MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782205

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014504	CTTT	2	8	134	141	0 %	75 %	0 %	25 %	307149646
2	NC_014504	AGCC	2	8	315	322	25 %	0 %	25 %	50 %	307149647
3	NC_014504	CAAA	2	8	462	469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014504	TTTC	2	8	615	622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014504	CAAA	2	8	1576	1583	75 %	0 %	0 %	25 %	307149649
6	NC_014504	TAAA	2	8	1681	1688	75 %	25 %	0 %	0 %	307149649
7	NC_014504	CATC	2	8	1833	1840	25 %	25 %	0 %	50 %	307149649
8	NC_014504	TTTA	2	8	1967	1974	25 %	75 %	0 %	0 %	307149649
9	NC_014504	GGAA	2	8	2297	2304	50 %	0 %	50 %	0 %	307149649
10	NC_014504	GAAC	2	8	2622	2629	50 %	0 %	25 %	25 %	307149649
11	NC_014504	TTAC	2	8	2770	2777	25 %	50 %	0 %	25 %	307149649
12	NC_014504	GATT	2	8	3618	3625	25 %	50 %	25 %	0 %	307149650
13	NC_014504	TAAT	2	8	3922	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	307149650
14	NC_014504	TGCT	2	8	5008	5015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014504	TTGG	2	8	5095	5102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014504	TTCA	2	8	5141	5148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014504	TTCA	2	8	5405	5412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014504	GATT	2	8	5542	5549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014504	TTTA	2	8	6065	6072	25 %	75 %	0 %	0 %	307149654
20	NC_014504	TTTC	2	8	7279	7286	0 %	75 %	0 %	25 %	307149654
21	NC_014504	AAGG	2	8	8178	8185	50 %	0 %	50 %	0 %	307149654
22	NC_014504	AAAT	2	8	8630	8637	75 %	25 %	0 %	0 %	307149654
23	NC_014504	CTTG	2	8	8719	8726	0 %	50 %	25 %	25 %	307149654
24	NC_014504	GAAG	2	8	8925	8932	50 %	0 %	50 %	0 %	307149654
25	NC_014504	ATGG	2	8	9064	9071	25 %	25 %	50 %	0 %	307149654
26	NC_014504	CATT	2	8	9561	9568	25 %	50 %	0 %	25 %	307149655
27	NC_014504	TCCT	2	8	9756	9763	0 %	50 %	0 %	50 %	307149656
28	NC_014504	ATAA	2	8	9796	9803	75 %	25 %	0 %	0 %	307149656
29	NC_014504	TCCT	2	8	12123	12130	0 %	50 %	0 %	50 %	307149656
30	NC_014504	ATTA	2	8	12708	12715	50 %	50 %	0 %	0 %	307149657
31	NC_014504	TGTC	2	8	13202	13209	0 %	50 %	25 %	25 %	307149657
32	NC_014504	TAAC	2	8	14272	14279	50 %	25 %	0 %	25 %	307149658
33	NC_014504	AGAA	2	8	14294	14301	75 %	0 %	25 %	0 %	307149658
34	NC_014504	CCAT	2	8	15680	15687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014504	GATA	2	8	16236	16243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014504	CTGA	2	8	16448	16455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014504	TTGC	2	8	16671	16678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014504	TAAA	2	8	17220	17227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014504	GCTT	2	8	17630	17637	0 %	50 %	25 %	25 %	307149659
40	NC_014504	AAGA	2	8	17935	17942	75 %	0 %	25 %	0 %	307149659
41	NC_014504	TTTC	2	8	18662	18669	0 %	75 %	0 %	25 %	307149659
42	NC_014504	ATCC	2	8	18709	18716	25 %	25 %	0 %	50 %	307149659
43	NC_014504	TGAT	2	8	19645	19652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014504	CCTT	2	8	19793	19800	0 %	50 %	0 %	50 %	307149661
45	NC_014504	CTGG	2	8	19953	19960	0 %	25 %	50 %	25 %	307149661
46	NC_014504	CAAT	2	8	21664	21671	50 %	25 %	0 %	25 %	307149661
47	NC_014504	TGGC	2	8	22198	22205	0 %	25 %	50 %	25 %	307149661
48	NC_014504	GCAA	2	8	22712	22719	50 %	0 %	25 %	25 %	307149661
49	NC_014504	ATTG	2	8	23199	23206	25 %	50 %	25 %	0 %	307149661
50	NC_014504	AATT	2	8	23804	23811	50 %	50 %	0 %	0 %	307149661
51	NC_014504	CAGC	2	8	24320	24327	25 %	0 %	25 %	50 %	307149661
52	NC_014504	TTAC	2	8	24367	24374	25 %	50 %	0 %	25 %	307149661
