MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri CARI chromosome

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014499	AAAAT	2	10	676	685	80 %	20 %	0 %	0 %	307128505
2	NC_014499	TAAAA	2	10	1081	1090	80 %	20 %	0 %	0 %	307128506
3	NC_014499	AATTT	2	10	1560	1569	40 %	60 %	0 %	0 %	307128506
4	NC_014499	TATAT	2	10	1903	1912	40 %	60 %	0 %	0 %	307128506
5	NC_014499	TTTAA	2	10	2027	2036	40 %	60 %	0 %	0 %	307128506
6	NC_014499	TATAT	2	10	2080	2089	40 %	60 %	0 %	0 %	307128506
7	NC_014499	TTTAA	2	10	2785	2794	40 %	60 %	0 %	0 %	307128507
8	NC_014499	AATTT	2	10	2818	2827	40 %	60 %	0 %	0 %	307128507
9	NC_014499	ATTTT	2	10	3268	3277	20 %	80 %	0 %	0 %	307128507
10	NC_014499	AAAAT	2	10	3683	3692	80 %	20 %	0 %	0 %	307128508
11	NC_014499	TACAA	2	10	3816	3825	60 %	20 %	0 %	20 %	307128508
12	NC_014499	ATTAT	2	10	4233	4242	40 %	60 %	0 %	0 %	307128508
13	NC_014499	AGAAA	2	10	4594	4603	80 %	0 %	20 %	0 %	307128508
14	NC_014499	AAATA	2	10	5087	5096	80 %	20 %	0 %	0 %	307128508
15	NC_014499	ATTTT	2	10	5134	5143	20 %	80 %	0 %	0 %	307128508
16	NC_014499	TGAAA	2	10	6024	6033	60 %	20 %	20 %	0 %	307128508
17	NC_014499	CTTTT	2	10	6367	6376	0 %	80 %	0 %	20 %	307128509
18	NC_014499	AATAT	2	10	6586	6595	60 %	40 %	0 %	0 %	307128509
19	NC_014499	TATAA	2	10	8290	8299	60 %	40 %	0 %	0 %	307128510
20	NC_014499	TATAA	2	10	8491	8500	60 %	40 %	0 %	0 %	307128510
21	NC_014499	ATAAG	2	10	9376	9385	60 %	20 %	20 %	0 %	307128510
22	NC_014499	AATGA	2	10	9910	9919	60 %	20 %	20 %	0 %	307128511
23	NC_014499	TTATT	2	10	10143	10152	20 %	80 %	0 %	0 %	307128511
24	NC_014499	TTTAA	2	10	10153	10162	40 %	60 %	0 %	0 %	307128511
25	NC_014499	ATGAA	2	10	10529	10538	60 %	20 %	20 %	0 %	307128512
26	NC_014499	TATAA	2	10	11392	11401	60 %	40 %	0 %	0 %	307128512
27	NC_014499	TTCAT	2	10	11463	11472	20 %	60 %	0 %	20 %	307128512
28	NC_014499	ATTAT	2	10	12386	12395	40 %	60 %	0 %	0 %	307128512
29	NC_014499	AGAAA	2	10	13969	13978	80 %	0 %	20 %	0 %	307128513
30	NC_014499	ATAAA	2	10	14136	14145	80 %	20 %	0 %	0 %	307128513
31	NC_014499	ATTAT	2	10	15060	15069	40 %	60 %	0 %	0 %	307128514
32	NC_014499	GAGTT	2	10	15260	15269	20 %	40 %	40 %	0 %	307128514
33	NC_014499	AAATG	2	10	18378	18387	60 %	20 %	20 %	0 %	307128516
34	NC_014499	AATTA	2	10	19182	19191	60 %	40 %	0 %	0 %	307128517
35	NC_014499	TTTGA	2	10	19346	19355	20 %	60 %	20 %	0 %	307128517
36	NC_014499	GATCT	2	10	19577	19586	20 %	40 %	20 %	20 %	307128517
37	NC_014499	ATTAT	2	10	20943	20952	40 %	60 %	0 %	0 %	307128519
38	NC_014499	TATTT	2	10	21137	21146	20 %	80 %	0 %	0 %	307128519
39	NC_014499	CCCAC	2	10	21246	21255	20 %	0 %	0 %	80 %	307128519
40	NC_014499	ATTCT	2	10	22035	22044	20 %	60 %	0 %	20 %	307128520
41	NC_014499	ATTTT	2	10	22259	22268	20 %	80 %	0 %	0 %	307128520
42	NC_014499	CGTAC	2	10	23893	23902	20 %	20 %	20 %	40 %	307128522
43	NC_014499	ATATA	2	10	24436	24445	60 %	40 %	0 %	0 %	307128523
44	NC_014499	ATTTT	2	10	24849	24858	20 %	80 %	0 %	0 %	307128523
45	NC_014499	AGATA	2	10	25169	25178	60 %	20 %	20 %	0 %	307128524
