MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 15347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	CATT	2	8	18	25	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014501	GTAT	2	8	1223	1230	25 %	50 %	25 %	0 %	307149946
3	NC_014501	ATTT	2	8	2411	2418	25 %	75 %	0 %	0 %	307149947
4	NC_014501	ATTA	2	8	2955	2962	50 %	50 %	0 %	0 %	307149948
5	NC_014501	TGGG	2	8	3018	3025	0 %	25 %	75 %	0 %	307149948
6	NC_014501	TGGA	2	8	3126	3133	25 %	25 %	50 %	0 %	307149948
7	NC_014501	GTTA	2	8	3707	3714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014501	GTTA	2	8	4154	4161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014501	TTTA	2	8	4185	4192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014501	TAAA	3	12	4378	4389	75 %	25 %	0 %	0 %	307149950
11	NC_014501	CAGC	2	8	4478	4485	25 %	0 %	25 %	50 %	307149950
12	NC_014501	TAAC	2	8	4689	4696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014501	TCCG	2	8	5528	5535	0 %	25 %	25 %	50 %	307149951
14	NC_014501	TGAG	2	8	5811	5818	25 %	25 %	50 %	0 %	307149951
15	NC_014501	TTGA	2	8	5966	5973	25 %	50 %	25 %	0 %	307149951
16	NC_014501	TAAT	2	8	6135	6142	50 %	50 %	0 %	0 %	307149951
17	NC_014501	AACA	2	8	6209	6216	75 %	0 %	0 %	25 %	307149951
18	NC_014501	CCAT	2	8	6713	6720	25 %	25 %	0 %	50 %	307149951
19	NC_014501	TTTA	2	8	7600	7607	25 %	75 %	0 %	0 %	307149952
20	NC_014501	AATT	2	8	9075	9082	50 %	50 %	0 %	0 %	307149953
21	NC_014501	TAAC	2	8	9093	9100	50 %	25 %	0 %	25 %	307149953
22	NC_014501	CTTG	2	8	9209	9216	0 %	50 %	25 %	25 %	307149953
23	NC_014501	TCTA	2	8	9330	9337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014501	TGCC	2	8	9636	9643	0 %	25 %	25 %	50 %	307149954
25	NC_014501	TAAA	2	8	10191	10198	75 %	25 %	0 %	0 %	307149954
26	NC_014501	TGTC	2	8	10362	10369	0 %	50 %	25 %	25 %	307149954
27	NC_014501	GTTT	2	8	10373	10380	0 %	75 %	25 %	0 %	307149954
28	NC_014501	TAAC	2	8	10843	10850	50 %	25 %	0 %	25 %	307149955
29	NC_014501	TTTA	2	8	10992	10999	25 %	75 %	0 %	0 %	307149955
30	NC_014501	ATCA	2	8	12205	12212	50 %	25 %	0 %	25 %	307149956
31	NC_014501	AATT	2	8	12673	12680	50 %	50 %	0 %	0 %	307149956
32	NC_014501	AATA	2	8	12907	12914	75 %	25 %	0 %	0 %	307149956
33	NC_014501	TCCC	2	8	13371	13378	0 %	25 %	0 %	75 %	307149956
34	NC_014501	TATT	2	8	14596	14603	25 %	75 %	0 %	0 %	307149957
35	NC_014501	GCTC	2	8	14838	14845	0 %	25 %	25 %	50 %	307149958
36	NC_014501	TGAG	2	8	15736	15743	25 %	25 %	50 %	0 %	307149959
37	NC_014501	ACGA	2	8	15751	15758	50 %	0 %	25 %	25 %	307149959
38	NC_014501	AAAT	2	8	17443	17450	75 %	25 %	0 %	0 %	307149960
39	NC_014501	AATA	2	8	18043	18050	75 %	25 %	0 %	0 %	307149961
40	NC_014501	CAAG	2	8	18425	18432	50 %	0 %	25 %	25 %	307149961
41	NC_014501	TCAA	2	8	18433	18440	50 %	25 %	0 %	25 %	307149961
42	NC_014501	TGAG	2	8	19423	19430	25 %	25 %	50 %	0 %	307149961
43	NC_014501	TGCT	2	8	19641	19648	0 %	50 %	25 %	25 %	307149961
44	NC_014501	AACA	2	8	20109	20116	75 %	0 %	0 %	25 %	307149961
45	NC_014501	AAAT	2	8	21080	21087	75 %	25 %	0 %	0 %	307149962
46	NC_014501	TAAA	2	8	21092	21099	75 %	25 %	0 %	0 %	307149962
47	NC_014501	AAAT	2	8	21206	21213	75 %	25 %	0 %	0 %	307149962
48	NC_014501	ATCA	2	8	21956	21963	50 %	25 %	0 %	25 %	307149963
49	NC_014501	GCGA	2	8	22449	22456	25 %	0 %	50 %	25 %	307149964