53	NC_014504	AAGA	2	8	25162	25169	75 %	0 %	25 %	0 %	307149661
54	NC_014504	ATCG	2	8	25310	25317	25 %	25 %	25 %	25 %	307149662
55	NC_014504	GGCC	2	8	25378	25385	0 %	0 %	50 %	50 %	307149662
56	NC_014504	CCTG	2	8	25476	25483	0 %	25 %	25 %	50 %	307149662
57	NC_014504	GTTG	2	8	25790	25797	0 %	50 %	50 %	0 %	307149662
58	NC_014504	AGTT	2	8	26303	26310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014504	ATCA	2	8	26385	26392	50 %	25 %	0 %	25 %	307149663
60	NC_014504	GAAA	2	8	27289	27296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014504	TCAA	2	8	27356	27363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014504	TTTA	2	8	28619	28626	25 %	75 %	0 %	0 %	307149666
63	NC_014504	TCAA	2	8	28690	28697	50 %	25 %	0 %	25 %	307149666
64	NC_014504	GAAA	2	8	29248	29255	75 %	0 %	25 %	0 %	307149666
65	NC_014504	TCCG	2	8	29755	29762	0 %	25 %	25 %	50 %	307149666
66	NC_014504	GGGT	2	8	29966	29973	0 %	25 %	75 %	0 %	307149666
67	NC_014504	CTGT	2	8	30205	30212	0 %	50 %	25 %	25 %	307149666
68	NC_014504	TCCG	2	8	30256	30263	0 %	25 %	25 %	50 %	307149666
69	NC_014504	TACT	2	8	30424	30431	25 %	50 %	0 %	25 %	307149666
70	NC_014504	TCAA	2	8	30492	30499	50 %	25 %	0 %	25 %	307149666
71	NC_014504	ACTC	2	8	31256	31263	25 %	25 %	0 %	50 %	307149666
72	NC_014504	ACTT	2	8	31960	31967	25 %	50 %	0 %	25 %	307149667
73	NC_014504	CTTT	2	8	31982	31989	0 %	75 %	0 %	25 %	307149667
74	NC_014504	CTCA	2	8	32000	32007	25 %	25 %	0 %	50 %	307149667
75	NC_014504	TTTA	2	8	32197	32204	25 %	75 %	0 %	0 %	307149667
76	NC_014504	ATTG	2	8	32542	32549	25 %	50 %	25 %	0 %	307149667
77	NC_014504	GAAA	2	8	32614	32621	75 %	0 %	25 %	0 %	307149667
78	NC_014504	TTCC	2	8	32726	32733	0 %	50 %	0 %	50 %	307149667
79	NC_014504	CTTG	2	8	33612	33619	0 %	50 %	25 %	25 %	307149668
80	NC_014504	AGTA	2	8	35143	35150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014504	ACAG	2	8	35532	35539	50 %	0 %	25 %	25 %	307149670
82	NC_014504	TATT	2	8	35738	35745	25 %	75 %	0 %	0 %	307149671
83	NC_014504	TTAA	2	8	36145	36152	50 %	50 %	0 %	0 %	307149671
84	NC_014504	GACT	2	8	36469	36476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014504	GATT	2	8	37876	37883	25 %	50 %	25 %	0 %	307149673
86	NC_014504	GAAA	2	8	37964	37971	75 %	0 %	25 %	0 %	307149673
87	NC_014504	ACGA	2	8	38058	38065	50 %	0 %	25 %	25 %	307149673
88	NC_014504	TTCG	2	8	38747	38754	0 %	50 %	25 %	25 %	307149675
89	NC_014504	AATT	2	8	38758	38765	50 %	50 %	0 %	0 %	307149675
90	NC_014504	TCTT	2	8	39616	39623	0 %	75 %	0 %	25 %	307149677
91	NC_014504	TAAT	2	8	39871	39878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014504	TCAA	2	8	40548	40555	50 %	25 %	0 %	25 %	307149678
93	NC_014504	CTGG	2	8	40709	40716	0 %	25 %	50 %	25 %	307149678
94	NC_014504	AAAC	2	8	40823	40830	75 %	0 %	0 %	25 %	307149678
95	NC_014504	AAAT	2	8	40935	40942	75 %	25 %	0 %	0 %	307149678
96	NC_014504	AACC	2	8	40976	40983	50 %	0 %	0 %	50 %	307149678
97	NC_014504	AGCA	2	8	41265	41272	50 %	0 %	25 %	25 %	307149678
98	NC_014504	CTAC	2	8	41714	41721	25 %	25 %	0 %	50 %	307149678
99	NC_014504	ATCA	2	8	41813	41820	50 %	25 %	0 %	25 %	307149678
100	NC_014504	ACAA	2	8	41964	41971	75 %	0 %	0 %	25 %	307149678
101	NC_014504	AATG	2	8	42001	42008	50 %	25 %	25 %	0 %	307149678
102	NC_014504	ACAA	2	8	42246	42253	75 %	0 %	0 %	25 %	307149678
103	NC_014504	TAAA	2	8	42882	42889	75 %	25 %	0 %	0 %	307149678
104	NC_014504	AACA	2	8	43040	43047	75 %	0 %	0 %	25 %	307149678
105	NC_014504	AAAG	2	8	43095	43102	75 %	0 %	25 %	0 %	307149678
106	NC_014504	TTGT	2	8	43397	43404	0 %	75 %	25 %	0 %	307149678
107	NC_014504	AAGT	2	8	43440	43447	50 %	25 %	25 %	0 %	307149678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.