MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	307069351
2	NC_014495	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
3	NC_014495	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
4	NC_014495	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	307069351
5	NC_014495	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014495	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	307069353
7	NC_014495	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	307069353
8	NC_014495	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	307069354
9	NC_014495	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	307069354
10	NC_014495	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
11	NC_014495	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	307069355
12	NC_014495	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	307069355
13	NC_014495	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	307069355
14	NC_014495	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
15	NC_014495	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
16	NC_014495	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	307069356
17	NC_014495	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	307069356
18	NC_014495	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	307069356
19	NC_014495	TTTC	2	8	5441	5448	0 %	75 %	0 %	25 %	307069357
20	NC_014495	TCAT	2	8	5785	5792	25 %	50 %	0 %	25 %	307069357
21	NC_014495	CAAG	2	8	6064	6071	50 %	0 %	25 %	25 %	307069358
22	NC_014495	ATTA	2	8	6082	6089	50 %	50 %	0 %	0 %	307069358
23	NC_014495	ATAA	2	8	6097	6104	75 %	25 %	0 %	0 %	307069358
24	NC_014495	AGAA	2	8	6351	6358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014495	AAGA	2	8	6808	6815	75 %	0 %	25 %	0 %	307069360
26	NC_014495	CAAA	3	12	6829	6840	75 %	0 %	0 %	25 %	307069360
27	NC_014495	AAGT	2	8	7079	7086	50 %	25 %	25 %	0 %	307069360
28	NC_014495	TAAA	2	8	7677	7684	75 %	25 %	0 %	0 %	307069360
29	NC_014495	GTAA	2	8	7769	7776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014495	AAGA	2	8	8389	8396	75 %	0 %	25 %	0 %	307069362
31	NC_014495	CAAT	2	8	8423	8430	50 %	25 %	0 %	25 %	307069362
32	NC_014495	AAGA	2	8	10136	10143	75 %	0 %	25 %	0 %	307069364
33	NC_014495	TCGC	2	8	10600	10607	0 %	25 %	25 %	50 %	307069365
34	NC_014495	GAAA	2	8	10647	10654	75 %	0 %	25 %	0 %	307069365
35	NC_014495	ATCC	2	8	11005	11012	25 %	25 %	0 %	50 %	307069365
36	NC_014495	AAGT	2	8	12115	12122	50 %	25 %	25 %	0 %	307069367
37	NC_014495	CTCC	2	8	12292	12299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_014495	TTTA	2	8	12300	12307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014495	TTAG	2	8	12521	12528	25 %	50 %	25 %	0 %	307069368
40	NC_014495	CAAG	2	8	12593	12600	50 %	0 %	25 %	25 %	307069368
41	NC_014495	GAAA	2	8	13697	13704	75 %	0 %	25 %	0 %	307069369
42	NC_014495	GAAA	2	8	13817	13824	75 %	0 %	25 %	0 %	307069369
43	NC_014495	ACCG	2	8	13829	13836	25 %	0 %	25 %	50 %	307069369
44	NC_014495	ATTT	2	8	13989	13996	25 %	75 %	0 %	0 %	307069369
45	NC_014495	ATGA	2	8	14489	14496	50 %	25 %	25 %	0 %	307069370
46	NC_014495	GAAA	2	8	14833	14840	75 %	0 %	25 %	0 %	307069370
47	NC_014495	TGTT	2	8	15409	15416	0 %	75 %	25 %	0 %	307069371
