MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 10866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	TTA	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014501	GCC	2	6	1439	1444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014501	GAG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014501	TCA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014501	TAA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014501	GCT	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014501	TTA	2	6	1552	1557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014501	GGC	2	6	2502	2507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014501	ACC	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014501	TAA	2	6	2557	2562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014501	ATT	2	6	4648	4653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014501	TTG	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014501	ATT	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014501	CTA	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014501	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014501	ACA	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014501	TTG	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014501	CAT	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014501	TCC	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014501	GCA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014501	TCA	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014501	ATA	2	6	10607	10612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014501	TAC	2	6	10636	10641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014501	CAA	2	6	10791	10796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014501	TTC	2	6	11656	11661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014501	TCA	2	6	11680	11685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014501	GTT	2	6	11688	11693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014501	TTG	2	6	11784	11789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014501	CAA	2	6	11918	11923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014501	ATG	2	6	11976	11981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014501	AGT	2	6	12016	12021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014501	CGA	2	6	12034	12039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014501	TAT	2	6	13667	13672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014501	TAA	2	6	13741	13746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014501	AAG	2	6	16052	16057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014501	AAT	2	6	16064	16069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014501	TAA	2	6	16079	16084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014501	TAA	2	6	16092	16097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014501	TAA	2	6	16101	16106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014501	AAC	2	6	20516	20521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014501	CTC	2	6	20586	20591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014501	CGC	2	6	20620	20625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014501	CGC	2	6	20742	20747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014501	CCT	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014501	CAA	2	6	21363	21368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014501	CAT	2	6	21374	21379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014501	CAT	2	6	21406	21411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014501	ACC	2	6	21453	21458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014501	ATC	2	6	22270	22275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014501	TCC	2	6	22848	22853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014501	TCA	2	6	22985	22990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014501	ATT	2	6	23125	23130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014501	ATT	2	6	23155	23160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014501	TCT	2	6	23275	23280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014501	CTG	2	6	23490	23495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014501	TTA	2	6	23507	23512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014501	GCC	2	6	23826	23831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014501	CCT	2	6	23842	23847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014501	CGT	2	6	23996	24001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014501	ACC	2	6	24151	24156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014501	AGT	2	6	24219	24224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014501	TTA	2	6	25981	25986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014501	CCT	2	6	26054	26059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014501	TAC	2	6	26150	26155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014501	CAA	2	6	27238	27243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014501	GAA	2	6	28924	28929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014501	CAG	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014501	TTG	2	6	29504	29509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014501	TAT	3	9	30868	30876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014501	GTT	2	6	30913	30918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014501	GTT	2	6	30959	30964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014501	TGA	2	6	31008	31013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014501	TAA	2	6	31050	31055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014501	GTG	2	6	31071	31076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014501	TCA	2	6	31163	31168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014501	CTG	2	6	32699	32704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014501	CGA	2	6	32748	32753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014501	ATT	2	6	32763	32768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014501	ATT	2	6	32794	32799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014501	GTT	2	6	35959	35964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014501	ATA	2	6	36122	36127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014501	TAA	2	6	36151	36156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014501	ATT	2	6	36342	36347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014501	TCC	2	6	36389	36394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014501	TCT	2	6	36412	36417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014501	GAG	2	6	36424	36429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014501	ACC	2	6	36459	36464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014501	TCC	2	6	36526	36531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014501	AAT	2	6	36705	36710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014501	ATT	3	9	36746	36754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014501	ATT	2	6	36816	36821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014501	TGA	2	6	36903	36908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014501	TCA	2	6	36914	36919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014501	TAA	2	6	38820	38825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014501	TTA	2	6	41962	41967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014501	TGA	2	6	43312	43317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014501	ACT	2	6	43350	43355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014501	TTG	2	6	43360	43365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014501	TTC	2	6	43375	43380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014501	CTC	2	6	43407	43412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014501	GGA	2	6	43580	43585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014501	ATC	2	6	43623	43628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014501	ATC	2	6	43648	43653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014501	TTA	2	6	43695	43700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014501	CTC	2	6	43747	43752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014501	AGG	2	6	46457	46462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014501	ATT	2	6	46479	46484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014501	TAA	2	6	46521	46526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014501	ACA	2	6	46539	46544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014501	GAG	2	6	46551	46556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014501	AGC	2	6	48768	48773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014501	ATG	2	6	50014	50019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014501	CCA	2	6	50075	50080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014501	TCA	2	6	51348	51353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014501	TAG	2	6	51880	51885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014501	ATC	2	6	52370	52375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014501	TAC	2	6	52390	52395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014501	GAG	2	6	52433	52438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014501	TAA	2	6	53341	53346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014501	ATA	2	6	53347	53352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014501	GGC	2	6	54583	54588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014501	TGC	2	6	54606	54611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014501	AAC	2	6	56263	56268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014501	TTA	2	6	56322	56327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014501	TAA	2	6	56367	56372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014501	TGT	2	6	56405	56410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014501	CAA	2	6	56526	56531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014501	TTG	2	6	56579	56584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014501	CGA	2	6	57468	57473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014501	CTG	2	6	58520	58525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014501	TAA	2	6	58531	58536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014501	GAT	2	6	58665	58670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014501	TCA	2	6	58698	58703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014501	GTT	2	6	58731	58736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014501	TAA	2	6	61433	61438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014501	ATA	2	6	61462	61467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014501	AAT	2	6	61622	61627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014501	ACA	2	6	62295	62300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014501	GAT	2	6	62751	62756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014501	TAA	2	6	64350	64355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014501	TTA	2	6	64922	64927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_014501	TCA	2	6	65082	65087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_014501	CTT	2	6	69844	69849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_014501	AGA	2	6	147855	147860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_014501	TAA	2	6	236722	236727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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