MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 2503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	AGGCG	2	10	608	617	20 %	0 %	60 %	20 %	307543590
2	NC_014532	TTGCC	2	10	3573	3582	0 %	40 %	20 %	40 %	307543592
3	NC_014532	GAGCA	2	10	3644	3653	40 %	0 %	40 %	20 %	307543592
4	NC_014532	GATGG	2	10	8052	8061	20 %	20 %	60 %	0 %	307543595
5	NC_014532	GGGCT	2	10	8238	8247	0 %	20 %	60 %	20 %	307543595
6	NC_014532	ATTGG	2	10	10982	10991	20 %	40 %	40 %	0 %	307543597
7	NC_014532	GGGCA	2	10	12917	12926	20 %	0 %	60 %	20 %	307543598
8	NC_014532	GACGG	2	10	14112	14121	20 %	0 %	60 %	20 %	307543599
9	NC_014532	AGTCA	2	10	17027	17036	40 %	20 %	20 %	20 %	307543602
10	NC_014532	AGGCG	2	10	18934	18943	20 %	0 %	60 %	20 %	307543604
11	NC_014532	CTCGT	2	10	18948	18957	0 %	40 %	20 %	40 %	307543604
12	NC_014532	CAGCC	2	10	19590	19599	20 %	0 %	20 %	60 %	307543604
13	NC_014532	GCGCC	2	10	21611	21620	0 %	0 %	40 %	60 %	307543606
14	NC_014532	CGATG	2	10	22762	22771	20 %	20 %	40 %	20 %	307543606
15	NC_014532	GGCGC	2	10	24035	24044	0 %	0 %	60 %	40 %	307543607
16	NC_014532	CGGCT	2	10	24404	24413	0 %	20 %	40 %	40 %	307543608
17	NC_014532	AGGCG	2	10	25192	25201	20 %	0 %	60 %	20 %	307543608
18	NC_014532	CGGCG	2	10	25261	25270	0 %	0 %	60 %	40 %	307543608
19	NC_014532	GCCGC	2	10	25962	25971	0 %	0 %	40 %	60 %	307543609
20	NC_014532	CGCCC	3	15	30363	30377	0 %	0 %	20 %	80 %	307543614
21	NC_014532	GGCGG	2	10	31037	31046	0 %	0 %	80 %	20 %	307543614
22	NC_014532	CTGGC	2	10	32178	32187	0 %	20 %	40 %	40 %	307543615
23	NC_014532	GTCGG	2	10	32578	32587	0 %	20 %	60 %	20 %	307543615
24	NC_014532	GGAGC	2	10	33783	33792	20 %	0 %	60 %	20 %	307543616
25	NC_014532	AGCGG	2	10	35476	35485	20 %	0 %	60 %	20 %	307543617
26	NC_014532	GGCGC	2	10	39690	39699	0 %	0 %	60 %	40 %	307543622
27	NC_014532	CTGGC	2	10	42550	42559	0 %	20 %	40 %	40 %	307543625
28	NC_014532	TCCTC	2	10	42659	42668	0 %	40 %	0 %	60 %	307543625
29	NC_014532	TGAAC	2	10	43715	43724	40 %	20 %	20 %	20 %	307543626
30	NC_014532	CGCTC	2	10	44602	44611	0 %	20 %	20 %	60 %	307543627
31	NC_014532	CACGA	2	10	47997	48006	40 %	0 %	20 %	40 %	307543630
32	NC_014532	CCTCA	2	10	49251	49260	20 %	20 %	0 %	60 %	307543631
33	NC_014532	CCTGA	2	10	49284	49293	20 %	20 %	20 %	40 %	307543631
34	NC_014532	GGCTC	2	10	50184	50193	0 %	20 %	40 %	40 %	307543632
35	NC_014532	GTGCC	2	10	51682	51691	0 %	20 %	40 %	40 %	307543634
36	NC_014532	TGCCC	2	10	52379	52388	0 %	20 %	20 %	60 %	307543634
37	NC_014532	CGGCC	2	10	54884	54893	0 %	0 %	40 %	60 %	307543636
