MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066637
2	NC_014494	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066641
3	NC_014494	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307066642
4	NC_014494	TGCTTA	2	12	7714	7725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307066642
5	NC_014494	GCTAAC	2	12	7955	7966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307066642
6	NC_014494	TTGATT	2	12	8889	8900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307066644
7	NC_014494	TAAGGA	2	12	16897	16908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014494	GAAGTG	2	12	19985	19996	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014494	ACTAAT	2	12	20015	20026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014494	CATCTC	2	12	20901	20912	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014494	AGTTGA	2	12	21020	21031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066652
12	NC_014494	TTCTTG	2	12	24428	24439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307066655
13	NC_014494	ACTTTT	2	12	24497	24508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307066655
14	NC_014494	CTTTAT	2	12	27381	27392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307066661
15	NC_014494	TTTTTA	2	12	27851	27862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014494	ATGATA	2	12	29391	29402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307066665
17	NC_014494	GAAAGT	2	12	33134	33145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014494	CAATAA	2	12	33640	33651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307066675
19	NC_014494	TAAATT	2	12	35528	35539	50 %	50 %	0 %	0 %	307066679
20	NC_014494	CAATGA	2	12	35938	35949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307066680
21	NC_014494	TTCATG	2	12	37474	37485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307066681
22	NC_014494	GAAATT	2	12	42720	42731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307066689
23	NC_014494	GCCAAG	2	12	48213	48224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066694
24	NC_014494	ATTTGG	2	12	50376	50387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307066694
25	NC_014494	ATTTGG	2	12	52026	52037	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307066694
26	NC_014494	CATTTA	2	12	52786	52797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307066694
27	NC_014494	AGGCTA	2	12	53767	53778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307066694
28	NC_014494	AGGTTG	2	12	54490	54501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307066694
29	NC_014494	CGGTAG	2	12	55832	55843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307066694
30	NC_014494	ACTGGT	2	12	58251	58262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066699
31	NC_014494	CAGGCT	2	12	58564	58575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014494	AGGTTG	2	12	61149	61160	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307066705
33	NC_014494	TTGTTT	2	12	63377	63388	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	307066708
34	NC_014494	CGATTG	2	12	67396	67407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066713
35	NC_014494	TTCCTT	2	12	70541	70552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066715
36	NC_014494	TAAAAA	2	12	74807	74818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014494	AGGATA	2	12	76085	76096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066721
38	NC_014494	TCAATC	2	12	77414	77425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066721
39	NC_014494	TTCGGA	2	12	84452	84463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066725
40	NC_014494	TTACTG	2	12	87652	87663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307066728
41	NC_014494	AAAAAT	2	12	90812	90823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014494	GTTTCT	2	12	97953	97964	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307066736
43	NC_014494	TTCTAT	2	12	98392	98403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014494	TTCCTT	2	12	99033	99044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066737
45	NC_014494	TTGCAG	2	12	103186	103197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066741
46	NC_014494	TCCCAT	2	12	104245	104256	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014494	TCTTGC	2	12	104765	104776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307066743
48	NC_014494	GACTTG	2	12	105169	105180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066743
49	NC_014494	AAAATG	2	12	106847	106858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307066745
50	NC_014494	AATGGT	2	12	107904	107915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066746
51	NC_014494	ATTCTG	2	12	112901	112912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307066747
52	NC_014494	ACATCA	2	12	121508	121519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307066756
53	NC_014494	GCTTGC	2	12	122244	122255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066756
54	NC_014494	TACAGG	2	12	124469	124480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307066759
55	NC_014494	AAAAAC	2	12	124570	124581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307066759
56	NC_014494	TAAAAA	2	12	128383	128394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014494	TTTTGA	2	12	131596	131607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307066768
58	NC_014494	AAGCAG	2	12	132124	132135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014494	AAGGAA	2	12	136986	136997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066774
60	NC_014494	ACAATA	2	12	137650	137661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307066774
61	NC_014494	GCTTAT	2	12	143350	143361	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014494	TTATCT	2	12	156215	156226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307066795
63	NC_014494	TAACAA	2	12	157979	157990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	307066797
64	NC_014494	ATAAAA	2	12	160675	160686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307066802
65	NC_014494	AAGCAA	2	12	161245	161256	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307066803
66	NC_014494	TTGAAA	2	12	161719	161730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307066803
67	NC_014494	CCAGCT	2	12	162486	162497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307066803
