MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 3008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	TAACT	2	10	2574	2583	40 %	40 %	0 %	20 %	307149948
2	NC_014501	TGGAA	2	10	3139	3148	40 %	20 %	40 %	0 %	307149948
3	NC_014501	TTGAC	2	10	6123	6132	20 %	40 %	20 %	20 %	307149951
4	NC_014501	AAATA	2	10	6146	6155	80 %	20 %	0 %	0 %	307149951
5	NC_014501	AAATA	2	10	6839	6848	80 %	20 %	0 %	0 %	307149951
6	NC_014501	ATTAA	2	10	7659	7668	60 %	40 %	0 %	0 %	307149952
7	NC_014501	CGGAT	2	10	14171	14180	20 %	20 %	40 %	20 %	307149957
8	NC_014501	ACGTC	2	10	14487	14496	20 %	20 %	20 %	40 %	307149957
9	NC_014501	GAGTG	2	10	14867	14876	20 %	20 %	60 %	0 %	307149958
10	NC_014501	GATTG	2	10	17510	17519	20 %	40 %	40 %	0 %	307149960
11	NC_014501	TTTAA	2	10	17984	17993	40 %	60 %	0 %	0 %	307149961
12	NC_014501	CAAAG	2	10	21140	21149	60 %	0 %	20 %	20 %	307149962
13	NC_014501	GCCGC	2	10	21882	21891	0 %	0 %	40 %	60 %	307149963
14	NC_014501	TGGAA	2	10	24391	24400	40 %	20 %	40 %	0 %	307149966
15	NC_014501	CCTCT	2	10	25376	25385	0 %	40 %	0 %	60 %	307149966
16	NC_014501	TAAAT	2	10	25499	25508	60 %	40 %	0 %	0 %	307149966
17	NC_014501	AAAGC	2	10	25630	25639	60 %	0 %	20 %	20 %	307149966
18	NC_014501	CGTTC	2	10	25875	25884	0 %	40 %	20 %	40 %	307149966
19	NC_014501	TAACT	2	10	27295	27304	40 %	40 %	0 %	20 %	307149968
20	NC_014501	CATAA	2	10	28513	28522	60 %	20 %	0 %	20 %	307149968
21	NC_014501	ATACA	2	10	30831	30840	60 %	20 %	0 %	20 %	307149970
22	NC_014501	TTTAA	2	10	32921	32930	40 %	60 %	0 %	0 %	307149973
23	NC_014501	ACTCA	2	10	36281	36290	40 %	20 %	0 %	40 %	307149974
24	NC_014501	TTTAA	2	10	40316	40325	40 %	60 %	0 %	0 %	307149978
25	NC_014501	TAAAA	2	10	40453	40462	80 %	20 %	0 %	0 %	307149978
26	NC_014501	GGTCA	2	10	41635	41644	20 %	20 %	40 %	20 %	307149979
27	NC_014501	TTCTT	2	10	42166	42175	0 %	80 %	0 %	20 %	307149980
28	NC_014501	AATTA	2	10	42843	42852	60 %	40 %	0 %	0 %	307149980
29	NC_014501	AGAAA	2	10	45993	46002	80 %	0 %	20 %	0 %	307149983
30	NC_014501	TGAAA	2	10	46184	46193	60 %	20 %	20 %	0 %	307149983
31	NC_014501	GTCTT	2	10	47059	47068	0 %	60 %	20 %	20 %	307149984
32	NC_014501	TAAAA	2	10	50409	50418	80 %	20 %	0 %	0 %	307149987
33	NC_014501	AACTC	2	10	52662	52671	40 %	20 %	0 %	40 %	307149990
34	NC_014501	ATTTT	2	10	56182	56191	20 %	80 %	0 %	0 %	307149992
35	NC_014501	ACCCG	2	10	56634	56643	20 %	0 %	20 %	60 %	307149993
36	NC_014501	TAAAA	2	10	61064	61073	80 %	20 %	0 %	0 %	307149998
37	NC_014501	CAACC	2	10	62237	62246	40 %	0 %	0 %	60 %	307149999
38	NC_014501	TACAA	2	10	63669	63678	60 %	20 %	0 %	20 %	307150002
39	NC_014501	ACTGA	2	10	63989	63998	40 %	20 %	20 %	20 %	307150002
40	NC_014501	AAATC	2	10	66627	66636	60 %	20 %	0 %	20 %	307150005
41	NC_014501	AGACG	2	10	68103	68112	40 %	0 %	40 %	20 %	307150006
