MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	CTTAT	2	10	13743	13752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014502	TATTC	2	10	14259	14268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014502	GGAAA	2	10	15283	15292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014502	AATTA	2	10	16375	16384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014502	TAATC	2	10	22647	22656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014502	GTTGA	2	10	23686	23695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014502	ATTTC	2	10	41529	41538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014502	AAAAG	2	10	43310	43319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014502	CATAG	2	10	47502	47511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014502	ACTGG	2	10	55096	55105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014502	AAGAC	2	10	55202	55211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014502	ACTAA	2	10	55247	55256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014502	TTCGC	2	10	55275	55284	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014502	TAGCC	2	10	56751	56760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014502	CTTAA	2	10	64212	64221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014502	AAAAT	2	10	65676	65685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014502	ATGGA	2	10	65865	65874	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014502	CATAA	2	10	66655	66664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014502	AGATA	2	10	69999	70008	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014502	TCGAT	2	10	70073	70082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014502	CAAGC	2	10	70392	70401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014502	TTAAT	2	10	78929	78938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014502	GTTTT	2	10	80316	80325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014502	TTCTT	2	10	81022	81031	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014502	TTCTT	2	10	81158	81167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014502	GAAAA	2	10	81877	81886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014502	ATATG	2	10	101715	101724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014502	GGAAA	2	10	104623	104632	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014502	CTCTT	2	10	107117	107126	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014502	CATAA	2	10	108356	108365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014502	CTTTA	2	10	128347	128356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014502	ATTTC	2	10	130153	130162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014502	TAAAT	2	10	131646	131655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014502	CTTTA	2	10	132927	132936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014502	GTAAA	2	10	147588	147597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014502	GGTTA	2	10	151026	151035	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014502	TTTTA	2	10	155386	155395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014502	ATAAA	2	10	155756	155765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014502	TTTTC	2	10	157005	157014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014502	TTTTC	2	10	157109	157118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014502	TGATT	2	10	184588	184597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014502	TGAGA	2	10	184917	184926	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014502	CTAAT	2	10	203649	203658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014502	GCAGC	2	10	204153	204162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014502	CGATG	2	10	205173	205182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014502	TAAAT	2	10	207274	207283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014502	TAAAT	2	10	207637	207646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014502	TAAAT	2	10	208000	208009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014502	AGTTA	2	10	209388	209397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014502	AGTTA	2	10	210084	210093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014502	TAATT	2	10	229311	229320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014502	AAATT	2	10	234026	234035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014502	TAACT	2	10	236865	236874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014502	GTAAA	2	10	237860	237869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014502	AGATT	2	10	239806	239815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014502	CCCCT	2	10	261445	261454	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_014502	GACCC	2	10	279079	279088	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014502	TATCT	2	10	280345	280354	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014502	ATTAA	2	10	281124	281133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014502	GTCTT	2	10	285430	285439	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014502	GTTCA	2	10	285817	285826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014502	GTAAA	2	10	286356	286365	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014502	ATTAA	2	10	286611	286620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014502	TAAAT	2	10	286753	286762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014502	GGTTA	2	10	291921	291930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014502	TAACA	2	10	291963	291972	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.