MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 chromosome

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014506	ATAGAT	2	12	62321	62332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014506	GCTATG	2	12	96370	96381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014506	AAAAGG	2	12	171092	171103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014506	TAAAAT	2	12	189242	189253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014506	TTTAAG	2	12	254756	254767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014506	TAAACA	2	12	268516	268527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014506	ATAATC	2	12	310239	310250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014506	TACTAT	2	12	388087	388098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014506	TAAAAA	2	12	498381	498392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014506	AAATTA	2	12	500661	500672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014506	AAAATT	2	12	514274	514285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014506	TTATAA	2	12	579595	579606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014506	GGATTG	2	12	589951	589962	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014506	AAATTT	2	12	647013	647024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014506	TTAAAT	2	12	647132	647143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014506	AGATAA	2	12	679243	679254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014506	TTTTAA	2	12	688487	688498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014506	ATAAAG	2	12	696241	696252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014506	AGGGCT	2	12	699488	699499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014506	ATAAAA	2	12	732055	732066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014506	GCTACG	2	12	1126605	1126616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014506	AATTTT	2	12	1149800	1149811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014506	AATTTT	2	12	1153161	1153172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014506	TATATT	2	12	1165771	1165782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014506	TTAGAT	2	12	1175379	1175390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014506	GTATTA	2	12	1175460	1175471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014506	TCATAA	2	12	1224705	1224716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014506	CAAACT	2	12	1228845	1228856	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014506	ATATTA	2	12	1366501	1366512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014506	TTCATT	2	12	1366532	1366543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014506	TACATC	2	12	1373140	1373151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014506	TATTTT	2	12	1384887	1384898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014506	ACCAAA	2	12	1418266	1418277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014506	CAAATA	2	12	1418296	1418307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014506	TAATTT	2	12	1442996	1443007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014506	AATAAA	2	12	1468528	1468539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014506	TGCTCT	2	12	1494295	1494306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014506	TTTAAA	2	12	1503254	1503265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014506	CACTTA	2	12	1662377	1662388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014506	GCACCG	2	12	1674114	1674125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014506	ATTTTT	2	12	1683825	1683836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014506	ATTTAT	2	12	1924972	1924983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014506	TAAAAA	2	12	1982919	1982930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014506	TTATTT	2	12	2029226	2029237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014506	TGCGTT	2	12	2036683	2036694	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014506	TTAATT	2	12	2108073	2108084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.