42	NC_014501	TATCT	2	10	68666	68675	20 %	60 %	0 %	20 %	307150006
43	NC_014501	AGCAC	2	10	68701	68710	40 %	0 %	20 %	40 %	307150006
44	NC_014501	TTTTA	2	10	72733	72742	20 %	80 %	0 %	0 %	307150009
45	NC_014501	GATGG	2	10	73037	73046	20 %	20 %	60 %	0 %	307150009
46	NC_014501	GTAAA	2	10	75504	75513	60 %	20 %	20 %	0 %	307150012
47	NC_014501	TATCT	2	10	77132	77141	20 %	60 %	0 %	20 %	307150015
48	NC_014501	TAAAT	2	10	77588	77597	60 %	40 %	0 %	0 %	307150015
49	NC_014501	AAATA	2	10	77867	77876	80 %	20 %	0 %	0 %	307150015
50	NC_014501	ATTTA	2	10	78230	78239	40 %	60 %	0 %	0 %	307150015
51	NC_014501	AGTGA	2	10	80782	80791	40 %	20 %	40 %	0 %	307150016
52	NC_014501	TTTTA	2	10	81785	81794	20 %	80 %	0 %	0 %	307150018
53	NC_014501	ATCAG	2	10	83420	83429	40 %	20 %	20 %	20 %	307150019
54	NC_014501	TTCTC	2	10	83797	83806	0 %	60 %	0 %	40 %	307150020
55	NC_014501	ATTTT	2	10	89494	89503	20 %	80 %	0 %	0 %	307150023
56	NC_014501	AGCCA	2	10	100101	100110	40 %	0 %	20 %	40 %	307150034
57	NC_014501	TATTT	2	10	101833	101842	20 %	80 %	0 %	0 %	307150036
58	NC_014501	ATACT	2	10	102499	102508	40 %	40 %	0 %	20 %	307150036
59	NC_014501	TGTTA	2	10	103171	103180	20 %	60 %	20 %	0 %	307150036
60	NC_014501	GCGAT	2	10	104686	104695	20 %	20 %	40 %	20 %	307150038
61	NC_014501	GTCCG	2	10	104849	104858	0 %	20 %	40 %	40 %	307150038
62	NC_014501	GCAAT	2	10	105139	105148	40 %	20 %	20 %	20 %	307150038
63	NC_014501	GTACC	2	10	105509	105518	20 %	20 %	20 %	40 %	307150038
64	NC_014501	CGATC	2	10	109122	109131	20 %	20 %	20 %	40 %	307150040
65	NC_014501	TCGAT	2	10	109488	109497	20 %	40 %	20 %	20 %	307150041
66	NC_014501	AATTT	2	10	112825	112834	40 %	60 %	0 %	0 %	307150045
67	NC_014501	AACCC	2	10	113142	113151	40 %	0 %	0 %	60 %	307150045
68	NC_014501	TAAAA	2	10	115508	115517	80 %	20 %	0 %	0 %	307150047
69	NC_014501	TGGCA	2	10	116566	116575	20 %	20 %	40 %	20 %	307150048
70	NC_014501	ATTTT	2	10	121243	121252	20 %	80 %	0 %	0 %	307150050
71	NC_014501	TTCTC	2	10	121462	121471	0 %	60 %	0 %	40 %	307150050
72	NC_014501	ATCGA	2	10	122462	122471	40 %	20 %	20 %	20 %	307150051
73	NC_014501	TTTTA	2	10	122924	122933	20 %	80 %	0 %	0 %	307150052
74	NC_014501	CGTAG	2	10	127556	127565	20 %	20 %	40 %	20 %	307150058
75	NC_014501	TACTC	2	10	128106	128115	20 %	40 %	0 %	40 %	307150059
76	NC_014501	GGTGA	2	10	128331	128340	20 %	20 %	60 %	0 %	307150059
77	NC_014501	GTTAG	2	10	131512	131521	20 %	40 %	40 %	0 %	307150064
78	NC_014501	GCTCC	2	10	131786	131795	0 %	20 %	20 %	60 %	307150064
79	NC_014501	TTGGT	2	10	134128	134137	0 %	60 %	40 %	0 %	307150065
80	NC_014501	TTAAG	2	10	134581	134590	40 %	40 %	20 %	0 %	307150065
81	NC_014501	TTAGA	2	10	136173	136182	40 %	40 %	20 %	0 %	307150067
82	NC_014501	TTTAG	2	10	141261	141270	20 %	60 %	20 %	0 %	307150070
