MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014507	CCGAA	2	10	2490463	2490472	40 %	0 %	20 %	40 %	307354620
1502	NC_014507	CGACC	2	10	2491339	2491348	20 %	0 %	20 %	60 %	307354621
1503	NC_014507	TTTGT	2	10	2498126	2498135	0 %	80 %	20 %	0 %	307354628
1504	NC_014507	CCGGA	2	10	2501395	2501404	20 %	0 %	40 %	40 %	307354630
1505	NC_014507	GAGAA	2	10	2508000	2508009	60 %	0 %	40 %	0 %	307354636
1506	NC_014507	AAACA	2	10	2509748	2509757	80 %	0 %	0 %	20 %	307354638
1507	NC_014507	ATCGA	2	10	2511159	2511168	40 %	20 %	20 %	20 %	307354640
1508	NC_014507	TCCTC	2	10	2511689	2511698	0 %	40 %	0 %	60 %	307354642
1509	NC_014507	CATAT	2	10	2513284	2513293	40 %	40 %	0 %	20 %	307354644
1510	NC_014507	AGGCG	2	10	2513912	2513921	20 %	0 %	60 %	20 %	307354645
1511	NC_014507	GAACT	2	10	2517254	2517263	40 %	20 %	20 %	20 %	307354650
1512	NC_014507	GATCG	2	10	2519748	2519757	20 %	20 %	40 %	20 %	307354652
1513	NC_014507	AATGA	2	10	2520425	2520434	60 %	20 %	20 %	0 %	307354653
1514	NC_014507	GAAAT	2	10	2523149	2523158	60 %	20 %	20 %	0 %	307354655
1515	NC_014507	ATACT	2	10	2523341	2523350	40 %	40 %	0 %	20 %	307354655
1516	NC_014507	TGAGG	2	10	2525133	2525142	20 %	20 %	60 %	0 %	307354657
1517	NC_014507	GATAT	2	10	2526881	2526890	40 %	40 %	20 %	0 %	307354657
1518	NC_014507	TCTTT	2	10	2528107	2528116	0 %	80 %	0 %	20 %	307354657
1519	NC_014507	CCTGC	2	10	2530115	2530124	0 %	20 %	20 %	60 %	307354658
1520	NC_014507	GGGAC	2	10	2530888	2530897	20 %	0 %	60 %	20 %	307354660
1521	NC_014507	GTTTC	2	10	2530899	2530908	0 %	60 %	20 %	20 %	307354660
1522	NC_014507	CCGCT	2	10	2531808	2531817	0 %	20 %	20 %	60 %	307354661
1523	NC_014507	CGGTT	2	10	2532532	2532541	0 %	40 %	40 %	20 %	307354661
1524	NC_014507	CCTCG	2	10	2535763	2535772	0 %	20 %	20 %	60 %	307354665
1525	NC_014507	ACAGG	2	10	2536071	2536080	40 %	0 %	40 %	20 %	307354665
1526	NC_014507	TTTTA	2	10	2538454	2538463	20 %	80 %	0 %	0 %	307354667
1527	NC_014507	TGGGG	2	10	2539934	2539943	0 %	20 %	80 %	0 %	307354668
1528	NC_014507	TTCCG	2	10	2542942	2542951	0 %	40 %	20 %	40 %	307354670
1529	NC_014507	AATAT	2	10	2543494	2543503	60 %	40 %	0 %	0 %	307354671
1530	NC_014507	ACTCC	2	10	2545983	2545992	20 %	20 %	0 %	60 %	307354673
1531	NC_014507	ATCTG	2	10	2546465	2546474	20 %	40 %	20 %	20 %	307354673
1532	NC_014507	AAAAT	2	10	2546778	2546787	80 %	20 %	0 %	0 %	307354673
1533	NC_014507	CTTTC	2	10	2547392	2547401	0 %	60 %	0 %	40 %	307354674
1534	NC_014507	CTGCC	2	10	2548833	2548842	0 %	20 %	20 %	60 %	307354675
1535	NC_014507	CAAAT	2	10	2549912	2549921	60 %	20 %	0 %	20 %	307354676
1536	NC_014507	CCGGC	2	10	2550812	2550821	0 %	0 %	40 %	60 %	307354677
1537	NC_014507	ATTGA	2	10	2552563	2552572	40 %	40 %	20 %	0 %	307354678
1538	NC_014507	CCAGA	2	10	2555890	2555899	40 %	0 %	20 %	40 %	307354683
1539	NC_014507	CGAGG	2	10	2557201	2557210	20 %	0 %	60 %	20 %	307354683
1540	NC_014507	AGATC	2	10	2558799	2558808	40 %	20 %	20 %	20 %	307354685
1541	NC_014507	ATCCG	2	10	2562680	2562689	20 %	20 %	20 %	40 %	307354687
