MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	CCAGAG	2	12	907	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149709
2	NC_014502	TGTTGA	2	12	6107	6118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307149713
3	NC_014502	TCAAAT	2	12	9222	9233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307149715
4	NC_014502	GCCACT	2	12	10180	10191	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307149715
5	NC_014502	GAGCTA	2	12	10795	10806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307149715
6	NC_014502	AAAGCT	2	12	11191	11202	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307149716
7	NC_014502	AAATTA	2	12	13493	13504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149717
8	NC_014502	AAAACC	2	12	16084	16095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149718
9	NC_014502	CATAAA	2	12	17143	17154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307149720
10	NC_014502	TGGTAG	2	12	18985	18996	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307149722
11	NC_014502	TGGTAG	2	12	19480	19491	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307149722
12	NC_014502	TGGTAG	2	12	19978	19989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307149722
13	NC_014502	AATGGG	2	12	26965	26976	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307149728
14	NC_014502	CAATCA	2	12	28841	28852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307149734
15	NC_014502	GGGGAA	2	12	30252	30263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149737
16	NC_014502	TTTCTG	2	12	33821	33832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307149742
17	NC_014502	ACCGCC	2	12	34597	34608	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307149743
18	NC_014502	TTTAAT	2	12	42858	42869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149750
19	NC_014502	ATTTTT	2	12	44201	44212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307149751
20	NC_014502	AAAATT	2	12	44472	44483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149752
21	NC_014502	CATGAG	2	12	44602	44613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307149752
22	NC_014502	ACCTGA	2	12	44837	44848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149752
23	NC_014502	ATAAAA	2	12	45117	45128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307149752
24	NC_014502	ATCTCC	2	12	50600	50611	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
25	NC_014502	TCTCCA	2	12	50766	50777	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
26	NC_014502	TCTCCA	2	12	50931	50942	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
27	NC_014502	ACCTGT	2	12	51038	51049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307149754
28	NC_014502	TCTCCA	2	12	51267	51278	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
29	NC_014502	ACCGTA	2	12	51399	51410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149754
30	NC_014502	TCTCCA	2	12	51783	51794	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
31	NC_014502	TCTCCA	2	12	51948	51959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
32	NC_014502	TCTCCA	2	12	52113	52124	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
33	NC_014502	TCTCCA	2	12	52278	52289	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
34	NC_014502	TCTCCA	2	12	52443	52454	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
35	NC_014502	TTTCTG	2	12	55659	55670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307149756
36	NC_014502	AGCTCA	2	12	56116	56127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149756
37	NC_014502	ACCTTC	2	12	60259	60270	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149760
38	NC_014502	AAAATC	2	12	62696	62707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307149762
39	NC_014502	TTAATG	2	12	63539	63550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149763
40	NC_014502	AACTTT	2	12	67893	67904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307149765
41	NC_014502	CATTGC	2	12	83955	83966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307149776
42	NC_014502	AAGCTG	2	12	84656	84667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307149776
43	NC_014502	GGCAAG	2	12	86197	86208	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307149776
44	NC_014502	ATAAGT	2	12	87244	87255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307149776
45	NC_014502	TAACAC	2	12	87660	87671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307149776
46	NC_014502	TAAAGC	2	12	89686	89697	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307149776
47	NC_014502	ATAGTA	2	12	93409	93420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307149776
48	NC_014502	TAATTG	2	12	94868	94879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149776
49	NC_014502	TTTCAT	2	12	95220	95231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307149776
50	NC_014502	TCATAA	3	18	95357	95374	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307149776
51	NC_014502	ATTAGG	2	12	95569	95580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149776
52	NC_014502	TATAGT	2	12	97261	97272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149776
53	NC_014502	TTTTAA	2	12	99705	99716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149776
54	NC_014502	TTGAAT	2	12	101037	101048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149776
55	NC_014502	TCTTTT	2	12	113525	113536	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307149783
56	NC_014502	TTTTGA	2	12	114245	114256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307149785
57	NC_014502	CACCTC	2	12	115890	115901	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	307149785
58	NC_014502	TACCTT	2	12	117447	117458	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307149787
59	NC_014502	GATTTA	2	12	121304	121315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149789
60	NC_014502	GGTCGG	2	12	122778	122789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307149790
61	NC_014502	CAAAGG	2	12	138923	138934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307149806
62	NC_014502	AACCGT	2	12	144282	144293	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149811
63	NC_014502	AACCCC	2	12	145212	145223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149811
64	NC_014502	CTCGTT	2	12	149664	149675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307149815
65	NC_014502	GGTAAT	2	12	154055	154066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149819
66	NC_014502	TAAGTT	2	12	157329	157340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149820
67	NC_014502	GATGTG	2	12	158370	158381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307149821
68	NC_014502	TGAGGA	2	12	162289	162300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307149825
69	NC_014502	ATCGTC	2	12	162350	162361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307149825
70	NC_014502	AATGGT	2	12	162974	162985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149825
71	NC_014502	TTGATT	2	12	171409	171420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307149834
72	NC_014502	ATGTTC	2	12	174288	174299	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307149834
73	NC_014502	GATGAA	2	12	175021	175032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307149835
74	NC_014502	ACCATC	2	12	176708	176719	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307149838
75	NC_014502	GTTTTC	2	12	177822	177833	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307149840
76	NC_014502	TGTTAA	2	12	185238	185249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307149852
77	NC_014502	GATTCA	2	12	185803	185814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307149853
78	NC_014502	TTCTCC	2	12	187065	187076	0 %	50 %	0 %	50 %	307149854
79	NC_014502	TTTTTA	2	12	192778	192789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307149861
80	NC_014502	TGTTAG	2	12	193053	193064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307149861
81	NC_014502	GGGGAA	2	12	194848	194859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149865
82	NC_014502	AGACAA	2	12	199261	199272	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307149872
83	NC_014502	CATCTA	2	12	216274	216285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149878
84	NC_014502	GCCTCA	2	12	228274	228285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307149894
85	NC_014502	ATCTTC	2	12	240466	240477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307149897
86	NC_014502	GAAAAC	2	12	242016	242027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307149901
87	NC_014502	ATTCCC	2	12	242791	242802	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149902
88	NC_014502	CCAAAG	2	12	242816	242827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307149902
89	NC_014502	AATGGT	2	12	243130	243141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149903
90	NC_014502	TTCTCG	2	12	244088	244099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307149905
91	NC_014502	TTCATC	2	12	244343	244354	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307149905
92	NC_014502	CTTTTT	2	12	250815	250826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307149907
93	NC_014502	AACCGA	2	12	253838	253849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307149912
94	NC_014502	CGGCTC	2	12	256156	256167	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307149915
95	NC_014502	AAAGCT	2	12	258457	258468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307149917
96	NC_014502	GAAGAT	2	12	262201	262212	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307149922
97	NC_014502	GGTACC	2	12	264211	264222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307149924
98	NC_014502	ACCCCC	2	12	268529	268540	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	307149928
99	NC_014502	TCACAA	2	12	268583	268594	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307149928
100	NC_014502	GAGGTT	2	12	272992	273003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307149931
101	NC_014502	TAGGAT	2	12	278563	278574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149936
102	NC_014502	CGAGTT	2	12	280575	280586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307149938
103	NC_014502	AAAACT	2	12	281041	281052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307149938
104	NC_014502	AACCGT	2	12	283032	283043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149939
105	NC_014502	AACCCC	2	12	283962	283973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149939
106	NC_014502	ACTCCA	2	12	288020	288031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307149942
107	NC_014502	TCAATT	2	12	290730	290741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307149943

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.