46	NC_014499	AAAAT	2	10	25207	25216	80 %	20 %	0 %	0 %	307128524
47	NC_014499	AAAAT	2	10	26038	26047	80 %	20 %	0 %	0 %	307128524
48	NC_014499	TATAT	2	10	26510	26519	40 %	60 %	0 %	0 %	307128524
49	NC_014499	GTTTG	2	10	26940	26949	0 %	60 %	40 %	0 %	307128524
50	NC_014499	GGAAA	2	10	27583	27592	60 %	0 %	40 %	0 %	307128524
51	NC_014499	TAAAT	2	10	28082	28091	60 %	40 %	0 %	0 %	307128524
52	NC_014499	GTTGT	2	10	28963	28972	0 %	60 %	40 %	0 %	307128525
53	NC_014499	ATATT	2	10	29038	29047	40 %	60 %	0 %	0 %	307128525
54	NC_014499	TATAT	2	10	29933	29942	40 %	60 %	0 %	0 %	307128526
55	NC_014499	TATTT	2	10	30617	30626	20 %	80 %	0 %	0 %	307128526
56	NC_014499	GATTT	2	10	31289	31298	20 %	60 %	20 %	0 %	307128527
57	NC_014499	TAAAA	2	10	31319	31328	80 %	20 %	0 %	0 %	307128527
58	NC_014499	TATTT	2	10	32036	32045	20 %	80 %	0 %	0 %	307128527
59	NC_014499	TATAA	2	10	32576	32585	60 %	40 %	0 %	0 %	307128528
60	NC_014499	ATTTA	2	10	33169	33178	40 %	60 %	0 %	0 %	307128528
61	NC_014499	AATTA	2	10	33567	33576	60 %	40 %	0 %	0 %	307128529
62	NC_014499	AATGT	2	10	33834	33843	40 %	40 %	20 %	0 %	307128530
63	NC_014499	ATTTT	2	10	33846	33855	20 %	80 %	0 %	0 %	307128530
64	NC_014499	TAAAT	2	10	35784	35793	60 %	40 %	0 %	0 %	307128531
65	NC_014499	ATCTA	2	10	36419	36428	40 %	40 %	0 %	20 %	307128531
66	NC_014499	TATAT	2	10	36911	36920	40 %	60 %	0 %	0 %	307128531
67	NC_014499	AAAAT	2	10	37394	37403	80 %	20 %	0 %	0 %	307128532
68	NC_014499	ATTTT	2	10	37540	37549	20 %	80 %	0 %	0 %	307128533
69	NC_014499	ATCAT	2	10	37613	37622	40 %	40 %	0 %	20 %	307128533
70	NC_014499	ATATA	2	10	38358	38367	60 %	40 %	0 %	0 %	307128534
71	NC_014499	AAAAT	2	10	39330	39339	80 %	20 %	0 %	0 %	307128535
72	NC_014499	AATTA	2	10	41330	41339	60 %	40 %	0 %	0 %	307128536
73	NC_014499	AATTA	2	10	41446	41455	60 %	40 %	0 %	0 %	307128537
74	NC_014499	AAGAA	2	10	41696	41705	80 %	0 %	20 %	0 %	307128537
75	NC_014499	TAATA	2	10	42043	42052	60 %	40 %	0 %	0 %	307128537
76	NC_014499	ATTTT	2	10	42484	42493	20 %	80 %	0 %	0 %	307128538
77	NC_014499	AATTA	2	10	44124	44133	60 %	40 %	0 %	0 %	307128539
78	NC_014499	TAAAA	2	10	44364	44373	80 %	20 %	0 %	0 %	307128539
79	NC_014499	ATTTT	2	10	44416	44425	20 %	80 %	0 %	0 %	307128539
80	NC_014499	TACTA	2	10	45481	45490	40 %	40 %	0 %	20 %	307128540
81	NC_014499	TTTTA	2	10	45946	45955	20 %	80 %	0 %	0 %	307128540
82	NC_014499	ATTAT	2	10	46049	46058	40 %	60 %	0 %	0 %	307128540
83	NC_014499	TATTT	2	10	47236	47245	20 %	80 %	0 %	0 %	307128543
84	NC_014499	AAAAT	2	10	48067	48076	80 %	20 %	0 %	0 %	307128544
85	NC_014499	AATAA	2	10	48314	48323	80 %	20 %	0 %	0 %	307128544
86	NC_014499	AATTT	2	10	49039	49048	40 %	60 %	0 %	0 %	307128545
87	NC_014499	TTAAA	2	10	49123	49132	60 %	40 %	0 %	0 %	307128545
88	NC_014499	TAAAT	2	10	49655	49664	60 %	40 %	0 %	0 %	307128545
89	NC_014499	TCATT	3	15	49842	49856	20 %	60 %	0 %	20 %	307128545
90	NC_014499	GTAAT	2	10	49930	49939	40 %	40 %	20 %	0 %	307128545
91	NC_014499	AATTA	2	10	50117	50126	60 %	40 %	0 %	0 %	307128545
92	NC_014499	TAATT	2	10	50356	50365	40 %	60 %	0 %	0 %	307128545
