MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 9999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	TCGC	2	8	231	238	0 %	25 %	25 %	50 %	307543590
2	NC_014532	CGCC	2	8	538	545	0 %	0 %	25 %	75 %	307543590
3	NC_014532	CCAA	2	8	727	734	50 %	0 %	0 %	50 %	307543590
4	NC_014532	ATGC	2	8	834	841	25 %	25 %	25 %	25 %	307543590
5	NC_014532	TGCA	2	8	1603	1610	25 %	25 %	25 %	25 %	307543590
6	NC_014532	ATCG	2	8	1706	1713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014532	GCCA	2	8	1940	1947	25 %	0 %	25 %	50 %	307543591
8	NC_014532	TCGT	2	8	2376	2383	0 %	50 %	25 %	25 %	307543591
9	NC_014532	GGCC	2	8	2703	2710	0 %	0 %	50 %	50 %	307543591
10	NC_014532	GCGT	2	8	3186	3193	0 %	25 %	50 %	25 %	307543592
11	NC_014532	GCGG	2	8	3697	3704	0 %	0 %	75 %	25 %	307543592
12	NC_014532	GCCG	2	8	3853	3860	0 %	0 %	50 %	50 %	307543592
13	NC_014532	GACA	2	8	4037	4044	50 %	0 %	25 %	25 %	307543592
14	NC_014532	CGTC	2	8	4576	4583	0 %	25 %	25 %	50 %	307543593
15	NC_014532	CGAA	2	8	5159	5166	50 %	0 %	25 %	25 %	307543593
16	NC_014532	TCGG	2	8	5498	5505	0 %	25 %	50 %	25 %	307543593
17	NC_014532	CGAG	2	8	5631	5638	25 %	0 %	50 %	25 %	307543593
18	NC_014532	GATG	2	8	5976	5983	25 %	25 %	50 %	0 %	307543593
19	NC_014532	AGCG	2	8	6037	6044	25 %	0 %	50 %	25 %	307543593
20	NC_014532	GCCG	2	8	6057	6064	0 %	0 %	50 %	50 %	307543593
21	NC_014532	TCCA	2	8	6277	6284	25 %	25 %	0 %	50 %	307543593
22	NC_014532	GATG	2	8	6594	6601	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014532	GAGG	2	8	6684	6691	25 %	0 %	75 %	0 %	307543594
24	NC_014532	CGCC	2	8	6826	6833	0 %	0 %	25 %	75 %	307543594
25	NC_014532	GATT	2	8	7074	7081	25 %	50 %	25 %	0 %	307543594
26	NC_014532	GCCA	2	8	7099	7106	25 %	0 %	25 %	50 %	307543594
27	NC_014532	AGCG	2	8	7532	7539	25 %	0 %	50 %	25 %	307543595
28	NC_014532	CGGG	2	8	11690	11697	0 %	0 %	75 %	25 %	307543598
29	NC_014532	CGGC	2	8	12216	12223	0 %	0 %	50 %	50 %	307543598
30	NC_014532	CGGT	2	8	12336	12343	0 %	25 %	50 %	25 %	307543598
31	NC_014532	CGGC	2	8	12795	12802	0 %	0 %	50 %	50 %	307543598
32	NC_014532	CCAG	2	8	12853	12860	25 %	0 %	25 %	50 %	307543598
33	NC_014532	CCAG	2	8	12997	13004	25 %	0 %	25 %	50 %	307543598
34	NC_014532	AGGG	2	8	13113	13120	25 %	0 %	75 %	0 %	307543598
35	NC_014532	AAGT	2	8	13859	13866	50 %	25 %	25 %	0 %	307543599
36	NC_014532	AACG	2	8	14460	14467	50 %	0 %	25 %	25 %	307543600
37	NC_014532	GCCG	2	8	15789	15796	0 %	0 %	50 %	50 %	307543601
38	NC_014532	GGCC	2	8	15932	15939	0 %	0 %	50 %	50 %	307543601
39	NC_014532	GCGG	2	8	16082	16089	0 %	0 %	75 %	25 %	307543601
40	NC_014532	GCGG	2	8	16862	16869	0 %	0 %	75 %	25 %	307543602
41	NC_014532	CAGG	2	8	17225	17232	25 %	0 %	50 %	25 %	307543602
42	NC_014532	GCTG	2	8	17266	17273	0 %	25 %	50 %	25 %	307543602
43	NC_014532	CTGG	2	8	17312	17319	0 %	25 %	50 %	25 %	307543602
44	NC_014532	AGAT	2	8	17463	17470	50 %	25 %	25 %	0 %	307543602
45	NC_014532	CCAG	2	8	17533	17540	25 %	0 %	25 %	50 %	307543602
46	NC_014532	TCCT	2	8	17543	17550	0 %	50 %	0 %	50 %	307543602
47	NC_014532	CCAG	2	8	17662	17669	25 %	0 %	25 %	50 %	307543602
48	NC_014532	GTGC	2	8	17904	17911	0 %	25 %	50 %	25 %	307543602