1542	NC_014507	AGGAA	2	10	2563928	2563937	60 %	0 %	40 %	0 %	307354687
1543	NC_014507	TCGAT	2	10	2564932	2564941	20 %	40 %	20 %	20 %	307354688
1544	NC_014507	AAAGG	2	10	2566095	2566104	60 %	0 %	40 %	0 %	307354689
1545	NC_014507	ATACT	2	10	2571039	2571048	40 %	40 %	0 %	20 %	307354693
1546	NC_014507	GGAGA	2	10	2571731	2571740	40 %	0 %	60 %	0 %	307354693
1547	NC_014507	AGGGC	2	10	2572218	2572227	20 %	0 %	60 %	20 %	307354693
1548	NC_014507	CGGAC	2	10	2572260	2572269	20 %	0 %	40 %	40 %	307354693
1549	NC_014507	ACCTG	2	10	2573220	2573229	20 %	20 %	20 %	40 %	307354693
1550	NC_014507	ATACC	2	10	2578341	2578350	40 %	20 %	0 %	40 %	307354698
1551	NC_014507	GGGAA	2	10	2579259	2579268	40 %	0 %	60 %	0 %	307354699
1552	NC_014507	CGATG	2	10	2580153	2580162	20 %	20 %	40 %	20 %	307354700
1553	NC_014507	GCATG	2	10	2580250	2580259	20 %	20 %	40 %	20 %	307354700
1554	NC_014507	TCGCC	2	10	2583338	2583347	0 %	20 %	20 %	60 %	307354702
1555	NC_014507	CATGC	2	10	2588467	2588476	20 %	20 %	20 %	40 %	307354707
1556	NC_014507	GAAAT	2	10	2597238	2597247	60 %	20 %	20 %	0 %	307354714
1557	NC_014507	ATTCA	2	10	2597320	2597329	40 %	40 %	0 %	20 %	307354714
1558	NC_014507	GGAAT	2	10	2597936	2597945	40 %	20 %	40 %	0 %	307354715
1559	NC_014507	CTGTA	2	10	2597946	2597955	20 %	40 %	20 %	20 %	307354715
1560	NC_014507	AGCGG	2	10	2601590	2601599	20 %	0 %	60 %	20 %	307354719
1561	NC_014507	CCTCG	2	10	2603399	2603408	0 %	20 %	20 %	60 %	307354720
1562	NC_014507	GTATC	2	10	2603841	2603850	20 %	40 %	20 %	20 %	307354721
1563	NC_014507	CATTC	2	10	2604989	2604998	20 %	40 %	0 %	40 %	307354722
1564	NC_014507	CGAAA	2	10	2607585	2607594	60 %	0 %	20 %	20 %	307354724
1565	NC_014507	TACCT	2	10	2609177	2609186	20 %	40 %	0 %	40 %	307354726
1566	NC_014507	ATTGT	2	10	2611233	2611242	20 %	60 %	20 %	0 %	307354728
1567	NC_014507	AAAAG	2	10	2612041	2612050	80 %	0 %	20 %	0 %	307354729
1568	NC_014507	TACCT	2	10	2613233	2613242	20 %	40 %	0 %	40 %	307354729
1569	NC_014507	CCGGA	2	10	2615218	2615227	20 %	0 %	40 %	40 %	307354732
1570	NC_014507	TAAGA	2	10	2619179	2619188	60 %	20 %	20 %	0 %	307354733
1571	NC_014507	GTTCA	2	10	2620139	2620148	20 %	40 %	20 %	20 %	307354734
1572	NC_014507	AGACG	2	10	2622208	2622217	40 %	0 %	40 %	20 %	307354736
1573	NC_014507	TTTAT	2	10	2622285	2622294	20 %	80 %	0 %	0 %	307354736
1574	NC_014507	TGGAG	2	10	2622859	2622868	20 %	20 %	60 %	0 %	307354737
1575	NC_014507	GCCAT	2	10	2625302	2625311	20 %	20 %	20 %	40 %	307354740
1576	NC_014507	TAGCA	2	10	2628862	2628871	40 %	20 %	20 %	20 %	307354744
1577	NC_014507	ATGTA	2	10	2629080	2629089	40 %	40 %	20 %	0 %	307354744
1578	NC_014507	GATTA	2	10	2631228	2631237	40 %	40 %	20 %	0 %	307354747
1579	NC_014507	TAACC	2	10	2632082	2632091	40 %	20 %	0 %	40 %	307354747
1580	NC_014507	TTTCT	2	10	2632945	2632954	0 %	80 %	0 %	20 %	307354748
1581	NC_014507	TTTGC	2	10	2635378	2635387	0 %	60 %	20 %	20 %	307354752
1582	NC_014507	TTTTC	2	10	2635664	2635673	0 %	80 %	0 %	20 %	307354752
1583	NC_014507	TATGA	2	10	2636814	2636823	40 %	40 %	20 %	0 %	307354756
