MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	CT	3	6	543	548	0 %	50 %	0 %	50 %	307149709
2	NC_014502	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	307149710
3	NC_014502	AG	3	6	2839	2844	50 %	0 %	50 %	0 %	307149710
4	NC_014502	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	307149711
5	NC_014502	AT	3	6	4352	4357	50 %	50 %	0 %	0 %	307149712
6	NC_014502	TA	3	6	7833	7838	50 %	50 %	0 %	0 %	307149713
7	NC_014502	TG	3	6	9246	9251	0 %	50 %	50 %	0 %	307149715
8	NC_014502	CT	3	6	9543	9548	0 %	50 %	0 %	50 %	307149715
9	NC_014502	AG	4	8	10349	10356	50 %	0 %	50 %	0 %	307149715
10	NC_014502	TA	3	6	11450	11455	50 %	50 %	0 %	0 %	307149716
11	NC_014502	AT	3	6	11748	11753	50 %	50 %	0 %	0 %	307149717
12	NC_014502	CG	3	6	12489	12494	0 %	0 %	50 %	50 %	307149717
13	NC_014502	AG	3	6	13009	13014	50 %	0 %	50 %	0 %	307149717
14	NC_014502	TA	3	6	13539	13544	50 %	50 %	0 %	0 %	307149717
15	NC_014502	TA	3	6	16624	16629	50 %	50 %	0 %	0 %	307149719
16	NC_014502	TA	3	6	17367	17372	50 %	50 %	0 %	0 %	307149720
17	NC_014502	TA	3	6	19103	19108	50 %	50 %	0 %	0 %	307149722
18	NC_014502	AT	3	6	22810	22815	50 %	50 %	0 %	0 %	307149723
19	NC_014502	AG	3	6	26757	26762	50 %	0 %	50 %	0 %	307149728
20	NC_014502	CA	3	6	26808	26813	50 %	0 %	0 %	50 %	307149728
21	NC_014502	AC	3	6	27883	27888	50 %	0 %	0 %	50 %	307149731
22	NC_014502	GA	3	6	28480	28485	50 %	0 %	50 %	0 %	307149732
23	NC_014502	CT	3	6	29714	29719	0 %	50 %	0 %	50 %	307149735
24	NC_014502	GT	4	8	30450	30457	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
25	NC_014502	GA	4	8	30659	30666	50 %	0 %	50 %	0 %	307149737
26	NC_014502	TG	3	6	30877	30882	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
27	NC_014502	TA	3	6	31302	31307	50 %	50 %	0 %	0 %	307149738
28	NC_014502	CG	3	6	32120	32125	0 %	0 %	50 %	50 %	307149740
29	NC_014502	AT	3	6	32223	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	307149740
30	NC_014502	TA	3	6	33151	33156	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
31	NC_014502	AT	3	6	33226	33231	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
32	NC_014502	CT	3	6	34328	34333	0 %	50 %	0 %	50 %	307149743
33	NC_014502	CT	3	6	37739	37744	0 %	50 %	0 %	50 %	307149748
34	NC_014502	CT	3	6	38644	38649	0 %	50 %	0 %	50 %	307149748
35	NC_014502	AC	3	6	42740	42745	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
36	NC_014502	CA	3	6	42905	42910	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
37	NC_014502	AC	3	6	43262	43267	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
38	NC_014502	TA	3	6	44996	45001	50 %	50 %	0 %	0 %	307149752
39	NC_014502	TC	3	6	45304	45309	0 %	50 %	0 %	50 %	307149752
40	NC_014502	AT	3	6	55462	55467	50 %	50 %	0 %	0 %	307149756
41	NC_014502	AT	3	6	57327	57332	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
42	NC_014502	TA	3	6	57694	57699	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
43	NC_014502	AT	3	6	57905	57910	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
44	NC_014502	AT	3	6	58065	58070	50 %	50 %	0 %	0 %	307149758
45	NC_014502	AT	3	6	58495	58500	50 %	50 %	0 %	0 %	307149758
46	NC_014502	TA	3	6	59373	59378	50 %	50 %	0 %	0 %	307149759
47	NC_014502	AT	3	6	59776	59781	50 %	50 %	0 %	0 %	307149760