48	NC_014495	TTTC	2	8	15723	15730	0 %	75 %	0 %	25 %	307069372
49	NC_014495	TAAA	2	8	16187	16194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014495	AACC	2	8	17852	17859	50 %	0 %	0 %	50 %	307069374
51	NC_014495	ATGA	2	8	18027	18034	50 %	25 %	25 %	0 %	307069375
52	NC_014495	CCAA	2	8	18115	18122	50 %	0 %	0 %	50 %	307069375
53	NC_014495	ACAA	2	8	19137	19144	75 %	0 %	0 %	25 %	307069376
54	NC_014495	CTTT	2	8	19281	19288	0 %	75 %	0 %	25 %	307069376
55	NC_014495	AAGC	2	8	19663	19670	50 %	0 %	25 %	25 %	307069377
56	NC_014495	ATGG	2	8	19768	19775	25 %	25 %	50 %	0 %	307069377
57	NC_014495	CTAT	2	8	19880	19887	25 %	50 %	0 %	25 %	307069377
58	NC_014495	TGAT	2	8	19940	19947	25 %	50 %	25 %	0 %	307069377
59	NC_014495	ACAG	2	8	20193	20200	50 %	0 %	25 %	25 %	307069377
60	NC_014495	ATTT	2	8	20398	20405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014495	GTAA	2	8	20457	20464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014495	TTTG	2	8	20865	20872	0 %	75 %	25 %	0 %	307069378
63	NC_014495	GAAA	2	8	21186	21193	75 %	0 %	25 %	0 %	307069378
64	NC_014495	ATCG	2	8	21297	21304	25 %	25 %	25 %	25 %	307069378
65	NC_014495	AGAA	2	8	22154	22161	75 %	0 %	25 %	0 %	307069378
66	NC_014495	GAAA	2	8	22710	22717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014495	ATTT	2	8	22961	22968	25 %	75 %	0 %	0 %	307069379
68	NC_014495	TTTC	2	8	23175	23182	0 %	75 %	0 %	25 %	307069379
69	NC_014495	AATA	2	8	24343	24350	75 %	25 %	0 %	0 %	307069380
70	NC_014495	TAGC	2	8	24408	24415	25 %	25 %	25 %	25 %	307069380
71	NC_014495	TCAT	2	8	24443	24450	25 %	50 %	0 %	25 %	307069380
72	NC_014495	CTTC	2	8	24623	24630	0 %	50 %	0 %	50 %	307069380
73	NC_014495	ACTT	2	8	24868	24875	25 %	50 %	0 %	25 %	307069380
74	NC_014495	AATC	2	8	25188	25195	50 %	25 %	0 %	25 %	307069380
75	NC_014495	TAAT	2	8	26119	26126	50 %	50 %	0 %	0 %	307069381
76	NC_014495	TTTC	2	8	26254	26261	0 %	75 %	0 %	25 %	307069381
77	NC_014495	CATA	2	8	26383	26390	50 %	25 %	0 %	25 %	307069381
78	NC_014495	TAAA	2	8	26546	26553	75 %	25 %	0 %	0 %	307069381
79	NC_014495	CCGG	2	8	27386	27393	0 %	0 %	50 %	50 %	307069382
80	NC_014495	TTGA	2	8	27576	27583	25 %	50 %	25 %	0 %	307069382
81	NC_014495	CCTA	2	8	27609	27616	25 %	25 %	0 %	50 %	307069382
82	NC_014495	AATC	2	8	27662	27669	50 %	25 %	0 %	25 %	307069382
83	NC_014495	ATTT	2	8	27830	27837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014495	GATA	2	8	27869	27876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014495	TGAT	2	8	28677	28684	25 %	50 %	25 %	0 %	307069383
86	NC_014495	AGTA	2	8	29029	29036	50 %	25 %	25 %	0 %	307069383
87	NC_014495	AAAG	2	8	29648	29655	75 %	0 %	25 %	0 %	307069383
88	NC_014495	AAAG	2	8	29795	29802	75 %	0 %	25 %	0 %	307069383
89	NC_014495	GAAA	2	8	30299	30306	75 %	0 %	25 %	0 %	307069385
90	NC_014495	GAAA	2	8	30351	30358	75 %	0 %	25 %	0 %	307069385
91	NC_014495	TGGA	2	8	30637	30644	25 %	25 %	50 %	0 %	307069385
92	NC_014495	AATT	2	8	31106	31113	50 %	50 %	0 %	0 %	307069385
93	NC_014495	AAGC	2	8	32101	32108	50 %	0 %	25 %	25 %	307069386
94	NC_014495	ATTG	2	8	32179	32186	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
95	NC_014495	ATTC	2	8	32458	32465	25 %	50 %	0 %	25 %	307069386
