MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 chromosome

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014506	CTTAT	2	10	11074	11083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014506	ATCAC	2	10	17754	17763	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014506	TGAAA	2	10	17782	17791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014506	ACTAA	2	10	65916	65925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014506	TATTT	2	10	81903	81912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014506	CTTTG	2	10	96167	96176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014506	TTTAT	2	10	109332	109341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014506	ATTAA	2	10	109369	109378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014506	TAAAA	2	10	130742	130751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014506	CAATA	2	10	151350	151359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014506	AAATT	2	10	153588	153597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014506	TAAGT	2	10	153606	153615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014506	TATTT	2	10	172196	172205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014506	AATTT	2	10	188693	188702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014506	ACTTA	2	10	202927	202936	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014506	ATTTT	2	10	223490	223499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014506	GTGGA	2	10	256751	256760	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014506	TTACA	2	10	271469	271478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014506	ACAAT	2	10	277119	277128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014506	ATTTT	2	10	285299	285308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014506	TAATC	2	10	285721	285730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014506	TAAAA	2	10	285747	285756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014506	AAAAG	2	10	304291	304300	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014506	ATTAT	2	10	305765	305774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014506	ACTTA	2	10	310164	310173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014506	GAATA	2	10	310266	310275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014506	AAAAG	2	10	323390	323399	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014506	GCTTT	2	10	323428	323437	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014506	TTAAA	2	10	334594	334603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014506	GTATA	2	10	340210	340219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014506	ATAAC	2	10	366334	366343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014506	TATAT	2	10	372237	372246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014506	AAATT	2	10	388142	388151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014506	TTTAT	2	10	436826	436835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014506	AAAGC	2	10	438214	438223	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014506	ATGAT	2	10	446614	446623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014506	AATTT	2	10	485394	485403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014506	ATTTT	2	10	496123	496132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014506	AAAAT	2	10	503339	503348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014506	GAAAA	2	10	519605	519614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014506	AGAAA	2	10	533576	533585	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014506	TCTTG	2	10	541984	541993	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014506	TTTGA	2	10	554195	554204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014506	AGTTA	2	10	598868	598877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014506	TATTT	2	10	610144	610153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014506	CTTAT	2	10	635962	635971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014506	AATAT	2	10	636372	636381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014506	ATTTT	2	10	655094	655103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014506	TCTAT	2	10	696292	696301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014506	TCGTG	2	10	697504	697513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014506	AAATT	2	10	698435	698444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014506	TTTTA	2	10	698451	698460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014506	CCGTA	2	10	700229	700238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014506	CAATT	2	10	712950	712959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014506	CAAAA	2	10	721378	721387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014506	ATTAT	2	10	731991	732000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014506	TATAT	2	10	748812	748821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014506	ATTTA	2	10	782026	782035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014506	TAAAA	2	10	785891	785900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014506	AAAAT	2	10	792443	792452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014506	ATTAC	2	10	807375	807384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014506	ATTTA	2	10	813103	813112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014506	ATATT	2	10	831154	831163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014506	AAAGG	2	10	856471	856480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014506	AAAAT	2	10	876259	876268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014506	TAATC	2	10	876648	876657	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014506	AAATT	2	10	886271	886280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014506	TTTAT	2	10	886657	886666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014506	TTTTA	2	10	904389	904398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014506	TGCTT	2	10	953376	953385	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014506	TATAA	2	10	996190	996199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014506	AGTAT	2	10	1056372	1056381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014506	ATATT	2	10	1075483	1075492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014506	TAAAA	2	10	1100740	1100749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014506	CTTAT	2	10	1120055	1120064	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014506	TATAA	2	10	1121161	1121170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014506	AATAA	2	10	1121903	1121912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014506	ATTTT	2	10	1147791	1147800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014506	AAGAA	2	10	1154727	1154736	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014506	GATAA	2	10	1165827	1165836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014506	AATTT	2	10	1181265	1181274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014506	CTCTT	2	10	