MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Sulcia muelleri CARI chromosome

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014499	CAAAAT	2	12	129	140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307128505
2	NC_014499	ATATTA	2	12	7356	7367	50 %	50 %	0 %	0 %	307128509
3	NC_014499	ATATAC	2	12	7707	7718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307128510
4	NC_014499	AAATGA	2	12	7923	7934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128510
5	NC_014499	CTGGGG	2	12	8183	8194	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307128510
6	NC_014499	TTTAAA	2	12	8851	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	307128510
7	NC_014499	AAAGAA	2	12	9202	9213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307128510
8	NC_014499	TAAAAA	2	12	10046	10057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128511
9	NC_014499	AAAATG	2	12	10228	10239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128511
10	NC_014499	ATAATT	2	12	12667	12678	50 %	50 %	0 %	0 %	307128512
11	NC_014499	AGGAAG	2	12	12720	12731	50 %	0 %	50 %	0 %	307128512
12	NC_014499	AAAAGA	2	12	14738	14749	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307128513
13	NC_014499	TAAAAT	2	12	15336	15347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128514
14	NC_014499	AGTATT	2	12	15976	15987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128514
15	NC_014499	TTTTAA	2	12	17272	17283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014499	AATTAA	2	12	17636	17647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128516
17	NC_014499	ATTTCT	2	12	19975	19986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307128517
18	NC_014499	ATTTGG	2	12	20656	20667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307128518
19	NC_014499	TCCAAA	2	12	20822	20833	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307128519
20	NC_014499	TAATAT	2	12	21034	21045	50 %	50 %	0 %	0 %	307128519
21	NC_014499	ATCTCT	2	12	21347	21358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307128519
22	NC_014499	CTCTTG	2	12	23312	23323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307128522
23	NC_014499	ACCTAA	2	12	24637	24648	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307128523
24	NC_014499	AATATT	2	12	24689	24700	50 %	50 %	0 %	0 %	307128523
25	NC_014499	ATAAAA	2	12	26281	26292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128524
26	NC_014499	AAAGAA	2	12	27390	27401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307128524
27	NC_014499	TATAAA	2	12	28326	28337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128524
28	NC_014499	CTCTTT	2	12	30862	30873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307128526
29	NC_014499	AAAATA	2	12	32586	32597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128528
30	NC_014499	TTGAAA	2	12	33652	33663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307128530
31	NC_014499	AATTTA	2	12	34419	34430	50 %	50 %	0 %	0 %	307128530
32	NC_014499	TTCAAA	2	12	34513	34524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307128530
33	NC_014499	TATTGA	2	12	35330	35341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128531
34	NC_014499	ATTAAT	2	12	37299	37310	50 %	50 %	0 %	0 %	307128532
35	NC_014499	ATTTAA	2	12	38613	38624	50 %	50 %	0 %	0 %	307128534
36	NC_014499	TAAAAA	2	12	39232	39243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128535
37	NC_014499	ATTAAA	2	12	39512	39523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128535
38	NC_014499	TTATTT	2	12	39829	39840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307128536
39	NC_014499	CTTATT	2	12	40213	40224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307128536
40	NC_014499	TTAAAT	2	12	41383	41394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014499	ATTTTT	2	12	42371	42382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307128538
42	NC_014499	TTTTCC	2	12	42920	42931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307128538
43	NC_014499	TTTTAA	2	12	43796	43807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128539
44	NC_014499	ATTTTT	3	18	44335	44352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307128539
45	NC_014499	CTATAG	2	12	45582	45593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307128540
46	NC_014499	AATTTA	2	12	47443	47454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014499	AAAAAT	2	12	47546	47557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128544
48	NC_014499	TAAAAA	2	12	47596	47607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128544
49	NC_014499	ATTTTG	2	12	48013	48024	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307128544
50	NC_014499	TAATTT	2	12	48275	48286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128544
51	NC_014499	ATTTCT	2	12	48435	48446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307128544
52	NC_014499	AAATTT	2	12	48537	48548	50 %	50 %	0 %	0 %	307128544
53	NC_014499	TTAAAT	2	12	49005	49016	50 %	50 %	0 %	0 %	307128545
54	NC_014499	TTGGAG	2	12	49219	49230	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307128545
55	NC_014499	TTAAAT	2	12	51204	51215	50 %	50 %	0 %	0 %	307128546
56	NC_014499	TTTATA	2	12	51686	51697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014499	TAATTT	2	12	52896	52907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128548
58	NC_014499	TTCTTT	2	12	55770	55781	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307128551
59	NC_014499	CATATT	2	12	55893	55904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307128551
60	NC_014499	TAAATT	2	12	56004	56015	50 %	50 %	0 %	0 %	307128551
61	NC_014499	TCATTA	2	12	56925	56936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307128552
62	NC_014499	AAAATT	2	12	58878	58889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128554
63	NC_014499	TATTAA	2	12	59647	59658	50 %	50 %	0 %	0 %	307128555
64	NC_014499	TAAATT	2	12	59779	59790	50 %	50 %	0 %	0 %	307128555
