MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	ATTGCC	2	12	9368	9379	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014501	TGTTTA	2	12	11744	11755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014501	TTTAGT	2	12	20464	20475	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014501	GTCTCA	2	12	26018	26029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014501	ATTTAA	2	12	58547	58558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014501	ATGAAT	2	12	73193	73204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014501	ATGACT	2	12	103693	103704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014501	GCATTT	2	12	125709	125720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014501	TAAATT	2	12	166602	166613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014501	TTGCTT	2	12	169463	169474	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014501	CCCCTT	2	12	171507	171518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014501	TAATCA	2	12	182162	182173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014501	GCCTTT	2	12	201581	201592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014501	TAAGAA	2	12	202841	202852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014501	ATCGTG	2	12	229312	229323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014501	ATAACA	2	12	237969	237980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014501	AAATCA	2	12	258456	258467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014501	AAAGCC	2	12	276089	276100	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014501	TTAAAT	2	12	281532	281543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014501	TTTAAG	2	12	293798	293809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014501	CATACT	2	12	304076	304087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014501	TTGTCT	2	12	315955	315966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014501	TTTTTC	2	12	329356	329367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014501	ATTAAT	2	12	367501	367512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014501	AAAAGT	2	12	389467	389478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014501	TTTTTA	2	12	415452	415463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014501	ACTTAA	2	12	440339	440350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014501	GATCAC	2	12	459489	459500	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014501	GAAAAA	2	12	475641	475652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014501	AGCTAA	2	12	491873	491884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014501	TAAAAT	2	12	492507	492518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014501	CAGAAT	2	12	514210	514221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014501	CCTTGT	2	12	551798	551809	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014501	TAACTA	2	12	558447	558458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014501	TACGAA	2	12	559255	559266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014501	TGCCGT	2	12	584064	584075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014501	CCCCTT	2	12	603647	603658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014501	TCAATA	2	12	612799	612810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014501	AAAAAT	2	12	628713	628724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014501	TAAATT	2	12	663178	663189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014501	TACTTT	2	12	664395	664406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014501	CAGCCG	2	12	695126	695137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014501	TTACAA	2	12	711198	711209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014501	AGCATG	2	12	740336	740347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014501	CGGCTT	2	12	741633	741644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014501	GATGCT	2	12	741652	741663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014501	TAAAAA	2	12	750256	750267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014501	GGGAAG	3	18	767533	767550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014501	GGGGAA	2	12	767558	767569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014501	TAGAGA	2	12	789049	789060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014501	TTGGCT	2	12	792583	792594	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014501	CAAAAT	2	12	795471	795482	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014501	AATTAA	2	12	841676	841687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014501	CTTAAC	2	12	845271	845282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014501	TATTTT	2	12	860193	860204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014501	GGGAAA	2	12	862387	862398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014501	GGCTTA	2	12	885784	885795	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014501	GTAATC	2	12	886122	886133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014501	TGGCAA	2	12	895846	895857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014501	TAATTA	2	12	900614	900625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014501	ATTTTT	2	12	929138	929149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014501	TTATCC	2	12	936525	936536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014501	CTCCTT	2	12	936940	936951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014501	TACGAA	2	12	959723	959734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014501	TTACTA	2	12	966011	966022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014501	CTATTC	2	12	986633	986644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014501	TTAAAA	2	12	989754	989765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014501	TTGAAT	2	12	996638	996649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014501	TGCCCC	2	12	1021782	1021793	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014501	ATTTTA	2	12	1038066	1038077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014501	TATAAT	2	12	1069098	1069109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014501	GGCACA	3	18	1074368	1074385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014501	ATTAGT	2	12	1078795	1078806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014501	AAATAG	2	12	1078968	1078979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014501	CCTTTA	2	12	1112402	1112413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014501	CTACGC	2	12	1120488	1120499	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014501	AATTGT	2	12	1142104	1142115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014501	TTAGAT	2	12	1144876	1144887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014501	ATTTGA	2	12	1149524	1149535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014501	ATGATT	2	12	1158189	1158200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014501	AGAATT	2	12	1158318	1158329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014501	TTTATT	2	12	1158544	1158555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014501	ATTTAA	2	12	1164801	1164812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014501	AAAGTT	2	12	1225726	1225737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014501	AGTAAT	2	12	1288888	1288899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014501	AGGGTA	2	12	1327535	1327546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014501	ACTAAA	2	12	1363017	1363028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014501	TTTTCC	2	12	1378468	1378479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014501	GTTCAG	2	12	1378612	1378623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014501	TCAAAT	2	12	1383866	1383877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014501	AGATTT	2	