68	NC_014494	CCAGCT	2	12	162519	162530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307066803
69	NC_014494	TTTGCT	2	12	169821	169832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307066809
70	NC_014494	ATAAAA	2	12	170210	170221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307066810
71	NC_014494	TCAGGG	2	12	171778	171789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307066814
72	NC_014494	ATAAAT	2	12	175121	175132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066818
73	NC_014494	TTCAAT	2	12	181082	181093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307066828
74	NC_014494	GAAGCA	2	12	183942	183953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307066833
75	NC_014494	TCAGGT	2	12	197659	197670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066849
76	NC_014494	ATTGAG	2	12	204289	204300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066856
77	NC_014494	TTCGGA	2	12	204419	204430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066856
78	NC_014494	AACAAG	2	12	208042	208053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307066858
79	NC_014494	GGATTG	2	12	209771	209782	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307066860
80	NC_014494	GACTGA	2	12	211071	211082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307066863
81	NC_014494	TGCACT	2	12	213555	213566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307066866
82	NC_014494	CAATAT	2	12	215035	215046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307066867
83	NC_014494	TGTTCG	2	12	215826	215837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307066868
84	NC_014494	ACTTGG	2	12	216623	216634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066868
85	NC_014494	ACCACG	2	12	221160	221171	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307066874
86	NC_014494	GCAGAC	2	12	221971	221982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066875
87	NC_014494	TTTTAC	2	12	223536	223547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014494	ACAAGA	2	12	229433	229444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307066881
89	NC_014494	CAGGAA	2	12	229637	229648	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307066882
90	NC_014494	TAAAGG	2	12	232326	232337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066886
91	NC_014494	GCAATC	2	12	234914	234925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307066891
92	NC_014494	ACATCA	2	12	235461	235472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307066893
93	NC_014494	TAAAGG	2	12	239713	239724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066902
94	NC_014494	AAATTA	2	12	240752	240763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066905
95	NC_014494	ACTTGG	2	12	240819	240830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066905
96	NC_014494	TTGAAG	2	12	243760	243771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066909
97	NC_014494	GTAAAG	2	12	244443	244454	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307066911
98	NC_014494	AAACTC	2	12	245818	245829	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307066913
99	NC_014494	AGATAA	2	12	249920	249931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307066918
100	NC_014494	ACGATA	2	12	250731	250742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014494	CATAAT	2	12	251986	251997	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307066921
102	NC_014494	TATCTG	2	12	257259	257270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307066928
103	NC_014494	AAAGCA	2	12	258977	258988	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307066929
104	NC_014494	ACAATT	2	12	259379	259390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	307066929
105	NC_014494	TGAAAT	2	12	265390	265401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	307066932
106	NC_014494	TCTTAA	2	12	267546	267557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014494	TGTCAA	2	12	274163	274174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307066942
108	NC_014494	GATGGT	2	12	274923	274934	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307066943
109	NC_014494	TGCCTT	2	12	276574	276585	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307066944
110	NC_014494	GCTATG	2	12	276683	276694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066944
111	NC_014494	GTTGCT	2	12	281192	281203	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	307066946
112	NC_014494	GGTTGC	2	12	284551	284562	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014494	GCAAGA	2	12	285083	285094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307066949
114	NC_014494	ATTCGA	2	12	286481	286492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307066949
115	NC_014494	GTCAGT	2	12	289886	289897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066950
116	NC_014494	ATTTTT	2	12	299274	299285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014494	CGATAC	2	12	300221	300232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307066961
118	NC_014494	TCTTTT	2	12	303993	304004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014494	TTTTGG	2	12	304515	304526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066965
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122	NC_014494	AAAATG	2	12	319530	319541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307066979
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132	NC_014494	CAACCT	2	12	339682	339693	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307067000
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219	NC_014494	GCAATT	2	12	529408	529419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307067195
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227	NC_014494	CTTTGC	2	12	542710	542721	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307067206
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230	NC_014494	AGGCTC	2	12	550857	550868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307067212
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233	NC_014494	CTTGAC	2	12	559857	559868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307067221
234	NC_014494	GTTAAC	2	12	559980	559991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307067221
235	NC_014494	TAAAGA	2	12	562554	562565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307067223
