MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	TGAA	2	8	3238	3245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014502	ATTA	2	8	8168	8175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014502	TAAT	2	8	13885	13892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014502	TAAA	2	8	14231	14238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014502	TAAA	2	8	14759	14766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014502	TGAC	2	8	15355	15362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014502	ATAA	2	8	15378	15385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014502	TATT	2	8	15800	15807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014502	GTCA	2	8	16321	16328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014502	TTTA	2	8	16855	16862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014502	AGCA	2	8	17822	17829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014502	TTAA	2	8	18186	18193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014502	AATC	2	8	23501	23508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014502	GTTT	2	8	23747	23754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014502	ATTT	2	8	24595	24602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014502	TAAT	2	8	25206	25213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014502	CCAA	2	8	25847	25854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014502	GTTA	2	8	31094	31101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014502	TTAA	2	8	33703	33710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014502	TTGG	2	8	35505	35512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014502	TTAA	2	8	36169	36176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014502	TCTG	2	8	36784	36791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014502	TAAA	2	8	39365	39372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014502	TAAT	2	8	39456	39463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014502	TCCT	2	8	40464	40471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014502	TTCC	2	8	41155	41162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014502	ATCT	2	8	41431	41438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014502	TTAA	2	8	41583	41590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014502	AATT	2	8	42553	42560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014502	TTTA	2	8	43738	43745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014502	TACT	2	8	43754	43761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014502	CTTT	2	8	43863	43870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014502	TCAA	2	8	46813	46820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014502	CTAA	2	8	46998	47005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014502	ACGG	2	8	47292	47299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014502	ACGA	2	8	47333	47340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014502	GATA	2	8	47400	47407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014502	AGTT	2	8	52548	52555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014502	AGAT	2	8	54714	54721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014502	AAAT	2	8	55032	55039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014502	ACAA	2	8	61352	61359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014502	TAAT	2	8	64282	64289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014502	TATT	2	8	64440	64447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014502	AGAT	2	8	65631	65638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014502	TTAC	2	8	66178	66185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014502	ATTA	2	8	66780	66787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014502	TATT	2	8	68310	68317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014502	CAAT	2	8	69411	69418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014502	TGTA	2	8	69950	69957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014502	TGTT	2	8	70333	70340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014502	TAGA	2	8	71976	71983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014502	TAGA	2	8	74015	74022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014502	ATAA	2	8	74246	74253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014502	TTTC	2	8	74289	74296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014502	ATTG	2	8	75521	75528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014502	TTTA	2	8	75618	75625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014502	ATTT	2	8	77112	77119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014502	AATT	2	8	77177	77184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014502	ATTT	2	8	77263	77270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014502	CAAT	2	8	77432	77439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014502	TTAT	2	8	77499	77506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014502	TTAA	2	8	78817	78824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014502	TAAA	2	8	78845	78852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014502	GATT	2	8	79018	79025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014502	TAAA	2	8	79085	79092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014502	TTTA	2	8	79281	79288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014502	ACTA	2	8	79338	79345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014502	AGTA	2	8	79408	79415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014502	TTAA	2	8	80068	80075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014502	ATTA	2	8	80421	80428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014502	TCTA	2	8	80779	80786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014502	CTAA	2	8	80897	80904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014502	TTTG	2	8	81186	81193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014502	TTCT	2	8	81237	81244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014502	AATC	2	8	82214	82221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014502	ATAA	2	8	82458	82465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014502	TTTA	2	8	82482	82489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014502	AATT	2	8	83492	83499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014502	AAAT	2	8	101403	101410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014502	TTGA	2	8	101513	101520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014502	TACT	2	8	103042	103049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014502	TTAC	2	8	103219	103226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014502	TATC	2	8	103249	103256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014502	ATTG	2	8	103394	103401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014502	TGCA	2	8	103419	103426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014502	TAAA	2	8	103507	103514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014502	CCAC	2	8	103585	103592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_014502	TACT	2	8	103812	103819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014502	ATTC	2	8	103974	103981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014502	TAAA	2	8	104810	104817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014502	TAAA	2	8	106042	106049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014502	ATCA	2	8	106574	106581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014502	AATT	2	8	106886	106893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014502	TTTG	2	8	106994	107001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014502	TTGA	2	8	107200	107207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014502	TTAT	2	8	108324	108331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014502	TTTA	2	8	109008	109015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014502	AATT	2	8	110296	110303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014502	ATAA	2	8	110385	110392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014502	CGAT	2	8	117856	117863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014502	AATT	2	8	120563	120570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014502	GGTT	2	8	120703	120710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014502	ATTT	2	8	121131	121138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014502	ATTA	2	8	122024	122031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014502	ATTG	2	8	127269	127276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014502	AATA	2	8	129596	129603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014502	ATCC	2	8	130074	130081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014502	TTAA	2	8	131533	131540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014502	GAGC	3	12	131798	131809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014502	AATC	2	8	132073	132080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014502	GATC	2	8	132175	132182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014502	TAAA	2	8	132363	132370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014502	TAAA	2	8	132567	132574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014502	AGTT	2	8	132798	132805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014502	TAAA	2	8	132873	132880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014502	AAAG	2	8	134547	134554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014502	AAAG	2	8	134556	134563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014502	AATT	2	8	135785	135792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014502	TGAA	2	8	135849	135856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014502	TGAT	2	8	146598	146605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014502	TATC	2	8	147130	147137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014502	TGGC	2	8	147217	147224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014502	CGGG	2	8	147326	147333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014502	TAAT	2	8	147353	147360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014502	AGAA	2	8	147361	147368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014502	AATG	2	8	147378	147385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014502	TTAT	2	8	147606	147613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014502	ATAA	2	8	147682	147689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014502	AAAT	2	8	147853	147860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014502	CATA	2	8	147934	147941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014502	ACCA	2	8	148767	148774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014502	ACTT	2	8	154336	154343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014502	TAAA	2	8	154470	154477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014502	TTAG	2	8	154952	154959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014502	GTTA	2	8	155009	155016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014502	TTTA	2	8	155061	155068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014502	CTTC	2	8	155162	155169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014502	CTTA	2	8	155252	155259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014502	TAAA	2	8	155685	155692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014502	TAAA	2	8	156001	156008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014502	ATTT	2	8	156057	156064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014502	TCCC	2	8	156370	156377	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_014502	AAAT	2	8	156589	156596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014502	CAAT	2	8	156597	156604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014502	AAAC	2	8	157240	157247	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014502	GATA	2	8	157293	157300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014502	AATA	2	8	159201	159208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014502	ATTA	2	8	161918	161925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014502	TCAA	3	12	161931	161942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014502	TAAT	2	8	164103	164110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014502	ATTG	2	8	164156	164163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014502	TAAA	2	8	164588	164595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014502	TATT	2	8	174948	174955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014502	ATTA	2	8	176922	176929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014502	ATTA	2	8	177494	177501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014502	TTTA	2	8	178037	178044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014502	ATTT	2	8	178455	178462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014502	ATTT	2	8	183652	183659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014502	CTAT	2	8	183704	183711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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187	NC_014502	ATAA	2	8	219738	219745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014502	TAAT	2	8	222318	222325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.