MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 1367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014498	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	307126152
2	NC_014498	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	307126152
3	NC_014498	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	307126152
4	NC_014498	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	307126153
5	NC_014498	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	307126154
6	NC_014498	TAGTT	2	10	6220	6229	20 %	60 %	20 %	0 %	307126158
7	NC_014498	CTATG	2	10	8953	8962	20 %	40 %	20 %	20 %	307126160
8	NC_014498	AAATC	2	10	9064	9073	60 %	20 %	0 %	20 %	307126160
9	NC_014498	AAGAA	2	10	10779	10788	80 %	0 %	20 %	0 %	307126166
10	NC_014498	TTCGT	2	10	11502	11511	0 %	60 %	20 %	20 %	307126168
11	NC_014498	TACCG	2	10	11991	12000	20 %	20 %	20 %	40 %	307126170
12	NC_014498	TTGTT	2	10	12055	12064	0 %	80 %	20 %	0 %	307126170
13	NC_014498	ATCCA	2	10	14918	14927	40 %	20 %	0 %	40 %	307126175
14	NC_014498	CAAGA	2	10	14949	14958	60 %	0 %	20 %	20 %	307126175
15	NC_014498	AAACA	2	10	20184	20193	80 %	0 %	0 %	20 %	307126179
16	NC_014498	TCAAT	2	10	21811	21820	40 %	40 %	0 %	20 %	307126180
17	NC_014498	TTTTC	2	10	21851	21860	0 %	80 %	0 %	20 %	307126180
18	NC_014498	TAAAT	2	10	22369	22378	60 %	40 %	0 %	0 %	307126180
19	NC_014498	ACTCT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	0 %	40 %	307126180
20	NC_014498	AAACG	2	10	23693	23702	60 %	0 %	20 %	20 %	307126180
21	NC_014498	TTGGT	2	10	23922	23931	0 %	60 %	40 %	0 %	307126180
22	NC_014498	CAATT	2	10	23991	24000	40 %	40 %	0 %	20 %	307126180
23	NC_014498	AGGAA	2	10	25007	25016	60 %	0 %	40 %	0 %	307126183
24	NC_014498	ATTGA	2	10	26425	26434	40 %	40 %	20 %	0 %	307126185
25	NC_014498	ATTCT	2	10	28558	28567	20 %	60 %	0 %	20 %	307126187
26	NC_014498	ATGCT	2	10	29786	29795	20 %	40 %	20 %	20 %	307126187
27	NC_014498	ATGGT	2	10	38201	38210	20 %	40 %	40 %	0 %	307126195
28	NC_014498	TAAGT	2	10	40881	40890	40 %	40 %	20 %	0 %	307126197
29	NC_014498	CCCAT	2	10	41632	41641	20 %	20 %	0 %	60 %	307126197
30	NC_014498	TCCCA	2	10	42306	42315	20 %	20 %	0 %	60 %	307126198
31	NC_014498	TCGTG	2	10	43387	43396	0 %	40 %	40 %	20 %	307126200
32	NC_014498	TAGAT	2	10	45069	45078	40 %	40 %	20 %	0 %	307126204
33	NC_014498	CTTAT	2	10	45577	45586	20 %	60 %	0 %	20 %	307126206
34	NC_014498	AAAGA	2	10	50339	50348	80 %	0 %	20 %	0 %	307126217
35	NC_014498	TAAAT	2	10	51900	51909	60 %	40 %	0 %	0 %	307126221
36	NC_014498	AAGGA	2	10	51955	51964	60 %	0 %	40 %	0 %	307126221
37	NC_014498	GAAAA	2	10	52225	52234	80 %	0 %	20 %	0 %	307126222
38	NC_014498	TCAGC	2	10	52396	52405	20 %	20 %	20 %	40 %	307126222
39	NC_014498	TCAAG	2	10	53053	53062	40 %	20 %	20 %	20 %	307126224
40	NC_014498	AGAAA	2	10	53141	53150	80 %	0 %	20 %	0 %	307126224
41	NC_014498	TATGC	2	10	54274	54283	20 %	40 %	20 %	20 %	307126225
42	NC_014498	TGACT	2	10	55395	55404	20 %	40 %	20 %	20 %	307126225
43	NC_014498	GCTAG	2	10	55709	55718	20 %	20 %	40 %	20 %	307126226
44	NC_014498	GCAAG	2	10	55761	55770	40 %	0 %	40 %	20 %	307126226
