MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	TATTT	2	10	975	984	20 %	80 %	0 %	0 %	307149681
2	NC_014503	ATTAT	2	10	2513	2522	40 %	60 %	0 %	0 %	307149681
3	NC_014503	CTAAG	2	10	4591	4600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014503	AACGG	2	10	4939	4948	40 %	0 %	40 %	20 %	307149683
5	NC_014503	TTACC	2	10	5518	5527	20 %	40 %	0 %	40 %	307149683
6	NC_014503	TGATT	2	10	8885	8894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014503	ATTTT	2	10	8917	8926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014503	ATTCA	2	10	9213	9222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014503	AATTT	2	10	9277	9286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014503	TTGAG	2	10	12175	12184	20 %	40 %	40 %	0 %	307149685
11	NC_014503	TTGGC	2	10	14722	14731	0 %	40 %	40 %	20 %	307149688
12	NC_014503	CTTTT	2	10	15246	15255	0 %	80 %	0 %	20 %	307149688
13	NC_014503	TCGCT	2	10	16123	16132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014503	TAAAA	2	10	18367	18376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014503	CGTGG	2	10	19000	19009	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014503	AACCG	2	10	21018	21027	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014503	CTATC	2	10	24196	24205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014503	TGCTT	2	10	24311	24320	0 %	60 %	20 %	20 %	307149692
19	NC_014503	ATTAG	2	10	24807	24816	40 %	40 %	20 %	0 %	307149692
20	NC_014503	TGTTC	2	10	27004	27013	0 %	60 %	20 %	20 %	307149692
21	NC_014503	ACAGA	2	10	28717	28726	60 %	0 %	20 %	20 %	307149695
22	NC_014503	ACAAG	2	10	30271	30280	60 %	0 %	20 %	20 %	307149697
23	NC_014503	CAGGG	2	10	34238	34247	20 %	0 %	60 %	20 %	307149700
24	NC_014503	GGATG	2	10	35021	35030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014503	ACCTT	2	10	35137	35146	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014503	CCCAA	2	10	35166	35175	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014503	TTTCT	2	10	35407	35416	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014503	TTAAA	2	10	35597	35606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014503	ATTCT	2	10	36814	36823	20 %	60 %	0 %	20 %	307149701
30	NC_014503	GTAAA	2	10	38052	38061	60 %	20 %	20 %	0 %	307149702
31	NC_014503	AGTTC	2	10	41458	41467	20 %	40 %	20 %	20 %	307149705
32	NC_014503	ACAGC	2	10	41605	41614	40 %	0 %	20 %	40 %	307149705
33	NC_014503	ACTGT	2	10	43075	43084	20 %	40 %	20 %	20 %	307149705
34	NC_014503	GGCGG	2	10	43656	43665	0 %	0 %	80 %	20 %	307149705
35	NC_014503	AGGAA	2	10	44622	44631	60 %	0 %	40 %	0 %	307149705
36	NC_014503	TCTCT	2	10	44960	44969	0 %	60 %	0 %	40 %	307149706

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.