MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	307069351
2	NC_014495	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	307069351
3	NC_014495	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	307069351
4	NC_014495	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	307069355
5	NC_014495	CCACT	2	10	6602	6611	20 %	20 %	0 %	60 %	307069359
6	NC_014495	TTATC	2	10	6863	6872	20 %	60 %	0 %	20 %	307069360
7	NC_014495	GTATT	2	10	8784	8793	20 %	60 %	20 %	0 %	307069363
8	NC_014495	GAAAA	2	10	9044	9053	80 %	0 %	20 %	0 %	307069363
9	NC_014495	GATCG	2	10	12494	12503	20 %	20 %	40 %	20 %	307069368
10	NC_014495	CAAGA	2	10	13779	13788	60 %	0 %	20 %	20 %	307069369
11	NC_014495	GGGTG	2	10	14219	14228	0 %	20 %	80 %	0 %	307069369
12	NC_014495	TGTTC	2	10	15145	15154	0 %	60 %	20 %	20 %	307069371
13	NC_014495	TTTCT	2	10	19118	19127	0 %	80 %	0 %	20 %	307069376
14	NC_014495	TTTAA	2	10	19245	19254	40 %	60 %	0 %	0 %	307069376
15	NC_014495	AGACA	2	10	21765	21774	60 %	0 %	20 %	20 %	307069378
16	NC_014495	GAAAA	2	10	24974	24983	80 %	0 %	20 %	0 %	307069380
17	NC_014495	ATTTT	2	10	25923	25932	20 %	80 %	0 %	0 %	307069381
18	NC_014495	ATTCA	2	10	26456	26465	40 %	40 %	0 %	20 %	307069381
19	NC_014495	GATTG	2	10	28346	28355	20 %	40 %	40 %	0 %	307069383
20	NC_014495	GTACA	2	10	28887	28896	40 %	20 %	20 %	20 %	307069383
21	NC_014495	ATGAT	2	10	30322	30331	40 %	40 %	20 %	0 %	307069385
22	NC_014495	GAAAG	2	10	30461	30470	60 %	0 %	40 %	0 %	307069385
23	NC_014495	GAAAA	2	10	30670	30679	80 %	0 %	20 %	0 %	307069385
24	NC_014495	AAGAA	2	10	31127	31136	80 %	0 %	20 %	0 %	307069385
25	NC_014495	CAAAT	2	10	31411	31420	60 %	20 %	0 %	20 %	307069386
26	NC_014495	TTTTC	2	10	32493	32502	0 %	80 %	0 %	20 %	307069386
27	NC_014495	GACTG	2	10	35178	35187	20 %	20 %	40 %	20 %	307069388
28	NC_014495	TCTTT	2	10	38476	38485	0 %	80 %	0 %	20 %	307069391
29	NC_014495	GGAAG	2	10	39983	39992	40 %	0 %	60 %	0 %	307069394
30	NC_014495	TGAAA	2	10	45399	45408	60 %	20 %	20 %	0 %	307069403
31	NC_014495	ACAAA	2	10	46233	46242	80 %	0 %	0 %	20 %	307069403
32	NC_014495	TCTCT	2	10	48688	48697	0 %	60 %	0 %	40 %	307069406
33	NC_014495	AGCTT	2	10	51627	51636	20 %	40 %	20 %	20 %	307069407
34	NC_014495	TCTAT	2	10	55038	55047	20 %	60 %	0 %	20 %	307069411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.