MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 1549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	ATCG	2	8	1706	1713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014532	GATG	2	8	6594	6601	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014532	AGCG	2	8	21131	21138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014532	GATC	2	8	21201	21208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014532	GCCC	2	8	28067	28074	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_014532	GGTG	2	8	29122	29129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014532	TCGG	2	8	38503	38510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014532	TGAA	2	8	48616	48623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014532	AATT	2	8	49992	49999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014532	GAAC	2	8	59379	59386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014532	GCGA	2	8	60557	60564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014532	TCTG	2	8	66632	66639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014532	GTCA	2	8	70558	70565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014532	TGCC	2	8	76447	76454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014532	TCTA	2	8	84026	84033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014532	CATG	2	8	104228	104235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014532	ACGG	2	8	105803	105810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014532	GGCT	2	8	106763	106770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014532	CGTC	2	8	107761	107768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014532	ACGC	2	8	113683	113690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014532	CAGG	2	8	115068	115075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014532	GGCA	2	8	115640	115647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014532	TCAA	2	8	122368	122375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014532	GATT	2	8	122391	122398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014532	TGGC	2	8	126240	126247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014532	GTCG	2	8	126460	126467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014532	CTTT	2	8	126656	126663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014532	TCGT	2	8	129227	129234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014532	TCCG	2	8	132971	132978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014532	CGAG	2	8	135348	135355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014532	TGGC	2	8	136139	136146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014532	CGGG	2	8	138953	138960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014532	GCCT	2	8	142494	142501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014532	GCAG	2	8	145808	145815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014532	AGGA	2	8	145834	145841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014532	CAGC	2	8	145956	145963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014532	ATCG	2	8	148261	148268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014532	TGCA	2	8	148279	148286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014532	AGCG	2	8	156886	156893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014532	CGGG	2	8	156941	156948	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014532	GCCG	2	8	156991	156998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014532	CGAT	2	8	159265	159272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014532	GCGA	2	8	167268	167275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014532	CCGA	2	8	175149	175156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014532	TCCC	2	8	177952	177959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014532	TTTG	2	8	181528	181535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014532	TAGT	2	8	184283	184290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014532	GATG	2	8	186493	186500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014532	GCAC	2	8	189893	189900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014532	AGGC	2	8	191056	191063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014532	TGCT	2	8	192599	192606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014532	TGAA	2	8	202983	202990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014532	TTAA	2	8	206816	206823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014532	CGGC	2	8	209653	209660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014532	TGGC	2	8	213167	213174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014532	TTCT	2	8	219338	219345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014532	TTTG	2	8	219366	219373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014532	CGGG	2	8	227783	227790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014532	CCGG	2	8	229952	229959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014532	CTGG	2	8	229979	229986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014532	GCAC	2	8	235854	235861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014532	TCCA	2	8	238123	238130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014532	CCTG	2	8	243998	244005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014532	CATC	2	8	244067	244074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014532	GCGG	2	8	250530	250537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014532	TCGC	2	8	250674	250681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014532	AGGG	2	8	257616	257623	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014532	GGTC	2	8	257720	257727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014532	CATT	2	8	257761	257768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014532	TGGT	2	8	259768	259775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014532	GCGT	2	8	260094	260101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014532	TACC	2	8	260501	260508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014532	TCGG	2	8	260655	260662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014532	GCCT	2	8	261369	261376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014532	GAAA	2	8	261541	261548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014532	ACCC	2	8	261751	261758	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_014532	AAAG	2	8	262696	262703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014532	GTTG	2	8	263062	263069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014532	GCTA	2	8	263753	263760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014532	GACA	2	8	263962	263969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014532	AGCG	2	8	264609	264616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014532	GGCG	2	8	267317	267324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014532	CCAA	2	8	280741	280748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014532	CCGG	2	8	312439	312446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014532	AAGG	2	8	313124	313131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014532	AGGG	2	8	313794	313801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014532	TGCC	2	8	313829	313836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014532	GCCG	2	8	316911	316918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014532	CCAT	2	8	331816	331823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014532	CTAA	2	8	333610	333617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014532	TTGT	2	8	340184	340191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014532	CCGA	2	8	343324	343331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014532	CTGG	2	8	350227	350234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014532	ATGC	2	8	354852	354859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014532	CTGC	2	8	356577	356584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014532	TCTA	2	8	357043	357050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014532	GGCT	2	8	357365	357372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014532	TGAC	2	8	357511	357518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014532	TGGA	2	8	357838	357845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014532	CGTA	2	8	358802	358809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014532	CATG	2	8	359194	359201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014532	GTCA	2	8	362074	362081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014532	CGAG	2	8	362646	362653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014532	GGGC	2	8	364232	364239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014532	