83	NC_014501	CTTGG	2	10	142169	142178	0 %	40 %	40 %	20 %	307150070
84	NC_014501	GTGGG	2	10	144449	144458	0 %	20 %	80 %	0 %	307150072
85	NC_014501	TTAAT	2	10	144773	144782	40 %	60 %	0 %	0 %	307150072
86	NC_014501	TATCC	2	10	148321	148330	20 %	40 %	0 %	40 %	307150076
87	NC_014501	CCGAC	2	10	150644	150653	20 %	0 %	20 %	60 %	307150078
88	NC_014501	GTCTG	2	10	150743	150752	0 %	40 %	40 %	20 %	307150078
89	NC_014501	AACAT	2	10	151222	151231	60 %	20 %	0 %	20 %	307150079
90	NC_014501	AAAAT	2	10	153848	153857	80 %	20 %	0 %	0 %	307150081
91	NC_014501	GAATG	2	10	155995	156004	40 %	20 %	40 %	0 %	307150082
92	NC_014501	TCAAG	2	10	156733	156742	40 %	20 %	20 %	20 %	307150083
93	NC_014501	ATCTG	2	10	159181	159190	20 %	40 %	20 %	20 %	307150086
94	NC_014501	CGTTT	2	10	159615	159624	0 %	60 %	20 %	20 %	307150086
95	NC_014501	TACCT	2	10	161812	161821	20 %	40 %	0 %	40 %	307150088
96	NC_014501	CATAA	2	10	161899	161908	60 %	20 %	0 %	20 %	307150088
97	NC_014501	GTTAA	2	10	163293	163302	40 %	40 %	20 %	0 %	307150089
98	NC_014501	GGTGA	2	10	164622	164631	20 %	20 %	60 %	0 %	307150090
99	NC_014501	TCCGA	2	10	169884	169893	20 %	20 %	20 %	40 %	307150096
100	NC_014501	AAAAT	2	10	180243	180252	80 %	20 %	0 %	0 %	307150103
101	NC_014501	TTTAC	2	10	181233	181242	20 %	60 %	0 %	20 %	307150104
102	NC_014501	CGGTT	2	10	188336	188345	0 %	40 %	40 %	20 %	307150109
103	NC_014501	AGATT	2	10	188943	188952	40 %	40 %	20 %	0 %	307150110
104	NC_014501	TTTGA	2	10	189962	189971	20 %	60 %	20 %	0 %	307150111
105	NC_014501	GGGTT	2	10	195152	195161	0 %	40 %	60 %	0 %	307150117
106	NC_014501	TAAAT	2	10	197286	197295	60 %	40 %	0 %	0 %	307150118
107	NC_014501	AAATA	2	10	197309	197318	80 %	20 %	0 %	0 %	307150118
108	NC_014501	AAAAT	2	10	198994	199003	80 %	20 %	0 %	0 %	307150119
109	NC_014501	ATGAG	2	10	199623	199632	40 %	20 %	40 %	0 %	307150119
110	NC_014501	TAGTA	2	10	200408	200417	40 %	40 %	20 %	0 %	307150120
111	NC_014501	ATTTT	2	10	201896	201905	20 %	80 %	0 %	0 %	307150122
112	NC_014501	ATTTT	2	10	207399	207408	20 %	80 %	0 %	0 %	307150125
113	NC_014501	CTGGT	2	10	208454	208463	0 %	40 %	40 %	20 %	307150125
114	NC_014501	TGGGT	2	10	209651	209660	0 %	40 %	60 %	0 %	307150126
115	NC_014501	CTAAA	2	10	211163	211172	60 %	20 %	0 %	20 %	307150128
116	NC_014501	TAATT	2	10	214475	214484	40 %	60 %	0 %	0 %	307150130
117	NC_014501	TTTTC	2	10	216719	216728	0 %	80 %	0 %	20 %	307150133
118	NC_014501	ATCCC	2	10	218212	218221	20 %	20 %	0 %	60 %	307150135
119	NC_014501	TCTCA	2	10	219016	219025	20 %	40 %	0 %	40 %	307150137
120	NC_014501	TAAGT	2	10	221770	221779	40 %	40 %	20 %	0 %	307150140
121	NC_014501	ATTTA	2	10	224038	224047	40 %	60 %	0 %	0 %	307150142
122	NC_014501	ACCCT	2	10	224383	224392	20 %	20 %	0 %	60 %	307150142
