MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	ATTT	2	8	71	78	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
2	NC_014503	TAAA	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	307149680
3	NC_014503	AGTC	2	8	406	413	25 %	25 %	25 %	25 %	307149680
4	NC_014503	ATTT	2	8	450	457	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
5	NC_014503	TATT	2	8	572	579	25 %	75 %	0 %	0 %	307149680
6	NC_014503	AAGG	2	8	783	790	50 %	0 %	50 %	0 %	307149681
7	NC_014503	ATTT	2	8	955	962	25 %	75 %	0 %	0 %	307149681
8	NC_014503	AGTT	2	8	1388	1395	25 %	50 %	25 %	0 %	307149681
9	NC_014503	ACTC	2	8	1413	1420	25 %	25 %	0 %	50 %	307149681
10	NC_014503	CATT	2	8	1478	1485	25 %	50 %	0 %	25 %	307149681
11	NC_014503	GTTC	2	8	3045	3052	0 %	50 %	25 %	25 %	307149681
12	NC_014503	ATTT	2	8	3152	3159	25 %	75 %	0 %	0 %	307149681
13	NC_014503	GTGG	2	8	3197	3204	0 %	25 %	75 %	0 %	307149681
14	NC_014503	AGAA	2	8	3317	3324	75 %	0 %	25 %	0 %	307149682
15	NC_014503	GATT	2	8	3573	3580	25 %	50 %	25 %	0 %	307149682
16	NC_014503	TCCA	2	8	3961	3968	25 %	25 %	0 %	50 %	307149682
17	NC_014503	TTAA	2	8	3982	3989	50 %	50 %	0 %	0 %	307149682
18	NC_014503	AGTT	2	8	4196	4203	25 %	50 %	25 %	0 %	307149682
19	NC_014503	TTAT	2	8	4426	4433	25 %	75 %	0 %	0 %	307149682
20	NC_014503	TTAA	2	8	4624	4631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014503	TCAA	2	8	5232	5239	50 %	25 %	0 %	25 %	307149683
22	NC_014503	GATA	2	8	5641	5648	50 %	25 %	25 %	0 %	307149683
23	NC_014503	CAGG	2	8	5696	5703	25 %	0 %	50 %	25 %	307149683
24	NC_014503	ATTG	2	8	5968	5975	25 %	50 %	25 %	0 %	307149683
25	NC_014503	TTAA	2	8	6221	6228	50 %	50 %	0 %	0 %	307149684
26	NC_014503	CGAG	2	8	6366	6373	25 %	0 %	50 %	25 %	307149684
27	NC_014503	GGAA	2	8	7188	7195	50 %	0 %	50 %	0 %	307149684
28	NC_014503	ATTG	2	8	7273	7280	25 %	50 %	25 %	0 %	307149684
29	NC_014503	GACA	2	8	7833	7840	50 %	0 %	25 %	25 %	307149684
30	NC_014503	ATTA	2	8	7990	7997	50 %	50 %	0 %	0 %	307149684
31	NC_014503	CCAA	2	8	8081	8088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014503	TTCC	2	8	8211	8218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014503	ACTA	2	8	8793	8800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014503	CTTT	2	8	9496	9503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014503	ATTA	2	8	9507	9514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014503	ACCT	2	8	10227	10234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014503	ATAA	2	8	11094	11101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014503	ATTG	2	8	11247	11254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014503	ATAA	2	8	11289	11296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014503	GGTT	2	8	11485	11492	0 %	50 %	50 %	0 %	307149685
41	NC_014503	AATT	2	8	11968	11975	50 %	50 %	0 %	0 %	307149685
42	NC_014503	AATA	2	8	12407	12414	75 %	25 %	0 %	0 %	307149685
43	NC_014503	TTCT	2	8	12442	12449	0 %	75 %	0 %	25 %	307149685
44	NC_014503	AATA	2	8	12914	12921	75 %	25 %	0 %	0 %	307149686
45	NC_014503	TATC	2	8	12988	12995	25 %	50 %	0 %	25 %	307149686
46	NC_014503	CCTA	2	8	13124	13131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014503	AAGA	2	8	13153	13160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014503	AATT	2	8	13977	13984	50 %	50 %	0 %	0 %	307149687
49	NC_014503	CAAT	2	8	14077	14084	50 %	25 %	0 %	25 %	307149687
50	NC_014503	TCTA	2	8	14820	14827	25 %	50 %	0 %	25 %	307149688
51	NC_014503	CAAC	2	8	14890	14897	50 %	0 %	0 %	50 %	307149688
52	NC_014503	TGTA	2	8	15036	15043	25 %	50 %	25 %	0 %	307149688
53	NC_014503	CTTT	2	8	15053	15060	0 %	75 %	0 %	25 %	307149688
54	NC_014503	TCAT	2	8	15628	15635	25 %	50 %	0 %	25 %	307149688
55	NC_014503	CAGC	2	8	15657	15664	25 %	0 %	25 %	50 %	307149688
56	NC_014503	CAAC	2	8	15929	15936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014503	TTTA	2	8	16215	16222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014503	TTAA	2	8	17277	17284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014503	CTTC	2	8	17689	17696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014503	CATC	2	8	18219	18226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014503	GTCA	2	8	18887	18894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014503	ATAA	2	8	19411	19418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014503	AATT	2	8	19532	19539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014503	TGGT	2	8	20265	20272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014503	TCAA	2	8	20443	20450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014503	TGAT	2	8	20686	20693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014503	GAAA	2	8	20922	20929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014503	AATT	2	8	21232	21239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014503	TTAA	2	8	21388	21395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014503	TTGA	2	8	22513	22520	25 %	50 %	25 %	0 %	307149690