38	NC_014532	CAGGC	2	10	56963	56972	20 %	0 %	40 %	40 %	307543638
39	NC_014532	TGACC	2	10	57498	57507	20 %	20 %	20 %	40 %	307543638
40	NC_014532	GCTGG	2	10	60796	60805	0 %	20 %	60 %	20 %	307543641
41	NC_014532	CTGGC	2	10	61935	61944	0 %	20 %	40 %	40 %	307543642
42	NC_014532	ACGTC	2	10	62339	62348	20 %	20 %	20 %	40 %	307543642
43	NC_014532	CGCTG	2	10	63069	63078	0 %	20 %	40 %	40 %	307543643
44	NC_014532	CGACT	2	10	64092	64101	20 %	20 %	20 %	40 %	307543644
45	NC_014532	ACCCG	2	10	67975	67984	20 %	0 %	20 %	60 %	307543647
46	NC_014532	TGGCC	2	10	68297	68306	0 %	20 %	40 %	40 %	307543647
47	NC_014532	CCGCA	2	10	68950	68959	20 %	0 %	20 %	60 %	307543648
48	NC_014532	GGGGC	2	10	72207	72216	0 %	0 %	80 %	20 %	307543652
49	NC_014532	CGCGG	2	10	72410	72419	0 %	0 %	60 %	40 %	307543652
50	NC_014532	GCCGA	2	10	72787	72796	20 %	0 %	40 %	40 %	307543652
51	NC_014532	GGGCG	2	10	72842	72851	0 %	0 %	80 %	20 %	307543652
52	NC_014532	CGGCA	2	10	73770	73779	20 %	0 %	40 %	40 %	307543653
53	NC_014532	CGACG	2	10	74314	74323	20 %	0 %	40 %	40 %	307543653
54	NC_014532	CGGGC	2	10	74452	74461	0 %	0 %	60 %	40 %	307543654
55	NC_014532	CGCGG	2	10	75269	75278	0 %	0 %	60 %	40 %	307543654
56	NC_014532	GGCCA	2	10	78182	78191	20 %	0 %	40 %	40 %	307543657
57	NC_014532	CGGGA	2	10	78545	78554	20 %	0 %	60 %	20 %	307543657
58	NC_014532	GGCGC	2	10	78691	78700	0 %	0 %	60 %	40 %	307543657
59	NC_014532	CTGGC	2	10	79106	79115	0 %	20 %	40 %	40 %	307543658
60	NC_014532	GGCTC	2	10	82099	82108	0 %	20 %	40 %	40 %	307543661
61	NC_014532	CCGGT	2	10	82505	82514	0 %	20 %	40 %	40 %	307543661
62	NC_014532	GCATC	2	10	83401	83410	20 %	20 %	20 %	40 %	307543661
63	NC_014532	CTTCG	2	10	85227	85236	0 %	40 %	20 %	40 %	307543662
64	NC_014532	GGCCA	2	10	86438	86447	20 %	0 %	40 %	40 %	307543663
65	NC_014532	ATGTC	2	10	89209	89218	20 %	40 %	20 %	20 %	307543665
66	NC_014532	CCATG	2	10	89552	89561	20 %	20 %	20 %	40 %	307543665
67	NC_014532	GGCCT	2	10	90116	90125	0 %	20 %	40 %	40 %	307543666
68	NC_014532	ACGAC	2	10	91689	91698	40 %	0 %	20 %	40 %	307543668
69	NC_014532	GCGGT	2	10	91778	91787	0 %	20 %	60 %	20 %	307543668
70	NC_014532	GAGGC	2	10	92104	92113	20 %	0 %	60 %	20 %	307543668
71	NC_014532	TCGGC	2	10	94103	94112	0 %	20 %	40 %	40 %	307543669
72	NC_014532	GCGAC	2	10	94314	94323	20 %	0 %	40 %	40 %	307543669
73	NC_014532	CGTCT	2	10	97431	97440	0 %	40 %	20 %	40 %	307543673
74	NC_014532	GGCCT	2	10	98424	98433	0 %	20 %	40 %	40 %	307543673
75	NC_014532	CTGCG	2	10	98607	98616	0 %	20 %	40 %	40 %	307543673
