MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTTTTG	2	12	7551	7562	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014507	AATAAA	2	12	67261	67272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014507	GAAAAA	2	12	101527	101538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014507	ATCTTT	2	12	122059	122070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014507	AATATA	2	12	167756	167767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014507	AGATAT	2	12	179489	179500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014507	ATTGTT	2	12	182575	182586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014507	ATCTAT	2	12	223755	223766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014507	TTATAT	2	12	307566	307577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014507	TACGAA	2	12	314725	314736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014507	CTTGCA	2	12	314996	315007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014507	TATCTC	2	12	340003	340014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014507	ATTTTT	2	12	369866	369877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014507	TCCCTC	2	12	416113	416124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014507	CCTCCC	2	12	432845	432856	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_014507	ATTTTT	2	12	443143	443154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014507	TTTGTT	2	12	445793	445804	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014507	ACGAAA	2	12	461569	461580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014507	GATCTG	2	12	461834	461845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014507	TGGGCG	2	12	491518	491529	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014507	TTGTTT	2	12	491585	491596	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014507	ATTTTT	2	12	505932	505943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014507	GTATAT	2	12	526316	526327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014507	ATAGTT	2	12	533947	533958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014507	TTATCC	2	12	670966	670977	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014507	TTTAAA	2	12	692941	692952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014507	CTTTAC	2	12	699741	699752	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014507	AGGCCG	2	12	741738	741749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014507	AAGCGA	2	12	742618	742629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014507	TTTTTG	2	12	761404	761415	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014507	TTGAGG	2	12	787978	787989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014507	GATTTG	2	12	792872	792883	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014507	TCTGGT	2	12	874918	874929	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014507	TTTTTC	2	12	874945	874956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014507	AACTCC	2	12	878040	878051	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014507	GCCGGG	2	12	880700	880711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014507	CCGGGA	2	12	882880	882891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014507	CCGGCA	2	12	950959	950970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014507	CTAAAG	2	12	955379	955390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014507	TCCTCA	2	12	972980	972991	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014507	CTCCGG	2	12	978446	978457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014507	GGAGGT	2	12	1009878	1009889	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014507	ATAAAT	2	12	1030950	1030961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014507	CCTCCC	2	12	1047784	1047795	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_014507	GTGACG	2	12	1161570	1161581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014507	TTTGGA	2	12	1167237	1167248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014507	TTATAA	2	12	1202813	1202824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014507	AAACAA	2	12	1218944	1218955	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014507	ATATGA	2	12	1219608	1219619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014507	CTCGGG	2	12	1221773	1221784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014507	ATTAAA	2	12	1291382	1291393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014507	GAATAT	2	12	1407291	1407302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014507	ATTTAT	2	12	1408556	1408567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014507	TTGTTT	2	12	1467390	1467401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014507	AATTTG	2	12	1475873	1475884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014507	CTTCCC	2	12	1487999	1488010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014507	TGAAAA	2	12	1497217	1497228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014507	ATAACA	2	12	1540147	1540158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014507	CAAAAT	2	12	1563619	1563630	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014507	GAAATA	2	12	1567640	1567651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014507	GAGTAA	2	12	1570486	1570497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014507	CCGGGT	2	12	1583765	1583776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014507	TGCGAT	2	12	1666363	1666374	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014507	TGCCCG	2	12	1670477	1670488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014507	AACTAA	2	12	1693545	1693556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014507	CCTCCC	2	12	1710305	1710316	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_014507	AATTTA	2	12	1739562	1739573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014507	CGGCCC	2	12	1761339	1761350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014507	TCTCAT	2	12	1761678	1761689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014507	CCGGCC	2	12	1763995	1764006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014507	CCGGAG	2	12	1792653	1792664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014507	AATCCA	2	12	1807471	1807482	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014507	TGAATA	2	12	1864925	1864936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014507	TCCCAA	2	12	1888646	1888657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014507	AAATAA	2	12	2025200	2025211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014507	CAAAAT	2	12	2048016	2048027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014507	CCTCTC	2	12	2097296	2097307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014507	ATATTG	2	12	2179564	2179575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014507	AGATTA	2	12	2188990	2189001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014507	GAGTTT	2	12	2230121	2230132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014507	ATAATT	2	12	2249682	2249693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014507	CAGATT	2	12	2263310	2263321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014507	TTGAGG	2	12	2287831	2287842	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014507	CTCCGG	2	12	2291145	2291156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014507	CTCTTC	2	12	2292044	2292055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014507	TTCTCA	2	12	2347863	2347874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014507	TCGCTT	2	12	2354582	2354593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014507	CGGCCT	2	12	2355462	2355473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014507	ATTTTT	2	12	2363719	2363730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014507	AGCAAA	2	12	2380936	2380947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014507	CAGGAA	2	12	2430814	2430825	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014507	AAATTT	2	12	2454047	2454058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014507	CCGGCC	2	12	2482640	2482651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014507	ATTTCC	2	12	2498167	2498178	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014507	ATTTTT	2	12	2499914	2499925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014507	TACAAT	2	12	2512118	2512129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014507	TGAAAT	2	12	2522726	2522737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014507	GATATT	2	12	2554243	2554254	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014507	CATTAT	2	12	2616541	2616552	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014507	CAAATT	2	12	2640081	2640092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014507	CTGAAT	2	12	2646065	2646076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014507	AAAATT	2	12	2657052	2657063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014507	CACCAA	2	12	2731519	2731530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014507	TATTCT	2	12	2778524	2778535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014507	ACATGA	2	12	2799390	2799401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014507	CCCACC	2	12	2822494	2822505	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_014507	GAATCA	2	12	2839948	2839959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.