123	NC_014501	TCACT	2	10	227704	227713	20 %	40 %	0 %	40 %	307150145
124	NC_014501	CAAGA	2	10	227725	227734	60 %	0 %	20 %	20 %	307150145
125	NC_014501	TTTAG	2	10	232890	232899	20 %	60 %	20 %	0 %	307150150
126	NC_014501	GGCTT	2	10	233181	233190	0 %	40 %	40 %	20 %	307150150
127	NC_014501	ACTCA	2	10	233244	233253	40 %	20 %	0 %	40 %	307150150
128	NC_014501	CACTT	2	10	235558	235567	20 %	40 %	0 %	40 %	307150154
129	NC_014501	GAGGT	2	10	238700	238709	20 %	20 %	60 %	0 %	307150157
130	NC_014501	CTGCT	2	10	239841	239850	0 %	40 %	20 %	40 %	307150158
131	NC_014501	GATTG	2	10	240579	240588	20 %	40 %	40 %	0 %	307150158
132	NC_014501	TCTCT	2	10	241851	241860	0 %	60 %	0 %	40 %	307150159
133	NC_014501	TGAGA	2	10	242926	242935	40 %	20 %	40 %	0 %	307150160
134	NC_014501	AAGAA	2	10	244485	244494	80 %	0 %	20 %	0 %	307150161
135	NC_014501	AAAAT	2	10	251823	251832	80 %	20 %	0 %	0 %	307150169
136	NC_014501	CAAAA	2	10	252340	252349	80 %	0 %	0 %	20 %	307150169
137	NC_014501	GGGGA	2	10	253221	253230	20 %	0 %	80 %	0 %	307150169
138	NC_014501	AAGAC	2	10	260962	260971	60 %	0 %	20 %	20 %	307150175
139	NC_014501	CGGCT	2	10	261607	261616	0 %	20 %	40 %	40 %	307150176
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142	NC_014501	GACAA	2	10	265213	265222	60 %	0 %	20 %	20 %	307150180
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144	NC_014501	AATTA	2	10	268260	268269	60 %	40 %	0 %	0 %	307150183
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146	NC_014501	ATAGG	2	10	268999	269008	40 %	20 %	40 %	0 %	307150184
147	NC_014501	GGTTA	2	10	269016	269025	20 %	40 %	40 %	0 %	307150184
148	NC_014501	TGATT	2	10	270222	270231	20 %	60 %	20 %	0 %	307150186
149	NC_014501	GAGTT	2	10	271150	271159	20 %	40 %	40 %	0 %	307150187
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152	NC_014501	AAATA	2	10	279804	279813	80 %	20 %	0 %	0 %	307150192
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156	NC_014501	ATTGA	2	10	291941	291950	40 %	40 %	20 %	0 %	307150202
157	NC_014501	TTTGA	2	10	295852	295861	20 %	60 %	20 %	0 %	307150206
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246	NC_014501	TCGAG	2	10	481681	481690	20 %	20 %	40 %	20 %	307150382
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249	NC_014501	TTTCG	2	10	490087	490096	0 %	60 %	20 %	20 %	307150385
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253	NC_014501	GAATA	2	10	501815	501824	60 %	20 %	20 %	0 %	307150397
254	NC_014501	TGGCT	2	10	520139	520148	0 %	40 %	40 %	20 %	307150412
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260	NC_014501	TTTAG	2	10	533693	533702	20 %	60 %	20 %	0 %	307150423
261	NC_014501	CCTGA	2	10	536759	536768	20 %	20 %	20 %	40 %	307150425
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