76	NC_014532	CGGCC	2	10	98693	98702	0 %	0 %	40 %	60 %	307543673
77	NC_014532	GCCGG	2	10	98791	98800	0 %	0 %	60 %	40 %	307543673
78	NC_014532	TCGCG	2	10	100592	100601	0 %	20 %	40 %	40 %	307543675
79	NC_014532	ACGCC	2	10	101001	101010	20 %	0 %	20 %	60 %	307543675
80	NC_014532	TCCTC	2	10	101616	101625	0 %	40 %	0 %	60 %	307543675
81	NC_014532	GGGGC	2	10	103749	103758	0 %	0 %	80 %	20 %	307543678
82	NC_014532	CTGGA	2	10	103925	103934	20 %	20 %	40 %	20 %	307543678
83	NC_014532	TGGGT	2	10	109444	109453	0 %	40 %	60 %	0 %	307543684
84	NC_014532	GGCGT	2	10	111102	111111	0 %	20 %	60 %	20 %	307543686
85	NC_014532	CGTGG	2	10	112629	112638	0 %	20 %	60 %	20 %	307543686
86	NC_014532	TCGAC	2	10	113109	113118	20 %	20 %	20 %	40 %	307543686
87	NC_014532	CCAGC	2	10	114376	114385	20 %	0 %	20 %	60 %	307543688
88	NC_014532	GATCG	2	10	118346	118355	20 %	20 %	40 %	20 %	307543692
89	NC_014532	CACTG	2	10	118471	118480	20 %	20 %	20 %	40 %	307543692
90	NC_014532	CAACC	2	10	119962	119971	40 %	0 %	0 %	60 %	307543693
91	NC_014532	GCCAG	2	10	120837	120846	20 %	0 %	40 %	40 %	307543693
92	NC_014532	CCTGG	2	10	121042	121051	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
93	NC_014532	TGCCG	2	10	121851	121860	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
94	NC_014532	AGGGA	2	10	123985	123994	40 %	0 %	60 %	0 %	307543694
95	NC_014532	ATCAG	2	10	124370	124379	40 %	20 %	20 %	20 %	307543695
96	NC_014532	CCAAG	2	10	125324	125333	40 %	0 %	20 %	40 %	307543696
97	NC_014532	GGGCG	2	10	125688	125697	0 %	0 %	80 %	20 %	307543696
98	NC_014532	GGCTG	2	10	127395	127404	0 %	20 %	60 %	20 %	307543697
99	NC_014532	GCATG	2	10	129027	129036	20 %	20 %	40 %	20 %	307543699
100	NC_014532	GCCCC	2	10	129205	129214	0 %	0 %	20 %	80 %	307543699
101	NC_014532	CAGCG	2	10	129714	129723	20 %	0 %	40 %	40 %	307543700
102	NC_014532	CGAGC	2	10	132858	132867	20 %	0 %	40 %	40 %	307543702
103	NC_014532	CACGG	2	10	136554	136563	20 %	0 %	40 %	40 %	307543706
104	NC_014532	GGCGG	2	10	136601	136610	0 %	0 %	80 %	20 %	307543706
105	NC_014532	GGCGG	2	10	136701	136710	0 %	0 %	80 %	20 %	307543706
106	NC_014532	GCCCC	2	10	139158	139167	0 %	0 %	20 %	80 %	307543709
107	NC_014532	GTCAT	2	10	140764	140773	20 %	40 %	20 %	20 %	307543710
108	NC_014532	TGAGC	2	10	144087	144096	20 %	20 %	40 %	20 %	307543713
109	NC_014532	CTTCT	2	10	144829	144838	0 %	60 %	0 %	40 %	307543714
110	NC_014532	TGGGC	2	10	149350	149359	0 %	20 %	60 %	20 %	307543717
111	NC_014532	GCGCC	2	10	149813	149822	0 %	0 %	40 %	60 %	307543718