93	NC_014499	TTTAT	2	10	50597	50606	20 %	80 %	0 %	0 %	307128546
94	NC_014499	TTTTC	2	10	52198	52207	0 %	80 %	0 %	20 %	307128547
95	NC_014499	GAAAT	2	10	52342	52351	60 %	20 %	20 %	0 %	307128547
96	NC_014499	AATGA	2	10	52416	52425	60 %	20 %	20 %	0 %	307128547
97	NC_014499	AAATT	2	10	54730	54739	60 %	40 %	0 %	0 %	307128550
98	NC_014499	AATTA	2	10	55359	55368	60 %	40 %	0 %	0 %	307128551
99	NC_014499	ATCTG	2	10	55681	55690	20 %	40 %	20 %	20 %	307128551
100	NC_014499	ATATA	2	10	55967	55976	60 %	40 %	0 %	0 %	307128551
101	NC_014499	AATAG	2	10	56690	56699	60 %	20 %	20 %	0 %	307128552
102	NC_014499	ATTTT	2	10	57114	57123	20 %	80 %	0 %	0 %	307128552
103	NC_014499	TAAAA	2	10	57808	57817	80 %	20 %	0 %	0 %	307128553
104	NC_014499	ATATA	2	10	57875	57884	60 %	40 %	0 %	0 %	307128553
105	NC_014499	AATTA	2	10	57950	57959	60 %	40 %	0 %	0 %	307128553
106	NC_014499	TATAA	2	10	58297	58306	60 %	40 %	0 %	0 %	307128554
107	NC_014499	AAATT	2	10	59152	59161	60 %	40 %	0 %	0 %	307128554
108	NC_014499	TTAAA	2	10	59710	59719	60 %	40 %	0 %	0 %	307128555
109	NC_014499	ATTAT	2	10	59958	59967	40 %	60 %	0 %	0 %	307128555
110	NC_014499	TAAAA	2	10	61353	61362	80 %	20 %	0 %	0 %	307128556
111	NC_014499	TTAAT	2	10	61490	61499	40 %	60 %	0 %	0 %	307128556
112	NC_014499	TTAAA	2	10	61535	61544	60 %	40 %	0 %	0 %	307128556
113	NC_014499	ATTTA	2	10	61940	61949	40 %	60 %	0 %	0 %	307128556
114	NC_014499	AAAAC	2	10	62948	62957	80 %	0 %	0 %	20 %	307128556
115	NC_014499	TAATT	2	10	65350	65359	40 %	60 %	0 %	0 %	307128557
116	NC_014499	TATAA	2	10	67597	67606	60 %	40 %	0 %	0 %	307128560
117	NC_014499	AATTA	2	10	67899	67908	60 %	40 %	0 %	0 %	307128560
118	NC_014499	AATTA	2	10	68031	68040	60 %	40 %	0 %	0 %	307128560
119	NC_014499	TAAAA	2	10	68061	68070	80 %	20 %	0 %	0 %	307128560
120	NC_014499	ATACA	2	10	68609	68618	60 %	20 %	0 %	20 %	307128562
121	NC_014499	AAATA	2	10	68624	68633	80 %	20 %	0 %	0 %	307128562
122	NC_014499	AAAAT	2	10	70134	70143	80 %	20 %	0 %	0 %	307128564
123	NC_014499	TTTTC	2	10	70913	70922	0 %	80 %	0 %	20 %	307128565
124	NC_014499	ATATA	2	10	73268	73277	60 %	40 %	0 %	0 %	307128565
125	NC_014499	TATTT	2	10	74494	74503	20 %	80 %	0 %	0 %	307128565
126	NC_014499	ATTAA	2	10	74543	74552	60 %	40 %	0 %	0 %	307128565
127	NC_014499	TTAAT	2	10	75688	75697	40 %	60 %	0 %	0 %	307128566
128	NC_014499	ATTTA	2	10	75908	75917	40 %	60 %	0 %	0 %	307128566
129	NC_014499	TCAAA	2	10	79642	79651	60 %	20 %	0 %	20 %	307128568
130	NC_014499	ATATT	2	10	83565	83574	40 %	60 %	0 %	0 %	307128572
131	NC_014499	TTAAA	2	10	83848	83857	60 %	40 %	0 %	0 %	307128572
132	NC_014499	GATTT	2	10	84745	84754	20 %	60 %	20 %	0 %	307128573
133	NC_014499	TAAAA	2	10	85904	85913	80 %	20 %	0 %	0 %	307128573
134	NC_014499	TTTAA	2	10	87177	87186	40 %	60 %	0 %	0 %	307128573
135	NC_014499	AAATT	2	10	89323	89332	60 %	40 %	0 %	0 %	307128575
136	NC_014499	TATAA	2	10	90107	90116	60 %	40 %	0 %	0 %	307128577
137	NC_014499	GGATT	2	10	90589	90598	20 %	40 %	40 %	0 %	307128577
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.