MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782205

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014504	GAT	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149646
2	NC_014504	TAG	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149646
3	NC_014504	GGC	2	6	188	193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149646
4	NC_014504	TTA	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014504	CGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149647
6	NC_014504	ATT	2	6	486	491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014504	ATT	2	6	541	546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014504	ATT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014504	ACA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149648
10	NC_014504	AGA	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149648
11	NC_014504	TAC	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149648
12	NC_014504	TCA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149648
13	NC_014504	AGC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149648
14	NC_014504	AGG	2	6	1154	1159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149648
15	NC_014504	ACA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149648
16	NC_014504	GAT	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149648
17	NC_014504	TGC	2	6	1366	1371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149649
18	NC_014504	CGG	2	6	1389	1394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149649
19	NC_014504	GGA	2	6	1403	1408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149649
20	NC_014504	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149649
21	NC_014504	AGC	2	6	1553	1558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149649
22	NC_014504	GAA	2	6	1626	1631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
23	NC_014504	ATT	3	9	1699	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149649
24	NC_014504	TTG	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149649
25	NC_014504	GAA	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
26	NC_014504	AAG	2	6	2191	2196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
27	NC_014504	TCA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149649
28	NC_014504	TAA	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149649
29	NC_014504	AGA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
30	NC_014504	TGG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149649
31	NC_014504	AAC	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149649
32	NC_014504	AGA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149649
33	NC_014504	TCA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149649
34	NC_014504	TTA	2	6	3009	3014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149650
35	NC_014504	CAA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149650
36	NC_014504	AAG	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149650
37	NC_014504	GTC	2	6	3400	3405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149650
38	NC_014504	AGT	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149650
39	NC_014504	CGT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149650
40	NC_014504	CAA	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149650
41	NC_014504	GAA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149650
42	NC_014504	GCG	2	6	3502	3507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149650
43	NC_014504	CTC	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149650
44	NC_014504	AGC	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149650
45	NC_014504	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149650
46	NC_014504	AGC	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149650
47	NC_014504	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014504	GTA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014504	GGC	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014504	AAT	2	6	4112	4117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149651
51	NC_014504	AGA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149651
52	NC_014504	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149651
53	NC_014504	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149651
54	NC_014504	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149651
55	NC_014504	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149652
56	NC_014504	ATT	2	6	4512	4517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
57	NC_014504	ATT	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
58	NC_014504	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149652
59	NC_014504	TTA	2	6	4734	4739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149652
60	NC_014504	TCC	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014504	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014504	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014504	CCT	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014504	GAC	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014504	ATG	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014504	CTA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014504	AAT	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014504	TAC	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014504	CTT	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014504	AGC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014504	CCA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014504	AAT	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014504	TAA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149653
74	NC_014504	TCT	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149653
75	NC_014504	TTC	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149653
76	NC_014504	AAT	2	6	5917	5922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149653
77	NC_014504	TCA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149653
78	NC_014504	ATG	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149653
79	NC_014504	ATC	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014504	ATT	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014504	TCA	2	6	6123	6128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
82	NC_014504	CAA	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149654
83	NC_014504	ATC	2	6	6168	6173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
84	NC_014504	TTC	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
85	NC_014504	CTG	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149654
86	NC_014504	CGG	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149654
87	NC_014504	CCA	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
88	NC_014504	ATC	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
89	NC_014504	GAG	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149654
90	NC_014504	ATA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
91	NC_014504	TAT	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149654
92	NC_014504	TCT	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
93	NC_014504	CAC	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
94	NC_014504	AGG	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149654
95	NC_014504	CAG	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149654
96	NC_014504	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
97	NC_014504	TCA	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
98	NC_014504	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
99	NC_014504	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149654
100	NC_014504	CTG	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149654
101	NC_014504	TTA	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149654
102	NC_014504	ATC	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
103	NC_014504	GTT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149654
104	NC_014504	CAT	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
105	NC_014504	GGC	2	6	7553	7558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149654
106	NC_014504	TCA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149654
107	NC_014504	TGA	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149654
108	NC_014504	GGT	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149654
109	NC_014504	AAT	2	6	7811	7816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
110	NC_014504	CCA	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149654
111	NC_014504	AAT	2	6	7928	7933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
112	NC_014504	TCT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
113	NC_014504	CTT	2	6	7990	7995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
114	NC_014504	GCA	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149654
115	NC_014504	AAT	2	6	8155	8160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
116	NC_014504	TTC	2	6	8237	8242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
117	NC_014504	AAG	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149654
118	NC_014504	TTC	2	6	8330	8335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
119	NC_014504	TGG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149654
120	NC_014504	GAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149654
121	NC_014504	GCA	2	6	8485	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149654
122	NC_014504	TTG	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149654
123	NC_014504	AGA	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149654
124	NC_014504	AAG	2	6	8816	8821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149654
125	NC_014504	TAA	2	6	8824	8829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149654
126	NC_014504	GGA	2	6	8953	8958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149654
127	NC_014504	CTT	2	6	9004	9009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149654
128	NC_014504	GTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149654
129	NC_014504	GAA	2	6	9184	9189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149654
130	NC_014504	ATA	2	6	9214	9219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149655
131	NC_014504	GTT	2	6	9364	9369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149655
132	NC_014504	AAT	2	6	9419	9424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149655
133	NC_014504	CCG	2	6	9454	9459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149655
134	NC_014504	AAG	2	6	9524	9529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149655
135	NC_014504	CGA	2	6	9657	9662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149655
136	NC_014504	CCA	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149656
137	NC_014504	AGG	2	6	9769	9774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149656
138	NC_014504	GAC	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149656
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140	NC_014504	AGA	2	6	10057	10062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149656
141	NC_014504	CTT	2	6	10091	10096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149656
142	NC_014504	ATT	2	6	10183	10188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149656
143	NC_014504	AAT	2	6	10221	10226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149656
144	NC_014504	TAC	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149656
145	NC_014504	ATC	2	6	10513	10518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149656
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149	NC_014504	TGT	2	6	10753	10758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149656
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152	NC_014504	GCG	2	6	11069	11074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149656
153	NC_014504	CCA	2	6	11169	11174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149656
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155	NC_014504	TGT	2	6	11311	11316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149656
156	NC_014504	TGT	2	6	11374	11379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149656
157	NC_014504	TTG	2	6	11469	11474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149656
158	NC_014504	TAG	2	6	11523	11528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149656
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160	NC_014504	GTT	2	6	11637	11642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149656
161	NC_014504	TCA	2	6	11671	11676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149656
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163	NC_014504	AAT	2	6	11737	11742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149656
164	NC_014504	CCG	2	6	11774	11779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149656
165	NC_014504	TTA	2	6	11824	11829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149656
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178	NC_014504	ATT	2	6	12683	12688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_014504	GAA	2	6	19008	19013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149660
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261	NC_014504	CTC	2	6	19067	19072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149660
262	NC_014504	CAG	2	6	19197	19202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149660
263	NC_014504	AGC	2	6	19214	19219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149660
264	NC_014504	TTG	2	6	19299	19304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149660
265	NC_014504	GTA	2	6	19362	19367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149660
266	NC_014504	AAG	2	6	19378	19383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149660
267	NC_014504	GAA	2	6	19425	19430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149660
268	NC_014504	TCC	2	6	19483	19488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149660
269	NC_014504	AAG	2	6	19489	19494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149660
270	NC_014504	AGA	2	6	19632	19637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014504	TTC	2	6	19707	19712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149661
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382	NC_014504	CAA	2	6	27831	27836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_014504	TTG	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_014504	ACC	2	6	28197	28202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149666
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