MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014503	TAA	2	6	8103	8108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014503	TTG	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014503	GAC	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014503	TTC	2	6	8361	8366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014503	TTC	2	6	8388	8393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014503	ATT	2	6	8625	8630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014503	ACA	2	6	8752	8757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014503	TAT	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014503	GAA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014503	TAT	2	6	8978	8983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014503	TCA	3	9	9061	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014503	TTC	2	6	9132	9137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014503	TAC	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014503	AGA	2	6	9255	9260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014503	TAT	2	6	9440	9445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014503	GAA	2	6	9533	9538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014503	TAT	2	6	9542	9547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014503	CCA	2	6	9561	9566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014503	CCT	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014503	AGG	2	6	9903	9908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014503	GTT	2	6	9995	10000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014503	CAT	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014503	GTA	2	6	10113	10118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014503	TTG	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014503	ATT	2	6	10263	10268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014503	GTT	2	6	10296	10301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014503	AGG	2	6	10332	10337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014503	TAT	2	6	10350	10355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014503	TGT	2	6	10450	10455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014503	TTA	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014503	TTA	2	6	10534	10539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014503	GAT	2	6	10567	10572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014503	CTA	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014503	CTT	2	6	10694	10699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014503	CTT	2	6	10730	10735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014503	GAA	2	6	10780	10785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014503	TCT	2	6	10834	10839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014503	TAA	3	9	10848	10856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014503	TTA	2	6	10862	10867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014503	ATA	2	6	10874	10879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014503	AAT	2	6	10920	10925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014503	TAT	2	6	10935	10940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014503	TTC	2	6	10941	10946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014503	AAT	2	6	11010	11015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014503	TCT	3	9	11029	11037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014503	TGA	2	6	11070	11075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014503	ATT	2	6	11088	11093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014503	ATT	2	6	11103	11108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014503	TGA	2	6	11149	11154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014503	GAT	2	6	11224	11229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014503	TCA	2	6	11320	11325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014503	CTG	2	6	11340	11345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014503	ACA	2	6	11360	11365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014503	TCT	2	6	11369	11374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014503	TTA	2	6	12615	12620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014503	TAT	2	6	13132	13137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014503	ACT	2	6	13200	13205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014503	TTG	2	6	13207	13212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014503	ACT	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014503	TCA	2	6	14269	14274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014503	AAT	2	6	15787	15792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014503	CTC	2	6	15885	15890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014503	TCA	2	6	15899	15904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014503	TTG	2	6	15994	15999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014503	ACT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014503	CTT	2	6	16422	16427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014503	ATT	2	6	16459	16464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014503	GAG	2	6	16636	16641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014503	CTA	2	6	16661	16666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014503	TAA	2	6	16720	16725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014503	TTG	2	6	16765	16770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014503	CGA	2	6	16866	16871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014503	TGC	2	6	16953	16958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014503	CGA	2	6	17028	17033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014503	CGT	2	6	17082	17087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014503	TAA	2	6	17195	17200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014503	TCA	2	6	17230	17235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014503	TGT	2	6	17238	17243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014503	ATA	2	6	17441	17446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014503	CAT	2	6	17467	17472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014503	GAG	2	6	17517	17522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014503	ATT	2	6	17555	17560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014503	TTG	2	6	17599	17604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014503	ATA	2	6	17661	17666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014503	TCA	2	6	17671	17676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014503	CTC	2	6	17797	17802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014503	ACT	2	6	17902	17907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014503	TAA	2	6	18010	18015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014503	AAT	2	6	18288	18293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014503	GAA	2	6	18350	18355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014503	TTG	2	6	18503	18508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014503	GTT	2	6	18583	18588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014503	ACT	2	6	18765	18770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014503	CAT	2	6	18818	18823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014503	ACG	2	6	18872	18877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014503	GTC	2	6	18910	18915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014503	AGA	2	6	18935	18940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014503	ACT	2	6	19037	19042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014503	TGC	2	6	19250	19255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014503	TTC	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014503	ATT	2	6	19439	19444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014503	TCA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014503	CTT	2	6	19493	19498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014503	TGA	2	6	19509	19514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014503	TAA	2	6	19526	19531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014503	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014503	TAA	2	6	19635	19640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014503	TAA	2	6	19664	19669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014503	ATT	2	6	19726	19731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014503	CGT	2	6	19739	19744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014503	ATA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014503	TTC	2	6	20160	20165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014503	GTA	2	6	20186	20191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014503	TCG	2	6	20412	20417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014503	GAG	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014503	GGA	2	6	20540	20545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014503	CTT	2	6	20562	20567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014503	GTC	2	6	20607	20612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014503	ATA	2	6	20711	20716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014503	ATT	2	6	20984	20989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014503	TAA	2	6	21177	21182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014503	GAA	2	6	21317	21322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014503	ACA	2	6	21349	21354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014503	TAA	2	6	21809	21814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014503	ATT	2	6	21863	21868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014503	TAT	2	6	21899	21904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014503	TCT	2	6	22013	22018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014503	ACC	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014503	CCG	2	6	22124	22129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014503	AAC	2	6	22134	22139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014503	TAG	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014503	CTC	2	6	27235	27240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014503	AAT	2	6	27248	27253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014503	AAT	2	6	27304	27309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014503	TAA	2	6	27319	27324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014503	TGT	2	6	27337	27342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014503	TTC	2	6	28088	28093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014503	ATT	3	9	28102	28110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014503	TTA	2	6	30820	30825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014503	GGC	2	6	30857	30862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014503	ATC	2	6	31242	31247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014503	ATC	2	6	31278	31283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014503	ATT	2	6	31284	31289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014503	GTT	2	6	34910	34915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.