MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 38923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014507	GAA	2	6	101	106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014507	ATA	2	6	209	214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014507	GTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014507	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014507	AGC	2	6	327	332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014507	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014507	TTC	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
9	NC_014507	CGG	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352169
10	NC_014507	ATA	2	6	541	546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352169
11	NC_014507	ACA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
12	NC_014507	TTG	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352169
13	NC_014507	TCC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
14	NC_014507	GAA	3	9	1143	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
15	NC_014507	TCC	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
16	NC_014507	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352169
17	NC_014507	CAG	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352169
18	NC_014507	CTT	2	6	1467	1472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
19	NC_014507	CAA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
20	NC_014507	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
21	NC_014507	CGG	2	6	1807	1812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014507	CAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352170
23	NC_014507	TCG	3	9	2174	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352170
24	NC_014507	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352170
25	NC_014507	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
26	NC_014507	ACT	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
27	NC_014507	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352171
28	NC_014507	TTC	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352171
29	NC_014507	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352171
30	NC_014507	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352171
31	NC_014507	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
32	NC_014507	CCG	2	6	2999	3004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
33	NC_014507	GGA	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
34	NC_014507	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
35	NC_014507	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
36	NC_014507	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
37	NC_014507	TGT	2	6	3390	3395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352171
38	NC_014507	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352171
39	NC_014507	TAA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014507	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014507	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014507	AAT	2	6	3719	3724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014507	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
44	NC_014507	TCT	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352172
45	NC_014507	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
46	NC_014507	CCG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
47	NC_014507	TAC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
48	NC_014507	CAG	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
49	NC_014507	GCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
50	NC_014507	CCG	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
51	NC_014507	GTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
52	NC_014507	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
53	NC_014507	CTC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
54	NC_014507	TCC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
55	NC_014507	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
56	NC_014507	TCC	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
57	NC_014507	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
58	NC_014507	AGA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
59	NC_014507	GTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
60	NC_014507	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
61	NC_014507	GAC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
62	NC_014507	TGA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
63	NC_014507	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
64	NC_014507	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
65	NC_014507	GGA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
66	NC_014507	CGT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
67	NC_014507	GTA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
68	NC_014507	GCC	2	6	5571	5576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
69	NC_014507	CGG	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
70	NC_014507	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352172
71	NC_014507	GAG	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
72	NC_014507	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
73	NC_014507	AGA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
74	NC_014507	AGA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
75	NC_014507	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
76	NC_014507	GAC	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
77	NC_014507	GGC	2	6	6340	6345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
78	NC_014507	GAA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
79	NC_014507	AGC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
80	NC_014507	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352172
81	NC_014507	CCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
82	NC_014507	ATG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
83	NC_014507	AGC	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
84	NC_014507	GCT	3	9	6611	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
85	NC_014507	GGT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014507	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352173
87	NC_014507	CCT	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
88	NC_014507	TTG	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352173
89	NC_014507	CGG	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352173
90	NC_014507	GAT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352173
91	NC_014507	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
92	NC_014507	GGA	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352173
93	NC_014507	TCT	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352173
94	NC_014507	CGA	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352173
95	NC_014507	GTG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352173
96	NC_014507	ATA	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014507	CAA	2	6	7622	7627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014507	GAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
99	NC_014507	GAT	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
100	NC_014507	GTT	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352174
101	NC_014507	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352174
102	NC_014507	GCC	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352174
103	NC_014507	TCC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352174
104	NC_014507	GAC	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352174
105	NC_014507	GAT	2	6	8243	8248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
106	NC_014507	TTC	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352174
107	NC_014507	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
108	NC_014507	TGA	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
109	NC_014507	AGA	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352174
110	NC_014507	CTG	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
111	NC_014507	TAG	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
112	NC_014507	AAG	2	6	8555	8560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352174
113	NC_014507	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352174
114	NC_014507	TTA	2	6	8645	8650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014507	TCT	2	6	8703	8708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014507	TCA	2	6	8847	8852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014507	TAA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
118	NC_014507	AAT	2	6	8956	8961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
119	NC_014507	GAT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352175
120	NC_014507	GCG	2	6	9081	9086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352175
121	NC_014507	CGA	2	6	9136	9141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
122	NC_014507	GCA	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
123	NC_014507	CGA	2	6	9499	9504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352175
124	NC_014507	AGA	2	6	9574	9579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352175
125	NC_014507	GCG	2	6	9695	9700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352175
126	NC_014507	AGC	2	6	9871	9876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014507	GCG	2	6	10013	10018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352176
128	NC_014507	CTT	2	6	10051	10056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352176
129	NC_014507	GAT	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352177
130	NC_014507	GAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352177
131	NC_014507	GGA	2	6	10427	10432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352177
132	NC_014507	GAG	2	6	10446	10451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352177
133	NC_014507	TTC	2	6	10570	10575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352177
134	NC_014507	GTT	2	6	10587	10592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352177
135	NC_014507	TTC	2	6	10602	10607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352177
136	NC_014507	CCG	2	6	10658	10663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352178
137	NC_014507	TGG	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352178
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139	NC_014507	TCT	2	6	10855	10860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352178
140	NC_014507	GAG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352178
141	NC_014507	AGG	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352178
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146	NC_014507	GGT	2	6	11160	11165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352178
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153	NC_014507	CTT	2	6	11513	11518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352178
154	NC_014507	ATC	2	6	11656	11661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352179
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159	NC_014507	TGT	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352179
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162	NC_014507	TAA	2	6	12513	12518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014507	ATT	2	6	12535	12540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014507	GGA	2	6	14229	14234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014507	TTC	2	6	14285	14290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_014507	GTT	2	6	14310	14315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_014507	TTA	2	6	14489	14494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014507	TTG	2	6	14505	14510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_014507	GGC	4	12	37465	37476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352195
500	NC_014507	CAG	2	6	37585	37590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195

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