112	NC_014532	CTGGC	2	10	150516	150525	0 %	20 %	40 %	40 %	307543718
113	NC_014532	GCCAG	2	10	153336	153345	20 %	0 %	40 %	40 %	307543720
114	NC_014532	GGCGT	2	10	153956	153965	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
115	NC_014532	TGGCG	2	10	154158	154167	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
116	NC_014532	GCTGG	2	10	154213	154222	0 %	20 %	60 %	20 %	307543720
117	NC_014532	TCGGC	2	10	155151	155160	0 %	20 %	40 %	40 %	307543721
118	NC_014532	CACGC	2	10	155986	155995	20 %	0 %	20 %	60 %	307543721
119	NC_014532	CGAGC	2	10	156292	156301	20 %	0 %	40 %	40 %	307543721
120	NC_014532	GCGCG	2	10	157495	157504	0 %	0 %	60 %	40 %	307543722
121	NC_014532	AGGGC	2	10	158273	158282	20 %	0 %	60 %	20 %	307543723
122	NC_014532	GCCGC	2	10	158527	158536	0 %	0 %	40 %	60 %	307543723
123	NC_014532	CGCAG	2	10	160175	160184	20 %	0 %	40 %	40 %	307543724
124	NC_014532	TCGGC	2	10	161475	161484	0 %	20 %	40 %	40 %	307543726
125	NC_014532	CGTGG	2	10	161660	161669	0 %	20 %	60 %	20 %	307543726
126	NC_014532	CTGGC	2	10	163035	163044	0 %	20 %	40 %	40 %	307543727
127	NC_014532	CGGGC	2	10	165146	165155	0 %	0 %	60 %	40 %	307543729
128	NC_014532	CAGGC	2	10	165819	165828	20 %	0 %	40 %	40 %	307543730
129	NC_014532	CGAGG	2	10	166567	166576	20 %	0 %	60 %	20 %	307543731
130	NC_014532	GGCCG	2	10	166658	166667	0 %	0 %	60 %	40 %	307543731
131	NC_014532	CCGGC	2	10	168269	168278	0 %	0 %	40 %	60 %	307543733
132	NC_014532	CCTGC	2	10	168812	168821	0 %	20 %	20 %	60 %	307543733
133	NC_014532	GCCAG	2	10	172282	172291	20 %	0 %	40 %	40 %	307543737
134	NC_014532	TGGGC	2	10	174127	174136	0 %	20 %	60 %	20 %	307543739
135	NC_014532	CAGCG	2	10	175287	175296	20 %	0 %	40 %	40 %	307543740
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393	NC_014532	AGCGG	2	10	613613	613622	20 %	0 %	60 %	20 %	307544122
394	NC_014532	GCCAT	2	10	615966	615975	20 %	20 %	20 %	40 %	307544124
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397	NC_014532	GTCGC	2	10	616306	616315	0 %	20 %	40 %	40 %	307544124
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495	NC_014532	GCGCG	2	10	799515	799524	0 %	0 %	60 %	40 %	307544277
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497	NC_014532	CAGGG	2	10	805626	805635	20 %	0 %	60 %	20 %	307544281
498	NC_014532	CGATC	2	10	807255	807264	20 %	20 %	20 %	40 %	307544282
499	NC_014532	GTCGA	2	10	808823	808832	20 %	20 %	40 %	20 %	307544283
500	NC_014532	AGCGC	2	10	810846	810855	20 %	0 %	40 %	40 %	307544285

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