45	NC_014498	TGAAT	2	10	56002	56011	40 %	40 %	20 %	0 %	307126226
46	NC_014498	AGTCT	2	10	57356	57365	20 %	40 %	20 %	20 %	307126228
47	NC_014498	GGAAA	2	10	58255	58264	60 %	0 %	40 %	0 %	307126229
48	NC_014498	GGAAT	2	10	58469	58478	40 %	20 %	40 %	0 %	307126229
49	NC_014498	AAACA	2	10	59261	59270	80 %	0 %	0 %	20 %	307126230
50	NC_014498	GTTCT	2	10	59651	59660	0 %	60 %	20 %	20 %	307126231
51	NC_014498	TGGAG	2	10	59697	59706	20 %	20 %	60 %	0 %	307126231
52	NC_014498	AGCGG	2	10	60567	60576	20 %	0 %	60 %	20 %	307126232
53	NC_014498	ATCCA	2	10	61145	61154	40 %	20 %	0 %	40 %	307126234
54	NC_014498	AAAGC	2	10	62216	62225	60 %	0 %	20 %	20 %	307126237
55	NC_014498	GTCTT	2	10	62251	62260	0 %	60 %	20 %	20 %	307126237
56	NC_014498	GGTTT	2	10	64396	64405	0 %	60 %	40 %	0 %	307126240
57	NC_014498	AATGT	2	10	65736	65745	40 %	40 %	20 %	0 %	307126240
58	NC_014498	CCGTT	2	10	66099	66108	0 %	40 %	20 %	40 %	307126241
59	NC_014498	GGTTC	2	10	66390	66399	0 %	40 %	40 %	20 %	307126241
60	NC_014498	TCCAG	2	10	67395	67404	20 %	20 %	20 %	40 %	307126242
61	NC_014498	ATTCA	2	10	71196	71205	40 %	40 %	0 %	20 %	307126242
62	NC_014498	CTCAA	2	10	72952	72961	40 %	20 %	0 %	40 %	307126242
63	NC_014498	TATTT	2	10	81526	81535	20 %	80 %	0 %	0 %	307126255
64	NC_014498	TTATT	2	10	81536	81545	20 %	80 %	0 %	0 %	307126255
65	NC_014498	AGCAG	2	10	85515	85524	40 %	0 %	40 %	20 %	307126259
66	NC_014498	CAGAT	2	10	95013	95022	40 %	20 %	20 %	20 %	307126271
67	NC_014498	TTTAC	2	10	95715	95724	20 %	60 %	0 %	20 %	307126271
68	NC_014498	GTGAC	2	10	99346	99355	20 %	20 %	40 %	20 %	307126274
69	NC_014498	GTGAT	2	10	100336	100345	20 %	40 %	40 %	0 %	307126274
70	NC_014498	TGGCT	2	10	103156	103165	0 %	40 %	40 %	20 %	307126275
71	NC_014498	AAATG	2	10	103762	103771	60 %	20 %	20 %	0 %	307126275
72	NC_014498	AGCTA	2	10	104656	104665	40 %	20 %	20 %	20 %	307126276
73	NC_014498	CCTTG	2	10	107546	107555	0 %	40 %	20 %	40 %	307126279
74	NC_014498	TCAAA	2	10	107740	107749	60 %	20 %	0 %	20 %	307126279
75	NC_014498	AGTGG	2	10	110107	110116	20 %	20 %	60 %	0 %	307126282
76	NC_014498	GGGTG	2	10	110145	110154	0 %	20 %	80 %	0 %	307126282
77	NC_014498	CTATT	2	10	111112	111121	20 %	60 %	0 %	20 %	307126283
78	NC_014498	GAAGC	2	10	111302	111311	40 %	0 %	40 %	20 %	307126283
79	NC_014498	GCTTG	2	10	111757	111766	0 %	40 %	40 %	20 %	307126285
80	NC_014498	GCTTT	2	10	113186	113195	0 %	60 %	20 %	20 %	307126286
81	NC_014498	TCTGG	2	10	113792	113801	0 %	40 %	40 %	20 %	307126286
82	NC_014498	AGCAT	2	10	114746	114755	40 %	20 %	20 %	20 %	307126286
83	NC_014498	TACCA	2	10	115444	115453	40 %	20 %	0 %	40 %	307126286
84	NC_014498	TTCCT	2	10	116461	116470	0 %	60 %	0 %	40 %	307126286
85	NC_014498	TTGGT	2	10	120416	120425	0 %	60 %	40 %	0 %	307126289
86	NC_014498	CTTCA	2	10	121471	121480	20 %	40 %	0 %	40 %	307126290
87	NC_014498	AATCA	2	10	121583	121592	60 %	20 %	0 %	20 %	307126291
88	NC_014498	AGCTC	2	10	123803	123812	20 %	20 %	20 %	40 %	307126293
89	NC_014498	GCTCC	2	10	128072	128081	0 %	20 %	20 %	60 %	307126300
90	NC_014498	GCTGT	2	10	128390	128399	0 %	40 %	40 %	20 %	307126300
