MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
2	NC_014495	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307069351
3	NC_014495	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307069351
4	NC_014495	ACAAAA	2	12	6688	6699	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307069359
5	NC_014495	AAAGAA	2	12	10263	10274	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307069364
6	NC_014495	TTTTTC	2	12	15847	15858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307069372
7	NC_014495	TGTCGT	2	12	22413	22424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307069378
8	NC_014495	TTTAAT	2	12	28567	28578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069383
9	NC_014495	AAGATG	2	12	30901	30912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307069385
10	NC_014495	TGCACT	2	12	31576	31587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307069386
11	NC_014495	TCAGAG	2	12	34175	34186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307069386
12	NC_014495	CAAATT	2	12	34789	34800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307069387
13	NC_014495	TGAAAG	2	12	37597	37608	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307069389
14	NC_014495	GAAAAA	2	12	39555	39566	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307069393
15	NC_014495	CTGACT	2	12	41166	41177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307069396
16	NC_014495	AAAATC	2	12	45808	45819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307069403
17	NC_014495	AATTTC	2	12	46213	46224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307069403
18	NC_014495	TAGAAA	2	12	47197	47208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307069404
19	NC_014495	GCGTCA	2	12	47937	47948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307069405
20	NC_014495	ATCGAG	2	12	54370	54381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307069410
21	NC_014495	AATAAA	2	12	56825	56836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307069413

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.