12	1394546	1394557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014501	CAAGAA	2	12	1421112	1421123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014501	ACACCC	2	12	1465137	1465148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014501	ACCAAA	2	12	1465264	1465275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014501	AGTTAT	2	12	1469180	1469191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014501	AAACTT	2	12	1472448	1472459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014501	GATTGC	2	12	1483632	1483643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014501	ACAGAG	2	12	1494357	1494368	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014501	CCCCTT	2	12	1498647	1498658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014501	CCCCTT	2	12	1498668	1498679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014501	CCGAAA	2	12	1528247	1528258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014501	TCAAAA	2	12	1528876	1528887	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014501	TTGCTT	2	12	1572770	1572781	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014501	TCAGCC	2	12	1572935	1572946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014501	CTAGAA	2	12	1575217	1575228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014501	TTTAAT	2	12	1621218	1621229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014501	CTCTTT	2	12	1627781	1627792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014501	TTAAAT	2	12	1631234	1631245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014501	TAAGAA	2	12	1667823	1667834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014501	AAAGCT	2	12	1688472	1688483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014501	AATTAA	2	12	1701081	1701092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014501	GAATAA	2	12	1706764	1706775	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014501	TATTTT	2	12	1710491	1710502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014501	AACAAA	2	12	1724509	1724520	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014501	CGGCTA	2	12	1730500	1730511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014501	ATTTAG	2	12	1731772	1731783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014501	AAGGGG	2	12	1738043	1738054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014501	GTTCCT	2	12	1760479	1760490	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014501	TATGTT	2	12	1761833	1761844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014501	GGGAAT	2	12	1762550	1762561	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014501	AATAAG	2	12	1803886	1803897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014501	TTTTTA	2	12	1815605	1815616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014501	ATTTTT	2	12	1822901	1822912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014501	ATTGAT	2	12	1826550	1826561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014501	AACTAT	2	12	1850328	1850339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014501	AAAGAA	2	12	1851121	1851132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014501	TTTGTT	2	12	1853688	1853699	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014501	AACGAT	2	12	1884701	1884712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014501	AACTCA	2	12	1888244	1888255	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014501	GATTTT	2	12	1900661	1900672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014501	ATTTTT	2	12	1928947	1928958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014501	TTTCTC	2	12	1939874	1939885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014501	TTTTAA	2	12	1947998	1948009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014501	CGTTTT	2	12	1952063	1952074	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014501	TCAAAA	2	12	1985650	1985661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014501	ATTAAG	2	12	1996856	1996867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014501	ATTAAT	2	12	2024376	2024387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014501	GAAAGG	2	12	2039473	2039484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014501	GCATCA	2	12	2039757	2039768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014501	CTACAA	2	12	2068239	2068250	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_014501	TAGTAT	2	12	2135711	2135722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_014501	ATTTAA	2	12	2186885	2186896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014501	CCTCAA	2	12	2225983	2225994	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014501	TAAATT	2	12	2240211	2240222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014501	ACTAAT	2	12	2252900	2252911	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_014501	ATTTTA	2	12	2312682	2312693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014501	TGTTAT	2	12	2349143	2349154	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014501	TCTCTT	2	12	2355846	2355857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_014501	ATTTTG	2	12	2472958	2472969	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014501	ATATTT	2	12	2480696	2480707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014501	AAAGAG	2	12	3855776	3855787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014501	TACCCG	2	12	3860411	3860422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
251	NC_014501	TTAAGT	2	12	3900018	3900029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014501	TGAGTG	2	12	3905988	3905999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014501	ATTTAA	2	12	3931454	3931465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_014501	GTTTTT	2	12	3957935	3957946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014501	TACCCT	2	12	3968889	3968900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
256	NC_014501	TTCACT	2	12	3969094	3969105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_014501	TTTCAG	2	12	3991043	3991054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_014501	AAAAGC	2	12	4022120	4022131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_014501	GTTTTT	2	12	4086882	4086893	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014501	ATCATT	2	12	4096186	4096197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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262	NC_014501	TATTTT	2	12	4151120	4151131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_014501	GGGGGT	2	12	4173530	4173541	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_014501	AAAAAT	2	12	4332443	4332454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014501	CCCCTT	2	12	4336440	4336451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_014501	TTGCTC	2	12	4369926	4369937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_014501	CTGTTG	2	12	4507163	4507174	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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284	NC_014501	TGGGGA	2	12	4548959	4548970	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014501	TAAAAA	2	12	4553653	4553664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_014501	AAGGGA	2	12	4664901	4664912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014501	CTTTAT	2	12	4680993	4681004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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321	NC_014501	TTTATT	2	12	5279136	5279147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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360	NC_014501	ATTTGT	2	12	6039925	6039936	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_014501	TCTAGC	2	12	6074895	6074906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_014501	TAAATA	2	12	6086210	6086221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.