	CAAGC	2	10	328018	328027	40 %	0 %	20 %	40 %	307543877
250	NC_014532	GTGCC	2	10	331236	331245	0 %	20 %	40 %	40 %	307543880
251	NC_014532	CGACC	2	10	332422	332431	20 %	0 %	20 %	60 %	307543881
252	NC_014532	TGACG	2	10	334179	334188	20 %	20 %	40 %	20 %	307543882
253	NC_014532	ACGTA	2	10	334896	334905	40 %	20 %	20 %	20 %	307543882
254	NC_014532	GCAGC	2	10	335401	335410	20 %	0 %	40 %	40 %	307543882
255	NC_014532	GCTTG	2	10	335890	335899	0 %	40 %	40 %	20 %	307543882
256	NC_014532	CGCTT	2	10	337525	337534	0 %	40 %	20 %	40 %	307543883
257	NC_014532	GCATG	2	10	340002	340011	20 %	20 %	40 %	20 %	307543884
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259	NC_014532	CGTGG	2	10	341730	341739	0 %	20 %	60 %	20 %	307543885
260	NC_014532	TGTCG	2	10	341871	341880	0 %	40 %	40 %	20 %	307543885
261	NC_014532	GCGCG	2	10	344075	344084	0 %	0 %	60 %	40 %	307543887
262	NC_014532	CTGGC	2	10	345718	345727	0 %	20 %	40 %	40 %	307543888
263	NC_014532	CGGGC	2	10	348210	348219	0 %	0 %	60 %	40 %	307543891
264	NC_014532	CCGTG	2	10	348249	348258	0 %	20 %	40 %	40 %	307543891
265	NC_014532	GCCTG	2	10	349473	349482	0 %	20 %	40 %	40 %	307543892
266	NC_014532	GCCCG	2	10	350271	350280	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
267	NC_014532	GTGGC	2	10	350285	350294	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_014532	TGGCC	2	10	351809	351818	0 %	20 %	40 %	40 %	307543893
269	NC_014532	AGGCC	2	10	352860	352869	20 %	0 %	40 %	40 %	307543894
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271	NC_014532	TGGTC	2	10	356019	356028	0 %	40 %	40 %	20 %	307543896
272	NC_014532	CCCGA	2	10	357023	357032	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
273	NC_014532	GAAAA	2	10	360448	360457	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014532	TAAGG	2	10	360489	360498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014532	CGGCT	2	10	364506	364515	0 %	20 %	40 %	40 %	307543902
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288	NC_014532	GCATC	2	10	380197	380206	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_014532	CTCCC	2	10	382106	382115	0 %	20 %	0 %	80 %	307543919
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294	NC_014532	AGTCG	2	10	396651	396660	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_014532	CGAGT	2	10	398786	398795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_014532	TCGAA	2	10	403440	403449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
299	NC_014532	TGCCA	2	10	403470	403479	20 %	20 %	20 %	40 %	307543933
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301	NC_014532	CTCTC	2	10	404060	404069	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
302	NC_014532	AGCTC	2	10	404433	404442	20 %	20 %	20 %	40 %	307543934
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380	NC_014532	CTGGG	2	10	514319	514328	0 %	20 %	60 %	20 %	307544047
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382	NC_014532	GAGCC	2	10	518530	518539	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
383	NC_014532	CGCGG	2	10	522380	522389	0 %	0 %	60 %	40 %	307544053
384	NC_014532	CCAGT	2	10	523763	523772	20 %	20 %	20 %	40 %	307544055
385	NC_014532	GCCGA	2	10	526736	526745	20 %	0 %	40 %	40 %	307544057
386	NC_014532	CGCGA	2	10	528064	528073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
387	NC_014532	TCGAG	2	10	530247	530256	20 %	20 %	40 %	20 %	307544060
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395	NC_014532	CGGCG	2	10	543762	543771	0 %	0 %	60 %	40 %	307544068
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398	NC_014532	CGGCT	2	10	547369	547378	0 %	20 %	40 %	40 %	307544071
399	NC_014532	GCCCA	2	10	548606	548615	20 %	0 %	20 %	60 %	307544072
400	NC_014532	TCGCC	2	10	548937	548946	0 %	20 %	20 %	60 %	307544073
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402	NC_014532	TTGAA	2	10	550887	550896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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