49	NC_014532	CAGC	2	8	17918	17925	25 %	0 %	25 %	50 %	307543602
50	NC_014532	CGTT	2	8	18076	18083	0 %	50 %	25 %	25 %	307543603
51	NC_014532	GTTC	2	8	18092	18099	0 %	50 %	25 %	25 %	307543603
52	NC_014532	TGCA	2	8	18213	18220	25 %	25 %	25 %	25 %	307543603
53	NC_014532	GCCG	2	8	18672	18679	0 %	0 %	50 %	50 %	307543603
54	NC_014532	GCAT	2	8	18894	18901	25 %	25 %	25 %	25 %	307543604
55	NC_014532	GGCC	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	307543604
56	NC_014532	GCCG	2	8	20395	20402	0 %	0 %	50 %	50 %	307543605
57	NC_014532	CCTG	2	8	20751	20758	0 %	25 %	25 %	50 %	307543605
58	NC_014532	AGCG	2	8	21131	21138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014532	GATC	2	8	21201	21208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014532	TGCC	2	8	21642	21649	0 %	25 %	25 %	50 %	307543606
61	NC_014532	CGGC	2	8	22278	22285	0 %	0 %	50 %	50 %	307543606
62	NC_014532	GCGG	2	8	22552	22559	0 %	0 %	75 %	25 %	307543606
63	NC_014532	CGAC	2	8	22798	22805	25 %	0 %	25 %	50 %	307543606
64	NC_014532	GCAA	2	8	22836	22843	50 %	0 %	25 %	25 %	307543606
65	NC_014532	CTCG	2	8	23039	23046	0 %	25 %	25 %	50 %	307543607
66	NC_014532	GGCC	2	8	23063	23070	0 %	0 %	50 %	50 %	307543607
67	NC_014532	CACT	2	8	23132	23139	25 %	25 %	0 %	50 %	307543607
68	NC_014532	CGCC	2	8	23942	23949	0 %	0 %	25 %	75 %	307543607
69	NC_014532	CAAT	2	8	24022	24029	50 %	25 %	0 %	25 %	307543607
70	NC_014532	GTGC	2	8	24192	24199	0 %	25 %	50 %	25 %	307543607
71	NC_014532	TCGG	2	8	24464	24471	0 %	25 %	50 %	25 %	307543608
72	NC_014532	CGTT	2	8	24788	24795	0 %	50 %	25 %	25 %	307543608
73	NC_014532	CTGG	2	8	24850	24857	0 %	25 %	50 %	25 %	307543608
74	NC_014532	GTGA	2	8	24974	24981	25 %	25 %	50 %	0 %	307543608
75	NC_014532	GGCG	2	8	25001	25008	0 %	0 %	75 %	25 %	307543608
76	NC_014532	GCCG	2	8	25327	25334	0 %	0 %	50 %	50 %	307543608
77	NC_014532	GGCC	2	8	25501	25508	0 %	0 %	50 %	50 %	307543608
78	NC_014532	GTGA	2	8	25579	25586	25 %	25 %	50 %	0 %	307543608
79	NC_014532	CGTG	2	8	26790	26797	0 %	25 %	50 %	25 %	307543610
80	NC_014532	GGCG	2	8	26962	26969	0 %	0 %	75 %	25 %	307543610
81	NC_014532	GCCT	2	8	27085	27092	0 %	25 %	25 %	50 %	307543610
82	NC_014532	GGCC	2	8	27312	27319	0 %	0 %	50 %	50 %	307543610
83	NC_014532	GGAA	2	8	27935	27942	50 %	0 %	50 %	0 %	307543610
84	NC_014532	GCCC	2	8	28067	28074	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_014532	GGTG	2	8	29122	29129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014532	GCTG	2	8	29342	29349	0 %	25 %	50 %	25 %	307543612
87	NC_014532	GCTC	2	8	29351	29358	0 %	25 %	25 %	50 %	307543612
88	NC_014532	GCTT	2	8	29516	29523	0 %	50 %	25 %	25 %	307543612
89	NC_014532	AACG	2	8	29748	29755	50 %	0 %	25 %	25 %	307543613
90	NC_014532	GCTG	2	8	29872	29879	0 %	25 %	50 %	25 %	307543613
91	NC_014532	CTGG	2	8	31437	31444	0 %	25 %	50 %	25 %	307543614
92	NC_014532	AGCG	2	8	32052	32059	25 %	0 %	50 %	25 %	307543615
93	NC_014532	CGGT	2	8	32294	32301	0 %	25 %	50 %	25 %	307543615
94	NC_014532	CGGC	2	8	32485	32492	0 %	0 %	50 %	50 %	307543615
95	NC_014532	CGGG	2	8	32562	32569	0 %	0 %	75 %	25 %	307543615