50	NC_014501	CTTC	2	8	22569	22576	0 %	50 %	0 %	50 %	307149964
51	NC_014501	TACA	2	8	22819	22826	50 %	25 %	0 %	25 %	307149964
52	NC_014501	GCTA	2	8	24536	24543	25 %	25 %	25 %	25 %	307149966
53	NC_014501	AGGA	2	8	24699	24706	50 %	0 %	50 %	0 %	307149966
54	NC_014501	AATC	2	8	26218	26225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014501	ATCA	2	8	26316	26323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014501	AAGA	2	8	26464	26471	75 %	0 %	25 %	0 %	307149967
57	NC_014501	CAAA	2	8	26702	26709	75 %	0 %	0 %	25 %	307149967
58	NC_014501	ATGT	2	8	26897	26904	25 %	50 %	25 %	0 %	307149967
59	NC_014501	CAAG	2	8	27035	27042	50 %	0 %	25 %	25 %	307149967
60	NC_014501	ATAA	2	8	27205	27212	75 %	25 %	0 %	0 %	307149967
61	NC_014501	ACCA	2	8	28086	28093	50 %	0 %	0 %	50 %	307149968
62	NC_014501	TCAG	2	8	28742	28749	25 %	25 %	25 %	25 %	307149968
63	NC_014501	CGGC	2	8	28788	28795	0 %	0 %	50 %	50 %	307149968
64	NC_014501	GTTC	2	8	28856	28863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014501	AAAT	2	8	28878	28885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014501	ACTC	2	8	28937	28944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014501	TTTC	2	8	29389	29396	0 %	75 %	0 %	25 %	307149969
68	NC_014501	AAAG	2	8	29606	29613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014501	GATT	2	8	29844	29851	25 %	50 %	25 %	0 %	307149970
70	NC_014501	CTCC	2	8	29895	29902	0 %	25 %	0 %	75 %	307149970
71	NC_014501	AATT	2	8	30569	30576	50 %	50 %	0 %	0 %	307149970
72	NC_014501	GGGT	2	8	30944	30951	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014501	CCTT	2	8	31142	31149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014501	GTTT	2	8	33725	33732	0 %	75 %	25 %	0 %	307149973
75	NC_014501	GGTG	2	8	33766	33773	0 %	25 %	75 %	0 %	307149973
76	NC_014501	AATT	2	8	34342	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	307149973
77	NC_014501	AATG	2	8	35209	35216	50 %	25 %	25 %	0 %	307149973
78	NC_014501	AAAG	2	8	35378	35385	75 %	0 %	25 %	0 %	307149973
79	NC_014501	TGAT	2	8	35589	35596	25 %	50 %	25 %	0 %	307149973
80	NC_014501	ACAG	2	8	35854	35861	50 %	0 %	25 %	25 %	307149973
81	NC_014501	ATAA	2	8	36026	36033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014501	CAAC	2	8	36948	36955	50 %	0 %	0 %	50 %	307149975
83	NC_014501	GTTT	2	8	37202	37209	0 %	75 %	25 %	0 %	307149975
84	NC_014501	AATT	2	8	37596	37603	50 %	50 %	0 %	0 %	307149975
85	NC_014501	AGTG	2	8	37805	37812	25 %	25 %	50 %	0 %	307149975
86	NC_014501	AAAC	2	8	38066	38073	75 %	0 %	0 %	25 %	307149975
87	NC_014501	GGTT	2	8	38414	38421	0 %	50 %	50 %	0 %	307149975
88	NC_014501	TTCG	2	8	38849	38856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014501	TTCT	2	8	38953	38960	0 %	75 %	0 %	25 %	307149976
90	NC_014501	TGTC	2	8	39765	39772	0 %	50 %	25 %	25 %	307149977
91	NC_014501	AGCC	2	8	39914	39921	25 %	0 %	25 %	50 %	307149978
92	NC_014501	CAAG	2	8	40106	40113	50 %	0 %	25 %	25 %	307149978
93	NC_014501	TCCT	2	8	40734	40741	0 %	50 %	0 %	50 %	307149979
94	NC_014501	CTTC	2	8	41045	41052	0 %	50 %	0 %	50 %	307149979
95	NC_014501	TAAG	2	8	41805	41812	50 %	25 %	25 %	0 %	307149979
96	NC_014501	TGAT	2	8	41896	41903	25 %	50 %	25 %	0 %	307149979
97	NC_014501	GATT	2	8	41936	41943	25 %	50 %	25 %	0 %	307149979