1584	NC_014507	AGAAA	2	10	2637863	2637872	80 %	0 %	20 %	0 %	307354757
1585	NC_014507	ACTCT	2	10	2638272	2638281	20 %	40 %	0 %	40 %	307354757
1586	NC_014507	TATCG	2	10	2644003	2644012	20 %	40 %	20 %	20 %	307354760
1587	NC_014507	TCCCG	2	10	2644132	2644141	0 %	20 %	20 %	60 %	307354760
1588	NC_014507	AAATA	2	10	2644345	2644354	80 %	20 %	0 %	0 %	307354760
1589	NC_014507	CAGGG	2	10	2646802	2646811	20 %	0 %	60 %	20 %	307354764
1590	NC_014507	GCCCT	2	10	2650316	2650325	0 %	20 %	20 %	60 %	307354765
1591	NC_014507	AGAGA	2	10	2650558	2650567	60 %	0 %	40 %	0 %	307354765
1592	NC_014507	TTGAA	2	10	2650626	2650635	40 %	40 %	20 %	0 %	307354765
1593	NC_014507	AACAC	2	10	2654068	2654077	60 %	0 %	0 %	40 %	307354768
1594	NC_014507	CCTCC	2	10	2656627	2656636	0 %	20 %	0 %	80 %	307354770
1595	NC_014507	TCTCC	2	10	2664867	2664876	0 %	40 %	0 %	60 %	307354778
1596	NC_014507	CCTGT	2	10	2667419	2667428	0 %	40 %	20 %	40 %	307354779
1597	NC_014507	TCGAT	2	10	2668409	2668418	20 %	40 %	20 %	20 %	307354780
1598	NC_014507	CGGAT	2	10	2672232	2672241	20 %	20 %	40 %	20 %	307354783
1599	NC_014507	CACCG	2	10	2673053	2673062	20 %	0 %	20 %	60 %	307354785
1600	NC_014507	CCAGC	2	10	2675501	2675510	20 %	0 %	20 %	60 %	307354789
1601	NC_014507	CCGAA	2	10	2677060	2677069	40 %	0 %	20 %	40 %	307354790
1602	NC_014507	ATAAA	2	10	2678468	2678477	80 %	20 %	0 %	0 %	307354791
1603	NC_014507	GATGA	2	10	2680809	2680818	40 %	20 %	40 %	0 %	307354795
1604	NC_014507	GCTTT	2	10	2685963	2685972	0 %	60 %	20 %	20 %	307354801
1605	NC_014507	ATCAT	2	10	2687893	2687902	40 %	40 %	0 %	20 %	307354803
1606	NC_014507	TCTCT	2	10	2688412	2688421	0 %	60 %	0 %	40 %	307354803
1607	NC_014507	GCGGG	2	10	2694840	2694849	0 %	0 %	80 %	20 %	307354813
1608	NC_014507	ATCCA	2	10	2696941	2696950	40 %	20 %	0 %	40 %	307354814
1609	NC_014507	GAGAA	2	10	2700428	2700437	60 %	0 %	40 %	0 %	307354817
1610	NC_014507	TTATC	2	10	2701941	2701950	20 %	60 %	0 %	20 %	307354819
1611	NC_014507	AGGCC	2	10	2706367	2706376	20 %	0 %	40 %	40 %	307354823
1612	NC_014507	TCCTG	2	10	2706782	2706791	0 %	40 %	20 %	40 %	307354824
1613	NC_014507	AGAGA	2	10	2706903	2706912	60 %	0 %	40 %	0 %	307354824
1614	NC_014507	CGCCC	2	10	2707235	2707244	0 %	0 %	20 %	80 %	307354825
1615	NC_014507	GAAGA	2	10	2707659	2707668	60 %	0 %	40 %	0 %	307354826
1616	NC_014507	GTGGA	2	10	2710887	2710896	20 %	20 %	60 %	0 %	307354829
1617	NC_014507	CGAAG	2	10	2714928	2714937	40 %	0 %	40 %	20 %	307354833
1618	NC_014507	TGCCC	2	10	2716679	2716688	0 %	20 %	20 %	60 %	307354835
1619	NC_014507	CCTCG	2	10	2717581	2717590	0 %	20 %	20 %	60 %	307354836
1620	NC_014507	CTGTA	2	10	2717650	2717659	20 %	40 %	20 %	20 %	307354836
1621	NC_014507	TGCAA	2	10	2717756	2717765	40 %	20 %	20 %	20 %	307354836
1622	NC_014507	CCCGC	2	10	2721110	2721119	0 %	0 %	20 %	80 %	307354839
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1624	NC_014507	TGATA	2	10	2722985	2722994	40 %	40 %	20 %	0 %	307354841
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.