MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782204

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014503	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	307149680
2	NC_014503	TA	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	307149681
3	NC_014503	GA	3	6	2375	2380	50 %	0 %	50 %	0 %	307149681
4	NC_014503	TA	3	6	3298	3303	50 %	50 %	0 %	0 %	307149682
5	NC_014503	GA	3	6	3540	3545	50 %	0 %	50 %	0 %	307149682
6	NC_014503	CT	3	6	5449	5454	0 %	50 %	0 %	50 %	307149683
7	NC_014503	CT	3	6	6347	6352	0 %	50 %	0 %	50 %	307149684
8	NC_014503	AT	3	6	7666	7671	50 %	50 %	0 %	0 %	307149684
9	NC_014503	AT	3	6	7710	7715	50 %	50 %	0 %	0 %	307149684
10	NC_014503	AT	3	6	8452	8457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014503	AT	3	6	10144	10149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014503	AT	3	6	12073	12078	50 %	50 %	0 %	0 %	307149685
13	NC_014503	GA	3	6	12134	12139	50 %	0 %	50 %	0 %	307149685
14	NC_014503	CT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	0 %	50 %	307149685
15	NC_014503	CT	4	8	12863	12870	0 %	50 %	0 %	50 %	307149686
16	NC_014503	TA	3	6	12872	12877	50 %	50 %	0 %	0 %	307149686
17	NC_014503	TA	3	6	13027	13032	50 %	50 %	0 %	0 %	307149686
18	NC_014503	AT	3	6	13111	13116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014503	TG	3	6	13533	13538	0 %	50 %	50 %	0 %	307149687
20	NC_014503	AT	3	6	13563	13568	50 %	50 %	0 %	0 %	307149687
21	NC_014503	CT	3	6	13576	13581	0 %	50 %	0 %	50 %	307149687
22	NC_014503	CT	3	6	16439	16444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014503	AG	3	6	16472	16477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014503	CT	3	6	18403	18408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014503	GT	3	6	19207	19212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014503	TA	3	6	19760	19765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014503	TA	3	6	21306	21311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014503	TA	3	6	21631	21636	50 %	50 %	0 %	0 %	307149689
29	NC_014503	CA	3	6	23652	23657	50 %	0 %	0 %	50 %	307149690
30	NC_014503	TC	3	6	25668	25673	0 %	50 %	0 %	50 %	307149692
31	NC_014503	GA	3	6	27293	27298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014503	TC	3	6	27782	27787	0 %	50 %	0 %	50 %	307149693
33	NC_014503	AC	3	6	27809	27814	50 %	0 %	0 %	50 %	307149694
34	NC_014503	GA	5	10	28757	28766	50 %	0 %	50 %	0 %	307149695
35	NC_014503	AG	3	6	29665	29670	50 %	0 %	50 %	0 %	307149696
36	NC_014503	CT	3	6	32153	32158	0 %	50 %	0 %	50 %	307149700
37	NC_014503	CT	3	6	32392	32397	0 %	50 %	0 %	50 %	307149700
38	NC_014503	TC	3	6	33221	33226	0 %	50 %	0 %	50 %	307149700
39	NC_014503	TC	3	6	34699	34704	0 %	50 %	0 %	50 %	307149700
40	NC_014503	TC	3	6	35157	35162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014503	TG	3	6	35722	35727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014503	GA	3	6	36347	36352	50 %	0 %	50 %	0 %	307149701
43	NC_014503	TA	4	8	36892	36899	50 %	50 %	0 %	0 %	307149701
44	NC_014503	TC	3	6	37674	37679	0 %	50 %	0 %	50 %	307149702
45	NC_014503	AG	3	6	38737	38742	50 %	0 %	50 %	0 %	307149702
46	NC_014503	GA	3	6	39261	39266	50 %	0 %	50 %	0 %	307149703
47	NC_014503	TG	3	6	40279	40284	0 %	50 %	50 %	0 %	307149704
48	NC_014503	TG	3	6	40784	40789	0 %	50 %	50 %	0 %	307149704
49	NC_014503	GA	3	6	41105	41110	50 %	0 %	50 %	0 %	307149704
50	NC_014503	GT	3	6	43142	43147	0 %	50 %	50 %	0 %	307149705
51	NC_014503	TA	3	6	43322	43327	50 %	50 %	0 %	0 %	307149705
52	NC_014503	TG	3	6	43779	43784	0 %	50 %	50 %	0 %	307149705
53	NC_014503	AG	3	6	43794	43799	50 %	0 %	50 %	0 %	307149705
54	NC_014503	TG	3	6	44360	44365	0 %	50 %	50 %	0 %	307149705
55	NC_014503	AG	3	6	45499	45504	50 %	0 %	50 %	0 %	307149706
56	NC_014503	TA	3	6	45812	45817	50 %	50 %	0 %	0 %	307149706

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.