MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 24229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014494	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066637
2	NC_014494	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066637
3	NC_014494	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
4	NC_014494	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066637
5	NC_014494	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066637
6	NC_014494	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066637
7	NC_014494	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
8	NC_014494	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066637
9	NC_014494	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066637
10	NC_014494	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066637
11	NC_014494	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066637
12	NC_014494	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066637
13	NC_014494	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066637
14	NC_014494	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066637
15	NC_014494	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066638
16	NC_014494	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066638
17	NC_014494	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
18	NC_014494	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
19	NC_014494	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066638
20	NC_014494	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
21	NC_014494	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066638
22	NC_014494	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066638
23	NC_014494	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
24	NC_014494	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066638
25	NC_014494	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066638
26	NC_014494	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066638
27	NC_014494	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066638
28	NC_014494	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066638
29	NC_014494	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066639
30	NC_014494	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066639
31	NC_014494	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066639
32	NC_014494	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066639
33	NC_014494	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
34	NC_014494	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
35	NC_014494	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066640
36	NC_014494	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
37	NC_014494	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066640
38	NC_014494	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
39	NC_014494	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
40	NC_014494	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
41	NC_014494	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
42	NC_014494	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066640
43	NC_014494	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
44	NC_014494	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066640
45	NC_014494	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066640
46	NC_014494	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
47	NC_014494	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066640
48	NC_014494	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066641
49	NC_014494	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066641
50	NC_014494	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066641
51	NC_014494	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066641
52	NC_014494	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066641
53	NC_014494	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066641
54	NC_014494	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066641
55	NC_014494	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066641
56	NC_014494	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066641
57	NC_014494	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
58	NC_014494	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
59	NC_014494	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
60	NC_014494	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
61	NC_014494	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066642
62	NC_014494	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
63	NC_014494	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
64	NC_014494	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066642
65	NC_014494	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
66	NC_014494	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
67	NC_014494	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
68	NC_014494	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
69	NC_014494	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
70	NC_014494	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
71	NC_014494	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
72	NC_014494	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
73	NC_014494	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066642
74	NC_014494	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066642
75	NC_014494	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066642
76	NC_014494	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066642
77	NC_014494	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066642
78	NC_014494	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
79	NC_014494	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
80	NC_014494	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
81	NC_014494	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
82	NC_014494	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
83	NC_014494	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
84	NC_014494	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066642
85	NC_014494	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
86	NC_014494	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
87	NC_014494	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
88	NC_014494	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307066642
89	NC_014494	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066642
90	NC_014494	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066642
91	NC_014494	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
92	NC_014494	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
93	NC_014494	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066642
94	NC_014494	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066642
95	NC_014494	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
96	NC_014494	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066642
97	NC_014494	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066642
98	NC_014494	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066643
99	NC_014494	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066643
100	NC_014494	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066643
101	NC_014494	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066643
102	NC_014494	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066644
103	NC_014494	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066644
104	NC_014494	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066644
105	NC_014494	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066644
106	NC_014494	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066644
107	NC_014494	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066644
108	NC_014494	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066644
109	NC_014494	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066645
110	NC_014494	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066645
111	NC_014494	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066645
112	NC_014494	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066646
113	NC_014494	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066646
114	NC_014494	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066646
115	NC_014494	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066646
116	NC_014494	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066646
117	NC_014494	ATC	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066646
118	NC_014494	CAA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066646
119	NC_014494	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066646
120	NC_014494	ATC	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066646
121	NC_014494	GAA	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066646
122	NC_014494	ACT	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066646
123	NC_014494	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066646
124	NC_014494	TAT	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066646
125	NC_014494	ATA	2	6	10092	10097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066646
126	NC_014494	GAT	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066646
127	NC_014494	TCT	2	6	10262	10267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066646
128	NC_014494	AAG	2	6	10564	10569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066647
129	NC_014494	TGG	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066647
130	NC_014494	GAA	2	6	10726	10731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066647
131	NC_014494	GCT	2	6	10750	10755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066647
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139	NC_014494	TGA	2	6	11442	11447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066647
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496	NC_014494	GGT	2	6	46045	46050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066692
497	NC_014494	GAA	2	6	46234	46239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066692
498	NC_014494	GAA	2	6	46285	46290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066692
499	NC_014494	GAG	2	6	46313	46318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066692
500	NC_014494	CAT	3	9	46366	46374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066693

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