65	NC_014499	TATTAA	2	12	59791	59802	50 %	50 %	0 %	0 %	307128555
66	NC_014499	ATATTA	2	12	60644	60655	50 %	50 %	0 %	0 %	307128556
67	NC_014499	GAAAAA	2	12	60718	60729	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307128556
68	NC_014499	TCTAAA	2	12	62275	62286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307128556
69	NC_014499	TAAAAA	2	12	65724	65735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128557
70	NC_014499	TTCTTT	2	12	65737	65748	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307128557
71	NC_014499	GGAGAT	2	12	66255	66266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307128558
72	NC_014499	GAAAAA	2	12	67156	67167	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014499	AATATA	2	12	68313	68324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128561
74	NC_014499	ATTAAA	2	12	68571	68582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128562
75	NC_014499	ATAAAA	2	12	68655	68666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128563
76	NC_014499	CATTAC	2	12	69490	69501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014499	AAAATA	2	12	69903	69914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128564
78	NC_014499	TTAAAT	2	12	70071	70082	50 %	50 %	0 %	0 %	307128564
79	NC_014499	ATTAAA	2	12	70106	70117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128564
80	NC_014499	TAAAAA	2	12	70251	70262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128564
81	NC_014499	AATTAA	2	12	70564	70575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128564
82	NC_014499	ATTAGT	2	12	72742	72753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128565
83	NC_014499	ACTTTA	2	12	73136	73147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307128565
84	NC_014499	TAATTT	2	12	73717	73728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128565
85	NC_014499	TAAATT	2	12	74921	74932	50 %	50 %	0 %	0 %	307128566
86	NC_014499	TTTTCT	2	12	76002	76013	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307128566
87	NC_014499	TTTATA	2	12	76545	76556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128566
88	NC_014499	TATATT	2	12	77677	77688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128566
89	NC_014499	ATTTTA	2	12	79606	79617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128568
90	NC_014499	TTTAAT	2	12	80891	80902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014499	AAAATT	2	12	80918	80929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014499	ATTTCA	2	12	82294	82305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307128571
93	NC_014499	TTTAAT	2	12	83687	83698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128572
94	NC_014499	TTTTAT	2	12	87823	87834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307128574
95	NC_014499	TATATT	2	12	89431	89442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128576
96	NC_014499	AATAAA	2	12	89574	89585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128576
97	NC_014499	ATATTT	2	12	89846	89857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128576
98	NC_014499	TAATTT	2	12	91802	91813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128579
99	NC_014499	AAATAT	2	12	92349	92360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307128579
100	NC_014499	TTTAAT	2	12	92379	92390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128579
101	NC_014499	CTAAAA	2	12	97672	97683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014499	TAATGA	2	12	98347	98358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307128580
103	NC_014499	ATTAAT	2	12	98671	98682	50 %	50 %	0 %	0 %	307128580
104	NC_014499	TTATAT	2	12	99304	99315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128581
105	NC_014499	TTTATA	16	96	100146	100241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014499	TTAAAA	2	12	100258	100269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014499	TGCACC	2	12	108522	108533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307128590
108	NC_014499	GATAAA	2	12	108706	108717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128590
109	NC_014499	TAAAAA	2	12	108951	108962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128590
110	NC_014499	TTAAAT	2	12	109895	109906	50 %	50 %	0 %	0 %	307128591
111	NC_014499	ATATTT	2	12	112775	112786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128596
112	NC_014499	TAAAAG	2	12	114708	114719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128598
113	NC_014499	AATAAA	2	12	115203	115214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128599
114	NC_014499	ATTTAT	2	12	116784	116795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307128600
115	NC_014499	TAAAAA	2	12	119403	119414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128603
116	NC_014499	TAAAAA	2	12	120814	120825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128604
117	NC_014499	GATTTA	2	12	121103	121114	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128604
118	NC_014499	TATATC	2	12	126142	126153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307128608
119	NC_014499	ATATGG	2	12	127472	127483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307128609
120	NC_014499	ATTTAG	3	18	129348	129365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128610
121	NC_014499	TAAAAA	2	12	130930	130941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307128611
122	NC_014499	AATGAA	2	12	131570	131581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128611
123	NC_014499	TGATAT	2	12	131881	131892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307128611
124	NC_014499	AAAGAA	2	12	133541	133552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307128611
125	NC_014499	TAAAAG	2	12	135054	135065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307128612
126	NC_014499	AGAATT	2	12	135367	135378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307128612
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.