MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 chromosome

Total Repeats: 995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014506	TGAATA	2	12	3297	3308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307719924
2	NC_014506	AAAAGA	2	12	3654	3665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307719924
3	NC_014506	AAAATA	3	18	5711	5728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307719925
4	NC_014506	AAAATG	2	12	7480	7491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307719927
5	NC_014506	AACACA	2	12	12250	12261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307719931
6	NC_014506	CAGATA	2	12	23272	23283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307719944
7	NC_014506	GGATTT	2	12	23743	23754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307719945
8	NC_014506	TAAAAA	2	12	23872	23883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307719945
9	NC_014506	CATTTG	2	12	25787	25798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307719946
10	NC_014506	AAAAAT	2	12	28982	28993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307719951
11	NC_014506	ATGTCA	2	12	30037	30048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307719952
12	NC_014506	TAAAGA	2	12	30152	30163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307719952
13	NC_014506	TCAAAA	2	12	31491	31502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307719954
14	NC_014506	GAAGAG	2	12	32726	32737	50 %	0 %	50 %	0 %	307719955
15	NC_014506	TATTGC	2	12	32968	32979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307719956
16	NC_014506	TTTTGA	2	12	34368	34379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307719956
17	NC_014506	CAAATC	2	12	35027	35038	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307719956
18	NC_014506	CAAAAG	2	12	37171	37182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307719957
19	NC_014506	CAGATG	2	12	41240	41251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307719962
20	NC_014506	AATATT	2	12	43445	43456	50 %	50 %	0 %	0 %	307719964
21	NC_014506	ATGGAA	2	12	43602	43613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307719964
22	NC_014506	CAAATG	2	12	45467	45478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307719965
23	NC_014506	TTGATT	2	12	45749	45760	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307719965
24	NC_014506	ACGGTG	2	12	46106	46117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307719965
25	NC_014506	ATATAA	2	12	46996	47007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307719966
26	NC_014506	TGATTT	2	12	49877	49888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307719968
27	NC_014506	ACACGG	2	12	52451	52462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307719970
28	NC_014506	CTGGAT	2	12	54629	54640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307719973
29	NC_014506	CCGAGT	2	12	58761	58772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307719976
30	NC_014506	AACGGT	2	12	59552	59563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307719976
31	NC_014506	AAAATC	2	12	59850	59861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307719976
32	NC_014506	ACCGAC	2	12	59954	59965	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307719976
33	NC_014506	TGAGGT	2	12	61421	61432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307719979
34	NC_014506	ATAGAT	2	12	62321	62332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014506	GAAACT	2	12	63973	63984	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307719980
36	NC_014506	ATTTTT	2	12	64319	64330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307719980
37	NC_014506	TGCAGA	2	12	66879	66890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307719984
38	NC_014506	TTTGCA	2	12	67266	67277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307719984
39	NC_014506	AAGACT	2	12	67977	67988	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307719984
40	NC_014506	AAATGA	2	12	69559	69570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307719986
41	NC_014506	TCAAGA	2	12	72816	72827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307719989
42	NC_014506	TGTCGA	2	12	74332	74343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307719989
43	NC_014506	GGGTGT	2	12	74651	74662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307719989
44	NC_014506	GCCTAT	2	12	77825	77836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307719991
45	NC_014506	TAAATC	2	12	78221	78232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307719992
46	NC_014506	ACATCT	2	12	81800	81811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307719996
47	NC_014506	TGGGCA	2	12	83598	83609	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307719997
48	NC_014506	ATTTCA	2	12	85591	85602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307719998
49	NC_014506	GTATTG	2	12	86592	86603	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307719999
50	NC_014506	TCGCTC	2	12	91718	91729	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307720006
51	NC_014506	GCTATG	2	12	96370	96381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014506	AGTAAA	2	12	101933	101944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307720017
53	NC_014506	GAAAAA	2	12	102637	102648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307720018
54	NC_014506	GGTGCA	2	12	106727	106738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307720023
55	NC_014506	TTGGAT	2	12	107060	107071	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307720023
56	NC_014506	AGGCAG	2	12	116684	116695	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307720035
57	NC_014506	TAATCA	2	12	117486	117497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720035