236	NC_014494	AGTGAA	2	12	568151	568162	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307067228
237	NC_014494	TGATTG	2	12	574784	574795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307067233
238	NC_014494	TACAGA	2	12	577498	577509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	307067237
239	NC_014494	ATTGTC	2	12	581607	581618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307067241
240	NC_014494	AAGGAA	2	12	584061	584072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307067244
241	NC_014494	CAGCTA	2	12	585738	585749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307067246
242	NC_014494	AGTTGA	2	12	586822	586833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067248
243	NC_014494	CTGTAA	2	12	588101	588112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307067249
244	NC_014494	AAAGTT	2	12	593129	593140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_014494	TAAAGA	2	12	593587	593598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_014494	CAAAAA	2	12	595876	595887	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	307067259
247	NC_014494	AGGAGA	2	12	597886	597897	50 %	0 %	50 %	0 %	307067259
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249	NC_014494	TCAAGT	2	12	600586	600597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307067260
250	NC_014494	CTAATT	2	12	601056	601067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_014494	TGCAGA	2	12	601898	601909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307067262
252	NC_014494	ACTGTT	2	12	606319	606330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307067264
253	NC_014494	TATTCG	2	12	607743	607754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307067264
254	NC_014494	CAAAGC	2	12	608790	608801	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307067264
255	NC_014494	ACTTCT	2	12	609774	609785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_014494	AGATTG	2	12	613597	613608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307067271
257	NC_014494	GAGATG	2	12	613929	613940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307067271
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259	NC_014494	AAGGAA	2	12	622964	622975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307067280
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261	NC_014494	TTAATA	2	12	626344	626355	50 %	50 %	0 %	0 %	307067282
262	NC_014494	GTATGG	2	12	628442	628453	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307067282
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265	NC_014494	GGAAAG	2	12	641512	641523	50 %	0 %	50 %	0 %	307067296
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276	NC_014494	ATGCAG	2	12	689855	689866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307067350
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279	NC_014494	TTGGTA	2	12	693533	693544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	307067354
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282	NC_014494	GATTGC	2	12	697733	697744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307067359
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287	NC_014494	GAGCCT	2	12	706694	706705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307067367
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327	NC_014494	TCACTT	2	12	788417	788428	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307067459
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345	NC_014494	TGGAGT	2	12	827154	827165	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307067501
346	NC_014494	TACCAA	2	12	828538	828549	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307067504
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349	NC_014494	AAAAAG	2	12	832514	832525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	307067506
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444	NC_014494	TCCATA	2	12	1006998	1007009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067686
445	NC_014494	CTCATC	2	12	1008122	1008133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307067686
446	NC_014494	ATTACG	2	12	1008311	1008322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307067686
447	NC_014494	TTTTTC	2	12	1009370	1009381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	307067686
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449	NC_014494	ACTTTC	2	12	1011430	1011441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307067687
450	NC_014494	GATAGA	2	12	1014058	1014069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307067688
451	NC_014494	CACCTT	2	12	1015717	1015728	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307067690
452	NC_014494	CCTGCT	2	12	1017504	1017515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307067692
453	NC_014494	CTCCAG	2	12	1025010	1025021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307067699
454	NC_014494	AATAAA	2	12	1026484	1026495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014494	TTTCAA	2	12	1026830	1026841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
456	NC_014494	GATTTT	2	12	1028863	1028874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307067700
457	NC_014494	CCAAGA	2	12	1034820	1034831	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307067704
458	NC_014494	TCAACA	2	12	1038338	1038349	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307067708
459	NC_014494	CAACTT	2	12	1040905	1040916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067713
460	NC_014494	TCAACT	2	12	1043116	1043127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307067716
461	NC_014494	GAGATG	2	12	1043235	1043246	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307067716
462	NC_014494	GAATTT	2	12	1047274	1047285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	307067721
463	NC_014494	TCATGG	2	12	1049580	1049591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307067724
464	NC_014494	CATTTT	2	12	1058740	1058751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	307067734
465	NC_014494	CTGTAT	2	12	1068050	1068061	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307067746
466	NC_014494	TGCGCT	2	12	1076205	1076216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307067752
467	NC_014494	AAGACA	2	12	1077502	1077513	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307067753
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