MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782205

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014504	ACAGC	2	10	62	71	40 %	0 %	20 %	40 %	307149646
2	NC_014504	CCTAA	2	10	1298	1307	40 %	20 %	0 %	40 %	307149648
3	NC_014504	AAAGG	2	10	2157	2166	60 %	0 %	40 %	0 %	307149649
4	NC_014504	TTACA	2	10	2271	2280	40 %	40 %	0 %	20 %	307149649
5	NC_014504	CTTGT	2	10	4568	4577	0 %	60 %	20 %	20 %	307149652
6	NC_014504	CCCAC	2	10	6336	6345	20 %	0 %	0 %	80 %	307149654
7	NC_014504	AATTG	2	10	10905	10914	40 %	40 %	20 %	0 %	307149656
8	NC_014504	TGAAG	2	10	11431	11440	40 %	20 %	40 %	0 %	307149656
9	NC_014504	AAATT	2	10	12085	12094	60 %	40 %	0 %	0 %	307149656
10	NC_014504	AGGAA	2	10	12324	12333	60 %	0 %	40 %	0 %	307149656
11	NC_014504	TTTTA	2	10	12692	12701	20 %	80 %	0 %	0 %	307149657
12	NC_014504	GAAAG	2	10	17733	17742	60 %	0 %	40 %	0 %	307149659
13	NC_014504	AGCAG	2	10	18678	18687	40 %	0 %	40 %	20 %	307149659
14	NC_014504	TTAAC	2	10	19324	19333	40 %	40 %	0 %	20 %	307149660
15	NC_014504	ACAAG	2	10	20874	20883	60 %	0 %	20 %	20 %	307149661
16	NC_014504	TGGGA	2	10	23755	23764	20 %	20 %	60 %	0 %	307149661
17	NC_014504	CGTGC	2	10	26785	26794	0 %	20 %	40 %	40 %	307149663
18	NC_014504	GAATG	2	10	31902	31911	40 %	20 %	40 %	0 %	307149667
19	NC_014504	ACTTA	2	10	37582	37591	40 %	40 %	0 %	20 %	307149673
20	NC_014504	ACCAA	2	10	40428	40437	60 %	0 %	0 %	40 %	307149678
21	NC_014504	TCAAA	2	10	40609	40618	60 %	20 %	0 %	20 %	307149678
22	NC_014504	TTGAT	2	10	41775	41784	20 %	60 %	20 %	0 %	307149678
23	NC_014504	ATTTT	2	10	43315	43324	20 %	80 %	0 %	0 %	307149678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.