MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 70574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	TGT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149946
2	NC_014501	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149946
3	NC_014501	TAT	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
4	NC_014501	ATC	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149946
5	NC_014501	GTC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149946
6	NC_014501	AAT	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149946
7	NC_014501	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149946
8	NC_014501	GCG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149946
9	NC_014501	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
10	NC_014501	GTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149946
11	NC_014501	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
12	NC_014501	AGA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149946
13	NC_014501	CGG	2	6	1281	1286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149946
14	NC_014501	TAC	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149947
15	NC_014501	TCG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149947
16	NC_014501	TAA	2	6	1793	1798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149947
17	NC_014501	TAA	2	6	1858	1863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149947
18	NC_014501	GGC	2	6	1991	1996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149947
19	NC_014501	TTA	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
20	NC_014501	CTG	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149947
21	NC_014501	TTC	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149947
22	NC_014501	ATT	3	9	2247	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
23	NC_014501	AGA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149947
24	NC_014501	ATT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
25	NC_014501	ACA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149947
26	NC_014501	GGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149948
27	NC_014501	GAT	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
28	NC_014501	GCG	2	6	2821	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149948
29	NC_014501	ATT	2	6	2831	2836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149948
30	NC_014501	CTC	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149948
31	NC_014501	CAA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149948
32	NC_014501	TCA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149948
33	NC_014501	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149948
34	NC_014501	TGA	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
35	NC_014501	AGG	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149948
36	NC_014501	GAA	2	6	3307	3312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149948
37	NC_014501	ACA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149948
38	NC_014501	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149948
39	NC_014501	CAG	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149948
40	NC_014501	GAT	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
41	NC_014501	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149949
42	NC_014501	CCT	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149949
43	NC_014501	TTA	2	6	3806	3811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149949
44	NC_014501	TGC	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149949
45	NC_014501	GTT	2	6	3861	3866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149949
46	NC_014501	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149949
47	NC_014501	CTT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
48	NC_014501	TTC	2	6	3973	3978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
49	NC_014501	CCT	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149949
50	NC_014501	TTC	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
51	NC_014501	TCA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149949
52	NC_014501	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149949
53	NC_014501	TCT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149950
54	NC_014501	CAC	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149950
55	NC_014501	CAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149950
56	NC_014501	TAG	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149950
57	NC_014501	TTC	2	6	4533	4538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149950
58	NC_014501	TAA	2	6	5273	5278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
59	NC_014501	TCA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
60	NC_014501	GAT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
61	NC_014501	GGC	2	6	5365	5370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149951
62	NC_014501	GCA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149951
63	NC_014501	ATA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
64	NC_014501	TCA	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
65	NC_014501	TGT	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149951
66	NC_014501	TCC	2	6	5771	5776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149951
67	NC_014501	TAA	2	6	5860	5865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
68	NC_014501	CGG	2	6	6157	6162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149951
69	NC_014501	AAT	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
70	NC_014501	AAT	2	6	6203	6208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
71	NC_014501	AAT	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
72	NC_014501	CTC	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149951
73	NC_014501	ATA	2	6	6369	6374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
74	NC_014501	CGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149951
75	NC_014501	CTG	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149951
76	NC_014501	AAT	2	6	6593	6598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
77	NC_014501	TTG	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149951
78	NC_014501	TAG	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
79	NC_014501	GAC	2	6	6803	6808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149951
80	NC_014501	TAA	2	6	6809	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
81	NC_014501	GAA	2	6	6829	6834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149951
82	NC_014501	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
83	NC_014501	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
84	NC_014501	AAT	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
85	NC_014501	ACA	2	6	7098	7103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149951
86	NC_014501	TTC	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149951
87	NC_014501	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
88	NC_014501	GTA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
89	NC_014501	CTA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
90	NC_014501	TTC	2	6	7304	7309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149951
91	NC_014501	TAA	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
92	NC_014501	CAC	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149952
93	NC_014501	ATC	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149952
94	NC_014501	TTC	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149952
95	NC_014501	CTG	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149952
96	NC_014501	TCC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149952
97	NC_014501	CAC	2	6	8029	8034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149952
98	NC_014501	TAT	2	6	8062	8067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149952
99	NC_014501	GCC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149952
100	NC_014501	TTC	2	6	8303	8308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149952
101	NC_014501	CGG	2	6	8331	8336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149952
102	NC_014501	ATA	2	6	8363	8368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149952
103	NC_014501	TCC	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149952
104	NC_014501	CAT	2	6	8419	8424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149952
105	NC_014501	TTG	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149952
106	NC_014501	CGC	2	6	8542	8547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149953
107	NC_014501	ATG	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149953
108	NC_014501	TCA	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149953
109	NC_014501	GGC	2	6	8715	8720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149953
110	NC_014501	TAA	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149953
111	NC_014501	GCA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149953
112	NC_014501	GCT	2	6	9007	9012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149953
113	NC_014501	CTT	2	6	9129	9134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149953
114	NC_014501	CCA	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149953
115	NC_014501	ATA	3	9	9227	9235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149953
116	NC_014501	CAA	2	6	9243	9248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149953
117	NC_014501	AAT	2	6	9480	9485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149954
118	NC_014501	CTT	3	9	9708	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149954
119	NC_014501	GCC	2	6	9721	9726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149954
120	NC_014501	TAA	3	9	9736	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149954
121	NC_014501	CTA	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149954
122	NC_014501	ATG	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149954
123	NC_014501	ACG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149954
124	NC_014501	CTT	2	6	10173	10178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149954
125	NC_014501	GCC	2	6	10262	10267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149954
126	NC_014501	ATG	2	6	10388	10393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149954
127	NC_014501	AAC	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149954
128	NC_014501	TTG	2	6	10504	10509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149954
129	NC_014501	TGA	2	6	10573	10578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149954
130	NC_014501	TGG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149955
131	NC_014501	AGA	2	6	10903	10908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149955
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257	NC_014501	CGT	2	6	24426	24431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149966
258	NC_014501	AGC	2	6	24461	24466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149966
259	NC_014501	GTG	2	6	24472	24477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149966
260	NC_014501	ACA	2	6	24478	24483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149966
261	NC_014501	ACA	2	6	24562	24567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149966
262	NC_014501	ATG	2	6	24838	24843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149966
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