1185172	1185181	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014506	ATAGT	2	10	1187564	1187573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014506	TGTGA	2	10	1191397	1191406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014506	TTGAT	2	10	1198026	1198035	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014506	ACAAA	2	10	1210354	1210363	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014506	ATTAA	2	10	1213739	1213748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014506	AAAGC	2	10	1215451	1215460	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014506	ATTTT	2	10	1235852	1235861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014506	AAAAT	2	10	1265063	1265072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014506	TATAT	2	10	1289570	1289579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014506	ATTTA	2	10	1292571	1292580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014506	TTTGC	2	10	1303689	1303698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014506	AAAAT	2	10	1313423	1313432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014506	ATTTT	2	10	1357389	1357398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014506	TAGTA	2	10	1361940	1361949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014506	TAATT	2	10	1362020	1362029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014506	TAAAC	2	10	1362038	1362047	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014506	AAATA	2	10	1402561	1402570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014506	ATTTT	2	10	1406299	1406308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014506	ATAAC	2	10	1406678	1406687	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014506	TTTAA	2	10	1423179	1423188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014506	CCTCA	2	10	1437197	1437206	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_014506	TTATA	2	10	1449321	1449330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014506	AATAT	2	10	1504968	1504977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014506	TTAAT	2	10	1509351	1509360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014506	TTTAA	2	10	1512483	1512492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014506	ATATT	2	10	1513987	1513996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014506	TATCT	2	10	1524381	1524390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014506	TTATA	2	10	1526268	1526277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014506	AAATA	2	10	1537965	1537974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014506	ACCTT	2	10	1542143	1542152	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014506	TAATA	2	10	1561144	1561153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014506	TACGG	2	10	1567474	1567483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014506	TCTCT	2	10	1569185	1569194	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014506	CACGA	2	10	1569942	1569951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014506	ATAGA	2	10	1571154	1571163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014506	AAAGC	2	10	1590118	1590127	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014506	AAATT	2	10	1591874	1591883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014506	TGAAA	2	10	1678534	1678543	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014506	ACAAA	2	10	1710091	1710100	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014506	TATAT	2	10	1712430	1712439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014506	TTTTA	2	10	1712708	1712717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014506	AATAG	2	10	1712898	1712907	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014506	TAAAA	2	10	1730453	1730462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014506	TACGG	2	10	1737261	1737270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014506	CACGA	2	10	1739841	1739850	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014506	ATAGA	2	10	1741053	1741062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014506	TAATT	2	10	1778598	1778607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014506	ATTTT	2	10	1797255	1797264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014506	TTTAC	2	10	1799954	1799963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014506	TTAAT	2	10	1858921	1858930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014506	TAAAG	2	10	1891827	1891836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014506	ATTAA	3	15	1898100	1898114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014506	ATTAT	2	10	1908757	1908766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014506	AGGCT	2	10	1925066	1925075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014506	TTTTC	2	10	1928321	1928330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014506	TAAAT	2	10	1969339	1969348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014506	AATTA	2	10	1979602	1979611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014506	AGATT	2	10	1988447	1988456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014506	ATTTA	2	10	1988519	1988528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014506	CCATC	2	10	1990774	1990783	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_014506	TTTTA	2	10	1991702	1991711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014506	ATATA	2	10	2036912	2036921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014506	AATAT	2	10	2056381	2056390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014506	ATTTT	2	10	2077471	2077480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014506	AAATA	2	10	2082377	2082386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014506	AAATA	2	10	2085674	2085683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014506	TTTCA	2	10	2087613	2087622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014506	ACCTT	2	10	2109530	2109539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014506	TAATG	2	10	2116260	2116269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014506	TTATA	2	10	2116275	2116284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014506	TAATA	2	10	2116316	2116325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014506	GATAA	2	10	2116546	2116555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014506	TACGG	2	10	2118217	2118226	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014506	TAAAA	2	10	2119995	2120004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014506	AATTT	2	10	2120011	2120020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014506	CACGA	2	10	2120942	2120951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_014506	ATAGA	2	10	2122154	2122163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014506	TTATT	2	10	2122416	2122425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014506	TGATG	2	10	2137452	2137461	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014506	TTTTA	2	10	2143307	2143316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.