MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Zinderia insecticola CARI chromosome

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014497	TAT	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014497	ATT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014497	AAT	3	9	252	260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014497	ATA	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014497	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014497	TAC	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014497	ATA	2	6	5475	5480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014497	AAT	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014497	GCA	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014497	ATA	2	6	5766	5771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014497	TGA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014497	CAG	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014497	ATT	2	6	5863	5868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014497	TTA	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014497	CTT	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014497	AAT	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014497	CTA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014497	TTA	2	6	6133	6138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014497	GAT	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014497	TGC	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014497	GTC	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014497	TTA	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014497	TAA	2	6	6435	6440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014497	TAA	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014497	GGA	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014497	ATT	2	6	6734	6739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014497	TTA	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014497	ATA	3	9	6909	6917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014497	ATG	2	6	6951	6956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014497	ATT	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014497	TAG	2	6	7165	7170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014497	ATA	2	6	7215	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014497	AAT	2	6	7222	7227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014497	TTA	2	6	7282	7287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014497	TAA	2	6	7363	7368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014497	ATA	2	6	7474	7479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014497	ATA	2	6	7643	7648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014497	GGA	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014497	AAC	2	6	7910	7915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014497	AGG	2	6	7983	7988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014497	ATT	2	6	8335	8340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014497	GAA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014497	TAT	2	6	8405	8410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014497	ATT	2	6	8416	8421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014497	AAT	2	6	8474	8479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014497	TCT	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014497	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014497	TTA	2	6	8631	8636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014497	AAT	2	6	8642	8647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014497	TAA	2	6	8698	8703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014497	ATA	2	6	8774	8779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014497	CGG	2	6	8815	8820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014497	TGA	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014497	ACT	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014497	AAT	2	6	9015	9020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014497	ACC	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014497	ATG	2	6	9145	9150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014497	TCC	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014497	GGA	2	6	9189	9194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014497	GGT	2	6	9309	9314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014497	TCA	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014497	CGT	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014497	GCT	2	6	9559	9564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014497	GTT	2	6	9608	9613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014497	AGA	2	6	9645	9650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014497	ATA	2	6	9829	9834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014497	GAT	2	6	9922	9927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014497	TTC	2	6	11837	11842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014497	TTC	2	6	11847	11852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014497	GCT	2	6	11906	11911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014497	AAC	2	6	11926	11931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014497	TAA	3	9	11964	11972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014497	TTA	2	6	11999	12004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014497	ATA	2	6	12022	12027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014497	ATT	2	6	12029	12034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014497	TAA	3	9	12047	12055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014497	TAA	2	6	12058	12063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014497	ATT	2	6	12075	12080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014497	TAA	2	6	12096	12101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014497	TAA	2	6	12183	12188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014497	TAA	2	6	12194	12199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014497	TAA	2	6	12219	12224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014497	ATA	2	6	12243	12248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014497	AAT	2	6	12249	12254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014497	TAT	2	6	12258	12263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014497	ATT	2	6	12304	12309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014497	ATA	2	6	12346	12351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014497	TAA	2	6	12373	12378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014497	ATA	4	12	12397	12408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014497	TAT	2	6	12414	12419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014497	ATT	2	6	12434	12439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014497	TAA	2	6	12455	12460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014497	TAA	2	6	12529	12534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014497	TAA	2	6	12540	12545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014497	TAA	2	6	12564	12569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014497	ATA	2	6	12584	12589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014497	AAT	2	6	12590	12595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014497	TAT	2	6	12598	12603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014497	TTA	2	6	12668	12673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014497	ATA	2	6	12690	12695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014497	TAA	2	6	12717	12722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014497	ATA	2	6	12742	12747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014497	AAT	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014497	TAT	2	6	12757	12762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014497	ATT	2	6	12777	12782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014497	TAA	2	6	12798	12803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014497	TAA	2	6	12892	12897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014497	ATT	2	6	13064	13069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014497	AAT	2	6	13079	13084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014497	TAA	2	6	13120	13125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014497	ATA	3	9	13149	13157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014497	CTA	2	6	13173	13178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014497	AGG	2	6	13216	13221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014497	TAT	2	6	13249	13254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014497	AAT	2	6	13289	13294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014497	TTA	2	6	13340	13345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014497	AGC	2	6	13393	13398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014497	ATA	2	6	13425	13430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014497	TAG	2	6	13461	13466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014497	TAA	3	9	13485	13493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014497	AGG	2	6	13546	13551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014497	TTA	2	6	13664	13669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014497	TTA	2	6	13811	13816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014497	ATT	2	6	13983	13988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014497	ATT	2	6	13994	13999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014497	ATT	2	6	14064	14069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014497	ATT	2	6	14078	14083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014497	ATT	2	6	14183	14188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014497	TTA	2	6	14243	14248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014497	ATT	2	6	14279	14284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014497	ATA	2	6	14285	14290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014497	ATT	2	6	14294	14299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014497	ATT	2	6	14327	14332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014497	ATA	2	6	14404	14409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014497	AAT	2	6	14452	14457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014497	TAA	2	6	14508	14513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014497	TAT	2	6	14546	14551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014497	TAG	2	6	14555	14560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014497	TAT	2	6	14589	14594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014497	GCT	2	6	14620	14625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014497	TTA	2	6	14656	14661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014497	AAT	2	6	14701	14706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014497	TTA	2	6	14776	14781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014497	ATT	2	6	14886	14891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.