58	NC_014506	TGTAAG	2	12	118661	118672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307720036
59	NC_014506	TTCATT	2	12	128841	128852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307720047
60	NC_014506	TTCACG	2	12	129501	129512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307720047
61	NC_014506	ATTTTT	2	12	135616	135627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307720053
62	NC_014506	TGTCTT	2	12	135891	135902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307720054
63	NC_014506	TTTTAA	2	12	135976	135987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307720054
64	NC_014506	ATTTAA	2	12	137568	137579	50 %	50 %	0 %	0 %	307720055
65	NC_014506	ATCTGC	2	12	139042	139053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307720057
66	NC_014506	AAATTA	2	12	139760	139771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307720057
67	NC_014506	GTGGAT	2	12	140361	140372	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307720059
68	NC_014506	AAAATG	2	12	151599	151610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307720073
69	NC_014506	CTAAAA	2	12	152773	152784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307720074
70	NC_014506	TAGATA	2	12	153271	153282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307720074
71	NC_014506	AGAGAA	2	12	155769	155780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307720077
72	NC_014506	CTATTA	2	12	155860	155871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307720077
73	NC_014506	CCTAAT	2	12	166445	166456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307720092
74	NC_014506	CAAAAA	2	12	167202	167213	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307720092
75	NC_014506	AAATCA	2	12	169637	169648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307720093
76	NC_014506	AAAAGG	2	12	171092	171103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014506	GTTTTT	2	12	172126	172137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	307720096
78	NC_014506	ATCAAT	2	12	173209	173220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720097
79	NC_014506	TAGCAC	2	12	182459	182470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307720107
80	NC_014506	TGCATT	2	12	182763	182774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307720107
81	NC_014506	CAACAT	2	12	183330	183341	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307720107
82	NC_014506	CATATA	2	12	184388	184399	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720107
83	NC_014506	TTTTAT	2	12	184498	184509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307720108
84	NC_014506	TAAAAT	2	12	189242	189253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014506	ATCTAA	2	12	192901	192912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720117
86	NC_014506	GGGCAA	2	12	193344	193355	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307720117
87	NC_014506	CAGATG	2	12	196834	196845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307720121
88	NC_014506	GGTGCC	2	12	201532	201543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307720125
89	NC_014506	CAAATC	2	12	201803	201814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307720125
90	NC_014506	AATAAC	2	12	202666	202677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307720126
91	NC_014506	ACTGGA	2	12	203018	203029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307720127
92	NC_014506	GAAGCA	2	12	203259	203270	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307720128
93	NC_014506	ATGTAA	2	12	204840	204851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307720129
94	NC_014506	TCTTTA	2	12	206810	206821	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307720131
95	NC_014506	TCATTA	2	12	208090	208101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307720132
96	NC_014506	TCTATT	2	12	208134	208145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307720132
97	NC_014506	GAACCA	2	12	208525	208536	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307720132
98	NC_014506	GATTTA	2	12	211809	211820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307720136
99	NC_014506	ACCTTT	2	12	212229	212240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307720137
100	NC_014506	AGTTGC	2	12	214935	214946	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307720142
101	NC_014506	AAAGGT	2	12	218336	218347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307720151
102	NC_014506	TGCAAC	2	12	218564	218575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307720152
103	NC_014506	CGTTTT	2	12	218868	218879	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307720153
104	NC_014506	CTGGTA	2	12	219307	219318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307720154
105	NC_014506	AAAAGA	2	12	219366	219377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307720154
106	NC_014506	CAAAAC	2	12	220358	220369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307720155
107	NC_014506	TTCACG	2	12	224979	224990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307720162
108	NC_014506	ATGAAA	2	12	225129	225140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307720162
109	NC_014506	CTTTCT	2	12	230935	230946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307720170
110	NC_014506	AAAAAG	2	12	232262	232273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307720172
111	NC_014506	AAAAGA	2	12	232908	232919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307720172
112	NC_014506	TGGTGT	2	12	239196	239207	0 %	50 %	50 %	0 %	307720180
113	NC_014506	AAATGG	2	12	241323	241334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307720182