96	NC_014495	AGTG	2	8	32776	32783	25 %	25 %	50 %	0 %	307069386
97	NC_014495	CTTC	2	8	32840	32847	0 %	50 %	0 %	50 %	307069386
98	NC_014495	ATTT	2	8	33022	33029	25 %	75 %	0 %	0 %	307069386
99	NC_014495	ATCA	2	8	33274	33281	50 %	25 %	0 %	25 %	307069386
100	NC_014495	GATC	2	8	33405	33412	25 %	25 %	25 %	25 %	307069386
101	NC_014495	ATTG	2	8	33553	33560	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
102	NC_014495	ATTG	2	8	33909	33916	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
103	NC_014495	TGGA	2	8	34067	34074	25 %	25 %	50 %	0 %	307069386
104	NC_014495	GTTG	2	8	34155	34162	0 %	50 %	50 %	0 %	307069386
105	NC_014495	AGAA	2	8	34231	34238	75 %	0 %	25 %	0 %	307069386
106	NC_014495	AGTT	2	8	34283	34290	25 %	50 %	25 %	0 %	307069387
107	NC_014495	TTCC	2	8	34292	34299	0 %	50 %	0 %	50 %	307069387
108	NC_014495	ATTG	2	8	34400	34407	25 %	50 %	25 %	0 %	307069387
109	NC_014495	TCAA	2	8	34616	34623	50 %	25 %	0 %	25 %	307069387
110	NC_014495	ACTC	2	8	34813	34820	25 %	25 %	0 %	50 %	307069387
111	NC_014495	TCTG	2	8	35229	35236	0 %	50 %	25 %	25 %	307069388
112	NC_014495	AGAA	2	8	35680	35687	75 %	0 %	25 %	0 %	307069389
113	NC_014495	TATT	2	8	35830	35837	25 %	75 %	0 %	0 %	307069389
114	NC_014495	AAGG	2	8	35871	35878	50 %	0 %	50 %	0 %	307069389
115	NC_014495	GATG	2	8	36173	36180	25 %	25 %	50 %	0 %	307069389
116	NC_014495	TCAA	2	8	36208	36215	50 %	25 %	0 %	25 %	307069389
117	NC_014495	GCCA	2	8	36428	36435	25 %	0 %	25 %	50 %	307069389
118	NC_014495	CATC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	0 %	50 %	307069389
119	NC_014495	AGTG	2	8	36992	36999	25 %	25 %	50 %	0 %	307069389
120	NC_014495	GCAA	2	8	37172	37179	50 %	0 %	25 %	25 %	307069389
121	NC_014495	GGTG	2	8	37190	37197	0 %	25 %	75 %	0 %	307069389
122	NC_014495	ATTA	2	8	37609	37616	50 %	50 %	0 %	0 %	307069389
123	NC_014495	GTTG	2	8	37809	37816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014495	ATCG	2	8	37917	37924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014495	GATT	2	8	38580	38587	25 %	50 %	25 %	0 %	307069391
126	NC_014495	CTTG	2	8	38619	38626	0 %	50 %	25 %	25 %	307069391
127	NC_014495	TAAT	2	8	38795	38802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014495	AAAC	2	8	38877	38884	75 %	0 %	0 %	25 %	307069392
129	NC_014495	GAAT	2	8	39424	39431	50 %	25 %	25 %	0 %	307069393
130	NC_014495	TTTG	2	8	39622	39629	0 %	75 %	25 %	0 %	307069393
131	NC_014495	GAAA	2	8	39780	39787	75 %	0 %	25 %	0 %	307069393
132	NC_014495	ATTA	2	8	39806	39813	50 %	50 %	0 %	0 %	307069393
133	NC_014495	ATTT	2	8	39866	39873	25 %	75 %	0 %	0 %	307069394
134	NC_014495	AAAG	2	8	39891	39898	75 %	0 %	25 %	0 %	307069394
135	NC_014495	CTTT	2	8	40511	40518	0 %	75 %	0 %	25 %	307069395
136	NC_014495	CTTG	2	8	40545	40552	0 %	50 %	25 %	25 %	307069395
137	NC_014495	ACAT	2	8	40700	40707	50 %	25 %	0 %	25 %	307069395
138	NC_014495	GAAT	2	8	41517	41524	50 %	25 %	25 %	0 %	307069397
139	NC_014495	GAAA	2	8	42606	42613	75 %	0 %	25 %	0 %	307069399
140	NC_014495	AAAT	2	8	42864	42871	75 %	25 %	0 %	0 %	307069399
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142	NC_014495	ATTT	2	8	43049	43056	25 %	75 %	0 %	0 %	307069399
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.