96	NC_014532	TGCC	2	8	33809	33816	0 %	25 %	25 %	50 %	307543616
97	NC_014532	TGCC	2	8	33849	33856	0 %	25 %	25 %	50 %	307543616
98	NC_014532	GATG	2	8	33965	33972	25 %	25 %	50 %	0 %	307543616
99	NC_014532	CTGG	2	8	34037	34044	0 %	25 %	50 %	25 %	307543616
100	NC_014532	GATG	2	8	34094	34101	25 %	25 %	50 %	0 %	307543616
101	NC_014532	CCTG	2	8	34243	34250	0 %	25 %	25 %	50 %	307543616
102	NC_014532	TCGG	2	8	35116	35123	0 %	25 %	50 %	25 %	307543617
103	NC_014532	GCTC	2	8	35321	35328	0 %	25 %	25 %	50 %	307543617
104	NC_014532	CACC	2	8	35746	35753	25 %	0 %	0 %	75 %	307543618
105	NC_014532	CGGC	2	8	35898	35905	0 %	0 %	50 %	50 %	307543618
106	NC_014532	GCCG	2	8	35927	35934	0 %	0 %	50 %	50 %	307543618
107	NC_014532	CTGG	2	8	36203	36210	0 %	25 %	50 %	25 %	307543618
108	NC_014532	AGGT	2	8	36360	36367	25 %	25 %	50 %	0 %	307543618
109	NC_014532	AGCG	2	8	36540	36547	25 %	0 %	50 %	25 %	307543618
110	NC_014532	GCCA	2	8	36747	36754	25 %	0 %	25 %	50 %	307543618
111	NC_014532	CCGG	2	8	36829	36836	0 %	0 %	50 %	50 %	307543618
112	NC_014532	CAGG	2	8	37033	37040	25 %	0 %	50 %	25 %	307543619
113	NC_014532	CGGT	2	8	37208	37215	0 %	25 %	50 %	25 %	307543619
114	NC_014532	CGGC	2	8	37422	37429	0 %	0 %	50 %	50 %	307543619
115	NC_014532	GGCC	2	8	37695	37702	0 %	0 %	50 %	50 %	307543619
116	NC_014532	CGTC	2	8	38216	38223	0 %	25 %	25 %	50 %	307543619
117	NC_014532	CGGG	2	8	38350	38357	0 %	0 %	75 %	25 %	307543619
118	NC_014532	TCGG	2	8	38503	38510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014532	GATC	2	8	38593	38600	25 %	25 %	25 %	25 %	307543620
120	NC_014532	CTTC	2	8	39326	39333	0 %	50 %	0 %	50 %	307543621
121	NC_014532	CTGG	2	8	40097	40104	0 %	25 %	50 %	25 %	307543622
122	NC_014532	TATC	2	8	42008	42015	25 %	50 %	0 %	25 %	307543624
123	NC_014532	CGAG	2	8	42262	42269	25 %	0 %	50 %	25 %	307543624
124	NC_014532	TGTT	2	8	44152	44159	0 %	75 %	25 %	0 %	307543626
125	NC_014532	GCTG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	50 %	25 %	307543627
126	NC_014532	GGTT	2	8	44497	44504	0 %	50 %	50 %	0 %	307543627
127	NC_014532	CACG	2	8	45256	45263	25 %	0 %	25 %	50 %	307543627
128	NC_014532	GGCG	2	8	45703	45710	0 %	0 %	75 %	25 %	307543628
129	NC_014532	GCTG	2	8	45998	46005	0 %	25 %	50 %	25 %	307543628
130	NC_014532	TGAG	2	8	46455	46462	25 %	25 %	50 %	0 %	307543628
131	NC_014532	TGGC	2	8	47082	47089	0 %	25 %	50 %	25 %	307543629
132	NC_014532	CAGC	2	8	47615	47622	25 %	0 %	25 %	50 %	307543630
133	NC_014532	CGAG	2	8	47766	47773	25 %	0 %	50 %	25 %	307543630
134	NC_014532	GCCG	2	8	48065	48072	0 %	0 %	50 %	50 %	307543630
135	NC_014532	CTTG	2	8	48405	48412	0 %	50 %	25 %	25 %	307543630
136	NC_014532	TCGC	2	8	48434	48441	0 %	25 %	25 %	50 %	307543630
137	NC_014532	TGCA	2	8	48447	48454	25 %	25 %	25 %	25 %	307543630
138	NC_014532	TGAA	2	8	48616	48623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014532	TGAT	2	8	48889	48896	25 %	50 %	25 %	0 %	307543631
140	NC_014532	AATT	2	8	49992	49999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014532	ACCG	2	8	50834	50841	25 %	0 %	25 %	50 %	307543632
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