GTGA	2	8	376970	376977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014532	CGCC	2	8	385758	385765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014532	TCGG	2	8	385777	385784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014532	CGCC	2	8	392760	392767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_014532	CCGG	2	8	392788	392795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014532	TGGT	2	8	393603	393610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014532	GCGT	2	8	393929	393936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014532	TACC	2	8	394336	394343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014532	TCGG	2	8	394490	394497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014532	GCCT	2	8	395302	395309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014532	GAAA	2	8	395474	395481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014532	ACCC	2	8	395684	395691	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014532	AAAG	2	8	396629	396636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014532	GTTG	2	8	396995	397002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014532	GCTA	2	8	397686	397693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014532	GACA	2	8	397895	397902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014532	AGCG	2	8	398542	398549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014532	TTGT	2	8	420936	420943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014532	TGAT	2	8	420959	420966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014532	GCTG	2	8	421550	421557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014532	CTTC	2	8	421798	421805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014532	CATC	2	8	423707	423714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014532	TCGG	2	8	434188	434195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014532	CCGC	2	8	438535	438542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_014532	CTGG	2	8	438555	438562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014532	CCCG	2	8	439469	439476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014532	GCGG	2	8	439489	439496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014532	CGGG	2	8	452528	452535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014532	GCCA	2	8	459752	459759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014532	TCCT	2	8	462470	462477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014532	ACAG	2	8	466884	466891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014532	TGGC	2	8	469245	469252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014532	CCAT	2	8	470389	470396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014532	CCTG	2	8	488385	488392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014532	GCCG	2	8	492176	492183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014532	TGGA	2	8	493067	493074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014532	GTTC	2	8	493299	493306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014532	GGGC	2	8	494580	494587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014532	CATG	2	8	496607	496614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014532	GGCC	2	8	500730	500737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014532	CGGC	2	8	500750	500757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014532	ATTC	2	8	503074	503081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014532	GGCA	2	8	513892	513899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014532	AGGG	2	8	513911	513918	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014532	GAGC	2	8	514878	514885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014532	AGTC	2	8	515524	515531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_014532	CTTC	2	8	613416	613423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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198	NC_014532	ATGT	2	8	636888	636895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_014532	TTCC	2	8	1263553	1263560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_014532	GCCC	2	8	1263703	1263710	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
444	NC_014532	GCCC	2	8	1263801	1263808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
445	NC_014532	GCAG	2	8	1264264	1264271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
446	NC_014532	GATA	2	8	1264553	1264560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
447	NC_014532	CAGG	2	8	1264999	1265006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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449	NC_014532	CAGT	2	8	1265431	1265438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
450	NC_014532	ATGC	2	8	1265642	1265649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
451	NC_014532	ATCC	2	8	1266663	1266670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_014532	GGGC	2	8	1266743	1266750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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456	NC_014532	TAAA	2	8	1270857	1270864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014532	ATAA	2	8	1271000	1271007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_014532	CCGG	2	8	1291152	1291159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_014532	CGGC	2	8	1291173	1291180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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465	NC_014532	AACG	2	8	1307873	1307880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
466	NC_014532	CGAG	2	8	1313380	1313387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_014532	TTCA	2	8	1316047	1316054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
468	NC_014532	TGCG	2	8	1317268	1317275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
469	NC_014532	ATCA	2	8	1317923	1317930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
470	NC_014532	TGTT	2	8	1318511	1318518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_014532	GATG	2	8	1319229	1319236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014532	TCGA	2	8	1319538	1319545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_014532	AAAG	2	8	1319638	1319645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
474	NC_014532	ACTC	2	8	1320107	1320114	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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476	NC_014532	TCGG	2	8	1320262	1320269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
477	NC_014532	TGAG	2	8	1320792	1320799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
478	NC_014532	ATGG	2	8	1321280	1321287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
479	NC_014532	ATGC	2	8	1322259	1322266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
480	NC_014532	TGGG	2	8	1322269	1322276	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
481	NC_014532	TAGT	2	8	1327819	1327826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014532	GCTG	2	8	1327939	1327946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014532	GGTC	2	8	1327957	1327964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_014532	TTGG	2	8	1329551	1329558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
485	NC_014532	GTGG	2	8	1329638	1329645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014532	TCCA	2	8	1330424	1330431	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
487	NC_014532	GGGC	2	8	1332669	1332676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
488	NC_014532	ATCC	2	8	1332688	1332695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_014532	CGGC	2	8	1333168	1333175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_014532	TGAC	2	8	1334438	1334445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_014532	GTTG	2	8	1335909	1335916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014532	GAAT	2	8	1336200	1336207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014532	GACC	2	8	1336468	1336475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_014532	CAGG	2	8	1336721	1336728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014532	ACGG	2	8	1336741	1336748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_014532	CCCG	2	8	1342067	1342074	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
497	NC_014532	CCAG	2	8	1352304	1352311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_014532	TTCG	2	8	1362356	1362363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014532	CGAG	2	8	1367767	1367774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_014532	GCCG	2	8	1367824	1367831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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