MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dickeya dadantii 3937 chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014500	AAGACG	2	12	17697	17708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014500	CAATGT	2	12	21561	21572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014500	GGTTTG	2	12	24780	24791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014500	ATAAAC	2	12	30988	30999	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014500	CGGTAT	2	12	53398	53409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014500	GCGGTG	2	12	65418	65429	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014500	GATGGC	2	12	102283	102294	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014500	CAAAAG	2	12	107968	107979	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014500	AATTAA	2	12	108122	108133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014500	TAAGGT	2	12	153261	153272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014500	AAGACG	2	12	236541	236552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014500	TTGCGG	2	12	269723	269734	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014500	AAGACG	2	12	283364	283375	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014500	GCAGGC	2	12	309004	309015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014500	ACCGGC	2	12	372061	372072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014500	TGACGG	2	12	372164	372175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014500	AACCGG	2	12	372605	372616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014500	TACGTG	2	12	382212	382223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014500	TTTATT	2	12	413998	414009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014500	ATTCAA	2	12	436636	436647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014500	GACGCC	2	12	484496	484507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014500	ATTGAT	2	12	490963	490974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014500	GACAGT	2	12	512184	512195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014500	TTTTAT	2	12	519370	519381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014500	ACGCCA	3	18	557157	557174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014500	AGAAAA	2	12	586424	586435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014500	GATATT	2	12	630304	630315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014500	CCGACC	2	12	640946	640957	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014500	TCGGCG	2	12	643476	643487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014500	CATTAC	2	12	644347	644358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014500	AAAGCA	2	12	705442	705453	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014500	GGGTCA	2	12	735042	735053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014500	TCCGGC	2	12	773753	773764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014500	AGATTT	2	12	816087	816098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014500	AGAATG	2	12	816720	816731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014500	TGAAAT	2	12	818211	818222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014500	CGGGGC	2	12	859887	859898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014500	TGTTGC	2	12	865830	865841	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014500	AGAATA	2	12	870443	870454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014500	TCCCGA	2	12	873535	873546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014500	GAAAGA	2	12	874237	874248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014500	GTGCAG	2	12	874361	874372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014500	CGTTGC	2	12	874905	874916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014500	CGATCT	2	12	875868	875879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014500	CCGTCA	2	12	876416	876427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014500	AATACC	2	12	877477	877488	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014500	TACCGA	2	12	887689	887700	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014500	ACGCCG	2	12	906371	906382	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014500	ATAAAA	2	12	925932	925943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014500	AATATA	2	12	925998	926009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014500	CTTGAT	2	12	1030177	1030188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014500	ATTGAC	2	12	1063294	1063305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014500	TTCTAT	2	12	1087040	1087051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014500	GTTTGG	2	12	1089216	1089227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014500	AAATGA	2	12	1101097	1101108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014500	GGCCGT	2	12	1212258	1212269	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014500	AAAGCG	2	12	1220735	1220746	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014500	CGGTAA	2	12	1242703	1242714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014500	AAAGCG	2	12	1246361	1246372	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014500	AAAAAG	2	12	1279816	1279827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014500	TTATTT	2	12	1349515	1349526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014500	TTGCCG	2	12	1405072	1405083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014500	ATAAAA	2	12	1413530	1413541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014500	GACTAT	2	12	1455223	1455234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014500	GTTCAT	2	12	1464598	1464609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014500	ATGAAA	2	12	1498233	1498244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014500	TTAAAA	2	12	1510002	1510013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014500	TCTTCC	2	12	1529540	1529551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014500	AGAAAA	2	12	1534703	1534714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014500	CGCCGG	2	12	1547602	1547613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014500	CCACAG	2	12	1571767	1571778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014500	ATTTTT	2	12	1573381	1573392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014500	TTCAGC	2	12	1606406	1606417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014500	ATCGAG	2	12	1638929	1638940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014500	CTCATG	2	12	1639132	1639143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014500	AATTTC	2	12	1647778	1647789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014500	TCAGGG	2	12	1676107	1676118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014500	GACGCC	2	12	1725729	1725740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014500	TAATGA	2	12	1740046	1740057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014500	CTTCAT	2	12	1756554	1756565	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014500	ATTTTA	2	12	1849059	1849070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014500	CTGACC	2	12	1871939	1871950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014500	CCGTCA	2	12	1895661	1895672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014500	TGGCCG	2	12	1935482	1935493	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014500	CGTTGC	2	12	1951888	1951899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014500	AACGGC	2	12	2004498	2004509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014500	TGGCGC	2	12	2005761	2005772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014500	CGGCGC	2	12	2005803	2005814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014500	GGCGCT	2	12	2005930	2005941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014500	GCTGGC	2	12	2020119	2020130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014500	GACTGC	2	12	2026522	2026533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014500	GGCGCT	2	12	2026682	2026693	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014500	GCTCCT	2	12	2039043	2039054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014500	CGTCAC	2	12	2055359	2055370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014500	AAAAAC	2	12	2055458	2055469	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014500	TATTCA	2	12	2097883	2097894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014500	TTCTGC	2	12	2133060	2133071	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014500	AATAAA	2	12	2140125	2140136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014500	CGTGGT	2	12	2170601	2170612	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014500	GTGATG	2	12	2199100	2199111	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014500	CGCTGG	2	12	2220410	2220421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014500	ATGAAG	2	12	2221030	2221041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014500	AAAAAC	2	12	2251482	2251493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014500	GTTTTT	2	12	2251512	2251523	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014500	AATAAA	2	12	2262332	2262343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014500	ATTCTG	2	12	2272401	2272412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014500	GGAGCT	2	12	2280867	2280878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014500	CGTTTG	2	12	2289012	2289023	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014500	TTTCCG	2	12	2329021	2329032	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014500	GCGGCT	2	12	2329181	2329192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014500	CTGATT	2	12	2329794	2329805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014500	TCAGGG	2	12	2361488	2361499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014500	TCATTA	2	12	2367374	2367385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014500	TGATTT	2	12	2367543	2367554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014500	ATTTTT	2	12	2368243	2368254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014500	TATCCG	2	12	2406046	2406057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014500	ACCTTA	2	12	2408092	2408103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014500	AAATAT	2	12	2417145	2417156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014500	CGGATG	2	12	2424713	2424724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014500	GCTGGT	2	12	2459249	2459260	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014500	GCGATA	2	12	2475555	2475566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014500	GTCAAA	2	12	2485873	2485884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014500	CTACGA	2	12	2524301	2524312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014500	GGGGCG	2	12	2524341	2524352	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014500	TTGGGG	2	12	2524388	2524399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014500	AGCGCC	2	12	2587504	2587515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014500	ACCGTC	2	12	2630407	2630418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014500	TCAGCG	2	12	2630459	2630470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014500	CACCCC	2	12	2630899	2630910	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
130	NC_014500	CCAGCG	2	12	2630970	2630981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014500	AGCCGC	2	12	2631252	2631263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014500	CTTCAC	2	12	2631679	2631690	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014500	ATTAAT	2	12	2662855	2662866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014500	TGTTTA	2	12	2666394	2666405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_014500	CCTGAC	2	12	2853509	2853520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.