MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014494	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014494	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014494	GGTG	2	8	14714	14721	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014494	TGAG	3	12	14736	14747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014494	AAAC	2	8	14802	14809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014494	TGAG	2	8	15331	15338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014494	GCTT	2	8	15429	15436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014494	CCTG	2	8	15477	15484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014494	GTGA	2	8	15757	15764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014494	AGCG	2	8	15928	15935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014494	AGCC	2	8	16809	16816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014494	GTAA	2	8	17231	17238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014494	GCGA	2	8	17387	17394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014494	ATTC	2	8	18253	18260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014494	CTAA	2	8	18607	18614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014494	GTCT	2	8	18632	18639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014494	TAGG	2	8	19263	19270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014494	AAAT	2	8	34989	34996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014494	ATTG	2	8	58883	58890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014494	AATA	2	8	60017	60024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014494	AGAA	2	8	62986	62993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014494	TTGA	2	8	63869	63876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014494	TTCT	2	8	65346	65353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014494	TGAT	2	8	66100	66107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014494	AATT	2	8	66438	66445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014494	CTAT	2	8	66542	66549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014494	GAAT	2	8	74582	74589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014494	TGCT	2	8	74878	74885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014494	ATTT	2	8	75409	75416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014494	GGGA	2	8	75526	75533	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014494	GAAG	2	8	75549	75556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014494	TGAC	2	8	75663	75670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014494	TATT	2	8	79383	79390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014494	ATAG	2	8	83970	83977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014494	TTTC	2	8	89277	89284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014494	TAAT	2	8	99521	99528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014494	GTTT	2	8	105525	105532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014494	AAGA	2	8	106726	106733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014494	CTTA	2	8	107957	107964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014494	AAGA	2	8	107983	107990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014494	ACTT	2	8	108147	108154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014494	TTGA	2	8	114047	114054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014494	AAAT	2	8	114163	114170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014494	GAAG	2	8	119582	119589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014494	AAAG	2	8	120618	120625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014494	AAAT	2	8	122315	122322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014494	CTTT	2	8	122376	122383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014494	AATT	2	8	125416	125423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014494	TTTG	2	8	126267	126274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014494	ATTC	2	8	129906	129913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014494	AAAT	2	8	130064	130071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014494	ATAA	2	8	130107	130114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014494	GTTT	2	8	131197	131204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014494	TGTA	2	8	131233	131240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014494	TTAG	2	8	133276	133283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014494	ACAT	2	8	135184	135191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014494	AAAG	2	8	135202	135209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014494	AGAA	2	8	142230	142237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014494	TTCA	2	8	146730	146737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014494	AAAT	2	8	151518	151525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014494	GTAT	2	8	151635	151642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014494	TCAG	2	8	151925	151932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014494	GATA	2	8	152701	152708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014494	TATT	2	8	152753	152760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014494	TCTA	2	8	153175	153182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014494	TGAA	2	8	153267	153274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014494	TTTA	2	8	153288	153295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014494	AAGC	2	8	153373	153380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014494	TTAT	2	8	155138	155145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014494	ATAA	2	8	155171	155178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014494	GTAT	2	8	156346	156353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014494	TTTA	2	8	156398	156405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014494	TATC	2	8	158620	158627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014494	ATTT	2	8	159454	159461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014494	AATT	2	8	160046	160053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014494	GAAG	2	8	160903	160910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014494	TTAT	2	8	163563	163570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014494	TGAA	2	8	163581	163588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014494	AAAG	2	8	167565	167572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014494	TAGG	2	8	174777	174784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014494	GTAG	2	8	174875	174882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014494	AAGC	2	8	174896	174903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014494	AAAT	2	8	175613	175620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014494	GAAA	2	8	176387	176394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014494	GGGA	2	8	179379	179386	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014494	AAAG	2	8	180509	180516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014494	GGAA	2	8	181877	181884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014494	CAAT	2	8	182015	182022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014494	GGCT	2	8	184837	184844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014494	AATT	2	8	189130	189137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014494	GAAA	2	8	189446	189453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014494	GCAG	2	8	189473	189480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014494	AGAT	2	8	190479	190486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014494	CAAA	2	8	191488	191495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014494	TGAT	2	8	202803	202810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014494	TTTC	2	8	202874	202881	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014494	TTCT	2	8	204087	204094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014494	TAAT	2	8	204115	204122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014494	AGCT	2	8	213435	213442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014494	AGAA	2	8	215289	215296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014494	GGTA	2	8	219310	219317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014494	AGAA	2	8	219768	219775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014494	AAAT	2	8	220360	220367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014494	ATTG	2	8	221677	221684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014494	AGAA	2	8	225232	225239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014494	AGAA	2	8	227063	227070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014494	GCAT	2	8	227085	227092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014494	AGAA	2	8	231240	231247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014494	GTTT	2	8	239104	239111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014494	ACAA	2	8	239112	239119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014494	TAAA	2	8	248195	248202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014494	TTTA	2	8	248269	248276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014494	TCAT	2	8	248344	248351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014494	CTTG	2	8	249085	249092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014494	AAAG	2	8	250670	250677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014494	AAGA	2	8	250769	250776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014494	AATT	2	8	253060	253067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014494	GAAA	2	8	254238	254245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014494	ACGA	2	8	254253	254260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014494	GAAA	2	8	258353	258360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014494	GAAA	2	8	258374	258381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014494	AATT	2	8	262728	262735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014494	TATT	2	8	262827	262834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014494	ATTA	2	8	262843	262850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014494	ATTT	2	8	265583	265590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014494	TAAA	2	8	266953	266960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014494	TTTA	2	8	266972	266979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014494	TTTA	2	8	267160	267167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014494	AATA	2	8	269641	269648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014494	CTGA	2	8	275924	275931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014494	GAAA	2	8	276006	276013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014494	CAAT	2	8	283188	283195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014494	GAAA	2	8	283256	283263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014494	CAAG	2	8	283432	283439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014494	CTAA	2	8	284730	284737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014494	AAAT	2	8	284898	284905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014494	AAAC	2	8	284911	284918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014494	GAAG	2	8	287019	287026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014494	CTTT	2	8	291557	291564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014494	ATAA	2	8	298161	298168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014494	GATT	2	8	300459	300466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014494	GCAG	2	8	301617	301624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014494	CAAA	2	8	301637	301644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014494	CAAA	2	8	301676	301683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014494	CTTT	2	8	308194	308201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014494	GGAA	2	8	308486	308493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014494	ACAA	2	8	310159	310166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014494	AGGA	2	8	310490	310497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014494	TTAA	2	8	313847	313854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014494	GTAA	2	8	318137	318144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014494	GCTG	2	8	318224	318231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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