98	NC_014501	TAAT	2	8	42208	42215	50 %	50 %	0 %	0 %	307149980
99	NC_014501	AAAC	2	8	42235	42242	75 %	0 %	0 %	25 %	307149980
100	NC_014501	CAAT	2	8	42305	42312	50 %	25 %	0 %	25 %	307149980
101	NC_014501	ATTT	2	8	42417	42424	25 %	75 %	0 %	0 %	307149980
102	NC_014501	GCCC	2	8	42712	42719	0 %	0 %	25 %	75 %	307149980
103	NC_014501	TAAA	2	8	42816	42823	75 %	25 %	0 %	0 %	307149980
104	NC_014501	ATAA	2	8	42900	42907	75 %	25 %	0 %	0 %	307149980
105	NC_014501	AAAC	2	8	43016	43023	75 %	0 %	0 %	25 %	307149980
106	NC_014501	TAAC	2	8	43426	43433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014501	CAGA	2	8	43482	43489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014501	TGGA	2	8	44427	44434	25 %	25 %	50 %	0 %	307149981
109	NC_014501	GATC	2	8	44785	44792	25 %	25 %	25 %	25 %	307149981
110	NC_014501	CTTT	2	8	44804	44811	0 %	75 %	0 %	25 %	307149981
111	NC_014501	AGTG	2	8	45204	45211	25 %	25 %	50 %	0 %	307149982
112	NC_014501	AAAC	2	8	45295	45302	75 %	0 %	0 %	25 %	307149982
113	NC_014501	GTGA	2	8	46269	46276	25 %	25 %	50 %	0 %	307149983
114	NC_014501	AGCA	2	8	46287	46294	50 %	0 %	25 %	25 %	307149983
115	NC_014501	ATTA	2	8	46512	46519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014501	GGAC	2	8	47292	47299	25 %	0 %	50 %	25 %	307149984
117	NC_014501	TTCT	2	8	47760	47767	0 %	75 %	0 %	25 %	307149984
118	NC_014501	GACC	2	8	48167	48174	25 %	0 %	25 %	50 %	307149984
119	NC_014501	AATT	2	8	48677	48684	50 %	50 %	0 %	0 %	307149984
120	NC_014501	AATC	2	8	49252	49259	50 %	25 %	0 %	25 %	307149986
121	NC_014501	GTTG	2	8	49302	49309	0 %	50 %	50 %	0 %	307149986
122	NC_014501	AAAT	2	8	49358	49365	75 %	25 %	0 %	0 %	307149986
123	NC_014501	TTTC	2	8	49509	49516	0 %	75 %	0 %	25 %	307149986
124	NC_014501	CAAA	2	8	49946	49953	75 %	0 %	0 %	25 %	307149986
125	NC_014501	CTGC	2	8	50269	50276	0 %	25 %	25 %	50 %	307149987
126	NC_014501	GATT	2	8	50674	50681	25 %	50 %	25 %	0 %	307149987
127	NC_014501	CGAG	2	8	50865	50872	25 %	0 %	50 %	25 %	307149987
128	NC_014501	ATTA	2	8	50964	50971	50 %	50 %	0 %	0 %	307149987
129	NC_014501	ATCA	2	8	51162	51169	50 %	25 %	0 %	25 %	307149987
130	NC_014501	ATCT	2	8	51337	51344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014501	AGGA	2	8	51689	51696	50 %	0 %	50 %	0 %	307149988
132	NC_014501	AATT	2	8	51790	51797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014501	TATC	2	8	51829	51836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014501	AGGA	2	8	52222	52229	50 %	0 %	50 %	0 %	307149989
135	NC_014501	TAAA	2	8	52321	52328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014501	AATT	2	8	53270	53277	50 %	50 %	0 %	0 %	307149990
137	NC_014501	GATG	2	8	53943	53950	25 %	25 %	50 %	0 %	307149991
138	NC_014501	TAAA	2	8	54419	54426	75 %	25 %	0 %	0 %	307149991
139	NC_014501	ATTG	2	8	54754	54761	25 %	50 %	25 %	0 %	307149992
140	NC_014501	TGGT	2	8	54977	54984	0 %	50 %	50 %	0 %	307149992
141	NC_014501	TCTT	2	8	56217	56224	0 %	75 %	0 %	25 %	307149992
142	NC_014501	ATCT	2	8	56456	56463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014501	ACCC	2	8	58020	58027	25 %	0 %	0 %	75 %	307149994
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167	NC_014501	TTAC	2	8	66939	66946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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