MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 7274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	GTG	2	6	25	30	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014532	GAT	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014532	TCC	2	6	96	101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014532	AAG	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014532	GAC	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014532	AGT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014532	GTC	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014532	GAT	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014532	CAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014532	AAC	2	6	7294	7299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014532	GTT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014532	GGC	2	6	7361	7366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014532	GCC	2	6	8622	8627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014532	GCA	2	6	9798	9803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014532	GGA	2	6	11014	11019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014532	ATT	2	6	11045	11050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014532	TCG	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014532	GAA	2	6	11121	11126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014532	GGC	2	6	16392	16397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014532	GGA	2	6	19933	19938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014532	GCC	2	6	21169	21174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014532	GAC	2	6	21186	21191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014532	CAG	2	6	21235	21240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014532	CGT	2	6	21276	21281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014532	GCA	2	6	21312	21317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014532	TCG	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014532	CGG	2	6	21420	21425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014532	CAC	2	6	21512	21517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014532	CCG	2	6	21551	21556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014532	CGA	2	6	21557	21562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014532	GCA	2	6	21570	21575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014532	TCG	2	6	21584	21589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014532	CGC	2	6	21592	21597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014532	GCG	2	6	26300	26305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014532	GTC	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014532	CGG	2	6	26416	26421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014532	GGC	2	6	28141	28146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014532	TGT	2	6	28179	28184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014532	ACG	2	6	28238	28243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014532	CGA	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014532	TGC	2	6	28290	28295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014532	GTG	2	6	28313	28318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014532	GAT	2	6	28374	28379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014532	GCC	2	6	28415	28420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014532	TTC	2	6	28421	28426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014532	TCT	2	6	29256	29261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014532	GCC	2	6	29273	29278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014532	GAA	2	6	29293	29298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014532	CCA	2	6	29720	29725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014532	GCC	2	6	30346	30351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014532	TCG	2	6	34260	34265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014532	GGC	2	6	35598	35603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014532	CGT	2	6	35628	35633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014532	GAA	2	6	38397	38402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014532	CGG	2	6	38430	38435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014532	CAT	2	6	38461	38466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014532	GTC	2	6	38496	38501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014532	CAT	2	6	38517	38522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014532	GCC	2	6	38534	38539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014532	GAA	2	6	38570	38575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014532	GAG	2	6	41177	41182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014532	TCT	2	6	41267	41272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014532	ATA	2	6	41309	41314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014532	GTC	2	6	41342	41347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014532	GGC	2	6	47499	47504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014532	GAG	3	9	47522	47530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014532	CCG	2	6	48565	48570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014532	TTG	2	6	48604	48609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014532	TTC	2	6	49934	49939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014532	CCG	3	9	49943	49951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014532	GCG	2	6	49954	49959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014532	ACC	2	6	50086	50091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014532	AAT	2	6	57803	57808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014532	GTG	2	6	59423	59428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014532	GAC	2	6	62358	62363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014532	CTG	2	6	66675	66680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014532	CCT	2	6	67500	67505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014532	CTA	2	6	67536	67541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014532	GGT	2	6	68584	68589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014532	CCG	2	6	68749	68754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014532	CGG	2	6	69344	69349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014532	CCG	2	6	69365	69370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014532	GCC	2	6	70493	70498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014532	CGG	2	6	70508	70513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014532	ATG	2	6	73265	73270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014532	CGC	2	6	73331	73336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014532	CGA	2	6	73366	73371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014532	AGG	2	6	73518	73523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014532	TGC	2	6	75630	75635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014532	TGA	2	6	75648	75653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014532	TGT	2	6	75699	75704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014532	GCG	2	6	75707	75712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014532	CGA	2	6	75770	75775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014532	ATT	2	6	75777	75782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014532	GTC	2	6	77517	77522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014532	GCC	2	6	78943	78948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014532	TCG	2	6	80288	80293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014532	TGC	2	6	80304	80309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014532	GTT	2	6	80311	80316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014532	TGG	2	6	80456	80461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014532	ATC	2	6	80494	80499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014532	CGT	2	6	80509	80514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014532	GTG	2	6	84002	84007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014532	TGA	2	6	84009	84014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014532	ATA	2	6	84038	84043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014532	TTC	2	6	84081	84086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014532	ACA	2	6	84163	84168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014532	CGT	2	6	85979	85984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014532	TGT	2	6	87343	87348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014532	GTT	2	6	87350	87355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014532	TCC	2	6	88758	88763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014532	CAA	2	6	88874	88879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014532	ACA	2	6	89109	89114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014532	CGT	2	6	89781	89786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014532	GCC	2	6	94477	94482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014532	GCG	2	6	94488	94493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014532	GCG	2	6	94497	94502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014532	GGA	2	6	94503	94508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014532	CGT	2	6	95910	95915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014532	GCG	2	6	95924	95929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014532	ATG	2	6	95933	95938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014532	GAC	2	6	95965	95970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014532	CGA	2	6	96016	96021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014532	GAT	2	6	99198	99203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014532	CGG	2	6	99227	99232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014532	CTT	2	6	100081	100086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014532	ACG	2	6	100119	100124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014532	GCG	2	6	100186	100191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014532	CCG	2	6	100194	100199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014532	GAC	2	6	100210	100215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014532	CTT	2	6	101901	101906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014532	CGG	2	6	101938	101943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014532	TTA	2	6	102275	102280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014532	CTG	2	6	102343	102348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014532	GAT	2	6	103031	103036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014532	CGG	2	6	105144	105149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014532	TCC	2	6	105653	105658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014532	CGG	2	6	105668	105673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014532	CGG	2	6	105735	105740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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