91	NC_014498	TCTAT	2	10	129593	129602	20 %	60 %	0 %	20 %	307126302
92	NC_014498	AGAAA	2	10	130518	130527	80 %	0 %	20 %	0 %	307126302
93	NC_014498	GCGGT	2	10	131811	131820	0 %	20 %	60 %	20 %	307126305
94	NC_014498	TGACT	2	10	133565	133574	20 %	40 %	20 %	20 %	307126307
95	NC_014498	AGGGC	2	10	136544	136553	20 %	0 %	60 %	20 %	307126309
96	NC_014498	ATTCT	2	10	139029	139038	20 %	60 %	0 %	20 %	307126313
97	NC_014498	TTACT	2	10	142846	142855	20 %	60 %	0 %	20 %	307126316
98	NC_014498	CAACC	2	10	143556	143565	40 %	0 %	0 %	60 %	307126316
99	NC_014498	TGCTT	2	10	144374	144383	0 %	60 %	20 %	20 %	307126317
100	NC_014498	TGGCT	2	10	144557	144566	0 %	40 %	40 %	20 %	307126317
101	NC_014498	AGATA	2	10	148524	148533	60 %	20 %	20 %	0 %	307126322
102	NC_014498	GTTTG	2	10	148691	148700	0 %	60 %	40 %	0 %	307126322
103	NC_014498	TATTT	2	10	150640	150649	20 %	80 %	0 %	0 %	307126324
104	NC_014498	AAAGC	2	10	153505	153514	60 %	0 %	20 %	20 %	307126327
105	NC_014498	CACAA	2	10	155268	155277	60 %	0 %	0 %	40 %	307126329
106	NC_014498	AGGAT	2	10	157334	157343	40 %	20 %	40 %	0 %	307126331
107	NC_014498	CTTTG	2	10	158643	158652	0 %	60 %	20 %	20 %	307126331
108	NC_014498	TCCTC	2	10	158769	158778	0 %	40 %	0 %	60 %	307126331
109	NC_014498	TCTTT	2	10	161513	161522	0 %	80 %	0 %	20 %	307126335
110	NC_014498	ATTTT	2	10	167975	167984	20 %	80 %	0 %	0 %	307126343
111	NC_014498	TTGGA	2	10	168422	168431	20 %	40 %	40 %	0 %	307126343
112	NC_014498	AACTA	2	10	175887	175896	60 %	20 %	0 %	20 %	307126351
113	NC_014498	CGTGG	2	10	177920	177929	0 %	20 %	60 %	20 %	307126353
114	NC_014498	CCAGG	2	10	178514	178523	20 %	0 %	40 %	40 %	307126353
115	NC_014498	GTGAA	2	10	178922	178931	40 %	20 %	40 %	0 %	307126354
116	NC_014498	TTGGA	2	10	184723	184732	20 %	40 %	40 %	0 %	307126360
117	NC_014498	ATGTT	2	10	195075	195084	20 %	60 %	20 %	0 %	307126371
118	NC_014498	GAAAT	2	10	197805	197814	60 %	20 %	20 %	0 %	307126374
119	NC_014498	TTAGT	2	10	198677	198686	20 %	60 %	20 %	0 %	307126375
120	NC_014498	CTTGC	2	10	199033	199042	0 %	40 %	20 %	40 %	307126375
121	NC_014498	GGCCT	2	10	200032	200041	0 %	20 %	40 %	40 %	307126377
122	NC_014498	CTGTT	2	10	200600	200609	0 %	60 %	20 %	20 %	307126377
123	NC_014498	AGAAA	2	10	202136	202145	80 %	0 %	20 %	0 %	307126380
124	NC_014498	TATAC	2	10	204097	204106	40 %	40 %	0 %	20 %	307126381
125	NC_014498	AGATC	2	10	204402	204411	40 %	20 %	20 %	20 %	307126382
126	NC_014498	TTTGT	2	10	206410	206419	0 %	80 %	20 %	0 %	307126384
127	NC_014498	ACTAT	2	10	210416	210425	40 %	40 %	0 %	20 %	307126387
128	NC_014498	TTGAG	2	10	212996	213005	20 %	40 %	40 %	0 %	307126390
129	NC_014498	ATGGA	2	10	215246	215255	40 %	20 %	40 %	0 %	307126394
130	NC_014498	AAATT	2	10	216143	216152	60 %	40 %	0 %	0 %	307126396
131	NC_014498	TTTGA	2	10	218034	218043	20 %	60 %	20 %	0 %	307126398
132	NC_014498	TTTAA	2	10	218133	218142	40 %	60 %	0 %	0 %	307126398
133	NC_014498	GAAAA	2	10	218299	218308	80 %	0 %	20 %	0 %	307126398
134	NC_014498	ATATT	2	10	218747	218756	40 %	60 %	0 %	0 %	307126398
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