71	NC_014503	CTGA	2	8	22652	22659	25 %	25 %	25 %	25 %	307149690
72	NC_014503	TTGA	2	8	22717	22724	25 %	50 %	25 %	0 %	307149690
73	NC_014503	AGGA	2	8	22733	22740	50 %	0 %	50 %	0 %	307149690
74	NC_014503	GCTT	2	8	22979	22986	0 %	50 %	25 %	25 %	307149690
75	NC_014503	GTTT	2	8	23803	23810	0 %	75 %	25 %	0 %	307149691
76	NC_014503	CTAA	2	8	24243	24250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014503	GCTT	2	8	24274	24281	0 %	50 %	25 %	25 %	307149692
78	NC_014503	CCTT	2	8	24411	24418	0 %	50 %	0 %	50 %	307149692
79	NC_014503	CTGT	2	8	24513	24520	0 %	50 %	25 %	25 %	307149692
80	NC_014503	ACGG	2	8	25238	25245	25 %	0 %	50 %	25 %	307149692
81	NC_014503	GAGG	2	8	25367	25374	25 %	0 %	75 %	0 %	307149692
82	NC_014503	CTTG	2	8	26188	26195	0 %	50 %	25 %	25 %	307149692
83	NC_014503	CCAA	2	8	27175	27182	50 %	0 %	0 %	50 %	307149692
84	NC_014503	GGAA	2	8	27496	27503	50 %	0 %	50 %	0 %	307149693
85	NC_014503	AATG	2	8	27526	27533	50 %	25 %	25 %	0 %	307149693
86	NC_014503	CGAC	2	8	27983	27990	25 %	0 %	25 %	50 %	307149694
87	NC_014503	TCAA	2	8	28173	28180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014503	TAAT	2	8	29005	29012	50 %	50 %	0 %	0 %	307149695
89	NC_014503	TGTT	2	8	29052	29059	0 %	75 %	25 %	0 %	307149695
90	NC_014503	GGTT	2	8	29154	29161	0 %	50 %	50 %	0 %	307149695
91	NC_014503	AGGG	2	8	29719	29726	25 %	0 %	75 %	0 %	307149696
92	NC_014503	GTTG	2	8	29766	29773	0 %	50 %	50 %	0 %	307149696
93	NC_014503	TGAG	2	8	29870	29877	25 %	25 %	50 %	0 %	307149696
94	NC_014503	CTGT	2	8	30707	30714	0 %	50 %	25 %	25 %	307149698
95	NC_014503	GGCT	2	8	30771	30778	0 %	25 %	50 %	25 %	307149698
96	NC_014503	TAAA	2	8	31030	31037	75 %	25 %	0 %	0 %	307149699
97	NC_014503	CCAC	2	8	31125	31132	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014503	AAGC	2	8	31135	31142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014503	TCAA	2	8	31197	31204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014503	TCAA	2	8	31329	31336	50 %	25 %	0 %	25 %	307149700
101	NC_014503	AACA	2	8	31391	31398	75 %	0 %	0 %	25 %	307149700
102	NC_014503	TAAA	2	8	31820	31827	75 %	25 %	0 %	0 %	307149700
103	NC_014503	ATTA	2	8	31856	31863	50 %	50 %	0 %	0 %	307149700
104	NC_014503	AATA	2	8	33533	33540	75 %	25 %	0 %	0 %	307149700
105	NC_014503	ATTG	2	8	33876	33883	25 %	50 %	25 %	0 %	307149700
106	NC_014503	AAGA	2	8	34228	34235	75 %	0 %	25 %	0 %	307149700
107	NC_014503	TAAA	2	8	34980	34987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014503	TAGT	2	8	36235	36242	25 %	50 %	25 %	0 %	307149701
109	NC_014503	AACA	2	8	36294	36301	75 %	0 %	0 %	25 %	307149701
110	NC_014503	TCTG	2	8	36849	36856	0 %	50 %	25 %	25 %	307149701
111	NC_014503	AATT	2	8	37003	37010	50 %	50 %	0 %	0 %	307149701
112	NC_014503	ATTA	2	8	37095	37102	50 %	50 %	0 %	0 %	307149701
113	NC_014503	TGTT	2	8	37749	37756	0 %	75 %	25 %	0 %	307149702
114	NC_014503	GTTT	2	8	39621	39628	0 %	75 %	25 %	0 %	307149703
115	NC_014503	TTTG	2	8	40088	40095	0 %	75 %	25 %	0 %	307149704
116	NC_014503	GGAG	2	8	40251	40258	25 %	0 %	75 %	0 %	307149704
117	NC_014503	TTGT	3	12	40388	40399	0 %	75 %	25 %	0 %	307149704
118	NC_014503	AGGA	2	8	41134	41141	50 %	0 %	50 %	0 %	307149704
119	NC_014503	TAAA	2	8	41870	41877	75 %	25 %	0 %	0 %	307149705
120	NC_014503	GTTC	2	8	44425	44432	0 %	50 %	25 %	25 %	307149705
121	NC_014503	ATTT	2	8	44586	44593	25 %	75 %	0 %	0 %	307149705
122	NC_014503	GAAA	2	8	45386	45393	75 %	0 %	25 %	0 %	307149706
123	NC_014503	ACAA	2	8	46250	46257	75 %	0 %	0 %	25 %	307149707
124	NC_014503	AAAG	2	8	46605	46612	75 %	0 %	25 %	0 %	307149707
125	NC_014503	AGAA	2	8	47021	47028	75 %	0 %	25 %	0 %	307149707
126	NC_014503	GTTT	2	8	47444	47451	0 %	75 %	25 %	0 %	307149707

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.