114	NC_014506	AGAGTG	2	12	241691	241702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307720183
115	NC_014506	AAACTT	2	12	242268	242279	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720183
116	NC_014506	CAGCGG	2	12	243768	243779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307720185
117	NC_014506	CGGCAG	2	12	244900	244911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307720186
118	NC_014506	CAGATG	2	12	245213	245224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307720187
119	NC_014506	AAAACA	2	12	249093	249104	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307720192
120	NC_014506	CAAAAA	2	12	250072	250083	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307720193
121	NC_014506	ATGTTA	2	12	252586	252597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307720196
122	NC_014506	TACTTA	2	12	254213	254224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307720197
123	NC_014506	TTTAAG	2	12	254756	254767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014506	ATACTA	2	12	255228	255239	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307720198
125	NC_014506	TACAAC	2	12	255682	255693	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307720198
126	NC_014506	GTTAAA	2	12	256790	256801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307720200
127	NC_014506	GATATT	2	12	261431	261442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307720204
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129	NC_014506	ATATGT	2	12	262912	262923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307720205
130	NC_014506	TAGATA	2	12	264203	264214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307720206
131	NC_014506	ATTTTG	2	12	264515	264526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307720206
132	NC_014506	TAAACA	2	12	268516	268527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014506	AAAAGA	2	12	274620	274631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307720218
134	NC_014506	GAGACA	2	12	274658	274669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307720218
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138	NC_014506	TTTGGG	2	12	281324	281335	0 %	50 %	50 %	0 %	307720226
139	NC_014506	GAGATT	2	12	281456	281467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307720226
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145	NC_014506	TGAAAA	2	12	303204	303215	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307720244
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147	NC_014506	TTTTCA	2	12	305671	305682	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307720247
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149	NC_014506	CCGCCT	2	12	308591	308602	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	307720250
150	NC_014506	GCATCC	2	12	308836	308847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307720251
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152	NC_014506	ATAATC	2	12	310239	310250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_014506	AGTACA	2	12	310844	310855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307720255
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155	NC_014506	ATTTGT	2	12	321666	321677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307720264
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157	NC_014506	TTTGTA	2	12	327276	327287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307720267
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169	NC_014506	GTTCAA	2	12	360226	360237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307720304
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180	NC_014506	TCTTTG	2	12	381975	381986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307720323
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185	NC_014506	TACTAT	2	12	388087	388098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
186	NC_014506	GTTCTA	2	12	389614	389625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307720331
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229	NC_014506	ATTGAT	2	12	493268	493279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307720430
230	NC_014506	AGATGA	2	12	494928	494939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307720432
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232	NC_014506	CAACGG	2	12	497587	497598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307720437
233	NC_014506	TAAAAA	2	12	498381	498392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_014506	TTTCTA	2	12	498889	498900	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307720439
235	NC_014506	CCTGTA	2	12	500233	500244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307720439
236	NC_014506	AAATTA	2	12	500661	500672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_014506	TATTTT	2	12	505786	505797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307720446
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239	NC_014506	AAAATT	2	12	514274	514285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_014506	ACTGAT	2	12	516716	516727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307720457
241	NC_014506	CTGCAG	2	12	516804	516815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307720457
242	NC_014506	ATTTGT	2	12	518905	518916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307720459
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245	NC_014506	TTGGAC	2	12	523638	523649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307720465
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334	NC_014506	GTAAGA	2	12	694755	694766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307720639
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