MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri CARI chromosome

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014499	TATTT	2	10	6238	6247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014499	ATTAT	2	10	20251	20260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014499	AATAT	2	10	29182	29191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014499	TTGCC	2	10	38193	38202	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014499	ATAAA	2	10	51871	51880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014499	AAATT	2	10	51925	51934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014499	ATTTT	2	10	68986	68995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014499	TCTAT	2	10	69393	69402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014499	ATTTT	2	10	69438	69447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014499	TATAA	2	10	69816	69825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014499	ATTTA	2	10	74876	74885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014499	GGTAA	2	10	93021	93030	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014499	GAAAA	2	10	94816	94825	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014499	GATAA	2	10	97355	97364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014499	TATAT	2	10	100126	100135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014499	TTATA	2	10	100136	100145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014499	ATTTA	2	10	106159	106168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014499	ATTTT	2	10	107126	107135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014499	TTAAA	2	10	129984	129993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014499	ATTTT	2	10	145316	145325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014499	ATATT	10	50	160319	160368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014499	TTTGT	2	10	169775	169784	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014499	ATATT	2	10	170142	170151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014499	TATTT	2	10	170321	170330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014499	TAATT	2	10	170424	170433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014499	TTTCT	2	10	171219	171228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014499	ATATT	2	10	185510	185519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014499	AAATA	2	10	186928	186937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014499	TATAT	2	10	187141	187150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014499	TATCA	2	10	187441	187450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014499	TTATA	2	10	188072	188081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014499	ATCCT	2	10	188268	188277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014499	ATTTT	2	10	191481	191490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014499	TGTAA	2	10	193842	193851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014499	ACAAA	2	10	193881	193890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014499	ATAAA	2	10	212113	212122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014499	TCATT	2	10	214878	214887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014499	TGAAA	2	10	214888	214897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014499	TTTAA	2	10	215081	215090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014499	TAAAT	2	10	220191	220200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014499	TTTAA	2	10	238452	238461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014499	ATTAT	2	10	262306	262315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014499	TAAAA	2	10	263336	263345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014499	GATAT	2	10	267918	267927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.