48	NC_014502	AT	3	6	60185	60190	50 %	50 %	0 %	0 %	307149760
49	NC_014502	TA	3	6	62665	62670	50 %	50 %	0 %	0 %	307149762
50	NC_014502	AT	5	10	63355	63364	50 %	50 %	0 %	0 %	307149763
51	NC_014502	TG	3	6	64611	64616	0 %	50 %	50 %	0 %	307149764
52	NC_014502	AT	3	6	64907	64912	50 %	50 %	0 %	0 %	307149764
53	NC_014502	CT	3	6	65294	65299	0 %	50 %	0 %	50 %	307149764
54	NC_014502	TA	3	6	67029	67034	50 %	50 %	0 %	0 %	307149765
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56	NC_014502	TC	3	6	72006	72011	0 %	50 %	0 %	50 %	307149768
57	NC_014502	TC	4	8	72558	72565	0 %	50 %	0 %	50 %	307149768
58	NC_014502	CT	3	6	73062	73067	0 %	50 %	0 %	50 %	307149769
59	NC_014502	AT	3	6	73077	73082	50 %	50 %	0 %	0 %	307149769
60	NC_014502	AG	3	6	73742	73747	50 %	0 %	50 %	0 %	307149769
61	NC_014502	AG	3	6	76507	76512	50 %	0 %	50 %	0 %	307149772
62	NC_014502	CT	3	6	77611	77616	0 %	50 %	0 %	50 %	307149773
63	NC_014502	TG	3	6	84419	84424	0 %	50 %	50 %	0 %	307149776
64	NC_014502	GA	3	6	86290	86295	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
65	NC_014502	TC	3	6	86775	86780	0 %	50 %	0 %	50 %	307149776
66	NC_014502	AG	3	6	87502	87507	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
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68	NC_014502	TG	3	6	88732	88737	0 %	50 %	50 %	0 %	307149776
69	NC_014502	GA	3	6	90045	90050	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
70	NC_014502	AT	3	6	93342	93347	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
71	NC_014502	AT	3	6	93560	93565	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
72	NC_014502	AT	3	6	93597	93602	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
73	NC_014502	GA	3	6	94076	94081	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
74	NC_014502	AT	3	6	94268	94273	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
75	NC_014502	AT	3	6	94625	94630	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
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79	NC_014502	TC	3	6	98942	98947	0 %	50 %	0 %	50 %	307149776
80	NC_014502	AT	3	6	99587	99592	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
81	NC_014502	TA	3	6	102218	102223	50 %	50 %	0 %	0 %	307149777
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83	NC_014502	AT	3	6	102967	102972	50 %	50 %	0 %	0 %	307149777
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108	NC_014502	AT	3	6	135498	135503	50 %	50 %	0 %	0 %	307149802
109	NC_014502	TA	3	6	136539	136544	50 %	50 %	0 %	0 %	307149804
110	NC_014502	CT	3	6	136744	136749	0 %	50 %	0 %	50 %	307149804
111	NC_014502	AG	4	8	138485	138492	50 %	0 %	50 %	0 %	307149806
112	NC_014502	AG	3	6	139053	139058	50 %	0 %	50 %	0 %	307149806
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118	NC_014502	CT	3	6	146059	146064	0 %	50 %	0 %	50 %	307149811
119	NC_014502	TG	3	6	146214	146219	0 %	50 %	50 %	0 %	307149811
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123	NC_014502	TG	3	6	152394	152399	0 %	50 %	50 %	0 %	307149817
124	NC_014502	TA	3	6	152648	152653	50 %	50 %	0 %	0 %	307149817
125	NC_014502	CT	3	6	152833	152838	0 %	50 %	0 %	50 %	307149817
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.