MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	TAAGGA	2	12	32647	32658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014498	GAAGTG	2	12	35735	35746	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014498	ACTAAT	2	12	35765	35776	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014498	CCCCCT	2	12	54115	54126	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
5	NC_014498	CAGGCT	2	12	76943	76954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014498	TAAAAA	2	12	93451	93462	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014498	AAAAAT	2	12	109600	109611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014498	TTCTAT	2	12	117180	117191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014498	TCCCAT	2	12	123030	123041	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014498	TAAAAT	2	12	125408	125419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014498	TAAAAA	2	12	141052	141063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014498	GCTTAT	2	12	156218	156229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014498	ATAAAA	2	12	174740	174751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014498	TTTGCT	2	12	183532	183543	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014498	ATAAAA	2	12	183923	183934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014498	TCAAAA	2	12	222834	222845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014498	TTTTAC	2	12	241549	241560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014498	TCTTAA	2	12	286392	286403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014498	GGTTGC	2	12	303372	303383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014498	TAGATA	2	12	336397	336408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014498	GAAAAA	2	12	362971	362982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014498	GCAGTT	2	12	406538	406549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014498	AGAAAT	2	12	465888	465899	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014498	AAATAA	2	12	471040	471051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014498	ATGAAG	2	12	476718	476729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014498	GCTTGC	2	12	520726	520737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014498	TATTTT	2	12	524038	524049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014498	TAAAAA	2	12	563212	563223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014498	TAAAAA	2	12	565897	565908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014498	TGCTTT	2	12	570245	570256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014498	TCTTTT	2	12	602459	602470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014498	AAAGTT	2	12	652598	652609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014498	AGATTG	2	12	671367	671378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014498	GAGATG	2	12	671699	671710	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014498	GAAGCA	2	12	754654	754665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014498	TACTGA	2	12	765257	765268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014498	GTTCTA	2	12	765292	765303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014498	ACTGGG	2	12	803208	803219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014498	AAAGGA	2	12	807067	807078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014498	CTAATA	2	12	814828	814839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014498	ACCATC	2	12	821550	821561	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014498	TTTCAA	2	12	850362	850373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014498	TACCTA	2	12	861340	861351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014498	ATTTTT	2	12	906459	906470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014498	TGATTG	2	12	936649	936660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014498	AAATAA	2	12	936781	936792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014498	AACAAA	2	12	1001220	1001231	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014498	AAACAA	2	12	1010334	1010345	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014498	AGTTCT	2	12	1021865	1021876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014498	CTATTT	2	12	1036051	1036062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014498	TAAAAA	2	12	1050382	1050393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014498	TAGAAT	2	12	1060446	1060457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014498	ATTCTG	2	12	1062173	1062184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014498	TTTTAT	2	12	1064859	1064870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014498	TTTAAT	2	12	1094931	1094942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014498	CCTGCT	2	12	1139327	1139338	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014498	TTTCAA	2	12	1148788	1148799	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014498	TCAAAT	2	12	1199694	1199705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014498	TACTTT	2	12	1207543	1207554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014498	ATATTT	2	12	1210174	1210185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014498	TTTTTA	2	12	1215234	1215245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014498	AAGAAA	2	12	1245346	1245357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014498	CTTTTT	2	12	1255625	1255636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014498	GAAATA	2	12	1255673	1255684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014498	TAAAAA	2	12	1267154	1267165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014498	CTTGGT	2	12	1286444	1286455	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014498	CTTTTT	2	12	1287307	1287318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014498	AAACAG	2	12	1295982	1295993	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014498	TTTATA	2	12	1337946	1337957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014498	TTTTAA	2	12	1341391	1341402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014498	ATAAAA	2	12	1353087	1353098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014498	ATAAAA	2	12	1362496	1362507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014498	CCCGAA	2	12	1376876	1376887	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014498	GTTTTT	2	12	1401541	1401552	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014498	TCTTTT	2	12	1419563	1419574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014498	TGAAAA	2	12	1429440	1429451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014498	ATCCTT	2	12	1451642	1451653	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014498	TTATGT	2	12	1451735	1451746	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014498	TTTATT	2	12	1467642	1467653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014498	CAATCT	2	12	1471618	1471629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014498	AAATTT	2	12	1490008	1490019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014498	CTTTTC	2	12	1490607	1490618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014498	CTTTCT	2	12	1588131	1588142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014498	AAAAAC	2	12	1594882	1594893	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014498	TTAAAA	2	12	1651134	1651145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014498	CCTAAG	2	12	1691445	1691456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014498	AACTTG	2	12	1691568	1691579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014498	ATTTGA	2	12	1714335	1714346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014498	TAATCA	2	12	1722307	1722318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014498	AAAAAG	2	12	1728667	1728678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014498	CACTTC	2	12	1742926	1742937	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014498	GAACAT	2	12	1766571	1766582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014498	TAGGCT	2	12	1789811	1789822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014498	ATATCA	2	12	1794548	1794559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014498	TCATTA	2	12	1801559	1801570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014498	TAATCA	2	12	1820316	1820327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014498	TATTAG	2	12	1846106	1846117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014498	CACTTC	2	12	1846137	1846148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014498	TCCTTA	2	12	1849225	1849236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014498	AATTGA	2	12	1872414	1872425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014498	TTTTTC	2	12	1883870	1883881	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014498	CCAGAA	2	12	1886711	1886722	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014498	AGGACA	2	12	1930423	1930434	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014498	AAAAAT	2	12	1933938	1933949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014498	TATTAG	2	12	1946204	1946215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014498	CACTTC	2	12	1946235	1946246	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014498	TCCTTA	2	12	1949323	1949334	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014498	ATGATT	2	12	1962327	1962338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014498	ATAGGA	2	12	1967690	1967701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014498	AGCCTG	2	12	1990223	1990234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014498	CCCGAA	2	12	2048089	2048100	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014498	TATTAG	2	12	2048963	2048974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014498	CACTTC	2	12	2048994	2049005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014498	TCCTTA	2	12	2052082	2052093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014498	ATAGAT	2	12	2096780	2096791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014498	TCTTTT	2	12	2108553	2108564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014498	GTTTTT	2	12	2128409	2128420	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014498	TAAATT	2	12	2134277	2134288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014498	ACCTTG	2	12	2198945	2198956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014498	TTTTTA	2	12	2212259	2212270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014498	AAAAAT	2	12	2227964	2227975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.